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「R」Shiny：用户界面（三）布局

在我们知道如何创建一系列输入和输出控件之后，我们需要学会如何在一个页面中对它们进行排列，以达到比较好的展示效果。这正是布局函数的工作，布局函数提供了一个应用高层次的可视化结构。...library(shiny) 概览 Shiny 应用布局由层次函数调用创建，其中 R 中的层次结构与输出中的层次结构匹配。...理论上讲，fluidPage() 包含了我们创建 Shiny 应用布局的一切，我们可以将之前学习过的各种输入输出控件扔进去。当然，想真正创建一个好的应用是远远不够，我们需要学习更多的布局函数。...主题 创建一个好看的主题通常需要花费大量时间，作为初学者的我们应该关注内容和页面。Shiny 提供了自带的一系列主题可以自由选择，减少我们对于主题的工作。下面代码展示了 4 个基本的主题。...技术实现 可能会有读者惊讶我们上面使用了一个 R 函数 theme_demo() 来创建 Shiny 的 UI。

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    基于R语言的shiny网页工具开发基础系列-06

    Louis 2.使用chartSeries 来绘价格图 stockVis也依赖于helpers.R, 包含适应通货膨胀调整股票价格的函数 选择框和日期范围 stockVis 包含一些新的小工具 一个日期范围选择器...，使用 dateRangeInput 创建 一对选择框，使用 checkboxInput 创建，选择框小工具很简单，被勾上会返回TRUE，反之FALSE 在ui对象中，选择框的name参数是log和adjust...一个反应表达式是 一个使用 小工具的输入 返回 一个值 的R表达式。每当小工具发生改变，反应表达式就会更新这个值。...事实上，shiny会防止你在这些函数之外使用反应表达式 热身 是时候修复损坏的选择框，“Adjust prices for inflation.”...，让用户能切换价格是否适应通货膨胀 helper.R 中的adjust函数使用由圣路易斯联邦储备银行提供的Consumer Price Index 数据，将历史价格转为当前价格，是如何用代码实现呢？

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    R语言shiny之导航栏（navbar）和侧边栏（sidebar）小例子

    在Y叔的公众号看到文章**《有人基于AnnotationHub和clusterProfiler做了个shiny，就能支持1700+的物种，你却老是在问我，非模式生物怎么办！》**。...正好自己最近在学习R语言的shiny。于是找到这个shiny的代码看了看，发现不是很长，花点时间应该可以重复出来。...原本的shiny对应的github主页 https://github.com/sk-sahu/sig-bio-shiny 今天先重复一小部分 包括 导航栏 侧边栏 文本输入框 数字输入框 选择框 提交按钮...基本功能是侧边栏输入文本，在主界面以表格的形式展示出来，而且还可以把过程分为好几个步骤，这里用到的代码是 withProgress(message = "Steps:",value = 0,{incProgress...paste0("Waitting","1")),incProgress(2/7,detail = paste0("Waitting","2"))} ui代码 ui可以简单理解为前端页面 library(shiny

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    基于R语言的shiny网页工具开发基础系列-04

    告诉shiny如何在server函数构建对象，该对象会在它的代码构建一个小工具的值的时候反应 第一步：加一个R对象到UI shiny提供了一个函数家族，将R对象转换成在UI中的输出，每个函数创建特定类型的输出...接下来，需要告诉shiny如何构建对象 就是在server函数中提供构建对象的R代码 server函数在shiny的处理中扮演一个特别的角色，他会构建一个类似列表(list)的对象，被命名为output...Shiny会自动让一个包含input值的对象反应，例如下面的server函数通过选择框小部件构建的文本，创建一个反应文本行 server shiny会使用新的值重建依赖于那个小工具的所有的输出，重建对象达到更新的目的 这就是如何用shiny创建反应，通过连接input列表中的值到output中的对象。...，操作选择框的时候文本也会随之改变 在改变的时候，反应部分的代码甚至会变黄，有助于理解反应输出 练习 在上面的App加第二行反应文本，加到app的主面板，展示如 “You have chosen a range

    8.2K10

    R : Shiny|搭建单细胞数据分析云平台

    之前我们分享了许多单细胞数据分析的教程cellranger拆库定量、seurat质控分析，monocle轨迹推断，R语言给单细胞数据分析带来更多可能。...那么，在数据分析进入下游之后，如何给自己的研究增加更多可交付的内容呢？Shiny会是一个不错的选择。 ?...shiny是一个R包，它可以让你很容易地直接基于R语言构建交互式web应用程序。你可以在网页上托管独立的应用程序，或者将它们嵌入R Markdown文档或构建仪表盘。...特别是，当实验室有好几个师弟师妹，研究不同的通路一会画一个小提琴图一会画一个tsne图，为什么不给你们实验室写一个Shiny！ 其实，并不难。...image 根据自己的喜好，我选择的是Multiple File（ui.R/server.R），主要是给人一种前端和后端分开的感觉，其实app.R也是一样的通过两个函数来分别控制，我起的名字是seuratreport

    4.5K20

    基于R语言的shiny网页工具开发基础系列-05

    上面是shiny团队的稿件 l5-更复杂的反应app 创建一个更复杂的依赖R脚本和额外数据的有灵魂的（能反应的）app 使用R脚本和数据 此篇旨在展示如何载入数据，R脚本，包，用来构建app。...，有percent_map构建，采用五个参数 前三个参数，var, color, 和 legend.title, 取决于选择框小工具的值 后两个参数，max和min，取决于滑块小工具的最大值和最小值 下面的...R的switch函数能随心所欲转换选择框的输出。...构建参数值 如何放置这些设置参数的代码 赶紧先自己做做吧 回顾 如今，你已经可以使用R脚本，数据集，包创建复杂的app了 有几个要点 对于shiny app 来说，app.R脚本所在的路径就是工作目录...每次启动，shiny会运行app.R中的代码，server函数之前的部分只会在这个app启动时运行一次 server之中的代码会运行多次，可能会拖慢app速度 switch是多选项小工具的实用辅助函数

    2.2K20

    十个超级好用的R语言编程技巧，一般人绝不知道！

    由于R语言生态系统内容繁复并在不断发展，人们往往容易忽视一些切实有用的知识。这些技巧往往非常简单，但对于完成工作有很大的帮助。 本文将介绍十个能够让R语言编程工作更加轻松的小知识。...1. switch函数 在if语句基于其他变量值来选定某个值时，switch可以很方便地缩短if语句。这个技巧在编程中需要根据之前的抉择加载一个不同的数据集时非常有用。...", "rabbit" ="rabbitdata.csv")) 当需要根据一个或多个输入菜单选择在Shiny应用程序中加载不同的数据集甚至环境文件时，这个技巧非常有用。...3. flexdashboard包 如果想要创建一个能快速启动和高效运行的Shiny仪表盘，可以选择flexdashboard。这个包提供简单的HTML快捷方式，可以简化侧边栏创建和构建行列展示。...R Shiny中的req函数和validate函数 R Shiny常常让人崩溃，特别是在弹出一般性错误提醒而程序员又一头雾水的时候。

    3.1K10

    「R」Shiny：响应式编程（一）server 函数

    在前面的文章中，我们介绍了如何创建用户界面。现在我们将内容转向对于 Shiny 服务端的讨论，它会让我们在运行时中使用R代码让用户界面栩栩如生。 在 Shiny 中，我们使用响应式编程表达服务逻辑。...我们将从 server 函数开始，讨论更多让 input 和 output 参数工作的细节。接着我们将回顾最简单的响应式（将输入直接连接到输出），然后讨论响应式表达式如何让我们减少重复的工作。...library(shiny) server 函数 学习过之前文章的读者应该已经知道，Shiny 的核心结构如下： library(shiny) ui <- fluidPage( # 前端界面 )...为了达到这样的目的，Shiny 每次启动一个新的会话，都会调用一次 server() 函数。就像其他任何 R 函数一样，每当 server 函数被调用时，它都会创建一个新的独立局部环境。...因为我们基本上不会自己调用这个函数，所有我们也不会要自己创建这些对象。相反，它们是 Shiny 启动时自动创建的，绑定一个特定的会话。

    3.2K10

    软件开发|如何用 R 语言的 Shiny 库编写 web 程序

    我这个月在写一些更加长的文章，所以你们可以在几周后再来看看。本月，我想简要地提下我自己一直在玩的一个很棒的R库。 我的一个亲密朋友最近在用R编写东西。...我进展有点慢，但我一直试图将它与我在其他领域的经验联系起来，我甚至开始考虑非常简单的web程序。 Shiny是一个来自RStudio的工具包，它让创建web程序变得更容易。...,textInput("textOut","Resultswillbeprintedinthisbox"))shinyApp(uiui,serverserver)当你在输入框中输入文字时，它会被复制到输出框中提示语后...包括在Shiny中的Bootstrap有了大量样式和主题，所以在学习了一点后，就能用R创建大量功能丰富的web程序。使用附加包可以将功能扩展到更高级的JavaScript程序、模板等。...经验丰富的R大牛可能已经知道Shiny了；它已经存在大约几年了。对于像我这样来自一个完全不同的编程语言，并且希望学习一点R的人来说，它是相当有帮助的。

    1.6K40

    基于R语言的shiny网页工具开发基础系列-01

    app的结构 一个shiny app分三个部分 一个用户界面对象 用户界面(ui)对象控制app的输出和外观 一个server函数 server 函数包含让计算机构建app的指令 调用shinyApp...runApp和其他R中的许多函数(read.csv, read.table)一样，第一个参数的是从工作目录到app的目录的文件路径，以上代码假设my_app文件夹包含在你的工作路径，因此，只需要输入文件夹的名字...当shiny app启动后，R的会话框会变成忙碌状态，不能运行任何其他代码，R会监控app并处理app的反应。...会话框的右上角的红色stop可以停止进程 3....改改代码练习一下 在工作目录创建一个新的文件夹App-1，用上面的代码创建一个app.R,看起来像这样 # 输入命令启动一下看看 runApp("App-1") 终止app并尝试做如下更改 1.把标题从

    2.8K30

    69-R可视化12-用easylabel轻松手动添加标记

    基于shiny 的easylabel 包或许是你的选择。 这里我以火山图为例。...没想到，它是需要直接以数据框操作的。...这里因为以火山图为例，先使用火山图绘图函数easyVolcano ：需要注意这里的数据框的行名需要是基因名 # 开始之前修改一下数据框 DEG$new_P <- -log10(DEG$P_value)...，也是y轴； ylim 是整个坐标轴y 的边界范围； xlim 同上，超过这两个边界的点会被标记为outlier; colScheme 为指定的颜色版; vline 标记y 轴线段，用于分割结果，类似之前的...geom_hline 操作； 接下来我们就可以在shiny 中交互添加了： 在shiny 界面，你还可以对标签的位置进行个性化设置： 此外，除了在图上标记，还有一个非常有意思的筛选框，你可以通过输入基因名的方式标记

    1K20

    「R」Rmarkdown与Shiny

    下面说说如何嵌入图。 一般的图非常简单，和平常写R代码一样，不过不在.R中写，而是在.Rmd中写，将你的代码写入如下的代码框中，使用Control+Alt+i可以直接插入一个代码框。...创建Shiny交互式应用程序 shiny由RStudio开发，不同于前面的动图，它可以在web浏览器中运行。...一个shiny应用程序基本由两个重要部分组成：一个是Web浏览器交互的HTTP服务器，另一个是HTTP服务器交互的R会话。...服务器背后的逻辑是根据输入input的样本容量n生成随机数，计算随机样本的均值，并将结果放在output中。...我们可以根据想展示给用户的参数来定义shiny应用程序的用户界面，shiny提供了丰富的输入控件： shiny_vars = ls(getNamespace("shiny")) shiny_vars[

    4.5K30

    Shiny 基础

    ，并没有输出，要想创建一个交互式的输出需要两步： 在UI里面添加一个R对象 在server函数内部告诉R如何去创建这个对象 在UI里面添加R对象 shiny提供了一系列的函数将R对象转化成UI界面的输出...，R对象名称为selected_var 提供R代码来创建这个对象 将R对象的名称放在UI里面只是告诉shiny在哪儿放置我们的输出结果，接下来我们需要告诉shiny如何去创建这个对象 server函数会创建一个类似列表的对象...，名称叫output，其包含更新app输出所需要的全部R代码；所以我们创建的每个R对象都要是这个output对象的一个元素，这个元素的名称和前面在UI里面创建的R对象名称要一致： server 之前保存的值，如果发生改变就会再次运行并且保存更新后的结果 Share your apps 有两种方式可以将我们的shiny app分享给别人： R脚本 这种方式需要用户电脑上安装了...app，需要提供weblink 为了让别人可以使用shiny app,我们需要： 将shiny app的目录打包成zip格式的文件 将zip文件放到网上(有网页链接) 然后就可以运行runUrl( "

    3.2K20

    R海拾遗-shiny4

    R海拾遗-shiny4 概述 shiny基础终章，shiny反应表达式学习 代码 在工作目录中创建一个名为stockVis的新文件夹 下载以下文件放在stockVis中 app.R：https://shiny.rstudio.com...这个stockvis展示的内容 选择一只股票 选择日期展示 选择是否将x轴log转换 是否通过通货膨胀对股票价格进行调整 默认情况下，stockVis会显示SPY代码(整个标普500的指数)。...解析app.r包 # 导入包 library(shiny) # 导入需要计算的函数 library(quantmod) # 导入计算通货膨胀的函数 ---- source("helpers.R")..."SPY"), # 日期选择框 dateRangeInput("dates", "Date range",# 框名...，当你选择第一个框的时候，shiny会重新从雅虎获得数据，相当于运行了下面的程序，并重新绘制图片，这可能会导致运算变慢，同时雅虎会认为数据异常，从而封闭访问 output$plot <- renderPlot

    2.7K40

    在ChatGPT帮助下创造简单的shinyAPP

    引言 ChatGPT是一种基于深度学习的自然语言处理模型，能够对人类语言进行自动理解和生成。而shinyAPP则是一种构建交互式Web应用程序的快速、简单、灵活的方式。...代码 Q1: 给我写一个利用DOSE R包计算疾病相似度矩阵的shinyAPP, 用中文注释 下面是一个利用DOSE R包计算疾病相似度矩阵的shinyAPP，注释中包含了代码的解释和中文注释： library...，以及一个选择分析方法的下拉框和一个计算按钮。...好的，根据您的要求，下面是一个使用DOSE R包计算两个疾病之间相似度的shinyAPP，界面与您提供的UI类似： library(shiny) library(DOSE) # 设置APP用户界面 ui...分别用于输入a、b两个术语集，以及一个下拉框，用于选择计算相似度的方法。

    2.3K20

    【译文】怎样学习R（下）

    如果你在处理数据框的时候遇到相关问题，查看15个容易解决数据库问题的解决方案。 数据可视化操作 有一样东西使得R成为一个强大的工具就是强大的数据可视化能力。...如果你想从可视化接下来能产生什么中得到灵感，你可以看一下诸如FlowingData那样博客，它展示了相关的可视化操作。 R的数据科学与机器学习 这里有很多供初学者查看如何进行数据科学的资源。...R markdown是基于knitr和pandoc包的。在R markdown中，R产生了一个最终的文档，并代替了R代码作为最终的结果。...你甚至可以通过使用Shiny包来创建一个交互式R mardown文档。...Shiny让R markdown的网络交互式应用的建立变得极其的容易，而你不需要知道HTML、CSS或者Javascript的相关知识。

    1.6K40

    「R」Shiny：用户界面（一）输入控件

    library(shiny) 输入控件的通用结构 所有的输入（控件）函数第 1 个参数都是相同的 inputId。...inputId 有两处限制： 必须是合法的变量名。 必须唯一。 大多数的输入函数的第 2 个参数是 label，它用于为控件创建可读的标签。它就没有限制了，尽量让大家看得懂该控件的含义即可。...数值输入 如果想要收集数值型数据，使用 sliderInput() 创建 1 个滑块，或使用 numericInput() 创建一个受限文本框。...选择列表 selectInput() 和 radioButtons() 是两种不同的创建选择列表方法。...如果你里面想要用到它，不妨参考 https://github.com/rstudio/shiny-examples/blob/master/009-upload/app.R 提供的示例 Shiny App

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