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使用MICE进行缺失值的填充处理

它通过将待填充的数据集中的每个缺失值视为一个待估计的参数,然后使用其他观察到的变量进行预测。对于每个缺失值,通过从生成的多个填充数据集中随机选择一个值来进行填充。...填充 填充是一种简单且可能是最方便的方法。我们可以使用Scikit-learn库中的SimpleImputer进行简单的填充。...在每次迭代中,它将缺失值填充为估计的值,然后将完整的数据集用于下一次迭代,从而产生多个填充的数据集。 链式方程(Chained Equations):MICE使用链式方程的方法进行填充。...它将待填充的缺失值视为需要估计的参数,然后使用其他已知的变量作为预测变量,通过建立一系列的预测方程来进行填充。每个变量的填充都依赖于其他变量的估计值,形成一个链式的填充过程。...步骤: 初始化:首先,确定要使用的填充方法和参数,并对数据集进行初始化。 循环迭代:接下来,进行多次迭代。在每次迭代中,对每个缺失值进行填充,使用其他已知的变量来预测缺失值。

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R数据科学整洁之道:使用tidyr进行长宽数据转换

在实际工作中,存在长、宽两种数据格式,宽数据是每个样本的信息在表中只占一行,而长数据每个样本的信息在表中占据多行。 本文简单介绍一下通过tidyr包进行长、宽数据格式转换。...) 宽数据转长数据 让数据变长,就是将许多列融合成两列,将列名移动到一个新的列名下,将值移动到另一个新的列名下。...,其中一列提供新的列名,另一列提供值。...tidyr中的pivot_wider与pivot_longer的操作正好相反,可以将长数据转换为宽数据。...最后总结 tidyr包最重要的两个函数是: pivot_longer,将宽数据转换为长数据,就是将很多列变成两列。 pivot_wider,将长数据转换为宽数据,就是将两列变成很多列。

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    tidyverse

    背景 Tidyverse 是 Rstudio 公司推出的专门使用 R 进行数据分析的一整套工具集合,里面包括了readr,tidyr, dplyr,purrr,tibble,stringr...《R 数据科学》电子书:https://r4ds.had.co.nz/ tidyverse 包重构了 R 语言处理数据的语法,比默认的 R 函数更加方便,相当于一套新的语法,使用起来更加方便...目前最新的版本中主要提供 pivot_longer,pivot_wider 等函数。...数据的整理是一个从数据框的统计结构(变量与观察值)到形式结构(列与行)的映射。...tidyr 包主要就是用来将数据转换为“整洁数据”的包,主要功能为 1)缺失值的简单补齐 2)长形表变宽形表与宽形表变长形表; 1.2 长数据与宽数据 长数据 宽数据 1.3

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    R&Python Data Science 系列:数据处理(4)长宽格式数据转换

    平时数据分析的时候,无法保证导入的数据一定是什么格式,因此需要了解长宽格式数据之间如何相互转换。 1 何为长宽格式数据 ?...这里不能使用透视表pivot_table()函数,因为pivot_table()函数对value进行计算(求和、平均等),但这里Message列都是字符型的,无法进行计算;若value为数值型数据,可以使用...pivot_wider()library(tidyverse)library(dplyr)library(tidyr)long_data %>% pivot_wider(id_cols = Player...5 总结 Python中pandas库和dfply库中的函数都可以实现长宽格式数据相互转换;R语言中reshape2包和tidyr包中的函数都可以实现长宽格式数据之间相互转换,建议Python...中使用dfply库中函数,R中使用tidyr包中函数,因为key键和value值比较明确。

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    R语言之数据框的合并

    横向合并:cbind ( ) 要横向合并两个数据框,可以使用 cbind( ) 函数。用于合并的两个数据框必须拥有相同的行数,而且要以相同的顺序排列。这种合并通常用于向数据框中添加变量。...该数据集是关于药物吲哚美辛(indometacin)的药物代谢动力学数据,一共有 6 名试验对象,每名试验对象在连续的 8 小时内定时测定了血液中的药物浓度,共有 11 次的测定值。...v.names:这是一个字符串,表示要重塑的值变量的名称。在这种情况下,"conc"表示原始数据中的浓度变量。 idvar:这是一个字符串或向量,表示标识变量的名称或变量列表。...tidyr 包以一种比较简洁统一的格式实现数据长宽格式的转换,其中,函数 pivot_wider( ) 用于把长格式数据转换为宽格式,而函数 pivot_longer( ) 用于把宽格式数据转换为长格式...tidyr 包中的 gather() 和 spread() 同样可以用于长型、宽型数据类型转换,详见 Cookbook for R。

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    UseGalaxy.cn生信云|零代码使用Tiverse优雅地处理数据集

    ,帮助用户重新整理数据框中的观测顺序。...Dplyr Mutate create, modify, and delete columns mutate 函数用于添加新变量或修改现有变量,能够基于已有数据创建新的变量列,支持对数据框进行实时的变量操作和修改...Dplyr Slice select rows by position slice 函数用于按行数进行切片,能够从数据框中提取特定的行,支持根据行数或行号选择需要的行,也支持使用负数表示从末尾开始计算的行数...Tidyr Pivot Longer from wide pivot_longer 函数用于将宽格式数据转换为长格式数据,能够根据用户指定的列将数据框中的多个列整理成一对 “名-值” 对,便于进一步的分析和处理...Tidyr Pivot Wider from long pivot_wider 函数用于将长格式数据转换为宽格式数据,能够将数据框中的一列分成多个列,根据指定的列名进行展开,使得数据以更直观的宽格式形式呈现

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    R语言|数据清洗

    数据清洗是数据分析流程中必不可少的一步。清洗得当的数据是可靠分析的基础,而在R语言中,有许多强大而灵活的工具可以帮助我们高效完成数据清洗。...3. tidyr tidyr专注于整理数据,提供了诸如pivot_longer()、pivot_wider()等功能。 4. stringr stringr专注于字符串处理,适合清理文本数据。 5....其他工具 根据需求还可以使用lubridate处理日期时间数据,janitor快速清理变量名等。 TIPS 使用示例 缺失值处理:缺失值处理是数据清洗的第一步。可以选择删除、填充或插值的方法。...is.na(data) # 删除含有缺失值的行 data_clean % na.omit() # 使用均值填充缺失值 data_filled % mutate...30, 30, 35, 40) ) # 检测重复 duplicated(data) # 删除重复行 data_unique % distinct() 修正异常值:通过计算分位数或使用业务规则修正数据中的异常值

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    如何使用Excel将某几列有值的标题显示到新列中

    如果我们有好几列有内容,而我们希望在新列中将有内容的列的标题显示出来,那么我们怎么做呢? Excel - TEXTJOIN function 1....- - - - 4 - - - 在开始,我们曾经使用INDEX + MATCH的方式,但是没有成功,一直是N/A https://superuser.com/questions/1300246/if-cell-contains-value-then-column-header...所以我们后来改为TEXTJOIN函数,他可以显示值,也可以显示值的标题,还可以多个列有值的时候同时显示。...- - 4 - - - 15 Year 5 - - - - 5 - - - =TEXTJOIN(", ",TRUE,IF(ISNUMBER(B2:I2),$B$1:$I$1,"")) 如果是想要显示值,...则: =TEXTJOIN(", ",TRUE,IF(ISNUMBER(B2:I2),B2:I2,"")) 其中,ISNUMBER(B2:I2)是判断值是不是数字,可以根据情况改成是不是空白ISBLANK

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    Excel技巧:使用上方单元格的值填充空单元格

    如下图1所示,在列A中有一些空单元格,如果对列A进行筛选,则只会出现有内容的单元格数据,因此空白单元格需要使用其上方单元格的内容填充。...图1 首先,选择包含空单元格的列,单击功能区“开始”选项卡“编辑”组中的“查找和选择——定位条件”,在弹出的“定位条件”对话框中勾选“空值”前的单选按钮。...然后,输入=号,按向上箭头键选择上方单元格,再按Ctrl+回车键,在所有被选择的单元格中输入公式。 最后,选择列A,复制数据,然后在所选列中单击右键,选择“粘贴值”命令。...完整的操作过程如下图2所示。 图2 如果你经常遇到填充空单元格的操作,那么可以使用宏来代替手工操作。...lngCol).EntireColumn .Value = .Value End With End With End Sub 在运行这个宏之前,使当前单元格位于要填充空白单元格的列中

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    Windows中VS code无法查看C++ STL容器的值

    Windows中VS code debug时无法查看C++ STL容器内容 本文阅读重点 < 1 Windows中VS code debug时无法查看C++ STL容器内容 1.1 而我相应的配置文件如下...我发现一个有效的解决方法,但在x64版本的Windows上安装MinGW时,虽然官方推荐MinGW版本的是x86_64的,但实践后发现如果选择安装 x86_64的, 很可能Debug时会无法看到STL容器...(vecotr、map等)的具体信息,看到的是相应的内存地址~ 故建议选 i686 (win32)的,然后安装步骤的下一步及后面的操作都按默认的来就好。...最后的效果: win32 版本的 MinGW官方下载地址: i686-posix-dwarf 我从这里下载到 MinGW 压缩包,然后解压到文件夹 D:\MinGW 中,接下来把MinGW的bin目录...,即 D:\MinGW\i686-8.1.0-release-posix-dwarf-rt_v6-rev0\mingw32\bin 加到了系统变量的 PATH 中。

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    小案例:结果缓存无法使用,RESULT_CACHE_MAX_SIZE值无法更改的问题

    最近遇到了一个 RESULT_CACHE_MAX_SIZE 参数值无法更改的问题。 首先我们需要知道 RESULT_CACHE_MAX_SIZE 是什么。...RESULT_CACHE_MAX_SIZE 是结果缓存能够使用sga内存的最大大小的限制参数。 当我们需要使用结果缓存的时候,这个值一定不能是0。并且以下的查询结果是 ENABLED ....DBMS_RESULT_CACHE.STATUS() -------------------------------------------------------------------------------- ENABLED 这个参数的默认值依存于...可以使用如下方法恢复。 给shared_pool_size一个最小值。保证结果缓存可以拿到内存空间。...就可以解决无法使用结果缓存和无法修改RESULT_CACHE_MAX_SIZE参数值的问题了。

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    R 数据整理(七:使用tidyr和dplyr处理数据框 2.0)

    我们可以使用tidyverse 系统来操作,其中包括了magrittr 包,readr 包,dplyr 包和 tidyr 包等。...,后续的参数是条件,这些条件是需要同时满足的,另外,条件中取 缺失值的观测自动放弃,这一点与直接在数据框的行下标中用逻辑下标有所不同,逻辑下标中有缺失值会在结果中 产生缺失值。...2.8 mutate 可以为数据框计算新变量,返回含有新变量以及原变量的新数据框: mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width) > head(test,...对于待分离的对象(col),不必加上引号;但对于即将创建的新列(into),需要使用引号,由于是两列,这里使用向量创建。sep参数设定读取表格信息时以何符号作为分隔符。...对于即将合并的新列,需要使用引号;但对于想要合并的多个列名,可以不用使用引号。sep 参数设定多列合并后不同数据分隔使用的分割符。

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    表达矩阵转换为数据框画图

    主要介绍使用pivot_longer进行长宽数据转换,这两个函数都是来自于tidyr包 问题背景 现在有一个表达矩阵,要画箱线图 但是,上面表格不满足向ggplot2画箱线图的函数传递参数的需求,要变换成数据框把所有数字变成一列传递给...rownames(exp) = paste0("gene",1:3) colnames(exp) = paste0("test",1:6) exp[,1:3] = exp[,1:3]+1 exp library(tidyr...变成数据框 rownames_to_column() %>% # 行名变成一列 mutate(group = rep(c("control","treat"),each = 3)) # 按test的分组新加一列分组...values_to = "count") 生信技能树 注意:以下情况都可以解决 列名是字符型数据 列名中含有数值型数据,可以names_prefix/names_transform提取,可以用readr包中的...parse_number()函数直接解析 列名中含有多个变量可以用正则表达式拆分成多列 一行有多个观测 列名有重复 详见使用pivot_longer和pivot_wider进行长宽数据转换-CSDN博客

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    tidyverse数据清洗案例详解

    一旦你有了整洁的数据和一些包提供的整洁工具,您将花费很少时间将数据从一种表示转换到另一种,从而可以将更多的时间花在分析问题上。 本文将为您提供整理数据的实用介绍以及tidyr包中附带的工具。...我们知道单元格代表案件数,因此我们将变量数存储在cases中,并用na.rm去除含有缺失值的行。这里使用pivot_longer()将数据变长,具体见后面函数详情。...对key进行计数,我们可以得到一些有关值结构的提示: who1 %>% count(key) ? 其中key的具体含义,查阅可得: 每列的前三个字母:新、旧病例。 之后两个字母:结核的类型。...例子如上面例子:将new_sp_m014到newrel_f65之间的列选取,汇总到key列名中,值存在cases列名中,并将含有缺失值的行进行删除。...我们将数据变宽,将year变为列名,对应在return中的数据进行填充。

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