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R语言STAN贝叶斯线性回归模型分析气候变化影响北半球海冰范围和可视化检查模型收敛性|附代码数据

在这个入门教程中,我们将从一个线性模型开始,经历模型建立的迭代过程。在我们的高级stan教程中,我们将探索更复杂的模型结构。首先,在建立模型之前,你需要定义你的问题并了解你的数据。...----点击标题查阅往期内容视频:R语言中的Stan概率编程MCMC采样的贝叶斯模型左右滑动查看更多01020304尝试自己将先验更改为一些不同的数字,看看会发生什么,这是贝叶斯建模中的一个常见问题,如果您的先验分布非常窄...对于更简单的模型,收敛通常不是问题,除非您的代码中有错误,或者运行采样器的迭代次数太少。收敛性差尝试仅运行 50 次迭代的模型并检查跟踪图。...plot(fit)图 9.Stan 模型不同链的跟踪图 。我们还可以查看后验密度和直方图。dens(it)hist(ft)图 10.Stan 模型中截距、斜率和残差方差的后验密度图和直方图 。...每一行都是模型的一次迭代(单一后验估计)。我们可以制作一些更漂亮的图。这个包是ggplot2。在200次后验抽样中,比较y的密度和y的密度。poy(y, yrep[1:200, ])图 12.

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R语言STAN贝叶斯线性回归模型分析气候变化影响北半球海冰范围和可视化检查模型收敛性|附代码数据

在这个入门教程中,我们将从一个线性模型开始,经历模型建立的迭代过程。在我们的高级stan教程中,我们将探索更复杂的模型结构。首先,在建立模型之前,你需要定义你的问题并了解你的数据。...----点击标题查阅往期内容视频:R语言中的Stan概率编程MCMC采样的贝叶斯模型转存失败重新上传取消左右滑动查看更多转存失败重新上传取消01020304尝试自己将先验更改为一些不同的数字,看看会发生什么...对于更简单的模型,收敛通常不是问题,除非您的代码中有错误,或者运行采样器的迭代次数太少。收敛性差尝试仅运行 50 次迭代的模型并检查跟踪图。...plot(fit)图 9.Stan 模型不同链的跟踪图 。我们还可以查看后验密度和直方图。dens(it)hist(ft)图 10.Stan 模型中截距、斜率和残差方差的后验密度图和直方图 。...每一行都是模型的一次迭代(单一后验估计)。我们可以制作一些更漂亮的图。这个包是ggplot2。在200次后验抽样中,比较y的密度和y的密度。poy(y, yrep\[1:200, \])图 12.

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    R语言STAN贝叶斯线性回归模型分析气候变化影响北半球海冰范围和可视化检查模型收敛性

    在这个入门教程中,我们将从一个线性模型开始,经历模型建立的迭代过程。在我们的高级stan教程中,我们将探索更复杂的模型结构。 首先,在建立模型之前,你需要定义你的问题并了解你的数据。...---- 点击标题查阅往期内容 视频:R语言中的Stan概率编程MCMC采样的贝叶斯模型 左右滑动查看更多 01 02 03 04 尝试自己将先验更改为一些不同的数字,看看会发生什么,这是贝叶斯建模中的一个常见问题...对于更简单的模型,收敛通常不是问题,除非您的代码中有错误,或者运行采样器的迭代次数太少。 收敛性差 尝试仅运行 50 次迭代的模型并检查跟踪图。...plot(fit) 图 9.Stan 模型不同链的跟踪图 。 我们还可以查看后验密度和直方图。...每一行都是模型的一次迭代(单一后验估计)。 我们可以制作一些更漂亮的图。这个包是ggplot2。 在200次后验抽样中,比较y的密度和y的密度。

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    56-R可视化-5-ggplot2基石三部曲之基础二

    开始前 主要为ggplot2 中的后四个部分的内容。 geometries 几何对象 不同的几何对象 image.png 几何对象的叠加 几何对象的本质,也就是画面上的不同图层。...因此若我们希望自定义y,需要将其改为 identity 。否则会报错。...散点图 jitter 通过为本来重叠在同一位置的点添加随机的“抖动”,使重叠的点产生错位,也因此能够完全地显示在图像里。 柱状图 dodge 可以让组中的直方图并列显示。...图层存在先后顺序,后来的图层越靠近顶层。 ggplot2 无法借助循环直接批量将绘图映射在同一层面上,可以借助列表先存储这些绘图,再使用拼图函数将它们拼接在同一画面上。...尝试在此图上叠加点图, # 能发现什么问题? 点图覆盖在箱线图上。后设定的图层在更靠近顶层的位置。

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    R语言STAN贝叶斯线性回归模型分析气候变化影响北半球海冰范围和可视化检查模型收敛性|附代码数据

    在这个入门教程中,我们将从一个线性模型开始,经历模型建立的迭代过程。在我们的高级stan教程中,我们将探索更复杂的模型结构。 首先,在建立模型之前,你需要定义你的问题并了解你的数据。...---- 01 02 03 04 尝试自己将先验更改为一些不同的数字,看看会发生什么,这是贝叶斯建模中的一个常见问题,如果您的先验分布非常窄,但不符合您对系统或数据分布的理解,您可以运行无法有意义地解释数据变化的模型...对于更简单的模型,收敛通常不是问题,除非您的代码中有错误,或者运行采样器的迭代次数太少。 收敛性差 尝试仅运行 50 次迭代的模型并检查跟踪图。...plot(fit) 图 9.Stan 模型不同链的跟踪图 。 我们还可以查看后验密度和直方图。...每一行都是模型的一次迭代(单一后验估计)。 我们可以制作一些更漂亮的图。这个包是ggplot2。 在200次后验抽样中,比较y的密度和y的密度。

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    R语言用贝叶斯线性回归、贝叶斯模型平均 (BMA)来预测工人工资|附代码数据

    这些数据是从 935 名受访者的随机样本中收集的。该数据集是_计量经济学数据集_系列的一部分 。 加载包 数据将首先使用该dplyr 包进行探索 ,并使用该ggplot2 包进行可视化 。...我们在数据中看到的工资变化的一种可能的、简单的解释是更聪明的人赚更多的钱。下图显示了每周工资和 IQ 分数之间的散点图。...gplot(wae, es(iq, wge)) + gom_oint() +gom_smoth() ---- 点击标题查阅往期内容 R语言和STAN,JAGS:用RSTAN,RJAG建立贝叶斯多元线性回归预测选举数据...,以及每个系数被包含在真实模型中的概率。..., newdt = wrkr,eitr = "BMA") # 将结果转换为元 exp(wk_pedct) 预计这名化妆工作人员的周薪为 745 元。

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    R语言用贝叶斯线性回归、贝叶斯模型平均 (BMA)来预测工人工资|附代码数据

    这些数据是从 935 名受访者的随机样本中收集的。该数据集是_计量经济学数据集_系列的一部分 。加载包数据将首先使用该dplyr 包进行探索 ,并使用该ggplot2 包进行可视化 。...#工资数据的简单柱状图hst(wge$wae, breks = 30)直方图还可用于大致了解哪些地方不太可能出现结果。...我们在数据中看到的工资变化的一种可能的、简单的解释是更聪明的人赚更多的钱。下图显示了每周工资和 IQ 分数之间的散点图。...gplot(wae, es(iq, wge)) + gom_oint() +gom_smoth()----点击标题查阅往期内容R语言和STAN,JAGS:用RSTAN,RJAG建立贝叶斯多元线性回归预测选举数据左右滑动查看更多... = wrkr,eitr = "BMA")# 将结果转换为元exp(wk_pedct)预计这名化妆工作人员的周薪为 745 元。

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    Unity性能调优手册3:分析工具,Profile,FrameDebugger,MemoryProfiler,HeapExplorer

    1.将目标平台从构建设置更改为iOS 2.将设备连接到PC并启动Development Build应用程序 3.从Unity Profiler中选择要连接的设备(图3.5) 4.开始记录 接下来...接下来,解释标题项。 调用更容易被视为视图,因为它将多个函数调用合并到单个项中。然而,尚不清楚它们是否都具有相同的处理时间,还是只有其中一个处理时间较长。...点击“快照面板Snapshot Panel ”或“详细面板Detail Panel ”按钮将显示或隐藏屏幕左侧和右侧的信息面板。如果您只想看到树状图,最好隐藏它们。你也可以点击“?”打开官方文件。...控件中显示了一个解释详情面板,因此检查您不理解的项目是个好主意。 屏幕的下一个区域称为树图,它以图形方式显示每个对象类别的内存使用情况。通过选择每个类别,您可以检查类别内的对象。...屏幕底部的部分称为树图表。这里,对象列表以表格格式排列。可以通过按树图表的标题对显示的项目进行分组、排序和过滤。 特别是,将类型分组使其更容易分析,因此请主动使用它。

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    R语言用贝叶斯线性回归、贝叶斯模型平均 (BMA)来预测工人工资|附代码数据

    这些数据是从 935 名受访者的随机样本中收集的。该数据集是_计量经济学数据集_系列的一部分 。 加载包 数据将首先使用该dplyr 包进行探索 ,并使用该ggplot2 包进行可视化 。...我们在数据中看到的工资变化的一种可能的、简单的解释是更聪明的人赚更多的钱。下图显示了每周工资和 IQ 分数之间的散点图。...gplot(wae, es(iq, wge)) + gom_oint() +gom_smoth() ---- 点击标题查阅往期内容 R语言和STAN,JAGS:用RSTAN,RJAG建立贝叶斯多元线性回归预测选举数据...,以及每个系数被包含在真实模型中的概率。..., newdt = wrkr,eitr = "BMA") # 将结果转换为元 exp(wk_pedct) 预计这名化妆工作人员的周薪为 745 元。

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    R语言用贝叶斯线性回归、贝叶斯模型平均 (BMA)来预测工人工资|附代码数据

    这些数据是从 935 名受访者的随机样本中收集的。该数据集是_计量经济学数据集_系列的一部分 。 加载包 数据将首先使用该dplyr 包进行探索 ,并使用该ggplot2 包进行可视化 。...我们在数据中看到的工资变化的一种可能的、简单的解释是更聪明的人赚更多的钱。下图显示了每周工资和 IQ 分数之间的散点图。...gplot(wae, es(iq, wge)) + gom_oint() +gom_smoth() ---- 点击标题查阅往期内容 R语言和STAN,JAGS:用RSTAN,RJAG建立贝叶斯多元线性回归预测选举数据...,以及每个系数被包含在真实模型中的概率。..., newdt = wrkr,eitr = "BMA") # 将结果转换为元 exp(wk_pedct) 预计这名化妆工作人员的周薪为 745 元。

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    R语言用贝叶斯线性回归、贝叶斯模型平均 (BMA)来预测工人工资|附代码数据

    相关视频拓端,赞30加载包数据将首先使用该dplyr 包进行探索 ,并使用该ggplot2 包进行可视化 。稍后,实现逐步贝叶斯线性回归和贝叶斯模型平均 (BMA)。...#工资数据的简单柱状图hst(wge$wae, breks = 30)​编辑直方图还可用于大致了解哪些地方不太可能出现结果。...我们在数据中看到的工资变化的一种可能的、简单的解释是更聪明的人赚更多的钱。下图显示了每周工资和 IQ 分数之间的散点图。...gplot(wae, es(iq, wge)) + gom\_oint() +gom\_smoth()​编辑----点击标题查阅往期内容R语言和STAN,JAGS:用RSTAN,RJAG建立贝叶斯多元线性回归预测选举数据左右滑动查看更多...= wrkr,eitr = "BMA")# 将结果转换为元exp(wk_pedct)​编辑预计这名化妆工作人员的周薪为 745 元。

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    Day7:R语言课程 (R语言进行数据可视化)

    提供了不同的示例图和相关代码(geom或theme的代码)。 ---- 练习 当前坐标轴标签文本默认为geom_point的输入内容(即列标题)。...这些异常值表示意外的观察结果。 使用geom_boxplot()图来绘制Wt和KO基因型之间样本均值的差异。 给图添加标题。...将轴标签的大小更改为默认值的1.5倍。 将轴文本的大小(刻度线上的标签)更改为比默认值大1.25倍。 以与更改轴文本大小相同的方式更改绘图标题的大小,使用plot.title。...将图片导出到文件 有两种方法可以将图输出到文件中(而不是简单地在屏幕上显示)。第一种(也是最简单的)是直接从RStudio“Plots”面板导出,点击绘图面板上方的Export。...注2: 如果在关闭设备之前已经制作了任何其他图表,它们将全部存储在同一个文件中; 除非另有说明,否则每个图通常都会有自己的页面。 ?

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    R语言贝叶斯MCMC:用rstan建立线性回归模型分析汽车数据和可视化诊断|附代码数据

    本文将谈论Stan以及如何在R中使用rstan创建Stan模型尽管Stan提供了使用其编程语言的文档和带有例子的用户指南,但对于初学者来说,这可能是很难理解的。...stan()函数要求将数据作为一个命名的列表传入,其中的元素是你在数据块中定义的变量。对于这个程序,我们创建一个元素为N、K、X和Y的列表。...评估收敛性当使用MCMC拟合一个模型时,检查链是否收敛是很重要的。我们推荐可视化来直观地检查MCMC的诊断结果。我们将创建轨迹图,Rhat值图。首先,让我们创建轨迹图。...轨迹图显示了MCMC迭代过程中参数的采样值。如果模型已经收敛,那么轨迹图应该看起来像一个围绕平均值的随机散点。如果链在参数空间中蜿蜒,或者链收敛到不同的值,那就证明有问题了。我们来演示。  ...点击标题查阅往期内容【视频】马尔可夫链蒙特卡罗方法MCMC原理与R语言实现|数据分享R语言实现MCMC中的Metropolis–Hastings算法与吉布斯采样R语言贝叶斯METROPOLIS-HASTINGS

    2.1K00

    数据视化的三大绘图系统概述:base、lattice和ggplot2

    后续将分别就lattice和ggplot2可视化绘图系统进行简要介绍。...,可以添加第三个元素,以指定页数 Main/sub 字符型向量,设定主标题和副标题 Panel 函数,设定每个面板要生成的图形 Scales 列表,添加坐标轴标注信息 Strip 函数,设定面板条带区域...1.3 面板函数 自定义面板的各个选项,然后在绘制图形的函数中调用即可 示例4:panel面板函数设置 mypanel = function(x,y){ panel.abline...1.5 页面布局 lattice无法使用par()函数,因此需要将图形存储到对象中,然后利用plot()函数中的split = 或position = 选项来进行控制 split的方法,将第一幅图放置到第二幅图的上面...2 ggplot2绘图系统 ggplot2将数据、数据到图形要素的映射以及图形要素绘制分离,然后按图层叠加的方式作图,通过+进行叠加。

    4.4K30

    如何通过R语言制作BBC风格的精美图片

    在BBC数据团队开发了一个R包,以ggplot2内部风格创建可发布出版物的图形,并且使新手更容易到R创建图形。 例如: ? 加载所有所需的R语言包 通常在R中创建图表需要安装和加载某些软件包。...它本质上修改了ggplot2的主题功能中的某些参数。例如,第一个参数是设置绘图标题元素的字体,大小,字体和颜色。...bbplot软件包的第二个功能finalise_plot()将使标题和副标题左对齐,并在图的右下角添加带有源和图像的页脚。...因为文本和其他元素的位置在RStudio的“plot”面板中无法准确呈现(这取决于显示绘图的大小和纵横比), 因此将其保存并打开文件可以准确地表示图形的外观。...image.png 尽管可能性要小得多,但是如果您确实想对折线图进行等效处理并以大于默认高度的高度导出它,则需要执行相同的操作,但是要根据上表将t的值更改为负值 。

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    R可视乎|分面一页多图

    geom_point()中可以改变的参数alpha,colour,fill,group,shape,size,stroke(边缘的厚度)。...所以我们还可以通过其他参数来引进更多的属性,但是越多图就显得越复杂。看下面这个图,但是可读性不是很高。 ? 3.使用分面 我们可以将图片按照第三个属性进行分面处理。...3.1.facet_wrap() 当想通过单个变量进行分面,则可以使用函数`facet_wrap()`其第一个参数是一个公式,创建公式的方式是在~符号后面加一个变量名,并且该变量应该是离散的。...~cyl) 4.4.要在每个面板中重复相同的数据,只需构造一个不包含faceting变量的数据框架。...去除条子框以及改变条子位置 加入参数:strip.position = "top"(默认),可改为其他(见上面参数详解)并加入theme将strip.placement="outside"就可以去除条子的框了

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    ggThemeAssist|鼠标调整主题,并返回代码

    当然你可以用Adobe Illustrator等工具做后期编辑,但要是图重画,所有后期编辑的工作又要重来,无法实现可重复分析,每个修改都很崩溃。 有没有更方便的方式调整主题细节呢?...图例文字属性 Legend Text 同上 图例背景属性 Legend Background 括填充色Fill,外边框类型Type、线宽Size和颜色Colour 图例核心属性 Legend Keys 即图例中颜色图状的属性...,同上 子标题和图注 ?...可以修改子标题(Subtitle)和图注(Caption)中的内容。...同时还可以修改文字的属性,如字体家族、样式、大小、颜色和水平位置 编辑结果导出绘图代码 以上面板中可修改上百个参数,并提供几百个属性值的选择。这些要是靠自己记住,那可真是太难了。

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