首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

北京大学陈语谦团队提出DMFF-DTA模型,通过双模态特征融合神经网络进行药物靶点亲和力预测

该模型集成了药物和靶点蛋白质的序列和图结构信息,引入了一种以结合位点为中心的图构建方法来提取结合信息,使药物-靶点相互作用的建模更加平衡和有效。实验证明了DMFF-DTA的性能超越了现有方法。...因此,作者提出了DMFF-DTA模型,该模型结合了一种基于数据检索的以结合位点为中心的蛋白质残基图构建方法。这降低了计算成本,促进了蛋白质和药物分子图的融合。...这种可视化不仅证实了模型预测的生物学合理性,而且还提供了模型焦点的清晰描述,与已建立的相互作用位点保持一致。...该模型通过创新的特征提取和融合模块,有效地整合了药物和蛋白质的序列和图结构信息。以结合位点为中心的图构建方法,使得基于图神经网络的药物-蛋白质相互作用建模更加平衡和有效。...未来的工作可以集中在细化药物-靶点相互作用的特定生物学机制。这可能涉及开发动态的权重调整方法来优化原始图信息,或者探索更好地反映分子结合过程物理现实的替代连接方案。

15010

SPSS用KMEANS(K均值)、两阶段聚类、RFM模型在P2P网络金融研究借款人、出款人行为数据规律|附代码数据

聚类分析过程: 数据的准备过程:也就是数据的预处理,包括特征标准化和降维。 特征的选择过程:从最初的特征中选择最有效的特征存储于向量中。 特征的提取过程:通过对所选择的特征进行转换形成新的突出特征。...聚类分析的模型设计   借款人总体数据统计 本文从借款人信息表中提取出923条不重复且有效条的借款人信息。...出借人行为聚类分析     聚类分析研究目的 本文借助聚类分析的方法,对P2P网络借贷平台中出借人进行客户细分,从而找出出借人的类别,最终使P2P网络借贷平台中对出借人有合理和准确的分类。...客户细分 基于RFM模型的客户分类原理分析 客户细分的方法有许多,但最终衡量方法是否适合的标准应该是细分结果的精确性以及与企业管理的匹配度。...聚类分析在出借人客户细分中的应用实现 本文从借款人信息表中提取出500不重复且有效条的借款人信息。相关重要数据如下表。 使用K-means均值进行聚类时,需要预先判断其聚类的类别数。

57900
  • 您找到你想要的搜索结果了吗?
    是的
    没有找到

    . | 基于绑定位点接触图的双模态神经网络助力药物靶点亲和力预测

    在图模态特征提取模块中,模型首先通过RDKit工具构建药物分子图,其中原子作为节点,化学键作为边。对于靶点蛋白,模型创新性地提出了一种基于AlphaFold2和数据库检索的结合位点图构建方法。...结合Uniprot数据库中的结合位点信息,模型构建了聚焦于结合区域的接触图。为了实现两个图之间的信息交互,模型引入了虚拟节点作为桥梁,同时采用了预热策略和源节点方法来确保特征提取的有效性。...具体而言,模型在实现最低MSE(0.218)的同时,保持了合理的运行时间(36.80秒/轮)和GPU内存消耗(17,681 MB)。...通过创新的结合位点图构建方法和高效的特征提取策略,模型实现了高精度预测和计算效率的有机统一。...这种合理的注意力分布很可能得益于作者提出的新型结合位点接触图构建方法,该方法在训练过程中为模型提供了空间结合信息的指导。

    12500

    仓库降本可执行手册

    所以降低仓储成本要在保证物流总成本最低和不降低企业的总体服务质量和目标水平的前提下进行,具体执行方法如下: 集中储存 集中储存可减少仓库面积,降低仓储保管费用;通过使用专用运输集装工具,可降低运输成本,...缩小库内通道宽度以增加储存有效面积。具体方法有采用窄巷道式通道,配以轨道式装卸车辆,以减少车辆运行宽度要求,采用侧叉车、推拉式叉车,以减少叉车转弯所需的宽度。 减少库内通道数量以增加有效储存面积。...具体方法有采用密集型货架、不依靠通道可进车的可卸式货架、各种贯通式货架、不依靠通道的桥式起重机装卸。 库位管理 存储定位是指被储存物位置的确定。如果定位系统有效,能大大节约寻找、存放、取出的时间。...而且能防止差错,便于清点及实行订货点等的管理。 “四号定位”方式 “四号定位”是用一组四位数字来确定存取位置的固定货位方法,是我国手工管理中采用的科学方法。这四个号码是:库号、架号、层号和位号。...此外,经常的监测也是掌握被存物资数量状况的重要工作。 “五五化”堆码 “五五化”堆码是我国手工管理中采用的一种科学方法。

    25510

    SilhoNet:一种用于3D对象位姿估计和抓取规划的RGB方法

    一、位姿估计简介 使用中间轮廓表示来促进在合成数据上学习模型以预测真实数据上的3D对象位姿,有效地桥接SIM到实际域移位; 在本文中,本文提出以下贡献: 1)SilhoNet,一种新的基于RGB的深度学习方法...二、SilhoNet方法 本文介绍了一种新颖的方法,该方法对单目彩色图像进行操作,以估计相对于相机中心的3D物体旋转位姿,并预测视觉上未被遮挡的抓取点。...给定对象的估计3D位姿和预先计算的抓取点的数据库,本文将每个抓取点从对象框架投影到相机框架中的遮挡掩模上。位于掩模的未被遮挡部分上的点被认为是有效的,并且可以从有效集中选择最高得分抓取。...的公布结果的性能,无论是否有迭代最近点(ICP)改进。...了解哪个抓取点被遮挡可以使机器人能够确定物体是否足够清晰以便抓取或者是否必须采取一些其他步骤以实现对物体的无阻碍抓取。

    89210

    MCVO: 一种适用于任意排列多相机的通用视觉里程计

    提出了一种基于多相机轨迹一致性的 SLAM 尺度估计策略,兼容不同的相机模型,无论是否具有视场重叠,均表现出较强的通用性和稳定性。 图 1:所提 MCVO 系统的示意图。...尺度修正与后端优化 在使用度量尺度初始化位姿估计系统后,我们使用仅依赖视觉的束调整(bundle adjustment)方法,结合从所有相机提取的特征,最小化先验与所有视觉测量残差的马氏距离范数之和,以获得最大后验状态估计...消融实验 进行了一系列消融实验,探讨不同数量的相机、特征提取器、特征匹配方法以及是否使用闭环检测的影响。通过全面分析验证了我们提出方法的各个部分的有效性。 1....讨论 与其他立体视觉里程计(VO)和多相机视觉里程计(VO)方法的比较表明,提出的 MCVO 在状态估计方面具有显著的有效性。对每个组件的分析验证了我们在多相机数据处理设计中的合理性。...然而仍然存在一些局限性: 多相机配置可以提高视觉里程计的鲁棒性,但不可避免地带来新的计算要求。我们的方法通过基于学习的特征提取来转移 CPU 负担,但也引入了对 GPU 资源的需求。

    15410

    图片魔术

    利用头发这个掩体传递密文,而本文所表演的魔术不过是把掩体换成了图片而已,使用了一种称为最低有效位(LSB)的算法。...我们知道图像像素的样点存在最低意义的比特位,比方说某个像素点为(255,255,255),用二进制表示就是每个颜色通道的数值都是11111111,最低意义的比特位就是这最后一位1,由于自然信号样点的奇偶性随机...比方说像素254和255仅在最低位不同,其差别是相当小的。 ? LSB算法正是通过修改这个最低有效位来达到传递密文的目的。 ?...隐写不仅需要发出方将信息藏进载体里,接收方需要正确从这个藏了信息的载体里提取出信息。LSB算法也是如此,可以分成两部分来看待,嵌入算法以及提取算法。...嵌入算法的主要做法是提取原始图片的像素,将其每个像素点最低有效位全部置零。将需要嵌入的秘密信息转换成二进制存储,并以此依次修改原图的像素。

    45810

    ​探秘 Web 水印技术

    它接受一个配置对象作为参数,该对象有一个 mode 属性,值可以是 open 或者 closed 。open 表示可以通过页面内的 JavaScript 方法来获取 Shadow DOM。...不可见水印通常具有比可见水印更好的隐蔽性和抗攻击性。虽不可见,但通过一定的技术手段是可以将水印信息从其载体上提取出来的,这就使得其载体具备了溯源能力,在关键时刻往往能发挥大作用。...如果将一个图像所有像素的比特位抽出来,就构成了 8 个不同的位平面,从 LSB(最低有效位 0)到 MSB(最高有效位 7)。...把图像从空间域变换到频率域后,就能够实现对图像数据进行不同频率成分的提取。对于图像信号来说,可以把灰度(亮度)看做频率,傅里叶变换可作为图像灰度值形成的空间域与其频率域的桥梁。...我们截取图像中的一部分并重新采样,然后尝试提取水印信息。 可以看到还是有很大概率可以提取到有效水印信息的。

    2.4K22

    【CPP】链表桶排序

    我们先只看数据的最低位,将各个数据放进它们最低位对应的桶子里。然后我们自然就发现,虽然各个桶子内部的数据仍然是乱序的,但是从最低位来看我们的数据已经排完了。...然后我们开始从第一个桶的第一个数开始,依次遍历每个桶的元素,将他们像之前提到过的队列一样一个个排出来再以他们的第二位压入桶中。在这里,两位数以下的数据就被压入了0号桶里,其他的数按照第二位排好了序。...由于一开始对个位数排序过,又因为我们从小到大排出了各个数,所以现在所有10以内的数已经排好在0号桶中了。按照同样的方法,我们继续把2位数排进了0号桶,又将三位数排好,将四位数排好。。。...但是这些都可以通过不断优化代码来解决,合理地利用桶排序,可以简单地得到较高的计算效率。 然后我们来看看具体实现。...在这里的Sort是个简单的选择排序,和桶排序无关,没有必要实现,但可以用来测试Swap函数是否稳定。

    49140

    干货 | 黑客带你还原韩剧《幽灵》中出现的隐写术

    由此可见,copy /b命令只是将几个文件进行了简单的追加合并,以达到隐蔽传送信息的目的,但是这种方法通过对比图像大小和文件大小,很容易检测到图像后面是否追加数据,所以copy/b只能算作一种简单的图像隐写技术...这样即没有起到压缩的作用,反而因为有一个庞大的调色板的存在而体积增大。所以真彩色图直接用R、G、B三个分量表示,又叫做24位色图。...可见RGB最低位的变化不会产生视觉上的差异。 上图可以看出随着改变位数的增加,像素点的颜色开始发生变化,当低5位均变化后,与原像素点相比发生了较为明显的颜色改变。...0x05 隐写升级 由于上面采用顺序隐写的方法,所以导致信息集中在图片的某一部分(下图中的差异对比图下方出现较宽区域的噪点)。...为了消除信息过于集中而导致图片某一区域像素信噪比过高,可以采用随机分配隐写位置的方式,将信息分散隐写在图片当中。

    1.9K81

    少即是多:视觉SLAM的点稀疏化(IROS 2022)

    本文基于上述情况,提出了一种在SLAM系统中实现地图点稀疏化的有效的图优化方法,进而减少一般特征点SLAM系统中的3D点和关键帧,减少了计算和存储资源,同时提高了位姿估计的精度。...,它们大多集中于减少数据量或计算成本,同时略微牺牲位姿精度;在现有的SLAM系统中,为了在保持位姿定位精度的同时减少地图大小和计算成本,作者引入了一种有效的点稀疏化算法,该算法可以直接集成到任何特征点的视觉...优化问题的快速计算和低计算量为目标的问题空间缩减方法可以大致分为两个部分的工作; 第一个部分的工作研究了基于图优化的快速位姿优化方法。...;所以主要研究方向有两个:(1)只提取相关的局部特征和点(2)剔除这些对位姿优化贡献不大的特征或点;在提出的方法中,在提取到足够的特征点和临时生成地图点之后,作者着重于抽取点来建立一个更简化的BA问题,...为了集成一个算法解决上述问题,作者提出一种基于有向图表示的新方法,即节点对应于点和位姿对;在此图中,利用节点之间的成本和容量能力,将节点的实际点可见性、空间多样性和基线转化为最小成本最大流量的二部分图。

    57630

    文心一言 VS 讯飞星火 VS chatgpt (224)-- 算法导论16.3 6题

    我们可以使用先序遍历(或后序遍历)来唯一地表示这棵树的结构。对于每个内部节点,我们记录其是否为左孩子(用1表示)或右孩子(用0表示)。由于有 n 个叶子节点,因此有 n−1 个内部节点。...这种方法的关键在于利用编码树的结构来有效地表示前缀码,同时确保每个字符值都能被准确地表示和恢复。 讯飞星火: 为了用最少的二进制位传输此编码,我们可以使用以下方法: 1....最优前缀码,又称为哈夫曼编码,是一种用于数据压缩的编码方式,它能够有效地表示字符集中的字符,尤其是当字符的使用频率不同。...位数的计算 根据哈夫曼编码的特性,我们可以知道,对于一个有n个字符的字符集,哈夫曼编码的总长度不会超过2n-1+\sum_{i=1}n}\log_2(fi)位,其中_i是第i个字符集中的频率。...在实际应用中,我们可以根据字符的频率来构建哈夫曼树,并使用线性于字符数量的二进制位来表示整个字符集的最优前缀码。这种方法的有效性基于哈夫曼编码的性质,以及编码过程中对哈夫曼树结构的合理利用。

    12320

    提出AI消除性别偏见新方法,适用于任何模型 | EMNLP 2022

    论文提出了MABEL,一种使用限定标签来让AI减少性别偏见的方法。 通过这一方法,团队证明如果上游预训练中对于性别偏见的矫正,能直接影响下游任务。 而且适用于任何模型。...使用限定标签减轻偏见 陈丹琦团队的这个新方法MABEL,全称是一种使用专用标签消除性别偏见的方法(a Method for Attenuating Gender Bias using Entailment...首先是数据集方面,研究团队使用的是自然语言推理(NLI)数据集,它在训练有区别性和高质量的句子表征方面特别有效。...由于研究团队主攻性别歧视方向的偏见,因此,他们从NLI数据集中提取了在前提或者假设中包含性别术语的所有隐含对。...此外,研究团队还评估了语言模型在使用了消除性别歧视的方法后是否仍然保持一般的语言理解,结果显示模型能够很好地保留其在GLUE上的自然语言理解(NLU)能力。

    75630

    BIB | DeepTorrent:一种基于深度学习用于预测DNA N4-甲基胞嘧啶位点的方法

    但是通过实验方法检测4mC位点耗时并且昂贵,而现有的一些基于机器学习的4mC预测器,性能不令人满意。所以作者提出了一种基于深度学习的方法DeepTorrent,以改进预测DNA序列的4mC位点的预测。...随后提出的预测DNA甲基化位点的计算方法为大规模识别DNA甲基化位点提供了一个有用的策略,并可以有效地促进实验研究。然而,目前的方法的性能在预测能力在很大程度上依赖于手工制作的特性和模型的质量。...想进一步提高性能,需要广泛的领域知识来设计模型训练所需要的信息丰富的的手工特征。并且由于对4mC的研究有限,得到提取用来预测4mC位点的具有很强的鉴别能力的有效特征是十分具有挑战性的。...基于上述问题,本文提出了DeepTorrent (预测N4-甲基细胞嘧啶位点的深度学习方法),这是一个基于深度学习,从DNA序列数据预测4mC位点的计算框架。...在第一个卷积层中,使用三个不同卷积核大小的卷积块从编码矩阵中并行地来提取特征。

    83110

    【优选算法篇】微位至简,数之恢宏——解构 C++ 位运算中的理与美

    这种方法不仅适用于该题目,也是一种编写健壮的位运算代码的好习惯。 1.4 只出现一次的数字 II(medium) 题目链接:137....该位能区分两个缺失的数字,因为 a 和 b 在这一位上必然不同。 计算 diff 的方法为 diff = tmp & -tmp,它提取 tmp 的最低有效位。...: lowbit 方法可以快速获取一个整数的最低为 1 的比特位,确保我们能高效地将两个缺失数字分开处理。...确保正确处理 diff 位的计算和分组条件: diff = tmp & -tmp 提取了 tmp 的最低有效位(第一个不为 0 的位)。...从基础的字符判定到复杂的加法运算,位运算用简洁的方式诠释了算法的本质——那是一种近乎哲学的简约主义,以最小的构件描绘出最大的问题解决空间。

    9210

    重中之重的数据清洗该怎么做?

    例如,iphone手机9.9元,那可能是并夕夕带来的噪声。为了解决这个问题,可以基于数据的四分位数范围应用标准公式来识别异常值。为此,取代表第75百分位的数据,减去代表第25百分位的数据。...可以将其替换为静态值,也可以将其填充为统计平均值。 如果无法合理预测数据,那么最好的选择是将其从数据集中删除。通过这样做,可以确保只测试完全输入的数据。...为此,可以使用dropna()函数自动删除至少包含一个空值的任何列。 用正则表达式处理数据 清理数据最有效的方法之一就是使用正则表达式。...也许有一个包含文本字符串的列,如(“1年”、“5年”、“10年”)。你不能直接把它们转换成整数,但是你知道如果你能只提取数字,它们在关系建模中会更有用。...数据可读和可解析 如果不想学习如何使用正则表达式,或者只想删除几个特定的单词,那么还有其他方法可以清理数据,使其更适合于模型训练。使用replace函数可以找到目标数据,并将其替换为预期的数据。

    1K10

    每日学术速递11.18

    此外,它还提供了新功能:WAM 可以定位拼接图像中的水印区域,并从多个小区域(不大于图像表面的 10%)提取不同的 32 位消息,误差小于 1 位 256×256 图像。 这篇论文试图解决什么问题?...Add-it方法还可以扩展到逐步生成,允许用户从文本提示开始,然后逐步添加元素或对场景进行修改。 5....实验结果: WAM在不可见性和鲁棒性方面与现有最先进方法竞争,特别是在抵抗拼接和修复攻击方面表现出色。 WAM能够定位拼接图像中的水印区域,并从图像的小区域中提取不同的32位消息。 5....,一个开放的研究问题是 \textit{是否可以使用这些模型生成的图像来学习更好的视觉表示}。...提取服装描述:使用大型视觉-语言模型(LLaVA)和大型语言模型(LLaMA)从数据集中提取特定服装项目的文本描述,以用于文本引导的扩散模型。

    12010

    【C语言】16 位的值,通过几种不同的方式将其拆分为高 8 位和低 8 位

    当我们想要将一个16位的 Register_Value 拆分成高8位和低8位,并存储到 Send_Data_Uart5 数组中时,有几种常见的方法可以实现。...在内存中,它通常占用两个字节(16位),取值范围是从 0 到 65535(即 2^16 - 1)。...我们通过右移运算符 >> 将 Register_Value 向右移动 8 位,这样原来的高 8 位就移到了最低 8 位的位置。这个操作得到的结果就是 Register_Value 的高 8 位。...我们使用位与运算符 & 和掩码 0xFF(二进制 11111111)来保留 Register_Value 的最低 8 位,其余高位清零。...方法 4(内联函数或宏)适用于需要提高代码重用性和可读性的场景。方法 2(指针和强制类型转换)虽然有效,但不推荐,因为它可能会引入平台依赖性和对齐问题。

    19710

    图解数据分析 | 数据清洗与预处理

    不能想当然地认为数据是有效的。 在现实世界中,数据一般都是异构的、有缺失的、有量纲的。有些数据是从多个不同的数据源中获取的,这些异构数据,在各自的系统中都是正确无误的,只不过很有“个性”。...有些数据中包含大量重复的数据、缺失的数据、或者离群的数据,在开始分析数据之前,必须好好检查数据是否有效,并对数据做预处理操作。 判断离群数值,并对其分析,有时会导致重大发现的产生。...异常值分析是检验数据中是否存在不合常理的数据,在数据分析中,既不能忽视异常值的存在,也不能简单地把异常值从数据分析中剔除。重视异常值的出现,分析其产生的原因,常常成为发现新问题进而改进决策的契机。...2.1 离群点检测 数据分析的数学基础 (1)描述性分析方法 在数据处理过程中,可以对数据做一个描述性分析,进而查看哪些数据是不合理的。...常用的统计量是最大值和最小值,用来判断变量的取值是否超出了合理的范围。例如,客户年龄的最大值是199,该值存在异常。

    1.2K61

    测试新人如何编写测试用例

    (子集),然后从每一个子集中选取少数具有代表性的数据作为测试用例。...例如: 我们要测试一个用户名是否合法,用户名的定义:8位数字组成的字符。 我们可以先划分子集:空用户名,1-7位数字,8位数字,9位或以上数字,非数字。...然后从每个子集选出若干个有代表性的值: 空用户名:“” (无效等价类实例,指对于软件规格说明而言,没有意义的、不合理的输入) 1-7位数字:"234" (无效等价类实例) 8位数字:"00000000"...(有效等价类实例,能检验程序是否实现了规格说明中所规定的功能和性能) 9位或以上数字:"1234567890" (无效等价类实例) 非数字:"abc&!!!"...5、正交分解法 从大量的(实验)数据(测试例)中挑选适量的,有代表性的点(例),从而合理地安排实验(测试)的一种科学实验设计方法。

    49410
    领券