首页
学习
活动
专区
圈层
工具
发布

「R」针对重复ID的处理

重复,特别是针对一些样本名称的重复问题的处理,是我在进行生信分析时经常遇到的。一种常见的解决策略是先找到重复之处,然后去重。但如果我们想要保留全部的重复ID呢?...一个简单的例子 生成一个非常简单的带重复的序列: r$> data = c("a", "b", "c", "d", "a")...虽然是同样的ID,但它有可能关联多种可能的事件。例如,一个肿瘤患者,它可以有肿瘤和正常两种组织的样本,这可能写在不同的行。亦或者肿瘤样本有不同的位置来源的信息等等,但共用一个样本ID。...解决的思路是对重复ID添加标记,可以是前缀或者后缀,这样既能视觉上识别,也能够通过编程的手段识别或者后续对前后缀裁剪。后缀才容易操作,更为推荐。...如果我们仅想要标记出第二次及以后出现的ID,这样能保留大部分的数据不做改动,怎么操作呢? R自带了make.unique()解决这个问题!

2.2K10

查找数组中重复的数字

题目来源于《剑指Offer》中的面试题3:找出数组中重复的数字。   // 题目:在一个长度为n的数组里的所有数字都在0到n-1的范围内。...数组中某些数字是重复的,但不知道有几个数字重复了,   // 也不知道每个数字重复了几次。请找出数组中任意一个重复的数字。...例如,如果输入长度为7的数组{2, 3, 1, 0, 2, 5, 3},   // 那么对应的输出是重复的数字2或者3。        ...此处介绍自己的一个做法,以空间换时间,通过新建数组来实现快速查找,具体做法是新建长度为length的数组newArray,初始化值为-1;将numbers数组的值依次作为newArray的下标和对应的值为...: (输出) 数组中的一个重复的数字 // 返回值: // true - 输入有效,并且数组中存在重复的数字 // false - 输入无效,或者数组中没有重复的数字

6.5K60
  • 您找到你想要的搜索结果了吗?
    是的
    没有找到

    html锚点id属性和name属性

    最近对模板更新时用到了这一点,举例说一下 // a.html 点击跳转到第一个锚点 点击跳转到第二个锚点 // a.html id...一般情况下,我们会在目标节点上添加id属性或者name属性,这个id或者name属性的值就是我们寻找锚点的依据,推荐使用id属性来标记锚点(因为id能够在各种标签上使用,name属性标记锚点时只能用在a...标签上) 需要一个触发锚点跳转的a标签。...a标签一般用作定义超链接,用作超链接时它的href属性的值是另一个页面的URL。a标签用作锚点时,href的值是锚点的id值或者name值。...同一页面内的锚点跳转时,给href赋值# + 锚点id的值或者# + 锚点name的值,需要跳转其他页面的锚点位置时,需要在#前面加上跳转的路径,例如:href="b.html#two"

    1.4K10

    html锚点id属性和name属性

    复制代码 // a.html 点击跳转到第一个锚点 点击跳转到第二个锚点 复制代码 // a.html id...一般情况下,我们会在目标节点上添加id属性或者name属性,这个id或者name属性的值就是我们寻找锚点的依据,推荐使用id属性来标记锚点(因为id能够在各种标签上使用,name属性标记锚点时只能用在a...标签上) 需要一个触发锚点跳转的a标签。...a标签一般用作定义超链接,用作超链接时它的href属性的值是另一个页面的URL。a标签用作锚点时,href的值是锚点的id值或者name值。...同一页面内的锚点跳转时,给href赋值# + 锚点id的值或者# + 锚点name的值,需要跳转其他页面的锚点位置时,需要在#前面加上跳转的路径,例如:href="b.html#two"

    1.9K60

    利用 Linux 查找重复文件

    在find的基础上,我们可与(如xargs命令)等其它基本Linux命令相结合,即能创造出无限的命令行功能,比如:可以快速查找出Linux某个文件夹及其子文件夹中的重复文件列表。...要实现这个功能在流程上是比较简单的,只要查找遍历出所有文件,再通过命令去比较每个文件的MD5就OK啦。...add-apt-repository ppa:hsoft/ppa sudo apt-get update sudo apt-get install dupeguru* 方法三:使用Find命令解析 在工作生活当中,我们很可能会遇到查找重复文件的问题...比如从某游戏提取的游戏文本有重复的,我们希望找出所有重复的文本,让翻译只翻译其中一份,而其他的直接替换。那么这个问题该怎么做呢?...size {}c -print0 | xargs -0 md5sum | sort | uniq -w32 --all-repeated=separate | cut -b 36- 大家先cd到自己想要查找重复文件的文件夹

    6.7K50

    利用 Linux 查找重复文件

    在find的基础上,我们可与(如xargs命令)等其它基本Linux命令相结合,即能创造出无限的命令行功能,比如:可以快速查找出Linux某个文件夹及其子文件夹中的重复文件列表。...要实现这个功能在流程上是比较简单的,只要查找遍历出所有文件,再通过命令去比较每个文件的MD5就OK啦。...add-apt-repository ppa:hsoft/ppa sudo apt-get update sudo apt-get install dupeguru* 方法三:使用Find命令解析 在工作生活当中,我们很可能会遇到查找重复文件的问题...比如从某游戏提取的游戏文本有重复的,我们希望找出所有重复的文本,让翻译只翻译其中一份,而其他的直接替换。那么这个问题该怎么做呢?...size {}c -print0 | xargs -0 md5sum | sort | uniq -w32 --all-repeated=separate | cut -b 36- 大家先cd到自己想要查找重复文件的文件夹

    5K30

    MySQL | 查找删除重复行

    image.png 本文讲述如何查找数据库里重复的行。这是初学者十分普遍遇到的问题。方法也很简单。...这个问题还可以有其他演变,例如,如何查找“两字段重复的行”(#mysql IRC 频道问到的问题) 如何查找重复行 第一步是定义什么样的行才是重复行。多数情况下很简单:它们某一列具有相同的值。...简单起见,这里只用到了临时表的方法。 我们的任务是:删除所有重复行,除了分组中id字段具有最小值的行。因此,需要找出大小大于1的分组,以及希望保留的行。你可以使用MIN()函数。... test.id ) 如何查找多列上的重复行 有人最近问到这样的问题:我的一个表上有两个字段b和c,分别关联到其他两个表的b和c字段。...如上所述,查找在某一字段上具有重复值的行很简单,只要用group分组,然后计算组的大小。并且查找全部字段重复的行也很简单,只要把所有字段放到group子句。

    7.7K30

    查找重复姓名的sql语句

    姓名 from 学生表 group by 姓名 having count(姓名)>=2即可,count(姓名)是自己又在返回的视图看到了另一个字段,这个字段用来显示出现的重复姓名的次数。...例如,对于上面提到的表格,我们做一个这样的查询: SELECT id, COUNT(course) as numcourse, score FROM student GROUP BY id 此时查询便会出错...字段中的单元格里的内容有多个值,关系型数据库是不允许这样的,这样就无法形成严格的关系约束条件了,所以会报错; 那么,对于 id 和 number列咋办呢?...且表间关系是一对多,即同一个app_category_id 对应多个category-id,现在我需要统计出每一个category_id在app_category表中出现的次数那么该如何实现呢,请看接下来的操作...BY category_id HAVING count(category_id) >2 其查询的结果是只有count的值大于2 的时候,才是需要的结果 ?

    5.9K10

    mongodb出现重复id怎么办?

    这个问题是我带的徒弟今天遇到的,程序在向mongodb中插入数据时出现id重复的错误,出错的提示如下: duplicate key error collection: index: id dup key...: { : ObjectId(‘68a3c9271f063c20cf82dec9’) }’, 看到这个错误提示你一定会很奇怪id不是自己生成的,怎么会重复呢?...要解答这个问题,我们先来看一下ObjectId以及什么是id。 id是集合中文档的主键,用于区分文档,它自动编入索引,并且指定 {id:} 查找是以id索引作为指南的。...很多情况下id是根据时间戳+主机+进程号+序列生成的,那么重复的原因可能有以下两种: 同一时间插入了两条数据,导致了数据库生成了同一个id值; 每次使用同一个变量存储不同的数据,进而导致mangodb认为每次存储的是同一条数据...至此, mongodb重复id的问题就解决了。

    1.9K20

    MySQL 如何查找删除重复行?

    如何查找重复行 第一步是定义什么样的行才是重复行。多数情况下很简单:它们某一列具有相同的值。本文采用这一定义,或许你对“重复”的定义比这复杂,你需要对sql做些修改。...,因此如何我将他们当做重复行,这里有一查询语句可以查找。...这里的语句是创建临时表,以及查找需要用DELETE删除的行。... test.id ) 如何查找多列上的重复行 有人最近问到这样的问题:我的一个表上有两个字段b和c,分别关联到其他两个表的b和c字段。...如上所述,查找在某一字段上具有重复值的行很简单,只要用group分组,然后计算组的大小。并且查找全部字段重复的行也很简单,只要把所有字段放到group子句。

    8.7K10

    深入理解 Python 的属性查找

    今天我们了解下python的属性查找,在Python中,属性查找(attribute lookup)是比较复杂的,特别是涉及到描述符descriptor的时候。...实例属性查找 按照python doc,如果obj是某个类的实例,那么obj.name(以及等价的getattr(obj,’name’))首先调用getattribute。...__dict__ cached_property例子 我们再来看看上一文章的这段代码 Widget是一个之定义了一个func函数的类,func是类的属性,这个也可以通过Widget.dict、w.dict...按照前面的类属性的访问顺序,我们可以怀疑,func是一个descriptor,这样才不会走到第2.2这种情况。...验证如下: 可以看到,即使Widget的实例也有一个‘a’属性,但是调用w.a的时候会调用类属性‘a’(一个descriptor)的set方法。

    1.2K100

    MySQL 如何查找删除重复行?

    如何查找重复行 第一步是定义什么样的行才是重复行。多数情况下很简单:它们某一列具有相同的值。本文采用这一定义,或许你对“重复”的定义比这复杂,你需要对sql做些修改。...,因此如何我将他们当做重复行,这里有一查询语句可以查找。...这里的语句是创建临时表,以及查找需要用DELETE删除的行。... test.id ) 如何查找多列上的重复行 有人最近问到这样的问题:我的一个表上有两个字段b和c,分别关联到其他两个表的b和c字段。...如上所述,查找在某一字段上具有重复值的行很简单,只要用group分组,然后计算组的大小。并且查找全部字段重复的行也很简单,只要把所有字段放到group子句。

    7.7K10

    Go语言圣经-查找重复行

    从标准输入中读取数据 1.if语句条件两边也不加括号,但是主体部分需要加{} 2.map存储了键/值(key/value)的集合,对集合元素,提供常数时间的存、取操作,map[string]int ==...> key的类型string和value的类型int 3.内置函数make创建空map, counts := make(map[string]int) 4.bufio包Scanner类型读取输入并将其拆成行或单词...() 停止输入是 EOF 终端情况下请使用 ctrl+d 文件的是直接 cat input | go run main.go dup1,go package main import (...第一个值是被打开的文件(*os.File) 2.os.Open返回的第二个值是内置error类型的值,如果不等于内置值nil(NULL)说明出错了 3.使用fmt.Fprintf表示打印任意类型默认格式值的动词...%v 4.map是一个由make函数创建的数据结构的引用,作为参数传递给某函数时相当于引用传递 package main import ( "bufio" "fmt"

    1.5K20

    Linux 查找重复文件方法汇总

    在find的基础上,我们可与(如xargs命令)等其它基本Linux命令相结合,即能创造出无限的命令行功能,比如:可以快速查找出Linux某个文件夹及其子文件夹中的重复文件列表。...要实现这个功能在流程上是比较简单的,只要查找遍历出所有文件,再通过命令去比较每个文件的MD5就OK啦。...add-apt-repository ppa:hsoft/ppa sudo apt-get update sudo apt-get install dupeguru* 方法三:使用Find命令解析 在工作生活当中,我们很可能会遇到查找重复文件的问题...比如从某游戏提取的游戏文本有重复的,我们希望找出所有重复的文本,让翻译只翻译其中一份,而其他的直接替换。那么这个问题该怎么做呢?...size {}c -print0 | xargs -0 md5sum | sort | uniq -w32 --all-repeated=separate | cut -b 36- 大家先cd到自己想要查找重复文件的文件夹

    2.9K30

    inux查找系统中重复文件

    查找和替换重复文件是大多数计算机用户的普遍要求。查找和删除重复文件是一项繁重的工作,需要时间和耐心。...如果您的机器由 GNU/Linux 驱动,那么查找重复文件会非常容易,这要归功于 “fdupes” 实用程序。...Fdupes - 在 Linux 中查找和删除重复文件 Fdupes是由Adrian Lopez用C编程语言编写的 Linux 实用程序,在 MIT 许可下发布。...该应用程序能够在给定的一组目录和子目录中找到重复的文件。Fdupes 通过比较文件的 MD5 签名然后进行字节到字节的比较来识别重复项。...它会递归搜索所有文件和文件夹,具体取决于文件和文件夹的数量,扫描重复项需要一些时间。与此同时,你会看到终端的总进度,就像这样。

    2.4K10
    领券