无法在docker镜像中安装R包 - 腾讯云开发者社区

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在Docker镜像中安装ChromeDriver

最近由于自动化测试需要，要在docker里面安装chromedriver。Docker是基于python3.8.10的，安装也比较简单。...修改docker的源下载chrome wget -q https://dl.google.com/linux/direct/google-chrome-stable\_current\_amd64.deb...安装chrome apt-get install ..../google-chrome-stable\_current\_amd64.deb -y 如果安装chrome出错，可以试一下以下命令安装： apt-get --fix-broken install ....selenium的pip包 pip install selenium 测试代码 from selenium import webdriver options = webdriver.ChromeOptions

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BiocManager无法安装R包

但是今天有一个学员起初是下载R包无法联网，所以失败，根据我们的经验当然是options(download.file.method = 'libcurl')就轻轻松松解决啦，不过这次居然是仅仅是解决了R自带...R包下载问题，使用BiocManager仍然是无法安装R包，如下所示： ?...其实真正的问题还是在联网上面！也就是说options(download.file.method = 'libcurl')并没有完全解决问题。...='libcurl') 果然，现在在Windows电脑里面R语言的安装R包和下载文件就OK啦。...接下来就继续安装R包吧使用管理员打开R哦，然后就 options()$repos options()$BioC_mirror options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn

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在 Gitlab 中构建 Docker 镜像

如何在以 Pod 形式运行的 Runner 中构建镜像并完成推送。跨 Runner 的文件共享 Gitlab 提供了两种方式的文件共享方式，用于在不同 Runner 之间传递文件。...Cache：用于在构建过程中传递一些中间文件，无需长久保存，例如下载的依赖文件。 Artifact：构建过程生成的交付目标，需要保存一定时间，例如生成的 JAR、测试报告等交付文件。...在构建环节中简单加入这一字段即可，例如： jar: stage: build tags: - maven script: - mvn package artifacts: paths: - target...这里生成的 JAR 文件将在后续用来构建 Docker 镜像。在 Pod 内构建 Docker 镜像 Docker 提供了一个 dind 镜像，意思就是“Docker in Docker”。...要使用 IMG，首先需要运行它的 Runner，这里偷懒使用 Alpine 镜像，后续在 CI 脚本中直接安装 IMG： #!

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解决Docker中ubuntu镜像安装MySQL

****前言**** 今天实在时有空，了解过MySQL主从复制，虽然很简单，但是也要配置配置测试测试，想要至少两台的MySQL服务器，然而第一方法想到的就是Docker跑ubuntu容器，在ubuntu...里面安装MySQL服务，虽然也可以使用腾云云服务器，我偏偏就是不干，就是想学习掌握Docker应用，其实我在32位主机玩Docker也是一种折腾。...0ubuntu0.14.04.1_i386.deb E: Sub-process /usr/bin/dpkg returned an error code (1) 在网络上，同样的问题，相同的方案，我的却不能解决，我还以为是Docker...sudo rm /var/lib/mysql/ -R sudo rm /etc/mysql/ -R sudo apt-get autoremove mysql* --purge sudo apt-get

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在MAC系统下安装Docker、Dify以及docker镜像加速

在MAC系统下安装Docker、Dify 1.Docker安装桌面左上角-关于本机 1.1 交互式安装使用页面顶部的下载按钮或从发行说明中下载安装程序。...双击Docker.dmg打开安装程序，然后将 Docker 图标拖到应用程序文件夹中。默认情况下，Docker Desktop 安装在/Applications/Docker.app。...1.2 从命令行安装 Docker.dmg从页面顶部的下载按钮或发行说明下载后，在终端中运行以下命令在应用程序文件夹中安装 Docker Desktop： sudo hdiutil attach Docker.dmg...–allowed-org=：运行应用程序时要求用户登录并成为指定 Docker Hub 组织的一部分 –user=：在安装过程中执行一次特权配置。这样用户就无需在首次运行时授予 root 权限。...Docker镜像设置为 Docker 虚拟机（VM）至少分配 2 个虚拟 CPU(vCPU) 和 8GB 初始内存，否则安装可能会失败。

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在docker中安装phpmyadmin

方法很简单，也不用改配置文件什么的，只需要几行命令：拉取phpmyadmin镜像 sudo docker pull phpmyadmin 运行镜像其中，PMA_HOST和PMA_PORT填写的内容是...MySQL数据库的地址和端口号 sudo docker run --restart=always -d --name myadmin -e PMA_HOST=172.17.0.1 -e PMA_PORT...=49153 -p 20888:80 phpmyadmin 然后phpmyadmin就成功运行在了本机的20888端口，在浏览器中输入localhost:20888就能访问了。

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「R」Windows R 安装包显示无法锁定目录怎么搞？

今天笔记本电脑装包反反复复出现下面错误： Error in install.packages : ERROR: failed to lock directory ‘D:\Tool\R_Library’...for modifying Try removing ‘D:\Tool\R_Library/00LOCK’ 尝试下解决方案： install.packages("Rcpp", dependencies...= TRUE, INSTALL_opts = '--no-lock') 把 Rcpp 改成要装的包名。...不行的话把报错文件删了： unlink("D:/Tool/R_Library/00LOCK", recursive = TRUE) 参考：https://stackoverflow.com/questions.../questions/14382209/r-install-packages-returns-failed-to-create-lock-directory

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Docker容器——在Ubuntu中安装Docker

Docker容器——在Ubuntu中安装Docker 背景日常我们开发时，我们会遇到各种各样的奇奇怪怪的问题（踩坑o(╯□╰)o），这个常见问题系列就是我日常遇到的一些问题的记录文章系列，这里整理汇总后分享给大家...，让其还在深坑中的小伙伴有绳索能爬出来。...1、更新apt包索引并安装基础包 sudo apt-get update sudo apt-get install \ apt-transport-https \ ca-certificates.../docker.list > /dev/null 4、再次更新包索引，开始进行安装docker sudo apt-get update sudo apt-get install docker-ce docker-ce-cli...| https://download.docker.com/linux/ubuntu focal/stable amd64 Packages 2、安装指定版本替换下方命名中的<VERSION_STRING

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在Docker中安装MongoDB

1.版本选取访问mongodb的镜像仓库地址：https://hub.docker.com/_/mongo?...tab=tags&page=1 这里选取最新版本进行安装，如果想安装其他的可用版本，可以使用命令“docker search mongo”来查看 2.拉取最新版本镜像这里执行命令"sudo docker...pull mongo:latest" 拉取最新版的mongodb镜像文件等待镜像拉取完成后，通过命令"sudo docker images"查看下拉取的镜像，可以看到，已经成功拉取到了本地 3.开始运行...外部可以直接通过宿主机 ip:27017 访问到 mongo 的服务 -v 为设置容器的挂载目录，这里是将本机的“/data/mongo”目录挂载到容器中的/data/db中，作为 mongodb 的存储目录...--auth 也就是在之前的启动命令后面加上 --auth：需要密码才能访问容器服务此时强行访问，可以看到提示，没有授权这里我们在连接的地方指定一下账户密码再来查询，已经正确查询出来之前添加的用户信息

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ChAMP R包安装中的事故

ChAMP 包提供了完整的分析illumina甲基化芯片的pipeline, 和普通的Bioconductor 包的安装一样，代码只有简单的两行 source("http://bioconductor.org.../biocLite.R") biocLite("ChAMP") 我用的电脑是windows 操作系统，64位的R-3.4.3，安装过程中除了网速较慢，花费一点时间安装之外，并没有出现任何的问题。...(now), ...): 无法载入共享目标对象‘D:/work/R-3.4.3/library/mvtnorm/libs/x64/mvtnorm.dll’：: `已达到了DLL数目的上限......dll 文件就是windows操作系统下的动态链接库，在加载R包的过程中，如果这个R包有对应的动态链接库，那么就会加载进来。...解决方案就是设置环境变量R_MAX_NUM_DLLS, 不管是什么操作系统，R语言对应的环境变量都可以在.Renviron文件中进行设置。

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使用docker镜像测试UCSCXenaShiny在Linux下的安装

Ubuntu 直接使用rocker提供的r镜像。...docker pull r-ubuntu:18.04 https://github.com/rocker-org/rocker/tree/master/r-ubuntu[1] 启动和进入镜像： docker...run --name ubuntu -it rocker/r-ubuntu:18.04 /bin/bash 进入R，然后安装CRAN包的安装方式进行安装。...一些包安装失败： Warning messages: 1: In install.packages("UCSCXenaShiny") : installation of package ‘curl’...vi /root/.R/Makevars 在文件中加入内容： CXX11=/opt/rh/devtoolset-9/root/usr/bin/g++ -std=c++11 其他有意思的是我发现在安装后对容器大小进行查看

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【Docker】在Docker环境中安装Tomcat服务

文章目录一、什么是Tomcat❔ 二、Docker下安装Tomcat操作演示 1️⃣前期准备 2️⃣下载tomcat镜像 3️⃣启动tomcat 4️⃣测试访问报错 5️⃣修改配置参数 6️⃣重新测试访问...二、Docker下安装Tomcat操作演示 1️⃣前期准备 #检查docker是否安装完成。...docker 2️⃣下载tomcat镜像 # 搜索tomcat镜像 [root@docker ~]# docker search tomcat NAME...~]# # 默认下载官方最新tomcat镜像 [root@docker ~]# docker pull tomcat Using default tag: latest latest: Pulling.../library/tomcat:latest # 查看下载的tomcat镜像 [root@docker ~]# docker images REPOSITORY TAG IMAGE ID

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「R」ggplot2在R包开发中的使用

在撰写本文时，ggplot2涉及在CRAN上的超过2,000个包和其他地方的更多包！在包中使用ggplot2编程增加了几个约束，特别是如果你想将包提交给CRAN。...尤其是在R包中编程改变了从ggplot2引用函数的方式，以及在aes()和vars()中使用ggplot2的非标准求值的方式。...有时候在开发R包时为了保证正常运行，不得不将依赖包列入Depdens。...常规任务最佳实践使用ggplot2可视化一个对象 ggplot2在包中通常用于可视化对象（例如，在一个plot()-风格的函数中）。...如果没有，则会将主题对象存储在编译后的包的字节码中，而该字节码可能与安装的ggplot2不一致！

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在UBUNTU虚拟机上安装R软件包

安装某些软件包时可能会出现一些问题。一个窍门是打开终端然后使用sudo命令安装一些软件包，（输入密码后）。...apt-get install r-cran-plyr r-cran-xml r-cran-reshape r-cran-reshape2 r-cran-rmysqlsudo apt-get install...r-cran-rjavasudo apt-get install r-cran-glmnetsudo apt-get build-dep r-cran-bootsudo apt-get build-dep...r-cran-classsudo apt-get build-dep r-cran-clustersudo apt-get build-dep r-cran-codetoolssudo apt-get...apt-get build-dep 然后，在RStudio中，输入 install.packages("RCurl")install.packages("xml")install.packages("

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在Ubuntu下安装单细胞3大R包

查看Ubuntu系统以及R版本 cat /etc/issue 通常来说，很多R包的安装对R版本是有要求的，比如BiocManager需要 R (≥ 3.5.0)，但是并不需要最新版R语言。...会删除软件包而保留软件的配置文件r # apt-get purge 会同时清除软件包和软件的配置文件 #然后更新Ubuntu源文件 ## 这里，不同Ubuntu系统有点不一样： cat /etc/issue...r-base-core r-base-dev 使用sudo安装一些必备包这里只是举例，我比较常用的包，安装非常耗时，一般来说小半天就过去了。...安装我们的主角-3大R包从代码的角度来看，很简单： options()$repos options()$BioC_mirror options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn...web/packages/Seurat/index.html http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/monocle.html R包安装失败通常是

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基于 Alpine 的 Docker 镜像编译的程序无法在云函数环境运行

最近有一个用户反馈, 他使用 golang:1.13.1-alpine3.10 这个镜像来编译的可执行程序无法在云函数的环境运行, 报错信息如下: fork/exec /var/user/main: no...such file or directory 在 macOS 下编译则没有这个问题问题定位还未来得及定位问题, 用户便反馈说换了一个镜像就没问题了, 于是没能获得更多信息过了几天, 有一个同事在群里贴出了..., 看看结果有什么不同 $ docker run -v $PWD:/go/src/test -w /go/src/test golang:1.13.1-alpine3.10 go build -o main-alpine...interpreter: No such file or directory No such file or directory 正是本文一开始提到的出错信息 (完整的出错信息可通过使用 Go 的 os/exec 包启动...因而使用 golang:1.13.1-alpine3.10 这个镜像编译出来的程序如果依赖于 musl libc, 则会在程序加载的时候找不到所需的动态库解决问题的方法很简单, 只需将镜像换成 golang

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Bioconductor 中的 R 包安装教程(续一)

这是《Bioconductor 中的 R 包安装教程》的第二篇，完整的文章可以点击阅读原文查阅。...以 DiffBind 包为例，DiffBind==3.4.0 是基于 Bioconductor==3.14（对应 R-4.1）开发的；我们在 Bioconductor==3.13（对应 R-4.0）中执行...BiocInstaller 安装我们以在 R-3.4（Bioconductor==3.6）中安装最新版本的 clusterProfiler 为例。...在 Aanconda2 环境 R==3.4.3 中安装 clusterProfiler，发现package ‘clusterProfile’ is not available (for R version...），从而导致无法正常安装。

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docker在windows，centos中的安装

centos安装方式，采用阿里云的镜像和安装脚本或者到https://store.docker.com/search?...type=edition&offering=community下载相应系统的安装包安装 #安装docker客户端 curl -sSL http://acs-public-mirror.oss-cn-hangzhou.aliyuncs.com.../docker-engine/internet | sh - #配置加速镜像 sudo mkdir -p /etc/docker sudo tee /etc/docker/daemon.json 安装 https://store.docker.com/editions/community/docker-ce-desktop-windows 安装包下载，双击安装就完事了。...windows设置镜像地址

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【图文安装教程】在docker中安装ES

在docker中安装ES怎么安装？本文就教大家怎么安装 1.部署单点es 1.1.创建网络因为我们还需要部署kibana容器，因此需要让es和kibana容器互联。...这里先创建一个网络： docker network create es-net 1.2.加载镜像这里我们采用elasticsearch的7.12.1版本的镜像，这个镜像体积非常大，接近1G。...课前资料提供了镜像的tar包：大家将其上传到虚拟机中，然后运行命令加载即可：比如，凯哥将es.tar、kibana.tar先上传到宿主机的apps目录下，然后使用rz命令上传：上传后：图片...我们使用： docker load -i 文件 docker load -i /root/apps/es.tar 需要等待，带镜像加载完成后，会出现镜像信息。...安装完成之后，docker ps -a 图片看到es状态是UP的才可以。然后在浏览器中输入：http://宿主机id:9200 即可看到es的响应结果。如下图：

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Docker-Centos7安装Docker CE 及在Docker CE中安装RabbitMQ

文章目录 Docker版本说明 Docker安装前置条件 Step1. Set up the Repository Step2....Verify that Docker CE Docker CE中安装RabbitMQ Docker版本说明参考官网： https://docs.docker.com/release-notes/docker-engine...在 2017 年 3 月 2 日, docker 团队宣布企业版 Docker Enterprise Edition ( EE ) 发布....Verify that Docker CE 运行hello-world镜像来测试是否安装成功,本地没有镜像时会自动从docker hub中下载,当出现Hello from Docker!...CE中安装RabbitMQ Docke镜像官方下载地址： https://www.rabbitmq.com/download.html#docker 我们这里使用rabbitmq:3.7.8-management

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