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【直播】基因组 37:gwas研究结果身上得到了验证

前面讲到了480万变异里面里面有一些在dbSNP数据库里面记录着可能是somatic变异,让有点担心,尤其是还看到了好几个MUC系列基因,主要是黏液素家族基因,而Mucin gene expression...in the effusions of otitis media with effusion.让想起了儿时种种不愉快,反正这个也不是什么隐私了,曝就曝吧!...emedicine.medscape.com/article/994656-treatment http://emedicine.medscape.com/article/994656-medication 本文重点是探究如何把现有的研究结果全基因组测序数据结合起来...搜索关键词是:Otitis Media With Effusion gene ,谷歌可以得到一系列结果,当然需要你英文水平还行才能看下去。...也就是这个科学团体研究了近万人才得到了这个可疑位点,跟OME显著相关。 前面我们已经把vcf文件添加了dbSNP标签,简单搜索一下发现,的确有这个变异,唉。

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交易系统

实盘交易时,会忽略以下标的: 法律限制,无法交易市场; 没有达到我对于成本和流动性考量市场。...使用交易策略规则 当前使用交易策略分为趋势跟踪和非趋势跟踪两大类,其中趋势跟踪策略包括(关于策略具体逻辑请参考原文): 时序动量-EWMAC 突破 截面动量 大类资产动量 标准化动量 动量加速...此时,可能会列出100多个品种最佳头寸。但其中绝大多数都少于一份合约,因此不可交易,而且账户里也没有数千万美元需要在所有这些工具中保持合理头寸。...今年系统最大变化是引入了一个动态优化系统,这意味着不会真的会交易100+品种!通过动态组合优化研究,发现跟踪误差最小投资组合是最优投资组合,在这些品种上采用整数合约头寸。...最后上一张作者实盘会回测对比收益图:

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    【WRF小技巧】WRF如何得到更好模拟结果

    以下文章来源于气海同途 ,作者气海同途 编者按:这是新开一个系列,有时间会逐步将WRF官方培训ppt挑选个人认为重要进行翻译,以及结合个人使用经验进行一些解释。...WRF作为成熟区域中尺度气象模式,文档齐全且教程详细,对于用户较为友好,但是想要获得一个好模拟结果,需要注意很多地方, 1 模拟区域domain设置 模拟区域不能太小,否则模拟结果基本为全球模式侧边界强迫结果...(Warner, 2011) 2 初始化和spin-up预热过程 模拟结果好坏很大程度取决于初始场(IC)质量。 要了解初始场数据来源,比如初始场来源于预报数据、再分析数据或者气候数据。...关于物理参数化方案,以后有时间再展开介绍,以下粗略提几点: 给定一套参数化方案组合,对于不同地区、domain大小、时间以及关注天气现象,其模拟结果是不同,没有哪种方案组合是完美的。...最后,WRF使用者应该时刻牢记以下几点: 模拟结果受到很多因素影响,如模拟区域设置(水平和垂直)、输入数据(包括气象场和静态数据)、侧边界条件等; 模式是存在缺陷,对于某些具体天气过程是无法得到模拟结果

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    得到最佳编程建议

    得到最佳编程建议   这是一个有关于我得到一些专业性编程建议故事,以及它如何影响了职业生涯。真心觉得此建议真可谓是字字珠玑,所以我想分享给大家。  ...建议   还是在1996年,得到第一份全职工作。公司:微软。产品:Windows 2000。老板是一个叫Terry Lahman家伙,满脸络腮胡子,却非常慈祥,打心眼里关心产品和他员工。...有一天,他走进办公室,然后,他说:   “Eric,希望每次走进来问你,‘你在干什么不知道事情?’时候,你总是能够说出点什么来。”   依然记得听到这句话时候有多么惊讶。...以为,如果将时间“浪费”在项目以外事情上,他会生气会斥责。但是万万没想到,他竟然鼓励去这么做。  结果   从那之后,开始搞一些小型兼职项目。学得很快。...最后遇见了Dave Abrahams,Boost联合创始人之一,他和我成了朋友。以至于后来当我终于下定决心离开微软,Dave请我担任了BoostPro Computering分包商。

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    差异分析得到结果注释一文就够

    通过前面的讲解,我们顺利了解了GEO数据库以及如何下载其数据,得到我们想要表达矩阵,也学会了两个常用套路分析得到表达矩阵,就是GSEA分析和差异分析。.../BIOCARTA/REACTOME等数据库 http://www.cnblogs.com/emanlee/archive/2011/08/02/2125314.html 虽然懂了原理可以让我们更方便理解结果...然后,理解 GO/KEGG/REACTOME/MSIGDB 这4个数据库结构,及对应生物学一样。接着,理解 超几何分布建议,GSEA这两个算法。最后把下面的代码跑一遍即可。...(因为Y叔包更新太频繁,只能保证下面的代码,今天是有效,所以赶快试一下吧) library(clusterProfiler) ### get the universal genes and sDEG.../KEGG注释一般是得到如下表格: ?

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    一些得到 Python 脚本

    下面的python脚本有一部分是百度然后修改,一部分是自己写,如果以后有什么新脚本或者这些脚本有修改也会在这里更新,这些源码放在这里仅以备份为目的把图片上传到 sm.ms 图床...情况下批量下载图片picdl.py# coding=utf-8 import requests filepath = 'E:/acg/acg/' #图片存放地址i = 1 #将图片URL存放在 E:...def photo_classify(files_path): # 读取文件夹中所有文件名称 files_list = os.listdir(files_path) # 循环文件夹中所有文件...def photo_classify(files_path): # 读取文件夹中所有文件名称 files_list = os.listdir(files_path) # 循环文件夹中所有文件...这里有最专业开发者&客户,能与产品人员亲密接触,专有的问题&需求反馈渠道,有一群志同道合兄弟姐妹。来加入属于我们开发者社群吧 。

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    学编程时最后事!

    这也是学编程时 最后事 ,如果能早点醒悟,应该能学到更多知识,身体和头发也会更好些。 下面把这件事以及毕业后 自救方法 分享给大家,希望帮助大家少走弯路,高效学编程。...最后学编程时最后事就是:做事不分主次,花了太多时间在技术无关纠结上。 举个例子,在大三学习微服务时候,独立开发了一个安卓 APP 叫 面试君主 。...实际应用 方法介绍完后,结合编程举几个实际应用例子。 做项目 以前参加比赛做项目时,一般都是拖到最后才匆匆忙忙提交结果。...也没有想过计划用多少时间把它学完,结果就是导致学习节奏慢,每天看个几节课。可能今天还没看,昨天就忘了。...刷算法 很多朋友跟我抱怨说自己会在一道算法题上纠结很久,多达几个小时,结果最后也没做出来,非常难受。 大一做 ACM 练习题时候也是这样,想不通就硬想,生来倔强,就以为自己能做出来。

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    面试时候只会聊项目,结果就把挂了!

    要知道,我们平时干活更偏重于业务,不可能大量接触到算法,数据结构,底层代码这类面试必问问题点,换句话说,面试准备点和平时工作要点匹配度很小。 作为面试官,只能根据候选人回答来决定面试结果。...下面列些一般会问部分问题: String a = "123"; String b = "123"; a==b结果是什么? 这包含了内存,String存储方式等诸多知识点。...2、能通过grep方式查关键字,具体用法是, grep 关键字 文件名,如果要两次在结果里查找的话,就用grep 关键字1 文件名 | 关键字2 --color。最后--color是高亮关键字。...在面试过程中,经常会听到一些比较遗憾回答,比如候选人对SQL优化技能讲得头头是道,但最后得知,这是他平时自学时掌握,并没用在实际项目里。...从这个案例中,想告诉大家是,你之前费了千辛万苦(其实方法方向得到,也不用费太大精力)准备很多技能和说辞,最后应该落实到你实际项目里。

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    md5加密,同样代码得到不同加密结果(已解决)

    场景: 开发环境(windows下)调用第三方接口验签通过,发测试环境(linux下)后死活验签通过不了   原因:   md5是一项成熟加密技术,问题应该在代码里,查了查感觉可能是字符编码问题...,导致加签没通过,这样的话只能是环境导致字符编码出现问题,就所知有getBytes()方法是得到一个操作系统默认编码格式字节数组,发现公共代码里进行md5加密是要进行转字节 /**...); } catch (NoSuchAlgorithmException e) { } return resultString; } 所以这里getBytes...()不确定性太大,需要指定编码方式来降低耦合(代码与环境耦合)。   ...解决方法:   将getBytes()方法指定具体编码方式,如:getBytes("UTF-8") /** * md5加密 */ public static String

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    妹子让看她写pytest,结果...

    突然发现拖延症已经严重影响到了。 什么是拖延症,简单来说就是个人选择而已。每时每刻,面临辛苦选项与逃避选项时,倾向于选择更安逸那一个。一而再再而三,就成了拖延。...很早之前就计划专注某个方面写一个系列,但是直到今日,仍没有结果,实在是有些惭愧,想从新逼迫自己进步,不知道能坚持多久。...第二,刚好有测试妹子给我提供了一些简单pytest小案例,也正有此意,那这篇文章就这样来了。 先声明:技术文主要还是以理解为主,不一定专业,如果看完还是不会,那一定是不够好。...不要因为太过于乏味而打消自己学习念头。 回到正文pytest,可能很多常写python的人第一次听到这个库,它究竟有什么用呢? pytest 是一个成熟全功能 Python 测试工具。...,每次执行时候会用pytest.main('-s 文件名') 其实这里-s是可以根据不同需求进行替换,这里我们替换成-v,那么执行结果就变成了 =======================

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    是怎么从零学会量化交易

    大家好是郑在爽。 众所周知本职工作是名程序员,以前每天打交道都是java python c++。 在几年前开始接触量化交易后,掌握语言又多了一门MQL。 ? 初识MQL ?...只是在写下第一行MQL时候,也没想到一个月后就有第一笔正收益。 ? 量化交易核心逻辑 ? 实际上对于有一定代码素养开发来说,理解量化交易最关键只需要弄明白三个东西。...这是刚开始学量化交易时写第一段代码。再加上其他交易逻辑,验证逻辑,大概花了一个月时间就上线了。...第一笔交易给我赚了多少钱呢,其实也不多,当时下是一笔 0.01 手 USDCHF多单,盈利300个小点,算下来大概3美刀多一点利润。 ? ‍...那时候,包括身边炒股朋友,直到大A股开始熔断之前,都还觉得自己是股神。

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    明明结果是对,为什么被合并查询后得到结果却出错了?| Power Query躲坑

    最近,有位朋友在一个实际工作问题中,在表2使用合并查询从表1结果中匹配最高(阶段)项,眼看着表1结果是对,但表2里却得到了错误返回结果,具体情况如图所示: 为什么会这样?...我们先来看表1处理情况。 为了合并查询得到最高阶段项,对表1进行降序排序: 然后通过删除重复项保留最高阶段数据: 从表1结果来看,的确保留了最高阶段数据。...然后,在表2里使用合并查询获取表1中结果并展开: 咦!!! 表1处理结果明明是阶段4(报价),为什么合并查询得到结果却是阶段2(售前)? 这难道是Power QueryBug吗?...这里问题根源其实是表1处理问题,以往发布多篇文章案例中,在涉及Power Query中使用排序问题时会强调,Power Query排序需要增加添加索引或Table.Buffer步骤,使排序结果真正...这十个问题,Power Query初学者经常问 5个PQ错误处理方式,最后一个其实最重要!

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    不是最后一个知道MDC吧?

    世上知识千千万,还好有来相伴。 大家好久不见,是walking。今天给大家带来一个日志方面的知识——MDC,不知道大家认识不,反正是最近刚知道?...这仅仅是我们自己看了别人在项目代码里用MDC以及MDC一点源码得到一些信息。我们还要到网上查一下资料,一是看我们以上认知是不是对,二是获取关于MDC更多信息,包括怎么使用。...写了一个测试接口,如下,简单模拟一个任务提交到线程池,然后在这个任务内部穿插着调了很多方法,假设很多业务逻辑,并且各个逻辑分支、方法都有自己日志输出,就是这样一个测试接口。...看到这,恍然大悟了吧,MDC作用就在这。如果还不明白,那么我们模拟多线程请求刚才们测试接口看下效果吧。 模拟了1秒内发10个线程请求,看下日志是什么样,帮助理解。...如果没有MDC猜此时此刻你应该处于雪崩状态。

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    star-fusion得到融合基因结果还需要可视化哦

    但是关于融合基因后续生物学介绍我们说不够,现在就带领大家仔细理解一下star-fusion软件结果!...我们示例项目得到结果,按照JunctionReadCount排序如下: #FusionName JunctionReadCount SpanningFragCount FGFR3--TACC3...首先IGV可视化 得到结果通常是需要可视化,如果我们单独IGV可视化FGFR3基因如下: ?...如果要批量检验全部样本star-fusion结果呢 就需要写自动化批量处理脚本了。这个很难哦,感觉写出来了能看懂也不多,就算了吧!...需要认真学好linux,参考在 《生信分析人员如何系统入门Linux(2019更新版)》 设定linux入门6个阶段 ,一般来说,每个阶段都需要至少一天以上学习: 第1阶段:把linux系统玩得跟

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    一年编程生涯中得到经验教训

    一年编程生涯中得到经验教训 一年前,还是一个新鲜出炉刚毕业学生,刚开始在Rocketrip工作。经过一年时间,学到了很多东西。...常常在想,要是能早点知道这些针对应届毕业生技巧,那么从学生到员工转变道路将会顺畅得多。 ? ps:顺序先后没有特定含义 1.对工作激情能大大提升你工作质量。...3.95%电子邮件没必要立即回应。这个比例可能有待商榷,但我想说明是需要立即响应电子邮件数量是非常少。匆匆忙忙回复每一个进来电子邮件,其成本会很高。你可以设置你手机至半小时后提醒。...不要依赖于你周围的人给你设定预期。如果给你预期工作量比你认为你应该做多,那么也许这家公司并不适合你。同时,竭尽全力工作,即使结果比你预期要多。 9.做业余项目。...赞同要将大部分生产时间用于工作,但我也认为应该做一些自己业余项目。博客、项目、等等,都可以。 10.不断学习。自学一些你认为需要和感兴趣东西。 11.为待做事件列一个清单。

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    用深度学习每次得到结果都不一样,怎么办?

    在这个教程中,你会学到怎样设置随机数生成器,才能每次用同样数据训练同一网络时,都能得到同样结果。 我们开始。 ? 教程概览 这个教程分为六部分: 为啥每次得到结果都不一样?...,请看下面这个帖子: How to Setup a Python Environment for Machine Learning and Deep Learning with Anaconda 为啥每次得到结果都不一样...发现这对神经网络和深度学习初学者而言是个常见问题。 这种误解可能出于以下问题: 如何得到稳定结果?...如何得到可重复结果 应该如何设置种子点 神经网络特意用随机性来保证,能通过有效学习得到问题近似函数。采用随机性原因是:用它机器学习算法,要比不用它效果更好。...如果仍然得到不同结果,怎么办? 为了重复迭代,报告结果和比较模型鲁棒性最好做法是多次(30+)重复实验,并使用汇总统计。

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    看了很多负采样论文,最后选择不采样了。

    然而,这么做会导致有两方面的问题没有被考虑仔细: 负采样会带来较大波动;基于采样方法很难获得最优排序结果; 尽管heterogeneous反馈在许多在线系统中被广泛使用,(例如view,click...之前工作缺乏用户行为之间关系深度探索,每个行为都会有自己对应上下文以及非常强迁移关系。 ?...基于内积乘法操作decouple操作, 我们将上式代入得到: 因为是均匀; 参数是商品相关; 和可以被很好地分开,优化以及是相互独立,我们可以通过预先计算这两项来加速。...讨论 在第个行为batch更新时间复杂度为:, 其中表示该batch中用户和商品在行为下正向交互次数。在MTL更新类行为时,一个batch需要耗费。...对于原始回归损失,会需要耗费次, 在实践中,因为 以及 ,本文模型复杂度得到了大大降低。 实验 1. 效果比较 ?

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    使用V函数,进行变量引用,得到想要结果值 》

    请求名称 运行结果 我们期望它得到过程是:{var_1} {var_2} 期望结果是:引用变量值。...实际结果是: 要进行两次变量计算。这个方法是办不到,得不到我们想要结果。...然后再使用$符号和大括号扩起来,进行了变量引用,这样才得到想要结果值。 http请求:修改了名称和消息体数据 运行成功 3.注意 取样器在运行时候,HTTP请求里名称也会进行代码运算。...这个脚本就会返回多个name值, 用table_name这个变量来接收这几个值。...${变量名称} 得到变量值。 ${__V(前缀_可变后缀)}得到是这个“前缀_可变后缀”变量名值。 ${__P(属性名称)} 得到是属性名称值。

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    投稿 | 现阶段为什么不看好纯粹数据交易?

    但是短期内,仍然不看好数据交易,因为现阶段数据交易缺乏了必要基础构建 ?...尽管大数据交易平台建设正值爆发期,数据交易号称市场规模也在不断壮大,同时也有国家大力政策支持。但是短期内,仍然不看好数据交易,因为现阶段数据交易缺乏了必要基础构建。...但在现阶段,大数据刚刚起步,绝大多数行业、企业对于本身数据、数据如何使用并不清晰。所谓认知理解基础,指的是知道“能用数据做什么”、“别人数据对有什么作用”、“数据对别人有什么作用”等等。...就拿大数据征信举例,不同部门信用评级标准不一样,很可能对于同一个评估结果就有天差地别。这时候该相信谁,该采用谁标准?大数据本应是告诉你答案,而不是让你陷入新难题。...结语: 曾经提出“技术不是大数据第一生产力,数据交易才能带来应用爆发(链接)”,但数据交易绝对不是纯粹数据原材料买卖,否自在未来将会丧失核心竞争力,借助大数据做一些现在做不到事情,才是大数据交易蓬勃发展未来

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