package cn.itcast.spark.source import java.util.Properties import org.apache.spark.sql.types....CSV 格式数据文本文件数据 -> 依据 CSV文件首行是否是列名称,决定读取数据方式不一样的 /* CSV 格式数据: 每行数据各个字段使用逗号隔开 也可以指的是,每行数据各个字段使用...单一 分割符 隔开数据 */ // 方式一:首行是列名称,数据文件u.dat val dataframe: DataFrame = spark.read .format("csv"...) dataframe.printSchema() dataframe.show(10, truncate = false) // 方式二:首行不是列名,需要自定义Schema信息,数据文件...读取MySQL表中数据 // 第一、简洁版格式 /* def jdbc(url: String, table: String, properties: Properties): DataFrame
前言 处理vcf文件的时候,需要多种切割,正则匹配,如果要自己写其实会比较麻烦,并且每次还得根据vcf文件格式或者需要读取的值不同要修改相应的代码。...因此我写了这个通用的读vcf的类,直接复制粘贴这部分代码就可以方便的用这个类进行vcf文件的读取,过滤,写出等操作。...类,存储的是vcf的信息,及对vcf文件的操作,一个是Record类,它包括vcf某一行存储的全部信息 读入vcf文件 gatk_result = "realignment.vcf" gatk = VCF...一般是在后面用样本名表示的列) record.CHROM record.line record.ID #其他的属性同理 INFO的读取 这是vcf中INFO的原始表示 CONTQ=28;DP=38;ECNT...文件 snv = "filter.vcf" result = gatk.header for record in gatk: if record.FILTER == "PASS" and float
CvInvoke.WaitKey(0); //方式二 //Image img = new Image("aa.jpg");//从文件加载图片...("保存成功"); //方式二 //imageBox1.Image.Save(@"D:\new.jpg"); } 我使用了两种方式进行读取和保存
在实际工程中,经常会遇到要一起读取众多小文件的办法。本来正常情况下是进行文件夹的遍历。 幸运的是,spark原生是支持这种功能的。它可以批量地读取众多的文件,也可以按照一定的方式进行过滤。...如下: sc.textfile("/dir/*.txt") 其中DIR就是路径,而*.txt则是对某种类型的文件进行过滤。 通过这种方式,可以直接实现对众多小文件的快速读取。
参考 https://testerhome.com/topics/8554 这篇文章 jacoco生成coverage.ec 在/data/data/yourPackageName/files/ 下, 通过...adb pull 该目录,提示该文件不存在 因无Root 权限 需定义一下下coverage.ec 文件的存放路径 在该文章 JacocoInstrumentation 中设置存放coverage.ec...getContext().getFilesDir().getPath().toString() + "/coverage.ec"; 又设置了缺省路径,该路径导致定义的路径中不会生成coverage.ec文件..., 又无手机Root权限,进而导致无法获取该文件,删除改行代码 后即可 在定义的路径下 生成Coverage.ec文件 再通过 命令 adb pull /mnt/sdcard/coverage.ec
ini是啥 ---- 你可以理解为就是一个配置文件的统称吧。比如test.conf,这样的你可以理解为他就是ini文件,里面一般存放一些配置信息。比如数据库的基本信息,一会我们进行讲解!...就是把一些配置信息提出去来进行单独管理,如果以后有变动只需改配置文件,无需修改代码。...ini中的基本格式 ---- [名称,根据实际情况写就行,没啥讲究] key1=value1 key2=value2 python中通过ConfigParser模块来进行读取操作 实战 ---- 演示场景...db = testdb charset = utf8 2、在python中读取信息并连接数据库,代码如下: import configparser import mysql.connector class...GetDB: def __init__(self, db_config): config = configparser.ConfigParser() config.read(db_config) #把配置文件里的数据读取出来并保存
假如你使用如下所示的代码,进行GitHub网站的文件读取: readr::read_csv('https://raw.githubusercontent.com/rfordatascience/tidytuesday...你需要对这个链接有一个基础认识: rfordatascience 用户名 tidytuesday 仓库名 master 分支名 data/2020/2020-07-28/penguins.csv 文件名及其路径...你之所以无法访问,就是因为 这个 https://raw.githubusercontent.com/ 网页前缀并不是很适合你。...,当然,这个时候你的R语言读取它也不是问题。...生信分析人员如何系统入门Linux(2019更新版)》 把R的知识点路线图搞定,如下: 了解常量和变量概念 加减乘除等运算(计算器) 多种数据类型(数值,字符,逻辑,因子) 多种数据结构(向量,矩阵,数组,数据框,列表) 文件读取和写出
在正常调用过程中,难免需要对多个文件夹下的多个文件进行读取,然而之前只是明确了spark具备读取多个文件的能力。...针对多个文件夹下的多个文件,以前的做法是先进行文件夹的遍历,然后再进行各个文件夹目录的读取。 今天在做测试的时候,居然发现spark原生就支持这样的能力。 原理也非常简单,就是textFile功能。...编写这样的代码,读取上次输出的多个结果,由于RDD保存结果都是保存为一个文件夹。而多个相关联RDD的结果就是多个文件夹。...通过如下代码: //## read all files(files in different directorys) val alldata = sc.textFile("data.../Flag/*/part-*") println(alldata.count()) 经过测试,可以实现对多个相关联RDD保存结果的一次性读取。
问题导读 1.spark2 sql如何读取json文件? 2.spark2读取json格式文件有什么要求? 3.spark2是如何处理对于带有表名信息的json文件的?...然而我们在使用spark读取的时候却遇到点小问题。...上面内容保存为文件people.json,然后上传到hdfs的跟路径,进入spark-shell,读取json文件 [Scala] 纯文本查看 复制代码 ?...个人认为这是spark不太好的地方,应该可以改进。这里也可以自动读取为表名或则忽略,而不是默认为一个字段名称。 既然目前spark是这么做,那么我们该如何做,才能让spark正确的读取?...从上面我们看出spark对于json文件,不是什么格式都是可以的,需要做一定的修改,才能正确读取,相信以后spark会有所改进。
前言 如果在spark-shell中使用textFile(“file://path”)演示,在local模式下是没有问题的,因为毕竟就是在本机运行,读取本地的文件。...但是如果spark-shell --master指定spark集群的话,这样运行就会有问题,会报找不到文件的错误。...解决方案 那么解决的方案其实也比较简单,就是在所有的集群节点上相同的path下上传该文件。然后在textFile(“file://{path}”)中指定该path即可。...注意: 各个节点的文件必须相同,否则依然会报错。 后话 博主的所有博文已经准备迁移到个人博客-桥路’s blog上,后续也会主要更新个人博客,如果大家需要可以去blog上多交流!感谢大家!
HBase时,编写的代码无法完成编译,在编译的过程中提示如下错误: Error:scalac: missing or invalid dependency detected while loading...JIRA中找到在代码中引用了HBaseContext时,使用Spark2编译Spark应用程序将会失败,因为HBaseContext模块引用了org.apache.spark.Logging。...2.在org.apache.spark包下创建一个Trait类型的Logging.scala类型,该类的内容通过Spark2源码找到 ?...将spark-core工程下org.apache.spark.internal.Logging类内容拷贝至我们工程下创建的org.apache.spark.Logging类中。 ?...4 总结 1.通过异常分析,由于Logging类在Spark2中私有化了,那在自己的工程中创建重写一个Logging类方式解决该问题。
服务器管理员对设备进行重启后发现无法进入系统,需要对服务器内的数据进行恢复。 三、分析服务器磁盘底层数据 服务器管理员对所有硬盘进行扇区级镜像后将镜像文件送到北京北亚数据恢复中心进行数据恢复。...以此进行故障现场模拟:三组RAIDZ内第一二组分别出现离线盘,热备盘及时进行替换;热备盘无冗余状态下第一组出现一块离线盘,第二组出现两块离线盘,ZPOOL进入高负荷状态(每次读取数据都需要进行校验得到正确数据...这种特性使得RAIDZ缺盘时无法直接进行校验得到数据,必须将整个ZPOOL作为一个整体进行解析。...六、编写数据提取程序并运行 经过仔细分析,发现在此存储中的ZFS版本与开源版本有较大差别,无法使用公司原先开发的解析程序进行解析,所以重新编写了数据提取程序。...图片3_副本.png 由于磁盘组内缺盘个数较多,每个IO流都需要通过校验得到,提取进度极为缓慢。
当机械硬盘插入电脑中时,如果示“文件或目录损坏且无法读取”的信息时,我们首先需要对机械硬盘进行目录修复操作。插入待修复的机械硬盘,打开“我的电脑”,找到机械硬盘所在的盘符。...文件或目录损坏且无法读取的恢复方法 图片 工具/软件:WishRecy 步骤1:先下载并解压程序运行后,选中需要恢复的盘,然后点《开始恢复》按钮 图片 步骤2:程序扫描到文件后,会放到与要恢复盘同名的目录中...图片 步骤3:打钩所有需要恢复的数据,然后点右上角的《另存为》按钮,将打钩的文件COPY出来。...图片 步骤4:等待程序将文件COPY完毕就可以了 。 图片 注意事项1:想要恢复文件或目录损坏且无法读取需要注意,一定要先找到资料再格式化。...注意事项2:文件或目录损坏且无法读取找到出来的资料需要暂时保存到其它盘里
当我想去访问另外一个层级的文件时,可以看到因为他将路径定义到了pachong这个路径下,所以他是怎么也查不到当前我要的文件的。 ? 将工作路径修改成如下 ?...这样文件就能正常读取了。 ?
服务器管理员对设备进行重启后发现无法进入系统,需要对服务器内的数据进行恢复。 三、分析服务器磁盘底层数据 服务器管理员对所有硬盘进行扇区级镜像后将镜像文件送到数据恢复中心进行数据恢复。...以此进行故障现场模拟:三组RAIDZ内第一二组分别出现离线盘,热备盘及时进行替换;热备盘无冗余状态下第一组出现一块离线盘,第二组出现两块离线盘,ZPOOL进入高负荷状态(每次读取数据都需要进行校验得到正确数据...这种特性使得RAIDZ缺盘时无法直接进行校验得到数据,必须将整个ZPOOL作为一个整体进行解析。...六、编写数据提取程序并运行 经过仔细分析,发现在此存储中的ZFS版本与开源版本有较大差别,无法使用公司原先开发的解析程序进行解析,所以重新编写了数据提取程序。...服务器数据恢复成功案例,北亚数据恢复中心3.png 由于磁盘组内缺盘个数较多,每个IO流都需要通过校验得到,提取进度极为缓慢。
常见的日志文件权限问题及解决方案2.1 日志文件权限过严问题:日志文件权限设置过严,导致普通用户无法读取。解决方案:调整日志文件权限,确保需要访问日志的用户有适当的权限。...解决方案:调整日志文件权限,确保只有授权用户可以读取。...adm 组的用户可以读取日志文件:sudo chmod 640 /var/log/syslog sudo chown root:adm /var/log/syslog2.3 日志文件目录权限设置不当问题...:日志文件目录权限设置不当,导致无法创建或读取日志文件。...,导致后续无法读取。
文件系统错误:存储设备上的文件系统发生错误,导致操作系统无法正确识别和访问文件或目录。病毒攻击:恶意软件或病毒攻击存储设备,破坏文件或目录结构,使其无法读取。...突然断电:在文件传输或写入过程中突然断电,可能导致文件或目录损坏且无法读取。人为误操作:误删除、格式化等操作可能导致重要文件或目录丢失,且无法恢复。...分区表损坏:存储设备的分区表损坏,导致操作系统无法正确识别分区,从而无法访问文件或目录。跨文件系统操作:在不同文件系统之间进行文件传输或操作,可能导致文件或目录损坏且无法读取。...文件权限问题:文件或目录权限设置错误,导致无法读取。存储空间不足:存储设备存储空间不足,可能导致文件写入失败,从而损坏文件或目录。...文件或目录损坏且无法读取恢复步骤如下:文件或目录损坏且无法读取恢复工具:数之寻软件【恢复步骤1】:下载并打开恢复软件,在软件中选择需要恢复的盘,再点《开始恢复》,软件会扫描这个盘的数据。
文件或目录损坏且无法读取。 不要太担心是出现了磁盘坏道,也许只是小小的存储问题。解决方法很简单,用chsdsk命令即可。...filename 仅用于 FAT/FAT32: 指定要检查是否有碎片的文件 /F 修复磁盘上的错误。 /V 在 FAT/FAT32 上: 显示磁盘上每个文件的完整路径和名称。...将日志文件大小改成指定的 KB 数。如果没有指定大小,则显示当前的大小。 /X 如果必要,强制卷先卸下。...数据丢失原因分析 出现这种错误提示,是由于各种原因导致的磁盘文件目录(FAT,MFT)出错造成。...恢复效果质量 如果是大移动硬盘并且是NTFS分区格式的,恢复质量十分理想,基本都能成功恢复文件和目录结构。
项目打包成 jar后包无法读取src/main/resources下文件 一、项目场景 二、问题描述 发现问题 分析问题 为什么使用 ClassPathResource 后, 可以找到打包后的文件路径?...三、解决方案 方案一 方案二 意外出现 总结 一、项目场景 在项目中读取文件时, 使用new File() 出现的一个坑以及解决流程 这种问题不仅在本地文件读取时会遇到, 而且在下载项目下 (例如:...java.io.FileNotFoundException: File 'holiday.txt' does not exist 即: 在打包后, 一开始配置的路径src/main/resources下无法找到该文件..., 然后读取这个临时文件 这种方式缺点是: 需要创建临时文件, 如果待读取文件过大, 则重新创建文件和复制操作会消耗一定的空间和时间, 影响性能 //方式二 利用FileUtils将ClassPathResource.getInputStream...核心和上面问题分析差不多, 基本上都是通过类加载器来获取资源文件的输入流进而找到这个文件
去掉distinct后,expand 操作就会被合并到Job 1 中,这样以来我们只要在读取文件时增加task, 让每个task处理更少的数据,就能提高效率。...3、解决办法及遇到的问题 该怎么提高读取文件的并行度呢? 基础表 table_a 存储格式为parquet,我们首先要了解spark sql 是怎么来处理parquet文件的。...3.1 spark sql分区方式(parquet) spark 通过FileSourceScanExec 来处理hdfs文件: /** 基础表table_a不为分桶表,读取数据的分区方式走此方法*/...如果想要增加分区,即task 数量,就要降低最终分片 maxSplitBytes的值,可以通过降低spark.sql.files.maxPartitionBytes 的值来降低 maxSplitBytes...读取hdfs文件时,并行了22个task,并且每个task处理数据均匀。 ? 2分40秒就能完成,有没有棒棒哒?
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