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R-rbind.fill|列数不一致的多个数据集“智能”合并,Get!

Q:多个数据集,列数不一致,列名也不一致,如何按行合并,然后保留全部文件的变量并集呢? A:使用 rbind.fill 函数试试!...数据集按列合并时,可以根据merge 或者 dplyr函数包的merge系列函数决定连接方式,达到数据合并的需求。...data1,data2,data3 列数不一致,列名也不一致,现在需要按行合并,可能的问题: 1)rbind: 是根据行进行合并(行叠加)但是要求rbind(a, c)中矩阵a、c的列数必需相等。...2)列数相同的时候,变量名不一致也会合并,导致出错 二 rbind.fill“智能”合并 列数不一致多个数据集,需要按行合并,尝试使用plyr包rbind.fill函数 library(plyr) rbind.fill...呐,就是这样,rbind.fill函数会自动对应数据列名,不存在的会补充列,缺失时NA填充。

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seaborn可视化数据框中的多个列元素

seaborn提供了一个快速展示数据库中列元素分布和相互关系的函数,即pairplot函数,该函数会自动选取数据框中值为数字的列元素,通过方阵的形式展现其分布和关系,其中对角线用于展示各个列元素的分布情况...,剩余的空间则展示每两个列元素之间的关系,基本用法如下 >>> df = pd.read_csv("penguins.csv") >>> sns.pairplot(df) >>> plt.show()...函数自动选了数据框中的3列元素进行可视化,对角线上,以直方图的形式展示每列元素的分布,而关于对角线堆成的上,下半角则用于可视化两列之间的关系,默认的可视化形式是散点图,该函数常用的参数有以下几个 ###...#### 3、 x_vars和y_vars 默认情况下,程序会对数据框中所有的数值列进行可视化,通过x_vars和y_vars可以用列名称来指定我们需要可视化的列,用法如下 >>> sns.pairplot...通过pairpplot函数,可以同时展示数据框中的多个数值型列元素的关系,在快速探究一组数据的分布时,非常的好用。

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    R 茶话会(七:高效的处理数据框的列)

    前言 这个笔记的起因是在学习DataExplorer 包的时候,发现: 这我乍一看,牛批啊。这语法还挺长见识的。 转念思考了一下,其实目的也就是将数据框中的指定列转换为因子。...换句话说,就是如何可以批量的对数据框的指定行或者列进行某种操作。...(这里更多强调的是对原始数据框的直接操作,如果是统计计算直接找summarise 和它的小伙伴们,其他的玩意儿也各有不同,掉头左转: 34....R 数据整理(六:根据分类新增列的种种方法 1.0) 其实按照我的思路,还是惯用的循环了,对数据框的列名判断一下,如果所取的列在数据框中,就修改一下其格式,重新赋值: data(cancer, package...比如我的数据里,只有一个分类数据,对其取反取数更加容易。

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    【Python】基于某些列删除数据框中的重复值

    导入数据处理的库 os.chdir('F:/微信公众号/Python/26.基于多列组合删除数据框中的重复值') #把路径改为数据存放的路径 name = pd.read_csv('name.csv...注:后文所有的数据操作都是在原始数据集name上进行。 三、按照某一列去重 1 按照某一列去重(参数为默认值) 按照name1对数据框去重。...四、按照多列去重 对多列去重和一列去重类似,只是原来根据一列是否重复删重。现在要根据指定的列判断是否存在重复(顺序也要一致才算重复)删重。...原始数据中只有第二行和最后一行存在重复,默认保留第一条,故删除最后一条得到新数据框。 想要根据更多列数去重,可以在subset中添加列。...如需处理这种类型的数据去重问题,参见本公众号中的文章【Python】基于多列组合删除数据框中的重复值。 -end-

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    【Python】基于多列组合删除数据框中的重复值

    最近公司在做关联图谱的项目,想挖掘团伙犯罪。在准备关系数据时需要根据两列组合删除数据框中的重复值,两列中元素的顺序可能是相反的。...本文介绍一句语句解决多列组合删除数据框中重复值的问题。 一、举一个小例子 在Python中有一个包含3列的数据框,希望根据列name1和name2组合(在两行中顺序不一样)消除重复项。...import numpy as np #导入数据处理的库 os.chdir('F:/微信公众号/Python/26.基于多列组合删除数据框中的重复值') #把路径改为数据存放的路径 df =...由于原始数据是从hive sql中跑出来,表示商户号之间关系的数据,merchant_r和merchant_l中存在组合重复的现象。现希望根据这两列组合消除重复项。...从上图可以看出用set替换frozense会报不可哈希的错误。 三、把代码推广到多列 解决多列组合删除数据框中重复值的问题,只要把代码中取两列的代码变成多列即可。

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    R语言第二章数据处理⑤数据框列的转化和计算目录正文

    正文 本篇描述了如何计算R中的数据框并将其添加到数据框中。一般使用dplyr R包中以下R函数: Mutate():计算新变量并将其添加到数据表中。 它保留了现有的变量。...同时还有mutate()和transmutate()的三个变体来一次修改多个列: Mutate_all()/ transmutate_all():将函数应用于数据框中的每个列。...Mutate_at()/ transmutate_at():将函数应用于使用字符向量选择的特定列 Mutate_if()/ transmutate_if():将函数应用于使用返回TRUE的谓词函数选择的列...tbl:一个tbl数据框 funs:由funs()生成的函数调用列表,或函数名称的字符向量,或简称为函数。predicate:要应用于列或逻辑向量的谓词函数。...# 将所有因子列转化成字符 my_data %>% mutate_if(is.factor, as.character) # 将左右数字列四舍五入 my_data %>% mutate_if(is.numeric

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    【R语言】根据映射关系来替换数据框中的内容

    前面给大家介绍过☞R中的替换函数gsub,还给大家举了一个临床样本分类的具体例子。今天我们接着来分享一下如何根据已有的映射关系来对数据框中的数据进行替换。...例如将数据框中的转录本ID转换成基因名字。我们直接结合这个具体的例子来进行分享。...接下来我们要做的就是将第四列中的注释信息,从转录本ID替换成相应的基因名字。我们给大家分享三种不同的方法。...=1) #读入CDs区域坐标文件 bed=read.table("5gene_CDs.bed",sep="\t") #从第四列提取转录本信息,这里用了正则表达式, #括号中匹配到的内容会存放在\\1中...参考资料: ☞R中的替换函数gsub ☞正则表达式 ☞使用R获取DNA的反向互补序列

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    R语言在数据科学中的应用

    功能介绍 大数据时代,我们需要一个强大的软件Runing!!!R语言出现了!!!这里是R语言最好的学习交流平台,包括R语言书籍,R语言课程,R语言程序包使用,教你获取数据,处理数据,做出决策!!...1 万亿元 每款能成功面市的新药的平均研发时间是 12 年 平均每款药物的研发成本约为 50 亿元 实验室中筛选的化合物只有大约 1/1000 能够进入到人体试验阶段 ?...(来源:生物文摘 2015-08-25 摘自《数据科学在业界的应用》) PPV课其他精彩文章: ---- 1、回复“干货”查看干货 数据分析师完整知识结构 2、回复“答案”查看大数据Hadoop...知识无极限 6、回复“啤酒”查看数据挖掘关联注明案例-啤酒喝尿布 7、回复“栋察”查看大数据栋察——大数据时代的历史机遇连载 8、回复“数据咖”查看数据咖——PPV课数据爱好者俱乐部省分会会长招募 9、...专注大数据行业人才的培养。每日一课,大数据(EXCEL、SAS、SPSS、Hadoop、CDA)视频课程。大数据资讯,每日分享!数据咖—PPV课数据爱好者俱乐部!

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    R语言数据集合并、数据增减、不等长合并

    sort 升序排列元素 rev 反转所有元素 order 获取排序后的索引 table 返回频数表 cut 将数据分割为几部分 split 按照指定条件分割数据 rbind 行合并 cbind 列合并...merge 按照指定列合并矩阵或者数据框 一、数据合并 1、merge()函数 最常用merge()函数,但是这个函数使用时候这两种情况需要注意: 1、merge(a,b),纯粹地把两个数据集合在一起...相比来说,其他一些方法要好一些,有dplyr,sqldf中的union 5、sqldf包 利用SQL语句来写,进行数据合并,适合数据库熟悉的人,可参考: R语言︱ 数据库SQL-R连接与SQL语句执行...R使用rowSums函数对行求和,使用colSums函数对列求和。...#do.call函数在数据框中执行函数(函数,数据列) library("plyr") #加载获取rbind.fill函数 #第一种方法 list1<-list() list1[[1]]=data.frame

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    GEO2R:对GEO数据库中的数据进行差异分析

    GEO数据库中的数据是公开的,很多的科研工作者会下载其中的数据自己去分析,其中差异表达分析是最常见的分析策略之一,为了方便大家更好的挖掘GEO中的数据,官网提供了一个工具GEO2R, 可以方便的进行差异分析...从名字也可以看出,该工具实现的功能就是将GEO数据库中的数据导入到R语言中,然后进行差异分析,本质上是通过以下两个bioconductor上的R包实现的 GEOquery limma GEOquery...用于自动下载GEO数据,并读取到R环境中;limma是一个经典的差异分析软件,用于执行差异分析。...Value distribution 该选项用箱线图展示所有样本中表达量的分布,结果示意如下 ? 2. Profile graph 该选项用于展示某个探针/基因在所有样本中的分布,结果示意如下 ?...第一个参数用于选择多重假设检验的P值校正算法,第二个参数表示是否对原始的表达量进行log转换,第三个参数调整最终结果中展示的对应的platfrom的注释信息,是基于客户提供的supplement file

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    问与答62: 如何按指定个数在Excel中获得一列数据的所有可能组合?

    excelperfect Q:数据放置在列A中,我要得到这些数据中任意3个数据的所有可能组合。如下图1所示,列A中存放了5个数据,要得到这5个数据中任意3个数据的所有可能组合,如列B中所示。...Dim n AsLong Dim vElements As Variant Dim lRow As Long Dim vResult As Variant '要组合的数据在当前工作表的列...A Set rng =Range("A1", Range("A1").End(xlDown)) '设置每个组合需要的数据个数 n = 3 '在数组中存储要组合的数据...lRow = lRow + 1 Range("B" & lRow) = Join(vResult, ", ") '每组组合放置在多列中...代码的图片版如下: ? 如果将代码中注释掉的代码恢复,也就是将组合结果放置在多列中,运行后的结果如下图2所示。 ? 图2

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    空间数据可视化笔记——simple features空间对象基础

    R与Python均提供有可以定制可视化应用的成熟框架。 ---- 今天这一篇跟大家分享空间数据可视化应用的前沿基础理念,以R语言为主,最后会贯穿一下Python中的简单实现。...而今天我要分享的内容就是是空间地理可视化前言应用的新方法,将地理信息数据浓缩成单个列表,每一个单独的地理信息对象都被压缩成数据框中的单个记录,这样无需ID,我们的整个空间地理信息数据框就完美的容纳了属性信息和地理信息...红色线条区域代表所有记录的地理信息属性列,是一个有与数据框等长的列表组成的列,英文表示为Simple feature geometry list-colum(sfc)。...列便是存储着空间地理信息数据的列表集合对象(geometry),其理念与R中的sf对象是一致的。...它提供了如同R语言中的sf一样的地理信息数据格式,先将独立几何对象的空间信息进行压缩封装在一个独立的空间几何对象中,然后用这些独立空间几何对象组成空间几何对象集,也即一列由列表组构成的GeoSeries

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    基础知识 | R语言数据分析之表格处理

    R语言处理数据 在R中很多内置函数,用于数据框的基本操作,比如转换、分组、排序、拼接等,常见的函数有rbind(),cbind(),dplyr(),tidyr(),reshape2,tidyverse...数据处理是ggplot2绘图的基础,同时也是R语言中花费时间较多的工作之一,提高数据处理的效率能够很快的得到可靠美观的图片。 01 表格拼接 #构建数据框 ?...#给数据框df18添加行或纵向添加表格 >dr1rbind(df18,df20) #给数据框df18添加列或横向添加表格 >dc1<-cbind(df18,df19) 运行结果如下: ?...merge()函数,合并数据框中的x和y的列名的向量,如果有些数据框y列名中没有数据,也会默认为是匹配x列名的数据。 #构建数据框 ? ?...all=TRUE是x=TRUE,y=TRUE的简写 >dm2数据框的匹配列,右边数据框的匹配列 >dm3

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    R语言入门之数据排序、合并、分类汇总

    数据排序 在R中对数据框中的数据排序,我们通常使用order()函数,该函数默认是升序,但是在要排序的变量前加上减号(-)就相当于降序排列了。...,dataframeB,by=c("ID","Country")) 2.2 添加行 将数据垂直合并时,我们常常使用rbind()函数,使用该函数时要求两数据框的列数相同,并且变量的顺序已经匹配好了。...数据分类汇总 在R中对数据进行分类汇总是一件比较容易的事情: # 对mtcars数据集的变量cyl和vs进行分类汇总并计算各组数值型变量的均值 attach(mtcars) # 固定数据集 aggdata...这里aggregate()函数的FUN=参数是用来指定对各组变量进行的操作,是一个函数(R内置函数或自定义函数),na.rm=是用来指定是否移除缺失值的参数。...关于数据的排序、合并与分类汇总就先讲到这里,有兴趣的朋友可以自行深入探索。 至此,R语言入门的所有内容均已介绍完毕,在后面的内容我会相继带大家入门Python编程以及进阶R语言。

    2.4K30

    R语言数据结构(二)矩阵

    数据结构是指在计算机中存储和组织数据的方式,不同的数据结构有不同的特点和适用场景。R语言中的常用数据结构,包括向量、矩阵、数组、列表和数据框。...为方便大家理解记忆,对每种数据结构的基本操作概括为四大类:创建数据结构往里面添加数据从里面查询数据对里面的数据进行修改这篇文章我们将介绍矩阵的使用矩阵矩阵是R语言中的一种二维数据结构,它是由一系列相同类型的元素组成的矩形数组...矩阵有两个维度,分别表示行数和列数,可以用dim()函数来获取。矩阵应用举例:创建矩阵创建矩阵的一种常用方法是使用matrix()函数,它可以将一个向量或多个向量组合成一个矩阵。...例如:# 访问m1矩阵中的第一行第二列的元素m1[1, 2]# [1] 4# 访问m2矩阵中的第二行的所有元素m2[2, ]# [1] 10 11 12# 访问m3矩阵中除了第一列以外的所有元素m3[,...m3矩阵中除了第二列以外的所有元素为NAm3[, -2] 中的第三行和第四列的元素为

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    单细胞测序—标准流程代码(3)—marker 基因富集分析_差异基因

    unique()函数会返回所有不同的细胞类型,即去重后的细胞类型列表。lapply() :是R中的一个循环函数,作用是对列表中的每个元素应用同一个函数,并返回一个列表。...lapply(degs, function(x){ ... }):对degs列表中的每一个元素(即每种细胞类型的差异表达结果)应用一个匿名函数。...:rbind()函数用于将多个数据框或矩阵按行绑定在一起。do.call()用于将rbind应用到lapply()生成的结果列表中,将不同细胞类型的统计结果合并为一个矩阵或数据框。...do.call(rbind, degs_list):将所有细胞类型的差异表达数据按行绑定在一起,生成一个整合了所有细胞类型的差异表达数据框degs_allcluster_type_df。...diffData = degs_allcluster_type_df:输入数据,即前面整合的所有细胞类型的差异表达数据框。

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    「R」apply,lapply,sapply用法探索

    apply函数可以对矩阵、数据框、数组(二维、多维),按行或列进行循环计算,对子元素进行迭代,并把子元素以参数传递的形式给自定义的FUN函数中,并以返回计算结果。...参数列表: X:数组、矩阵、数据框 MARGIN: 按行计算或按按列计算,1表示按行,2表示按列 FUN: 自定义的调用函数 …: 更多参数,可选 比如,对一个矩阵的每一行求和,下面就要用到apply做循环了...> x<-matrix(1:12,ncol=3) > apply(x,1,sum) [1] 15 18 21 24 下面计算一个稍微复杂点的例子,按行循环,让数据框的x1列加1,并计算出x1,x2列的均值...比如,对矩阵的列求和。...如果对数据框的列求和。 > lapply(data.frame(x), sum) $x1 [1] 12 $x2 [1] 12 lapply会自动把数据框按列进行分组,再进行计算。

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    【数据分析 R语言实战】学习笔记 第三章 数据预处理 (下)

    3.3缺失值处理 R中缺失值以NA表示,判断数据是否存在缺失值的函数有两个,最基本的函数是is.na()它可以应用于向量、数据框等多种对象,返回逻辑值。...在R语言中通过程序包mice中的函数mice()可以实现该方法,它随机模拟多个完整数据集并存入imp,再对imp进行线性回归,最后用pool函数对回归结果进行汇总。...by指定合并的依据(相同的行或列) by.x by.y分别为第一个数据框和第二个数据框要连接的列名 all, all.x, all.y逻辑值,默认为FALSE。...在R中,选取数据子集用中括号[] > data[data$salary>6] 3.4.3数据排序 R中的排序函数sort()只能对向量进行简单的排序,对含有多变量的数据集,需要用order指令来完成,...>t (data) 3.5.1揉数据函数 R中有两个揉数据函数stack()和unstack|(),用于数据长格式和宽格式之间的转换. stack()把一个数据框转换成两列:一列为数据,另一列为数据对应的列名称

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