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    ggplot2绘制热图标准化从0-1

    欢迎关注R语言数据分析指南 ❝最近有朋友询问绘制热图时如何使刻度条展示为从「0-1」,这就涉及对数据进行标准的特殊处理,通常对数据进行处理无外乎「取log」或者直接使用「scale()函数进行标准化」...数据清洗 df % # 将varechem数据集赋值给df,并进行列的选择和删除 select(1:14) %>% # 选择第1到14列的数据 select(-c(...ggplot(aes(name,id,fill=value))+ # 设置绘图的数据映射 geom_tile()+ # 绘制瓷砖图 labs(x=NULL,y=NULL)+ # 设置x和y轴标签为空...scale_fill_scico(palette="vik")+ # 设置填充颜色的配色方案为"vik" scale_y_discrete(expand=c(0,0),position =...'left')+ # 设置y轴为离散型,并将标签显示在左侧 scale_x_discrete(expand=c(0,0))+ # 设置x轴为离散型 theme(plot.background

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    「R」ggplot2 修改x和y轴刻度

    这个R tutorial描述如何使用ggplot2包修改x和y轴刻度。同样,该文包含如何执行轴转换(对数化,开方等)和日期转换。...改变x和y轴刻度 下面是一些设置刻度的函数: xlim() 和 ylim() expand_limits() scale_x_continuous() 和scale_y_continuous() 使用xlim...使用expand_limts()函数 注意,函数 expand_limits() 可以用于: 快速设置在x和y轴在 (0,0) 处的截距项 改变x和y轴范围 # set the intercept of...x and y axis at (0,0) sp + expand_limits(x=0, y=0) # change the axis limits sp + expand_limits(x=c(0,30...: NULL 没标签 waiver() 默认标签 character vector 指定标签 limits:指定刻度范围 trans:轴转换,可以使用 “log2”, “log10”, … 下面是示例:

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    86-R可视化18-自定义分类或连续数据坐标轴文本

    )[1] 前言 最近遇到一个问题,如何将ggplot 连续性数据的坐标轴文本,自定义成想要的分类数据,比如1:10 的数值替换成 id1, id2...id10,实现以假乱真的效果。...当然首先从基础说起,也就是从分类与连续数据的不同标签设置开始。...这里主要谈的还是标签,关于坐标的范围限定,可以参考:[[57-R可视化6-ggplot2三部曲最终之进阶为菜鸟]] 连续与分类数据的处理 无论是y 还是x 轴,都对应scale_**_discrete/...counts), fill = "red") + labs(x = NULL) + scale_x_continuous(breaks=seq(0,9,1), expand...=c(0,0), label = paste0("GSE", "00", 0:9)) 利用函数 有时候在不调整坐标轴的情况下,我们仅仅希望坐标添加上额外的标记

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    R语言进阶之坐标轴和文本

    label", ylab="y-axixlabel", xlim=c(xmin, xmax), ylim=c(ymin,ymax) ) 接下来,我将和大家简单介绍一下如何具体实现。...at 数值型向量,指定坐标轴记号的位置 labels 字符型向量,指定坐标轴记号的标记内容(默认是该处对应的数值) pos 指定坐标轴线的坐标位置 lty 指定线条类型 col 指定线条和坐标轴记号的颜色...las 0代表标签和坐标轴平行,2代表标签和坐标轴垂直 tck 指定坐标轴记号的长度,负值代表记号在图形外而正值代表在图形内,0代表不绘制记号,默认值是-0.01。...# 简单示例 # 创建数据 x c(1:10); y <- x; z <- 10/x # 创建图形边缘用于设置坐标轴 par(mar=c(5, 4, 4, 8) + 0.1) # 绘制x vs y...0.7, tck=-.01) # 给右侧的坐标轴添加标题 mtext("y=1/x", side=4, line=3, cex.lab=1,las=2,col="blue") # 添加主标题并且给底部和左侧的坐标轴添加标签

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    24式R入门作图必学之barplot条形图(一)

    plotly") #绘图plot_ly(x = group, y = values, type = "bar")图片三、进阶图形3.1 水平柱状图和刚刚的初阶一样,只是多添加了标签和...y轴,常用于计算靶点交叉数目可视化、多项频数可视化等#读取文件rt=read.table(inputFile, header=T, sep="\t",check.names =FALSE)rt1=table...=c(0, 0)) + scale_x_discrete(expand=c(0,0))+ theme_bw()ggsave(outFile,width=7,height=5...) #保存图片图片3.3 堆积百分比柱状图和刚刚的初阶类似,这里把y轴换成了百分数,常用于免疫浸润、其他需要百分比可视化等#读取文件rt=read.table(inputFile,sep="\...=c(0, 0)) + scale_x_discrete(expand=c(0,0))dev.off()图片四、讨论plotly这个包还是很有趣的,有交互性的可视化R包,可以绘制点图、线图、条形图、气泡图

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