两个分组非常明显的差异 右边的层次聚类也是如此,说明我们的normal和npc两个分组非常明显的差异 ?...诚然,有上面那样清晰可见的差异,这样的结果当然让人happy,但并不意味着所有的实验设计的结果都应该如此, 任何差异都应该是可以解释的,上图的normal和npc两个分组样本本来就是截然不同,它们的差异也就合情合理啦...然后,文章就使用这样的表达矩阵和分组信息,去找差异基因了,找毒品上瘾与否不同组的人的差异表达基因,毫无疑问,这样的差异分析,即使把阈值调的再低,也没多少统计学显著性的基因能被找出来的。 ?...实际上,这样的分析明显是有问题的, 既然不同的人差异这么大,理论上就可以把人当做是一个批次效应,使用北京大学李程课题组开发的sva包的combat函数,把这样的效应去除一下,接着再找差异。...那个才更有可能是毒品上瘾与否的差异啊!
在肿瘤研究中,寻找差异表达(上下调)基因是一个常见的步骤,用于识别在肿瘤组织与正常组织之间表达量发生显著变化的基因。...一个文章的差异分析课题思路是: 数据获取: 利用高通量测序技术(如RNA-seq)或微阵列技术获取肿瘤组织和正常组织的基因表达数据。...差异表达分析: 使用统计软件包(如DESeq2、edgeR、limma等)进行差异表达分析,这些工具可以处理计数数据并估计基因表达量的变化。...验证: 通过独立数据集或实验(如qPCR、Western blot等)验证差异表达基因的结果。 检查差异表达基因是否与已知的肿瘤生物学特性相符。...生物信息学分析: 对差异表达基因进行网络分析,如蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,以识别关键的调控基因和信号通路。 利用生存分析等方法评估差异表达基因与临床结果(如生存率、预后)之间的关系。
我在生信技能树的早期教程:《你确定你的差异基因找对了吗?》...和npc两个分组非常明显的差异 右边的层次聚类也是如此,说明我们的normal和npc两个分组非常明显的差异 如果分组在3张图里面体现不出来,实际上后续差异分析是有风险的。...数据库下载得到表达矩阵 一文就够 GSEA分析一文就够(单机版+R语言版) 根据分组信息做差异分析- 这个一文不够的 但是因为数据挖掘的核心是缩小目标基因,所以大家越来越喜欢强行找差异。...现在比较流行的Olink蛋白质组技术,就恰好符合这两个策略,首先它是人工选择了几百个或者几千个有明确功能的蛋白质进行检测,其次它在很多研究里面其实是在强行找差异,比如2024年3月的文章:《Serum...image-20240309192145821 生信技能树的早期教程:《你确定你的差异基因找对了吗?》提到过,如果是表达量矩阵,就必须要有三张图,但是这个文章就没有。
近日有粉丝就咨询我他们文献里面的CNV是如何进行拷贝数全景图聚类分群找差异。...多个CNV的比较的表格展示数值差异 在 Table S8, related to Figure 3....表格展示数值差异 除了上面的 Log2 copy number ratio values across CNA subtypes,还有 CNA frequency in each subtype 的差异...多个CNV的比较的波峰图展示差异 其实有比表格更好的展现方式: ? 波峰图展示差异 如果是比较两个亚群的CNV全景图 可以使用下面的图: ?...分群后具体的每个亚群的bed格式的CNV信息文件,又可以走一下GISTIC2的流程重新拿到各自的CNV全景图,如何读入maftools,就可以做另外的波峰图展示差异。
一般情况请注意别先删除了选中行,又去使用。那就会导致找不到选中行。。。。。哥犯了这个错误。。。..., MessageBoxDefaultButton.Button1) == DialogResult.OK) { //获得选择的序列号...lstwlview.Items[c[1]].Text; //ss = lstwlview.Items[c[0]].SubItems[1].Text;// 表示选中行的第二列
我在生信技能树的教程:《你确定你的差异基因找对了吗?》...和npc两个分组非常明显的差异 右边的层次聚类也是如此,说明我们的normal和npc两个分组非常明显的差异 如果分组在3张图里面体现不出来,实际上后续差异分析是有风险的。...生存分析和差异分析的关键是分组 在肿瘤学研究里面,就是对癌症患者的样本根据某个临床特征或者某些分子的特性来进行分组。...我前面提到过很多次,这样的混杂,其实对你差异分析的结果具有干扰,会影响我们对差异分析结果的生物学解释。...但是很多文章就喜欢取巧,针对性看top200的差异基因那么两个分组还是可以比较明显,如下: ? 针对显著的差异进行进行热图可视化 火山图看起来也会是很正常: ?
pivot 与 unpivot 函数是SQL2005新提供的2个函数,PIVOT 通过将表达式某一列中的唯一值转换为输出中的多个列来旋转表值表达式,并在必要时对最终输出中所需的任何其余列值执行聚合。...下面我通过PIVOT 来阐述整个函数的使用: 语法: SELECT 的列>, [第一个透视的列] AS , [第二个透视的列] AS , ......[最后一个透视的列] AS , FROM(的 SELECT 查询>) AS 的别名> PIVOT( (的列>) FOR [的值的列>]...将与 PIVOT 执行几乎完全相反的操作,将列转换为行,但是也不是完全的相同,PIVOT 会执行一次聚合,从而将多个可能的行合并为输出中的单个行。...另外,UNPIVOT 的输入中的空值不会显示在输出中,而在执行 PIVOT 操作之前,输入中可能有原始的空值。 3.动态处理和静态处理不一样的地方在于列转行的数量。
题目描述 依次输出列表中所有的偶数。题中有一个包含数字的列表 [10, 39, 13, 48, 32, 18, 3, 204, 592, 11],使用 for 循环依次输出这个列表中所有的偶数。...示例 示例 ① 输出: 10 48 32 18 204 592 输出描述 输出列表中所有的偶数。...代码讲解 下面是本题的代码: # 描述: 依次输出列表中所有的偶数 # 输入: 无输入 # 输出: 输出列表中所有的偶数 # 数字列表 numbers = [10, 39, 13, 48, 32, 18...print(num) 这样,程序会使用 for 循环遍历列表,并输出列表中所有的偶数。 相关知识点 这个Python编程习题涉及了以下主要知识点: 列表: 创建和使用包含数字的列表。...print(num) 这个习题适合初学者,因为它涵盖了Python编程的基础知识,包括列表、for循环、条件判断以及输出。帮助学习者理解如何使用循环输出列表中的偶数。
pivot 与 unpivot 函数是SQL2005新提供的2个函数,PIVOT 通过将表达式某一列中的唯一值转换为输出中的多个列来旋转表值表达式,并在必要时对最终输出中所需的任何其余列值执行聚合。...下面我通过PIVOT 来阐述整个函数的使用: 语法: SELECT 的列>, [第一个透视的列] AS , [第二个透视的列] AS , … [最后一个透视的列...] AS , FROM(的 SELECT 查询>) AS 的别名> PIVOT( (的列>) FOR [的值的列>] IN ( [第一个透视的列...将与 PIVOT 执行几乎完全相反的操作,将列转换为行,但是也不是完全的相同,PIVOT 会执行一次聚合,从而将多个可能的行合并为输出中的单个行。...另外,UNPIVOT 的输入中的空值不会显示在输出中,而在执行 PIVOT 操作之前,输入中可能有原始的空值。 3.动态处理和静态处理不一样的地方在于列转行的数量。
1B46-5AFCDF8A943D', 'TotalCount': 16} y_list = x['RegionSet'] #y_list是一个list,其中每个元素包含地域信息,每个元素又是单独的一个
正片开始 easypoi链接: EasyPoi官方文档 我们使用的注解版的导出 @Excel,官方文档中说明很详细,默认大家都会用,不会用的,copy一下官网的,跑一下,调一下就行了。...这样所有导出都没有学生列,但是如果教师(TC)(你们可怕的班主任或者往上的教导主任)导出时时可以看到年龄信息的。...——百度百科 根据反射我们可以拿到一个类的所有属性和方法,同理,注解也是一个类,也是可以拿到它的属性和方法,拿到之后就好办了,直接修改它的默认值,然后根据每个角色调整,就可以达到一个类实现动态导出的目的...以上面 TestExcle 为例: 先创建一个工具类,传入TestExcle对象,获取注解值,并修改: /** * 动态显示Excel导出列 * * @param * @author ...java.lang.reflect.InvocationHandler; import java.lang.reflect.Proxy; import java.util.Map; /** * 动态显示Excel导出列
iOS开发中行高灵活可变的UITableView的性能优化 一、UITableView的构建原理 在新闻类,电商类等应用中,应用着大量的图文混排视图,在表视图UITableView中,...上面列举的5中拉取cell高度的场景中,TableView配置部分只会在TableView第一次展现在屏幕上时出现,但是其拉取的是所有行的行高数据,如果表视图有100行或者更多,这将是一个十分耗费性能的过程...当执行TableView的reloadData方法进行界面刷新时,系统先会把所有行的行高数据拉取一遍,之后和UITableViewCell配置部分的场景一直,会拉取即将出现在屏幕上的cell的行高数据。...在开发中通常会遇到一些十分复杂的界面,而这些界面中cell的高度都是需要通过请求到的数据动态改变的,每个cell都要写复杂的尺寸计算代码十分令人心烦。...那么现在问题来了,如何才能让cell正确计算自己的高度,这就要使用到Autolayout了,无论是通过xib文件创建的cell还是代码创建的cell,若想让cell自动正确的计算出自身的高度,必须添加足够压力的约束
关于昨天程序出差我找bug的过程记录 昨天才程序 https://www.cnblogs.com/pythonywy/p/11006273.html ├── xxxx │ ├── src.py │...42m\t\t输入q退出程序 \t\t\t\t\033[5m") print(38 * '-') user_shopping_chiose = input('请输入你要选择的功能...58 top_up程序启动时间:2019-06-12 17:37:58 top_up程序启动时间:2019-06-12 17:37:58 我们发现他运行后内侧应该还存在日志相关函数,我们这时候看看原来的函数...,这里可以用时间生成函数来进行保证每次函数名不一样 #第二种找可能会出现相同地方'logger_login'这个名字 #第三种找可能会出现相同地方logging.getLogger('start')中(...'start')这个名字 我选择最容易修改的第三种进行修改 import logging from data_time import data_time def logger_login(user):
private static boolean same(int[] p,int l,int n){ for(int i=0;i<l;i++){ ...
一、需求 网上五花八门的获取方式有很多,但是很多都是过时的。方案都不可取。...二、获取方式 我采用本办法拿到这个数据列 1、拿到整个表格 var table = $('#postTable').DataTable(); 2、拿到表格的所有数据 var data = table.rows...().data(); 3、拿到选择的列的隐藏数据id var report_Id = $("#report_Id:checked").val(); 4、通过遍历+判断的形式拿到需要的数据列 for (var...{ if(data[i]["report_Id"] == report_Id){ tableName = data[i]["biz_Table_Name"]; } } 三、所有代码 //获取选中行的表名列
name], type1, type2 FROM #temp) a UNPIVOT ([amount] FOR [type] IN([type1],[type2])) b 今天文章到此就结束了,感谢您的阅读好运
消费、投资、出口是经济的三架马车,消费作为作为重要的组成部分,也是宏观经济研究的重要对象之一。...经济学家提出过很多消费函数:如:凯恩斯的绝对收入假说、杜森贝的相对收入假说、弗里德曼的持久收入假说、莫迪利尼亚的生命周期假说及现代的消费函数。...1,消费函数的选择 本次我们将借助前辈莫迪利尼亚的生命周期假说的消费函数来对比中美消费模型的差异性。...从消费函数可以看出,近年来中国当期消费刚性是上一期的2倍,消费刚性强于30年前的美国的1.0224,体现我国近年来强劲的消费动力。 基于当前收入消费系数为1来看中国居民的消费倾向高于30年前的美国。...中国居民也更看重上期的收入。 不过中国的消费强依赖于居民的可支配收入,而美国有最低的消费保障,体现美国的福利保障优于我国。 如果有美国最近几年的数据就更有对比性了
所谓隐式的主键就是指:如果在建表的时候没有指定主键,InnoDB 存储引擎会将第一列非空的列作为主键;如果没有的话会自动生成一列为 6 字节的主键。...可以看见,由于锁住的是不同的记录行,所以两个记录锁并没有相互排斥,来看一下现在表中的数据,由于事务 1 还没有 commit,所以应该是只有 id = 2 的 username 被修改了: ?...行锁退化为表锁示例 再来看下没有使用索引的例子: 同样的,新建两个事务,先执行事务 T1 的前两行,也就是不要执行 commit。...、9 的数据行的插入会被阻塞,但是 1 和 10 两条被操作的索引记录并不会被锁住。..., 13] (13, 20] (20, +∞] 细心的同学应该已经注意到了,和 Gap Lock 的不同之处就在于,Next-Key Lock 锁定的区间是左开右闭的,也就是说它是包含当前被操作的索引记录的
大家好,又见面了,我是你们的朋友全栈君。 其实很多人应该接触过cssText这个style对象的属性。 我们也先做一个测试吧。...height:200px;"> var div = document.getElementById('test'); alert(div.style.cssText); 这段代码其实就是获取元素的样式...结果在不同浏览器弹出的值是有差异的: IE6-8 IE9 即各大高级浏览器 当然上面是单样式设置,我们可以看出 两点: IE6-8 属性key大写,而且尾部不带;(分号) 我们再来看看一些...复合属性: IE6-8 IE9 以及高级浏览器 像border这样的简写属性,在IE6-8下会被展开。
在生物学上,经常会遇到找control和treat的差异基因或者任意两个或者两个以上处理条件下,最差异的变化,比如我有这样一个数据,几千个细胞分为处理过的和没处理过的,然后通过拍照记录了他们的形态大小等几十个特征...,我想知道哪个特征产生了最大的变化。...coef=1, n=Inf) DEfeature<-DEfeature[order(abs(DEfeature$logFC),decreasing = T),] head(DEfeature) 前几个差异最大的...image.png 可以明显看到两群细胞分为不同的分布方向,所以查看较大特征值和特征向量 #show the feature library(factoextra) # Visualize variable...image.png 我们可以看到三种方式的结果几乎是差不多的,说明差异最显著的feature是在不同的方法计算方式都是稳定的。
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