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表达量矩阵全部更改为0-1矩阵会影响降维聚类分群吗?

image-20210927091910905 然后做一个简单的转换: 代码如下所示: ct=pbmc@assays$RNA@counts ct ct[ct>0]=1 ct 标准的降维聚类分群...vjust = 0.5, hjust=0.5)) p1+p2 如下所示: 0-1矩阵的降维聚类分群...如果我们不进行这样的0-1矩阵转换,得到的图表是: 原始矩阵的降维聚类分群 这样的肉眼查看差异还是有点挑战,我们选择如下所示的代码: load(file = 'phe-by-basic-seurat.Rdata...gplots) balloonplot(table(phe_basic$seurat_clusters,phe_0_1$seurat_clusters)) 有意思的事情是,仍然是可以很大程度维持降维聚类分群结果的一致性哦...当然了,我说的是在降维聚类分群这个层面,并不是说后续差异分析,细胞通讯,转录因子分析哦!

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    表达量矩阵全部更改为0-1矩阵会影响降维聚类分群吗?

    首先查看表达量矩阵,是稀疏矩阵格式,如下所示: 然后做一个简单的转换: 代码如下所示: ct=pbmc@assays$RNA@counts ct ct[ct>0]=1 ct 标准的降维聚类分群...vjust = 0.5, hjust=0.5)) p1+p2 如下所示: 0-1矩阵的降维聚类分群...如果我们不进行这样的0-1矩阵转换,得到的图表是: 原始矩阵的降维聚类分群 这样的肉眼查看差异还是有点挑战,我们选择如下所示的代码: load(file = 'phe-by-basic-seurat.Rdata...gplots) balloonplot(table(phe_basic$seurat_clusters,phe_0_1$seurat_clusters)) 有意思的事情是,仍然是可以很大程度维持降维聚类分群结果的一致性哦...当然了,我说的是在降维聚类分群这个层面,并不是说后续差异分析,细胞通讯,转录因子分析哦!

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    Python types.MethodType动态更改类方法

    它是一类在运行时可以改变其结构的语言:例如新的函数、对象、甚至代码可以被引进,已有的函数可以被删除或是其他结构上的变化。...,在这个类里,定义了两个初始属性name和age,但是人还有性别啊!...如果这个类不是你写的是不是你会尝试访问性别这个属性呢? >>> P.sex = "male" >>> P.sex 'male' >>> 这时候就发现问题了,我们定义的类里面没有sex这个属性啊!...,分别是实例方法,类方法和静态方法,这里我们分别添加一下: import types #定义了一个类 class Person(object): num = 0 def __init_...24) #调用在class中的方法 P.eat() #给这个对象添加实例方法 P.run = types.MethodType(run, P) #调用实例方法 P.run(180) #给Person类绑定类方法

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    Linux之搜索查找类指令

    搜索查找类 1.1 find 指令 1.2 locate 指令 1.3 grep 指令和管道符号 │ 1....搜索查找类 1.1 find 指令 find指令将从指定目录向下递归地遍历其各个子目录,将满足条件的文件或者目录显示在终端。 基本语法:find [搜索范围] [选项] 选项说明 ?...应用实例 案例1:按文件名:根据名称查找/home目录下的 hello.txt 文件 find /home -name hello.txt 案例2:按拥有者:查找/opt目录下,用户名称为nobody的文件...find /opt -user nobody 案例3:查找整个linux系统下大于200M的文件(+n大于,-n小于,n等于,单位有k,M,G) find / -size +200M 1.2 locate...1.3 grep 指令和管道符号 │ grep过滤查找,管道符,“|”,表示将前一个命令的处理结果输出传递给后面的命令处理。 基本语法 grep [选项] 查找内容 源文件 常用选项 ?

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    二分查找会更快吗?Python中的二分查找与线性查找性能测试

    可以通过线性查找和二分查找来完成,但是要猜测哪个更快。 ? 为什么? 如果你最近参加过面试,你就会知道二分查找是面试官的最爱。 您为什么要花时间学习二分查找?C ++编程朋友可能已经告诉过您。...如果在包含11个元素的列表中进行线性查找,则必须遍历所有11个元素。如果您使用二分查找,最终可能要进行2次迭代,具体取决于您要查找的内容。请参见下面的图形。 显而易见,哪种方法更快。...为了检验哪种查找更快,我们可以计算二分查找相对于线性查找的时间。 ?...如果您有一个简短的列表,或者如果您在列表的下半部分寻找元素,那么执行线性查找可能会更好。 这也是编程之美。你不应该在不知道为什么的情况下使用一种方法来做某事。...如果你还不知道二分查找,现在你有了另一个工具来做查找。只要你觉得它有用,就使用它。 我希望我们能在一件事上达成一致。二分查找是相当酷的!

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    IP (定位数据库)地理位置查找真的能有效帮助阻止网络攻击吗?

    阻止访问分配给某些国家的整个IP范围也是一种选择,但对一个组织来说可能会非常有限。例如,该公司可能错过了潜在的合作伙伴关系。如果一家总部位于中东的组织试图与该公司联系以达成合作协议,该怎么办?...案例研究:IP地理定位用于威胁保护 虽然使用IP(定位数据库)地理定位API或查找并不是万能药,但该产品仍然可以降低组织遭受削弱性网络攻击的几率。例如,它的使用可以限制不必要的流量进出用户的网络。...通过我们的IP(定位数据库)地理位置查找运行它,发现IP地址实际上是基于乌克兰的: 由于你的组织在这个假设场景中不向乌克兰的客户提供服务,因此你的团队应该更加关注它。...事实上,虽然乌克兰 IP 地址可以非恶意访问你的网络,但该特定 IP 地址被明确引用为CLOP 勒索软件攻击的危害指标 (IoC) ,因此需要阻止。...他们应该特别注意可疑的 IP 地址,并确保在IP 地理位置查找的帮助下,每个访问者或用户在被授予访问网络连接的文件和系统之前都经过身份验证。

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    从 Django 模型中根据类查找外键

    在 Django 中,如果你有一个模型类,并希望找出哪些其他模型定义了指向该模型的外键,可以使用 Django 的元选项 (Meta) 和 ForeignKey 的反向关系属性。...例如,在 Book 模型中,外键可能叫做 author_id, 而在 Article 模型中,外键可能叫做 author.我们希望有一个方法可以根据外键的类来检索外键对象,无论外键的名称是什么。...我们还可以在模型类中定义一个 get_foreign_key_to() 方法,该方法返回指向给定类的外键字段。...# 在模型类中定义一个 `get_foreign_key_to()` 方法class Book(models.Model): author = models.ForeignKey('Author'...然后,我们调用了 get_foreign_key_to() 方法,并将 Author 类作为参数传递给该方法。

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