我前面说到 awk 只能处理文本文件，那当我们的文件不是文本格式时，比如是 gz 压缩文件或者BAM文件的时候，要用 awk 处理的话，就需要先做转换然后通过管道把数据传过给 awk 来分析，比如： $...此外，既然可以设置输入分隔符，自然也可以定义输出分隔符。我这里还是用 BEGIN 定义作为例子： $ awk '{if($1!...，其中每一个bed区域里各个位点的深度都是一样的，所以只留下一个值，这也是为什么我在上面累加深度的时候需要用 ($3-$2)*$4 的原因。...，下一篇是 awk 的进阶（进阶篇已经优先在我的知识星球中给所有星友分享了）。...虽然还不是十分全面，但我觉得能够掌握好上面的使用方法，并灵活应用，其实已经可以用一行命令处理很多基本的分析需求了，不必为了一个小功能费劲去写一个程序。
Awk的输入被解析成多个记录（Record），默认情况下，记录的分隔符是，因此可以认为一行就是一个记录，记录的分隔符可以通过内置变量RS更改。...默认情况下，记录的分隔符是回车，字段的分隔符是空白符，所以文本文件的每一行表示一个记录，而每一行中的内容被空白分隔成多个字段。利用字段和记录，awk就可以非常灵活地处理文件的内容。...内置变量FS也可以用于更改字段分隔符，它记录着当前的字段分隔符： 记录的分隔符可以通过内置变量RS更改： 如果将RS设置成空，行为有就一点怪异了，它会将连续不为空行的所有行（一个段落）当作一个记录，而且强制回车为字段分隔符...其中，内置变量名都是大写的。变量并不非一定要被声明或者被初始化，未初始化的字符串变量的值为””，未初始化的数值变量的值为0。字段变量可以用$n来引用，n的取值范围为[0,NF]。...，默认为空白 NF 每个记录中字段的个数 RS 记录的分隔符，默认为回车 OFS 输出时字段的分隔符，默认为空白 ORS 输出时记录的分隔符，默认为回车 RLENGTH 被match函数匹配的子串长度
Awk的输入被解析成多个记录(Record)，默认情况下，记录的分隔符是，因此可以认为一行就是一个记录，记录的分隔符可以通过内置变量RS更改。当记录匹配某个时，才会执行后续的action命令。 ...默认情况下，记录的分隔符是回车，字段的分隔符是空白符，所以文本文件的每一行表示一个记录，而每一行中的内容被空白分隔成多个字段。利用字段和记录，awk就可以非常灵活地处理文件的内容。 ...内置变量FS也可以用于更改字段分隔符，它记录着当前的字段分隔符： 记录的分隔符可以通过内置变量RS更改： 如果将RS设置成空，行为有就一点怪异了，它会将连续不为空行的所有行(一个段落)当作一个记录...变量并不非一定要被声明或者被初始化，未初始化的字符串变量的值为””，未初始化的数值变量的值为0。字段变量可以用n来引用，n的取值范围为[0,NF]。...下面的方法倒是可以，首先增加ARGC的值，再增加ARGV元素，我到现在也没搞懂这两者的区别： 与OFMT Awk中允许数值到字符串相互转换，其中内置变量定义了awk内部数值到字符串转换的格式，它的默认值为
Awk的输入被解析成多个记录（Record），默认情况下，记录的分隔符是\n，因此可以认为一行就是一个记录，记录的分隔符可以通过内置变量RS更改。...而每个记录由进一步地被分隔成多个字段（Field），默认情况下字段的分隔符是空白符，例如空格、制表符等等，也可以通过-F ERE选项或者内置变量FS更改。...默认情况下，记录的分隔符是回车，字段的分隔符是空白符，所以文本文件的每一行表示一个记录，而每一行中的内容被空白分隔成多个字段。利用字段和记录，awk就可以非常灵活地处理文件的内容。...定义输出时数值转换成字符串的格式，默认值为"%.6g" ENVIRON 存放系统环境变量的关联数组 FILENAME 当前被处理的文件名 NR 记录的总个数 FNR 当前文件中的记录的总个数 FS 字段分隔符...，默认为空白 NF 每个记录中字段的个数 RS 记录的分隔符，默认为回车 OFS 输出时字段的分隔符，默认为空白 ORS 输出时记录的分隔符，默认为回车 RLENGTH 被match函数匹配的子串长度
针对使用是过程的一些心得，写个小小的教程，awk太强大了，需要慢慢长时间的学习，我尽量保持更新这个教程吧。...awk基本概念awk是基于列的处理工具，它的工作方式是按行读取文本并视为一条记录，每条记录以字段分割成若干字段，然后输出各字段的值。...域（字段）awk中每个非空白的部分叫做域（或者字段），从左到右依次是第一个域，第二个域。$1，$2表示第一域第二个域，$0表示全部域，也就是整行。...通过为输入的分隔符变量制定相应分割方式，来更好的处理文本，而输出的分隔符变量则可以让我们在保存处理后的数据时更加灵活。...重复这个过程，知道文件全部被读取完毕。每读取一行时，它就会检查该行和提供的样式是否匹配。样式本身可以是正则表达式、条件以及行匹配范围等。
$ sed 's#10#100#g' example 不论什么字符，紧跟着s命令的都被认为是新的分隔符，所以，“#”在这里是分隔符，代替了默认的“/”分隔符。表示把所有10替换成100。...如例子所示，第一条命令删除1至5行，第二条命令用check替换test。命令的执行顺序对结果有影响。如果两个命令都是替换命令，那么第一个替换命令将影响第二个替换命令的结果。...FIELDWIDTHS 字段宽度列表(用空格键分隔)。 FILENAME 当前文件名。 FNR 同NR，但相对于当前文件。 FS 字段分隔符(默认是任何空格)。...OFS 输出字段分隔符(默认值是一个空格)。 ORS 输出记录分隔符(默认值是一个换行符)。 RLENGTH 由match函数所匹配的字符串的长度。 RS 记录分隔符(默认是一个换行符)。...RSTART 由match函数所匹配的字符串的第一个位置。 SUBSEP 数组下标分隔符(默认值是\034)。
关系表达式：可以用下面运算符表中的关系运算符进行操作，可以是字符串或数字的比较，如$2>%1选择第二个字段比第一个字段长的行。 模式匹配表达式：用运算符~(匹配)和~!(不匹配)。...CONVFMT 数字转换格式(默认值为%.6g) ENVIRON 环境变量关联数组。 ERRNO 最后一个系统错误的描述。 FIELDWIDTHS 字段宽度列表(用空格键分隔)。...OFS 输出字段分隔符(默认值是一个空格)。 ORS 输出记录分隔符(默认值是一个换行符)。 RLENGTH 由match函数所匹配的字符串的长度。 RS 记录分隔符(默认是一个换行符)。...第二个例子在整个文档的第一个域中匹配，所有匹配的都被替换成mytest。 index函数返回子字符串第一次被匹配的位置，偏移量从位置1开始。...本地日期和时间 %d 十进制日期 %D 日期 08/20/99 %e 日期，如果只有一位会补上一个空格 %H 用十进制表示24小时格式的小时 %I 用十进制表示12小时格式的小时 %j 从
多个替换可以在同一条命令中执行,用分号";"分隔，其格式为: # 同时执行两个替换规则 sed 's/^/添加的头部&/g；s/$/&添加的尾部/g' awk: awk语言的最基本功能是在文件或者字符串中基于指定规则浏览和抽取信息...关系表达式：可以用下面运算符表中的关系运算符进行操作，可以是字符串或数字的比较，如$2>%1选择第二个字段比第一个字段长的行。 模式匹配表达式：用运算符~(匹配)和~!(不匹配)。...记录分隔符：默认的输入和输出的分隔符都是回车，保存在内建变量ORS和RS中。 0变量：它指的是整条记录。如 awk '{print 变量NR：一个计数器，每处理完一条记录，NR的值就增加1。...awk可跟踪域的个数，并在内建变量NF中保存该值。如 域分隔符 内建变量FS保存输入域分隔符的值，默认是空格或tab。我们可以通过-F命令行选项修改FS的值。...输出域的分隔符默认是一个空格，保存在OFS中。如$ awk -F: '{print $1,$5}' test，$1和$5间的逗号就是OFS的值。
关系表达式：可以用下面运算符表中的关系运算符进行操作，可以是字符串或数字的比较，如$2>%1选择第二个字段比第一个字段长的行。 模式匹配表达式：用运算符~(匹配)和~!(不匹配)。...CONVFMT 数字转换格式(默认值为%.6g) ENVIRON 环境变量关联数组。 ERRNO 最后一个系统错误的描述。 FIELDWIDTHS 字段宽度列表(用空格键分隔)。...FS 字段分隔符(默认是任何空格)。 IGNORECASE 如果为真，则进行忽略大小写的匹配。 NF 当前记录中的字段数。 NR 当前记录数。 OFMT 数字的输出格式(默认值是%.6g)。...OFS 输出字段分隔符(默认值是一个空格)。 ORS 输出记录分隔符(默认值是一个换行符)。 RLENGTH 由match函数所匹配的字符串的长度。 RS 记录分隔符(默认是一个换行符)。...数组name中的下标是一个自定义变量x，awk初始化x的值为0，在每次使用后增加1。第二个域的值被赋给name数组的各个元素。
awk 如何处理文本流 awk 每次从输入文件或流中一行一行地读取文本，并使用字段分隔符将其解析成若干字段。在 awk 的术语中，当前的缓冲区是一个记录。...RS（ 记录分隔符(record separator)）。默认情况下是一个新行（n）。 NF（ 字段数(number of fields)）。当 awk 解析一行时，这个变量被设置为被解析出字段数。...影响 awk 行为的变量还有很多，但知道这些已经足够开始了。 单行 awk 脚本 对于一个如此强大的工具来说，有趣的是，awk 的大部分用法都是基本的单行脚本。...把 awk 程序写在一个叫 mail_merge.awk 的文件中。在 awk 脚本中的语句用 ; 分隔。第一个任务是设置字段分隔符变量和其他几个脚本需要的变量。...模板文件被逐行读取，并使用函数 sub 将任何出现的特殊字符序列替换为相关变量的值。然后将该行以及所做的任何替换输出到输出文件中。
当我们不指定文本内容的分割符的时候，awk默认把每一行的文本内容按照空格进行划分为列（当存在多个连续的空格时当做一个分割）。...我们构建一个格式化的txt文本，内容如下： 文本内容 我们可以输出文本的第一列、第二列数据： AWK输出指定列内容 针对某些列存在字段的缺失，AWK并不会报错，而是输出空值。...上面我们提到了AWK可以指定分隔符，默认的额分隔符是“空格”，其实分隔符也分为两类：输入分隔符、输出分隔符。 输入分隔符：FS，用于指定输入的格式文本时，按照何种分隔符进行列的划分。...输出分隔符：OFS，用于输出格式文本的时候，用何种分隔符进行列的划分。...用-F参数项指定已#为列的分隔符。
，列的分隔符 RS横着切，行的分隔符 【语法格式】 awk [–F] [“[分隔符]”] [’{print$1，$NF}’] [目标文件] awk 'BEGIN{FS="[列分隔符]...OFS 输 出字段分隔符(默认值是一个空格)。 ORS 输出记录分隔符(默认值是一个换行符)。...RSTART 由 match函数所匹配的字符串的第一个位置。 SUBSEP 数组下标分隔符(默认值是\034)。...{RS="/"} {print $0}' /etc/passwd 5、以一个或多个/为行的分割符，打印第二行的第二列，列的分隔符为默认的空格,并打印行号 awk 'BEGIN{RS="[/]+"} NR...*$–>表示以空格tea起始,任意字符结尾，实际就是匹配oldboy字符串后，紧接着的字符串□teacher.; 后面被替换的内容中的\1就是取前面的括号里的内容了，也就是我们要的oldboy字符串。
'BEGIN{}pattern{commands}END{}' awk的内置变量 内置变量 含义 $0 整行内容 n 当前行的第1-n个字段（按照指定分隔符分割后） NF(Number Field)...3 3 可以用这个输出每一行的最后一列的值 awk '{print $NF}' show.txt 输出行号 awk '{print NR}' show.txt 1 2 对每个文件的行号单独计数（显示...有兴趣的可以了解一下awk编程，这里就不再多做介绍了 假如有一个如下的访问日志request.log 2020-05-21 request enter 2020-05-21 request ip 127.0.0.1...127.0.0.1 我原来维护了一个hadoop集群，当想关闭集群中的所有DataNode节点（可以认为一个应用），假如每个机器jps，查看pid，kill。...，因为我在Linux对文本进行修改用vim比较多，sed的话可能在脚本中用的多一点，因此也没多少经验，简单介绍一个替换的示例 cat show.txt this is a test for sed this
用空格键分隔) FILENAME 当前文件名 FNR 同NR，但相对于当前文件 FS 字段分隔符(默认是任何空格) IGNORECASE 如果为真，则进行忽略大小写的匹配 NF 当前记录中的字段数...NR 当前记录数 OFMT 数字的输出格式(默认值是%.6g) OFS 输出字段分隔符(默认值是一个空格) ORS 输出记录分隔符(默认值是一个换行符) RLENGTH 由match函数所匹配的字符串的长度...RS 记录分隔符(默认是一个换行符) RSTART 由match函数所匹配的字符串的第一个位置 SUBSEP 数组下标分隔符(默认值是\034) 5....sub( Ere, Repl, [ In ] ) 用 Repl 参数指定的字符串替换 In 参数指定的字符串中的由 Ere 参数指定的扩展正则表达式的第一个具体值。sub 函数返回替换的数量。...%H 用十进制表示24小时格式的小时 %I 用十进制表示12小时格式的小时 %j 从1月1日起一年中的第几天 %m 十进制表示的月份 %M 十进制表示的分钟 %p 12小时表示法(AM/PM) %S
大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。...二、基础语法 2.1.记录与字段 awk是一种处理文本文件的编程语言，文件的每行数据都被称为记录，默认以空格或制表符为分隔符，每条记录被分成若干字段(列)，awk每次从文件中读取一条记录。...{x=1;x+=1;print x}' 2 awk中变量不需定义就可以直接使用，作为字符处理时未定义的变量默认值为空，作为数字处理时未定义的变量默认值为0 awk 'BEGIN{print "["x"]...这里面包含了两个循环，一个是隐含循环，awk会逐行处理数据；一个是for循环每列的值，如果等于root，就让x自加1，最后打印x的值 4.3.while循环 语法： while(条件判断){...' root:x:**:**:root:/root:/bin/bash sub(r,s,[,t]) 与gsub类似，但仅替换第一个匹配的字符串，而不是替换全部 substr(s,i,[,n]) 对字符串
在后用tr进行大小写替换与用sed进行大小写替换的区别3 awk/gawk编程语言，可对文本和数据进行处理3.1 常见参数-F fields 设置字段分隔符3.2 用法awk [options] '{script...}' file基础结构：'{script}'匹配结构：'/pattern/{script}'扩展结构：'BEGIN{script}{script}END{script}'awk在读取一行文本时，会用预定义的字段分隔符划分每个数据字段...，并分配给一个变量$0：代表整个文本行$1：代表文本行中的第1个数据字段（第1列）$NF：代表文本行中的最后一个数据字段awk默认的字段分隔符是任意空白字符（如：空格or制表符），也可以用-F参数自定义分隔符图片用...| awk '/UTR/{print $0}' | less -S #打印feature为UTR的整个文本行 3.3 awk内置变量FS：定义输入字段分隔符，同 -FRS：定义输入记录分隔符，Record...SeparatorOFS：定义输出字段分隔符ORS：定义输出记录分隔符NF：数据文件中的字段总数，可以简单理解为列数NR：已处理的输入记录数，可以简单理解为行数如何确定是空格还是tab键 cat -A3.4
1 到 n 个字段的信息 NF (Number Field) 处理行的字段个数 NR (Number Row) 处理行的行号 FNR (File Number Row) 多文件处理时，每个文件单独记录行号...> awk '{print FNR}' string.txt student.txt 1 1 2 3 4 5 用 -- 行分隔符和用 | 列分割符分割行，且输出字段分隔符为 & > awk 'BEGIN...，请使用while、 do while、 for三种循环方式实现（我只写for了） > awk 'BEGIN{sum=0;for(i=0;i<=100;i++)sum+=i;print sum}' 5050...,str) 在 str 中搜索符合 RE 的字串，将其替换为 RepStr;(只替换第一个) 替换的个数 gsub(RE,RepStr,str) 在 str 中搜索符合 RE 的字串，将其替换为 RepStr...;(替换所有) 替换的个数 以：为分隔符，返回 /etc/passwd 中每行中每个字段的长度 > awk '{print length($0)}' passwd 31 32 39 36 40 31
awk是怎样处理文本流的？ awk从输入文件或流中每次读取一行文本，并使用字段分隔符将其解析为多个字段。awk术语中，当前缓冲区（buffer）是一条记录。...，字段数量): 当awk解析一行记录时，NF代表已解析的字段数量 $0: 当前记录（行） 1, 2, NR (记录行数): 截至当前awk脚本已解析的记录行数 除此之外，还有很多其他影响awk行为的变量...例如，下面的单行脚本打印了 /etc/passwd中的用户名列表： awk -F":" '{print $1 }' /etc/passwd 如我们上面提到的，$1是当前记录的第一个字段。...模板文件逐行读取，sub函数用于替换相应的变量为指定的字符串。然后该行，连同所做的所有变量替换结果，被输出到输出文件。...awk进阶: 词频统计 awk的一个最强大的特性是关联数组。大部分编程语言中，数组元素通常是用数字作为索引，但awk中，数组通过一个key字符串来引用。
#始终为从5'到3'记录score：这一列的值对该类型存在性和坐标的可信度，可用·代替strand：正向和负向，+、-frame：密码子偏移，0、1、2attributes：属性，一个包含众多属性的列表...，格式为“标签=值”（tag=value），不同属性间用“;”分割。...')sed -i '1d' file3awk：也称gawk，编程语言，可对文本和数据进行处理外面用''，里面用""常见参数：-F：fields，设置字段分隔符#默认分隔符为任意空白字符，即空格或制表符用法...}'例如：'{print $9:$10@$11}'#可自定义输出分隔符，若行选择间输入“,”则默认为空格awk在读取一行文本时，会用预定义的字段分隔符划分每个数据字段，并分配给一个变量。...#$0代表整个文本行#$1代表文本行中的第一个数据字段#$NF代表文本行中的最后一个数据字段awk默认的字段分隔符是任意空白字符awk内置变量FS：定义输入字段分隔符，Field Separator，同
Shell 是指一种应用程序，这个应用程序提供了一个界面，用户通过这个界面访问操作系统内核的服务。 为什么要学习和使用shell？...比如，$1表示第1个字段(列)，$2表示第2个字段(列)，如此类推 NF 当前行拥有的字段（列）总数。 NR 当前awk所处理的行，是总数据的第几行。 FS 用户定义分隔符。...(NR值）字段数(NF值）} root 0 行号:1 字段数:7 user1 501 行号:2 字段数:7 如果我只想看看sshd这个伪用户的相关信息...num表示第几行 d ; 删除，删除指定的行。 p : 打印，输出指定的行。 s : 字串替换，用一个字符串替换另外一个字符串。格式为“行范围s/"旧字串/新字串/g”（和vim中的替换格式类似）。...加入我想要按照UID字段排序/etc/passwd文件: [root@localhost~]$ sort -t ":" -k 3,3 /etc/passwd #指定分隔符是“:”，用第三字段开头，第三字段结尾排序
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