将不同长度向量的列表转换为`tibble` - 腾讯云开发者社区

类型的类属依次为tbl_df, tbl, data.frame，用as_tibble()可以将一个数据框转换为tibble，或者直接通过tibble 像创建数据框般创建tibble 数据框： t.bp...另外，tibble类型允许其中的列是列表类型，这样，该列的每个元素就可以是复杂类型，比如建模结果（列表），元素之间可以保存不等长的值。...R lists 一个R的列表包括了各种类型的变量，并将他们放置在同一个列表当中，这些变量可以是矩阵、向量、数据集，甚至是其他的列表。...列表的提取也可以按照类似数据框的方式提取。、需要注意的是，列表用一个中括号提取内容，会返回一个列表，列表中包含提取的内容，只有用两个中括号，才会返回该内容本来的格式。...新建一个list my_list 长度的空列表my_list <- vector("list",

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R数据科学整洁之道：使用 tibble 实现简单数据框

tidyverse 中许多函数都可以创建 tibble，因为 tibble 是 tidyverse 的标准功能之一。可以通过 tibble() 函数使用一个向量来创建新 tibble。...tibble() 会自动重复长度为 1 的输入，并可以使用刚刚创建的新变量，如下所示： library(tidyverse) tibble( x = 1:5, y = 1, z = x ^ 2...data.frame() 函数功能要少得多：它不能改变输入的类型（例如，不能将字符串转换为因子）、变量的名称，也不能创建行名称。...创建 tibble 的另一种方法是使用 tribble() 函数，tribble 是 transposed tibble（转置 tibble）的缩写。...最后总结 tibble 相对于数据框来说，更简单，但更方便使用，两者的主要区别是： tibble 不能创建行名。 tibble 不能改变输入的类型（例如，不能将字符串转换为因子）、变量的名称。

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「R」用purrr实现迭代

每种类型的输出都有一个相应的函数： map()用于输出列表 map_lgl()用于输出逻辑型向量 map_dbl()用于输出双精度型向量 map_chr()用于输出字符型向量每个函数都使用一个向量（注意列表可以作为递归向量看待...）作为输入，并对向量的每个元素应用一个函数，然后返回和输入向量同样长度的一个新向量。....- attr(*, "class")= chr [1:3] "simpleError" "error" "condition" 如果将以上结果转换为2个列表，一个列表包含所有错误对象，另一个列表包含所有原始结果...因为长度都相同，所以将各个参数保存在一个数据框中： params = tibble::tribble( ~mean, ~sd, ~n, 5, 1, 1, 10, 5, 3,...本节就是对它们进行简单介绍预测函数一些函数可以与返回TRUE或FALSE的预测函数一同使用。

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R 数据整理（十一：用purrr包实现更花样的匿名函数使用）

提取列表元素的简写 map 除了调用无名函数时可以简写，在提取列表元素时也有简写的方法。较为复杂的数据，有时表现为列表的列表，每个列表元素都是列表或者向量。...JSON、YAML等格式转换为R对象就经常具有这种嵌套结构。一般这种类型的数据，导入的R 后就表现为嵌套列表的格式，也就是列表中的每个元素也都是列表。...purrr包的pmap类函数支持对多个列表、数据框、向量等进行向量化处理。pmap不是将多个列表等作为多个自变量，而是将它们打包为一个列表。...reduce2 reduce2(x, y, f) 中的x是要进行连续运算的数据列表或向量，而y是给这些运算提供不同的参数。...将数据分散存储在不同计算节点中，将需要的操作先映射到每台计算节点，进行信息提取压缩，最后用reduce的思想将不同节点的信息整合在一起。 6.

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R编程（六：向量类型详解1）

基础广义来说，向量有三种类型：存储相同数据类型的atomic vector；不同类型的 list。 NULL，长度为零的vector。...；如果需要避免factor 转型，则等向量一切处理完毕后，在转换为因子。...因子取子集，去除其他不包含levels的方法：其他日期 image.png 日期-时间 image.png 时间段反映的是两段时间的差值：列表从大类上，list 是区别于atomic...的另一大类向量。...数据框识别非法名称 image.png tibble 可以使用运算符号创建为什么要窄长的ggplot 类型数据，不要长宽数据转换rownames 的方法：数据框中定义列表的方法数据框中定义矩阵与数据框的方法

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R tips：使用enframe和map2优雅的迭代列表

使用enframe和map2迭代列表但是其实可以有更优雅的方式迭代列表，还可以完成更多的操作，比如在每个图形上加上各自的注释信息。...先将列表转变为一种特殊的tibble：包含两列name和value，name是列表名，value是相应的值。...对于test而言，value就是上面创建的三个向量，如下： test_t <- enframe(test) tets_t # # A tibble: 3 x 2 # name value...上面的图可以继续优化一下，如下： test_t %$% map2(name, value, function(x, y){ df tibble(y) #转换为tibble，列名为value...另外，上述图还可以直接交给cowplot拼图，如： test_t %$% map2(name, value, function(x, y){ df tibble(y) #转换为tibble

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R语言基础-数据清洗函数pivot_longer

cols：要转换为更长格式的列。...names_to：一个字符向量，指定要根据存储在 cols 指定的数据的列名中的信息创建一个或多个新列。如果长度为 0，或者如果提供了 NULL，则不会创建任何列。...如果长度为 1，将创建一个包含 cols 指定的列名的列。如果长度>1，将创建多个列。在这种情况下，必须提供 names_sep 或 names_pattern 之一来指定如何拆分列名。...names_sep 采用与单独（）相同的规范，可以是数字向量（指定要中断的位置），也可以是单个字符串（指定要拆分的正则表达式）。...原型（或简称 ptype）是一个零长度向量（如 integer() 或 numeric()），它定义了向量的类型、类和属性。如果您想确认创建的列是您期望的类型，请使用这些参数。

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Day07 生信马拉松-数据整理中的R

全文并非是对数据整理的实操整理,主要整理在数据整理/清洗中常用的R包介绍 library(tidyr) library(dplyr) library(stringr) library(tibble) 1...(x," ")) x2 = str_split(x," ")[[1]];x2 #向量长度仅为1，因此用[[1]] x2为字符型向量 ################################...输出逻辑向量 str_ends(x2,"e") #判断x2中e结尾的字符串,输出逻辑向量 1.5 字符串替换 x2 str_replace(x2,"o","A") #每个元素里面只替换第一次出现的目标字符...### ggplot2 分面相关设置（facet）详解 7.一些实操中的便捷函数 7.1 match() 函数 load("matchtest.Rdata") x y ## 把y的列名正确替换为x里面的...#是b的下标，可以给b取子集，也可以给与b对应的其他向量取子集。

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跟小洁老师学习R语言的第七天

专题一：玩转字符串1.检测字符串长度x 的字符数，空格也算length(x)#向量里面元素的个数2.字符串拆分str_split(x," ")#以空格为分隔符号将字符串拆分开x2 = str_split...= list()for(i in 1:length(x)){ s=s+x[[i]] result[[i]] = c(x[[i]],s)}resultdo.call(cbind,result)创建列表的三种方式...)library(dplyr)dat = t(exp) %>% #转置 as.data.frame() %>% #转换为数据框架 rownames_to_column() %>% #把行名变为正式的一列.../向量中的每个元素（向量）实施相同的操作test 列表，对列表中的每个元素（向量）求均值(试试方差var,

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生信马拉松 Day7

;x 1.1 检测字符串长度 str_length(x) #注意包括空格，空格也算一个 #[1] 42 length(x) #算的是向量有多少个元素 #[1] 1 1.2 字符串拆分 str_split...(x1) #转matrix x3 = head(x2,50) #只要前50行 pheatmap::pheatmap(x3) #画热图 #使用管道符%>%的代码 iris %>% select(-5...，不可以是多个逻辑值组成的向量 } #if+else的格式 if (){ }else{ } #ifelse的格式 ifelse( , ,) #第一个逗号前是逻辑值 #for的格式 for(){.../向量中的每个元素实施相同的操作 lapply(1:4,rnorm) #=rnorm(1),rnom(2),rnorm(3),rnom(4)，得到一个分别是1/2/3/4个元素的list 5.join...2种方法 2.如何把数据框某列的“ ”转换为NA iris$Species[iris$Species=='']=NA 3.如何删除多余的信息 #这里示例数据中，a$tumor_stage.diagnoses

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生信技能树- R语言-day7

TURE，生成长度相等的逻辑值向量，可以用来取子集，可以提出来含有h的地雷str_starts(x2,"T") #是否以t开头str_ends(x2,"e")#是否e结束5.字符串替换x2str_replace...个head 取头几个tail 取尾巴的几个还没做思考题：如何跳出一个表达矩阵里方差最大的1000个基因思考题：取出大于1的所有行向量/列表的隐式循环-lapplylapply(list, FUN, …)...对列表/向量中的每个元素实施相同的操作lapply(1:4,rnorm)两个数据框的链接merge可以合并inner_join:交集都存在的取inner_join(test1,test2,by="name...先转置3. 把行名变成一列4. “宽”变成“长”把格式变成类似于 ggplot2的形式，一列作为x，一列作为y5....1exp数据框如下library(tidyr)library(tibble)library(dplyr)dat = t(exp) %>% # 赋值dat，然后进行转置as.data.frame() %>

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2023.4生信马拉松day7-R语言综合应用

) library(tibble) 专题1 玩转字符串★★★ stringr包含几十个函数，本节课主要讲以下6个：图片 1. str_length() 检测字符串长度 str_length()数的是引号里面有多少个字母...str_length(x) length(x) 2. str_split(字符串,"拆分符号") 拆分字符串图片 -（1）拆分之后成为了了列表，列表的每个元素对应原来的每个元素拆分的结果 -（2）列表使用不方便...-（3）yes：逻辑值为TRUE时的返回值 -（4）no：逻辑值为FALSE时的返回值 -（5）支持单个的逻辑值，也支持多个逻辑值组成的向量 -（6）相当于对向量的每个元素逐个进行判断，然后对判断结果...#处理数据 library(tidyr) library(tibble) library(dplyr) dat = t(exp) %>% #转置 as.data.frame() %>% #...如何挑出30个数里最大的五个 -（1）排序 -（2）取最后五个图片 3.向量/列表的隐式循环-lapply() 对列表/向量中的每个元素实施相同的操作 lapply(1:4,rnorm) #批量画图

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R数据科学|3.5内容介绍及习题解答

mutate()一同使用。...最重要的一点是，这种函数必须是向量化的；它必须接受一个向量作为输入，并返回一个向量作为输出，而且输入向量与输出向量具有同样数目的分量。...下面介绍一些比较常用的创建函数：算术运算符：+、-、*、/、^ 它们都是向量化的，使用所谓的“循环法则”。如果一个参数比另一个参数短，那么前者会自动扩展到同样的长度。...，R会将较短向量的值，生成与较长向量相同长度的向量。...该代码还发出一个警告，即较短的向量不是较长向量的倍数。当发生这种情况时，会发出警告，因为这通常是无意的，可能是错误。

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R：purrr包用于循环迭代

map map(.x, .f, ...) map函数接受一个向量、列表，对其每一个元素执行函数。数据框其实是一种格式化表示的列表，所以也可以使用map迭代。 map函数默认返回列表。...# # $Petal.Length # [1] 3.758 # # $Petal.Width # [1] 1.199333 # # $Species # [1] NA 如果返回值需要是一个数值向量...，先将列表使用enframe转换为一个tibble： x <- 1:3 y <- list(4,5,6) paras <- list(mean=x, sd=y) paras tibble::enframe...，将多个列表包装为一个列表传给.f可。...如果此时使用map系列函数，那么就会返回一个值为NULL的列表。

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R不规则数据长变宽

交流群看到小伙伴提问：有一个数据，大概如下所示： a a b a c a b c c c a 1 3 3 3 2 5 7 2 1 9 8 想要转换为如下格式： a b c 1 3 2 3 3 2 3...1 5 9 8 我看了看，大概是提问的小伙伴自己没搞清楚自己想要什么，他自己给出来了一个非常丑陋的解决方案，他实现如下： #生成长度不等的list (猜测可以直接生成最长长度的data.frame...： $a [1] "1" "3" "3" "5" "8" $b [1] "3" "7" $c [1] "2" "2" "1" "9" 但是提问的小伙伴把需求搞复杂了，生成了列表之后一定要变成数据框...) %>% spread(x, y) %>% select(-id) 得到，如下所示： # A tibble: 5 × 3 a b c 的知识点路线图如下：了解常量和变量概念加减乘除等运算（计算器）多种数据类型（数值，字符，逻辑，因子）多种数据结构（向量，矩阵，数组，数据框，列表）文件读取和写出简单统计可视化

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「Workshop」第二期：程序控制与数据操作流

这一次的内容太多了，我讲了 2 小时都没讲完，后续再放视频吧。有一段还忘记录了。。。...recode_factor mutate, transmute mutate_ add_row add_column rename rownames_to_column, column_to_rowname 向量化函数...tibble tribble, enframe as_tibble, is_tibble 缺失值 drop_na fill replace_na 长转宽 pivot_wider, spread ?...宽转长 pivot_longer, gather ?...正则表达式与字符串处理：base 与 stringr 列表处理与迭代计算：purrr 统计建模：stats 与 broom 绘图：graphics 与 ggplot2 函数编程：apply家族和purrr

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R语言数据框、矩阵、列表的创建、修改、导出

)colnames(soft)#为了更为方便地处理，可以将不同类型的文件建设文件夹放在Rproject下，读取的时候只需按文件目录的格式输入文件夹名后Tab即可找到#如a的所有内容，同df1$df1[c(1,3),1:2] #取出第1、3行的1、2列数据，取多列的时候需要组织成合适的向量df1[,-ncol(df1)] #删去最后一列，"-"意义同向量列名或行名取子集...] #取出列为score的向量中值大于0的数据对应的行#筛选score > 0的基因df1[df1$score > 0,1] #df1$score > 0生成一个长度与df对应的逻辑值向量，取出行为TRUE...#取子集方法同数据框t(m) #转置行与列，数据框转置后为矩阵as.data.frame(m) #将矩阵转换为数据框列表列表内有多个数据框或矩阵，可通过list函数将其组成一个列表l 的重要性#再次说明1：5可以换为1:nrow(a)# 4.探索列表取子集l[2]

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从零开始的异世界生信学习 R语言部分 06 R应用专题

.检测字符串长度 str_length(x) #计算字符串中有多少字符 length(x) #计算向量中元素的个数图片图片 2. str_split 字符串拆分 x <- "The birch...canoe slid on the smooth planks." x ### 2.字符串拆分 str_split(x," ") #函数将一个向量拆分成一个列表了 x2 = str_split(x,"...) library(dplyr) dat = t(exp) %>% #转置表达矩阵，宽表变长表 as.data.frame() %>% #将表达矩阵转换为数据框 rownames_to_column...apply(test, 1, sum) ##对test数据框的每一行求和图片图片 ### 2.lapply(list, FUN, …) # 对列表/向量中的每个元素（向量）实施相同的操作...test <- list(x = 36:33,y = 32:35,z = 30:27);test #返回值是列表，对列表中的每个元素（向量）求均值(试试方差var,分位数quantile) lapply

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R语言-专题

x### 1.检测字符串长度str_length(x)length(x) #返回字符串的个数2.str_splitsplit返回列表，但是列表不能进行计算，对列表进行取子集### 2.字符串拆分str_split...)library(dplyr)dat = t(exp) %>% #转置 as.data.frame() %>% rownames_to_column() %>% #rownames变成一列...10个数a= norm(100)tail(sort(a),10)2.列表的隐式循环—lapply输入数据是列表，输出数据也是列表### 2.lapply(list, FUN, …) # 对列表/向量中的每个元素...（向量）实施相同的操作test 列表，对列表中的每个元素（向量）求均值(试试方差var,分位数quantile...)lapply(test,mean)lapply(test,fivenum)3.列表的隐式循环—sapply返回值为矩阵或向量### 3.sapply 简化结果，返回矩阵或向量sapply(test,mean

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R数据科学整洁之道：使用tidyr进行长宽数据转换

整洁数据（tidy data）是指如下图这样的数据表：在表中：每个变量都拥有自己的列每个观察/样本都拥有自己的行数据这样组织有两个明显的好处：既方便以向量的形式访问每一个变量，也方便变量之间进行向量化运算...FALSE, values_ptypes = NULL, values_transform = NULL, ... ) 创建一个宽表： library(knitr) tb_wide = tibble...tb_long) country year cases A 1999 0.7k A 2000 2k B 1999 37k B 2000 80k C 1999 212k C 2000 213k 长数据转宽数据...tidyr中的pivot_wider与pivot_longer的操作正好相反，可以将长数据转换为宽数据。...最后总结 tidyr包最重要的两个函数是： pivot_longer，将宽数据转换为长数据，就是将很多列变成两列。 pivot_wider，将长数据转换为宽数据，就是将两列变成很多列。

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R编程（二：基本数据类型及其操作之因子、矩阵、数据框和列表）

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