五一劳动节，连续五天，在钉钉群直播互动授课带领大家系统性掌握cytoscape软件的使用方法和技巧，课程已经结束啦。文末有录播回放学习方式，以及配套授课资料！...平均最短距离的作用与直径类似，但更有意义。也是与节点数目一起比较，判断网络分散或密集型。 意义： 如果是平均最短距离低的蛋白网络，可认为网络是紧密型，有倾向于形成功能性复合物或模块的趋势。 3....能够评估网络节点的调控性。如在网络中，如果某蛋白有high degree，就证明其和很多其他蛋白具有相关性，可认为其是关键蛋白。 4....这个插件有12个参数可以选择，那如果我们要得到PPI网络的关键基因，应选哪些参数最为合适呢？...https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32213192/ Centiscape，CytoHubba，MCODE 都可以筛选出关键基因或模块，但是使用了不同算法进行，大家可以根据筛选出来的基因数量使用其中一种或多种方法进行选择
先看看cytoscape.js是什么 cytoscape是一个网络图的可视化工具，大量的生物分子/基因领域的公司用它来做可视化分析。由于它的通用性，慢慢的也被其他领域的人用来做网络的可视化和分析。...cytoscape分为两种，一种叫做cytoscape desktop，是一个桌面软件，可以把数据导入然后生成可视化的网络图进行分析；另一种叫做cytoscape.js，是一个javascript库，主要给开发人员使用...由于Cytoscape.js允许用户与图形进行交互，并且库允许客户端挂接到用户事件，因此Cytoscape.js可以轻松集成到你的应用程序中，尤其是因为Cytoscape.js支持桌面浏览器（例如Chrome...Cytoscape.js包含了开箱即用的所有手势，包括捏缩放，框选择，平移等。 Cytoscape.js还考虑了图分析：该库包含图论中的许多有用功能。...你可以在Node.js上无头使用Cytoscape.js在终端或Web服务器上进行图形分析。 Cytoscape.js支持许多不同的图论用例。
模拟方法（Permutation test）： 通过随机重新分配基因标签并计算在随机数据集中获得的交集大小，可以评估观察到的交集是否显著。然后，将实际交集与模拟的分布进行比较。...它可以帮助你确定特定生物学过程或通路是否在两个列表的交集中显著富集。 在进行这些检验之前，你需要确定背景基因集的大小，以及两个列表中DEGs的数量。...数据整合： 用户可以将其他生物信息学数据集与网络数据集整合，以便在网络上显示附加信息。例如，可以将基因表达数据、蛋白质功能注释等与网络节点关联起来，从而在网络图上展示多维度的信息。...CytoHubba插件： 在Cytoscape中，使用CytoHubba插件来计算网络中的节点（基因/蛋白质）的度值（Degree Value）和其他参数值。...度值是指一个节点与其他节点连接的数量，通常用来衡量节点在网络中的重要性。
知识图谱（关系网络）可以用简单的形状和线条显示复杂的系统，帮助我们理解数据之间的联系。我们今天将介绍15个很好用的免费工具，可以帮助我们绘制网络图。...它可以很好地处理大量数据，并允许更改图的外观。 ipyssigma是JupyterLab的一个封装，它将Sigma.js与Python的NetworkX包结合在一起。可以web浏览器中查看网络结构。...它可以让你在不学习新方法的情况下在R和Python之间切换网络的计算任务。它提供了许多在Python或Jupyter notebook中使用的功能。...https://github.com/WestHealth/pyvis SNAP SNAP是一种用于分析和处理大型网络的通用高性能系统。图由节点和节点之间的有向/无向/多边组成。...网络是节点和/或边缘上有数据的图。 用c++编写的SNAP库是为快速工作和清晰的网络图而设计的。它处理有很多点和线的大网络，找出它们的形状，形成新的网络，并且可以在工作时改变一些东西。
下图是一个度为3的BTree，除了叶子节点，每个节点的子树个数不是2个就是3个，0004节点的子树有2个，0047|0051节点的子树有3个。...key的个数是否满足BTree的性质，如果不满足，则执行下面的第4步操作 以插入节点中间的key为中心，分裂成左右两部分，然后将中间的key插入到它的父节点中，这个key的左子树指向分裂后的左半部分，右子树指向分裂后的右半部分...这种情况只做上面的处理还不够，还要做其他处理。这种情况在2中删除叶子节点的元素导致叶子节点为空也存在，所以放到下面一起分析说明。...处理方法是，如果该叶子节点的兄弟节点有富余的元素，可以借一个过来，如果兄弟节点也没有富余的元素，这时候要对叶子节点进行合并。...删除元素z之前 删除元素z之后 上面讨论的是叶子节点的兄弟节点有富余的元素，可以从兄弟节点借。如果兄弟节点的元素也不富余的情况怎么处理呢？嗯，方法是将叶子节点进行合并。
本文将详细介绍集群，主要内容包括：集群的作用；集群的搭建方法及设计方案；集群的基本原理；客户端访问集群的方法；以及其他实践中需要的集群知识（集群扩容、故障转移、参数优化等）。...注意ip使用的是局域网ip而不是localhost或127.0.0.1，是为了其他机器上的节点或客户端也可以访问。...，该命令可以安装ruby-redis依赖 （2）启动节点 与第一种方法中的“启动节点”完全相同。...衡量数据分区方法好坏的标准有很多，其中比较重要的两个因素是(1)数据分布是否均匀(2)增加或删减节点对数据分布的影响。...下面是使用Hash Tag的一个例子；通过对product加Hash Tag，可以将所有产品信息放到同一个槽中，便于操作。 ? 5.
在之前的逻辑中，拖拽是完全自由的，那么磁贴布局就会约束两点： 对当前拖拽组件位置做约束。 可能把其他组件挤走。...拖入拖出判断当前拖拽位置是否进入了一个新容器，或者离开了当前容器；碰撞模块判断当前拖拽位置是否与其他 element 产生了碰撞，并做出相应的碰撞效果。...function collision(context, x, y) { // 先做拖入拖出判断 if (judgeDragInOrOut(context, event)) { // 如果判定为拖入或拖出...，则不会产生碰撞，提前 return // 但是拖出时需要对原来的父节点做一次 runGravity // 拖入时不用对原来父节点做 runGravity return { safeX...判断产生碰撞后，该碰撞会导致鼠标位置的 box，也就是 extraBox 放到该组件之上还是之下 } }); 首先要确定当前碰撞是否为初始化碰撞，且一旦有一个组件不是初始化碰撞，就认为没有发生初始化碰撞
该窗口可多开，可复制粘贴 Unlit Master：节点中最后一个节点，有且仅有一个，是定义材质表面的一个节点 SkodeUnlitGraph：最终效果显示窗口，可右键更改显示预览的模型/形状 Save...Input：从mesh可以获取的一些信息，法线、切线、位置、Matrix、贴图等 Master：上面第4条有提到 Math：数学相关函数 Procedural：在ShaderGraph中程序化的生成噪音贴图...logo c、空白窗口右键Create Node搜索“Sample Texture 2D”并创建 d、拖拽MainTexture，将生成的Property放到工作区成为属性节点 e、将MainTexture...滚动Tiling And Offset—Offset的Y值，发现此时输出显示有了波纹的效果 实现全息影像的滚动效果 创建Time节点、Vector2节点以及Multiply节点，Multiply节点将...删除Vector1节点，将Faction的输出值连至显示结果的AlphaClipThreshold端口 4️⃣ 传送门效果 1)、创建Twirl节点、Sample Texture 2D Twirl节点：
第二种格式是定义同种类型的多个关系，而他们有同一个source node的简写。 第三行显示了如何定义一个和其他nodes没关系的节点。这种形式对有连接关系的节点并不必要。...image.png 7.3GML格式 和SIF格式相比，GML是一种非常丰富的图表格式语言，可以被很多其他的网络可视化包支持。...当XGMML文件或会话不能被正确读取时，你可以用这个功能。这会拖慢读取过程，但是你想视图修补这种文件时，还是可行的。...Panel中的行可以以字母顺序排序，通过点击列的头名字。一个新列也可以创建，方法是使用Create new column ? image.png 。...image.png Cytoscape可以使用DAG(Directed Acyclic Graph有向无环图)注释网络中的目标。
为UI控件添加自动布局的约束可通过如下三种方式。 第一种：通过Xcode中Editor菜单的Align、Resolve Auto Layout Issues或Pin子菜单添加。...第二种：通过Interface Builder右下角的按钮来添加约束。使用Interface Builder打开界面设计文件之后，在右下角可以看到有几个按钮。...在按住键盘上control键的同时，在Interface Builder中从一个UI控件拖向另一个具有兄弟关系的UI控件即可看到蓝线。 ? 松开鼠标即可看到弹出菜单。 ?...可以看出，如果在两个具有兄弟关系的UI控件之间拖出蓝色的竖线，那么Xcode弹出的菜单将只能设置这两个UI控件在垂直方向上的约束关系。 如果拖出的蓝线为水平横线，那么Xcode将弹出如下所示菜单。...可以看出，如果在两个具有兄弟关系的UI控件之间拖出蓝色的水平横线，那么Xcode弹出的菜单将只能设置这两个UI控件在水平方向上的约束关系。
二叉查找树(BST)是一种特殊的二叉树；相对较小的值保持在左节点中，较大的值保存在右节点中。...js代码实现二叉查找树 首先我们先定义一个Node对象，用于保存数据(data)，也保存和其他节点的链接（left和right）。...是否有根节点，如果没有，那么是颗新树，传入的该节点就是根节点 if(this.root == null) { this.root = n; }else { //反之就定义一个current...这三种遍历理解了一种的实现代码，其他的都好理解，所以我着重写一下我对js代码实现中序遍历过程的具体理解。...js代码实现中序遍历 中序遍历使用递归的方式，以升序访问树中所有节点，先访问左子树，在访问根节点，最后访问右子树。 function inOrder(node) { if(!
(D3是肯定可以的了)，与其用D3从零开始为什么不找到现有的开源的专门做关系图的库，来实现它，百度了半天也没搜出个一支半截，最终还是看了某查网，发现它们引入了一个叫cytoscape.js的文件，百度了一下...这是文档给出的描述，说的很官方，大概意思就是如果你想要“关系”关系图的话你可以使用它，包括分子图、社交网络图一系列想要表达关系的图，并且提供可以用JS原生方法添加交互的API。...ok你的关系图做的很牛逼就够了，这正是我们想要的。使用方法很简单，一个div用于盛装画好的图，先引jquery，再引Cytoscape.js，然后就可以开始写你的代码了，还支持使用npm安装。...‘node’换成‘edge’就行了 这里个人感觉，有了.neighborhood("node/edge")方法，就可以吃遍天了，基本的需求要么就是target自身添加一些样式，要么就是neighborhood...因为目前国内使用cytoscape的很少，论坛上也没有多少资源，期待大家在使用之后能回到此处在做交流，我遇到的这些问题你是否也遇到了，如何解决的我们可以做一些探讨。
同样的方法，如果右击一个边（edge），可以选择add，那么可以添加各种说明和文本框，这点很像MS的ppt或类似的软件。关于这点会在5.6部分详说。...5 产生新的网络 有四种不同过的方式可以产生新的网络 A.输入已经存在的固定格式的网络文件 B.输入已经存在的未格式化的文本或excel文件 C.输入公共数据库中的数据 D.产生新的空网络，手工添加节点和边...5.1输入固定格式Network files Network file可以是supported network formats中描述的任意一种。...你也可以快速撤销或扩张群通过双击组节点或它的任何一个子节点。 添加网络注释 在画布的任何地方右击可以添加text，images 或其他形状的注释。...可以添加自己的图片，可以选择形状，也可以选择有或无边框的文本。也可以 被编辑。 6Nested NETworks：嵌套网络 Cytoscape有可以把潜逃网络和任何节点联系一起的功能。
比其他节点更“浅”（也就是说，有更短的测地距离）的节点有更高的紧密度。在网络分析中，紧密度倾向于表示最短路径长度，因为这样会有更多的中心节点赋予更高的值，而且通常与其他度量（比如：度）相联系。...紧密度是中心性的一种复杂度量。它被定义为节点v到其它可达节点的平均测地距离（比如：最短路径）： 其中当n>=2是从v出发在网络中连通部分V的大小。...有了NetworkX你就可以用标准或者不标准的数据格式加载或者存储网络，它可以产生许多种类的随机网络或经典网络，也可以分析网络结构，建立网络模型，设计新的网络算法，绘制网络等等 2安装 方式一：pip...图的显示还有两个比较好用的工具就是Cytoscape和Gephi也比较好用，显示图像方便又美观，其中Cytoscape可以读取CSV文件，可以对图进行拖拽。感兴趣的朋友可以研究一下。 ...图：各个节点的偏心距 查看节点到另一节点或其他节点的最短路径 查看节点到另一节点或其他节点的最短路径的长度 紧密中心性：越大说明中心越强。
JZGKCHINA 工控技术分享平台 尊重原创 勿抄袭 勿私放其他平台 前几天，有客户找到我们，说有十多个水厂的数据要上传到他们集团的中心数据库，这些水厂的数据都是直接从仪表采集到PLC里面的，而且，...读取AB PLC变量的节点配置完成后，我们需要检查一下配置的是否正确，此时我们就需要使用到万能的诊断节点“Debug”，该节点可以显示出当前配置节点的运行结果。...从左侧节点栏拖一个Debug节点到中心编辑区域内，使用鼠标将刚才配置的AB PLC节点和debug阶段连接起来： 点击页面右上角的部署按钮，即可将当前配置部署到边缘计算模块内自动运行起来。...从刚才的诊断信息我们可以看出，AB PLC通讯节点读回来的数据是一个对象结构。那么，我们需要使用JS语言将这个对象内元素的值取出来。...配置完后可以自行连接Debug节点进行输出查看 拼凑完成后需要配置http协议的其他内容。
也就是说，当Redis节点以集群模式启动时，会首先寻找是否有集群配置文件，如果有则使用文件中的配置启动，如果没有，则初始化配置并将配置保存到文件中。集群配置文件由Redis节点维护，不需要人工修改。...；注意ip使用的是局域网ip而不是localhost或127.0.0.1， 是为了其他机器上的节点或客户端也可以访问 同理，在7000节点中使用cluster meet命令，可以将所有节点加入到集群，完成节点握手...，该命令可以安装ruby-redis依赖 （2）启动节点 与第一种方法中的“启动节点”完全相同。 ...）指定主从关系：方法参见集群搭建 减少节点、 假设要下线7000/8000节点，可以分为两步： （1）迁移槽：使用reshard将7000节点中的槽均匀迁移到7001/7002/7003节点...下面是使用Hash Tag的一个例子；通过对product加Hash Tag，可以将所有产品信息放到同一个槽中，便于操作。 5.
使用Truffle框架开发分布式应用 使用控制台或网页与合约进行交互 前序知识要求 为了顺利完成本课程，最好对以下技术已经有一些基本了解： 一种面向对象的开发语言，例如：Python，Ruby...由于区块链里的每个块都存储有前一个块内容的哈希值，因此如果有任何块的内容被篡改，被篡改的块之后 所有块的哈希值也会随之改变，这样我们就很容易检测出区块链的各块是否被篡改了。...第七节 以太坊——世界计算机 以太坊是一种区块链的实现。在以太坊网络中，众多的节点彼此连接，构成了以太坊网络： ? 以太坊节点软件提供两个核心功能：数据存储、合约代码执行。...在每个以太坊全节点中，都保存有完整的区块链数据。以太坊不仅将交易数据保存在链上，编译后 的合约代码同样也保存在链上。 以太坊全节点中，同时还提供了一个虚拟机来执行合约代码。...JS开发库 为了便于构建基于web的DApp，以太坊还提供了一个非常方便的JavaScript库web3.js，它封装了以太坊节点的API 协议，从而让开发者可以轻松地连接到区块链节点而不必编写繁琐的RPC
对应3节点(3-node)，保存两个Key，2-3查找树的定义如下： 对于2节点，该节点保存一个key及对应value，以及两个指向左右节点的节点，左节点也是一个2-3节点，所有的值都比key要小，有节点也是一个...如果中序遍历2-3查找树，就可以得到排好序的序列。在一个完全平衡的2-3查找树中，根节点到每一个为空节点的距离都相同。...2-3树的查找和二叉查找树类似，要确定一个树是否属于2-3树，我们首先和其跟节点进行比较，如果相等，则查找成功；否则根据比较的条件，在其左中右子树中递归查找，如果找到的节点为空，则未找到，否则返回。...操作2：父节点：2-节点，子节点：3-节点 和第一种情况一样，我们也可以将新的元素插入到3-node节点中，使其成为一个临时的4-node节点，然后，将该节点中的中间元素提升到父节点即2-node...节点中，使其父节点成为一个3-node节点，然后将左右节点分别挂在这个3-node节点的恰当位置。
对应3节点(3-node)，保存两个Key，2-3查找树的定义如下： 对于2节点，该节点保存一个key及对应value，以及两个指向左右节点的节点，左节点也是一个2-3节点，所有的值都比key要小，有节点也是一个...一棵2-3查找树或为一颗空树，或由以下节点组成： 1)2-节点：含有一个键和两条链接，左链接指向的2-3树中的键都小于该节点，右链接指向的2-3树中的键都大于该节点。...如果中序遍历2-3查找树，就可以得到排好序的序列。在一个完全平衡的2-3查找树中，根节点到每一个为空节点的距离都相同。 ?...2-3树的查找和二叉查找树类似，要确定一个树是否属于2-3树，我们首先和其跟节点进行比较，如果相等，则查找成功；否则根据比较的条件，在其左中右子树中递归查找，如果找到的节点为空，则未找到，否则返回。...操作2：父节点：2-节点，子节点：3-节点和第一种情况一样，我们也可以将新的元素插入到3-node节点中，使其成为一个临时的4-node节点，然后，将该节点中的中间元素提升到父节点即2-node节点中，
一：先来看一下界面的截图： 说明： 拖动节点的时候，与该节点相关的箭头连线也会跟着调整； 用户可以使用鼠标从一个节点拖出一个箭头到另一个节点（鼠标在空白区域点击一下，拖出的箭头消失） 这三个图标，手型图标处于选中状态的时候...，节点可以拖动， 箭头图标处于选中状态的时候，可以使用鼠标绘制连线箭头 最后一个图标，用于在画布上创建一个节点方框 二： 关键代码文件如下图（用红框框住的为关键代码文件） 其他文件均为辅助代码文件（有些文件中的代码没有用到...） 三： CustomView类是我们的绘图面板，这个类继承自QGraphicsView 在这个类的构造函数中，我们创建了他的QGraphicsScene 并设置了它的大小（这也是为什么我们的绘图板有滚动条的原因...是起始处的方框节点，itemB是结束处的方框节点 注意mapFromItem是把方框节点中心点映射到scene坐标系中 紧接着的if,else是为了判断起始方框是否位于结束方框的下方，如果是，那么箭头的终点应该在结束方框的下边框上...就是与当前方框节点有关的箭头 八： 在来看一下CustomRect的MousePressEvent的代码 在这个代码中， 我们先为全局标志ScenClickFlag赋值， 这个标志着当前点击的是一个方框节点
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