将DNA序列看作是只包含['A', 'C', 'G', 'T']4个字符的字符串,给一个DNA字符串 ,找到所有长度为10的且出现超过1次的子串。...序列进行整数编码: [‘A’, ‘C’, ‘G’, ‘T’]4个字符分别用[0, 1, 2, 3](二进制形式(00, 01, 10, 11)所表示,故长度 为10的DNA序列可以用20个比特位的整数所表示...1.设置全局整数哈希int g_hash_map[1048576]; 1048576 = 2^20,表示所有的长度为10的 DNA序列。...2.将DNA字符串的前10个字符使用左移位运算转换为整数key,g_hash_map[key]++。...3.从DNA的第11个字符开始,按顺序遍历各个字符,遇到1个字符即将key右移2位 (去掉最低位),并且将新的DNA字符s[i]转换为整数后,或运算最高位(第19 、20位),g_hash_map[key
在NGS的数据分析中,去除PCR重复序列是一个常见的分析步骤,无论是WES/WGS的snp calling,还是chip_seq, ATAC_seq,都需要对原始的bam文件进行过滤,去除其中的PCR重复序列...在samtools中也提供了去除PCR重复的命令markdup, 该命令对输入的bam文件有以下两点要求 必须是经过samtools fixmate命令处理之后的文件 必须是按照比对上染色体坐标位置排序之后的文件...另外,由于fixmate命令要求输入的bam文件为按照read name,即序列名称排序之后的文件,所以在使用markdup命令时,需要以下4步转换过程 # 第一步,按照read name排序bam文件...2. picard MarkDuplicates picard的MarkDuplicates命令称得上是使用的最广泛的去除PCR重复的工具了,要求输入的bam文件为按照比对位置排序之后的文件,用法如下...input.bam # 第二步,运行markdup命令 sambamba markdup positionsort.bam markdup.bam 除了这三种方法之外,还有很多的工具可以去除PCR重复序列
大家好,又见面了,我是你们的朋友全栈君。...您可以使用嵌套循环遍历数组以查看新输入是否存在.在函数中执行此操作会更好.此外,在执行此操作时,您需要确保您不在第一个元素,否则您将获得空指针异常. for (int i = 0; i 的内容, 请发送邮件至 举报,一经查实,本站将立刻删除。
无论我们的Mac使用的是 SSD固态硬盘或HDD机械硬盘,都必须保持硬盘读写健康程度。毕竟,数据的丢失对于来我们来说是一个重大的损失,毕竟有些数据不是花钱就能买到的。...如果你也非常关注你的Mac硬盘健康情况的话,这篇文章应该可以帮助你! 今天我将告诉大家如何检查macOS中硬盘的状态。通过这种方式,你可以轻松找出硬盘的健康状态以及是否需要更换新的硬盘。...Mac 系统在操作系统中安装了一个非常出色的诊断工具,该工具称为“磁盘工具”。您在启动硬盘“应用程序文件夹”内的“工具文件夹”中,可以找到“磁盘工具”。...在其他程序文件夹中打开磁盘工具 ; 从左侧列表中选择一个硬盘; 按"急救"按钮; 点击"运行"同意以下所有条件,然后开始检查硬盘的过程; 完成后,将显示结果,并在检查磁盘窗口中查看详细报告。...如果你的硬盘未在"磁盘工具"中显示,则它将无法正常运行或定期停止工作,并且很快就会停止工作。磁盘也可能没有稳定的数据连接,如果过一段时间电脑损坏了,这极有可能是当初检测出来的问题。
我的博客即将同步至腾讯云开发者社区,邀请大家一同入驻:https://cloud.tencent.com/developer/support-plan?...在研究 DNA 时,识别 DNA 中的重复序列有时会对研究非常有帮助。 编写一个函数来查找 DNA 分子中所有出现超多一次的10个字母长的序列(子串)。...方法返回true和false来判断子串是否出现超多一次,但是字符串保存的空间消耗大。...复习一下位运算中的按位与或非 按位或规则: 1|1=1 1|0=1 0|1=1 0|0=0 按位与规则: 1&1=1 1&0=0 0&1=0 0&0=0 非运算规则: ~1=0 ~0=1 再复习一下十六进制...class Solution { public List findRepeatedDnaSequences(String s) { //ACGT的SCII码的二进制表示
题目: 提取不重复的整数 热度指数:4740 时间限制:1秒 空间限制:32768K 本题知识点: 数组 题目描述 输入一个int型整数,按照从右向左的阅读顺序,返回一个不含重复数字的新的整数...输入描述: 输入一个int型整数 输出描述: 按照从右向左的阅读顺序,返回一个不含重复数字的新的整数 输入例子: 9876673 输出例子: 37689 在线提交网址: http://www.nowcoder.com...tpId=37&tqId=21232&rp=&ru=/ta/huawei&qru=/ta/huawei/question-ranking 分析: 先将该输入的字符串进行逆序, 使用一个vector存储每一个字符..., 存入要求是当vector中没有该字符(使用算算法库中的find()函数)....for(auto it: vect) cout<<it; cout的地方覆盖之前的
列表,在Python中是最常见的一种数据类型,对它了解的越多,编程的效率就越高。
您还可以检查是否有用于入侵检测的开放端口。 在 Linux 中有多种检查端口的方法,我将在这个快速提示中分享我最喜欢的两种方法。...方法一:使用 lsof 命令查看当前登录的 Linux 系统中打开的端口 如果您直接或通过 SSH 登录到系统,则可以使用 lsof 命令检查其端口。...为您正在检查端口的 Linux 系统的 IP 地址。...结论 在这两种方法中,我更喜欢 lsof 命令,它比 nc 命令更快。但是,您需要登录系统并拥有 sudo 访问权限。换句话说,如果您正在管理系统,则 lsof 是更合适的选择。...nc 命令具有无需登录即可扫描端口的灵活性。 这两个命令都可用于根据您所处的场景检查 Linux 中的开放端口。
基因组注释包括基因组结构注释和基因组功能注释 结构注释的核心是基因识别,为了提高基因识别效率需要首先寻找并标记去除 重复的和低复杂性的序列。 什么是重复序列?...重复序列(repetitive sequence)是在基因组中不同位置出现的相同或对称性序列片段,一般不编码多肽。组织形式有两种:串联重复序列和分散重复序列。...分类 大致分三类: 低度重复序列 中度重复序列 高度重复序列 特点 GC含量低,AT含量高,3'和5'端有直接重复序列存在,有利形成环形结构。...常用数据库 GIRI的RepBase:常用的真核生物DNA重复序列数据库 RepeatMasker:常用的重复序列分析工具 ALU数据库:人和灵长类Alu重复片段 LINE-1数据库...: STR数据库:短的串联重复序列数据库,不再提供服务 ---- 1 RepeatMasker工具 这个工具有webserver版本和命令行版本 Using and Understanding
本文将以在内存不足的情况下,找出亿级规模整数集合中的不重复元素为例,探讨一种基于Bloom Filter的数据结构的解决方案。问题分析假设有一个包含2.5亿个整数的集合,需要找出其中不重复的整数。...具体地,思路是:初始化一个225MB大小的Bloom Filter分批读取整数数据,每次处理1万个对每批数据,将元素存入Bloom Filter再次遍历数据,检查每个元素是否在Bloom Filter中命中未命中的元素即为不重复元素代码实现...); // 持久化到磁盘} } reader.close(); reader = new BufferedReader(new FileReader(inputPath)); // 再次遍历,检查哪些元素未命中...二次遍历时只检查元素是否在Bloom Filter中,而不需要加载集合本身。总结对于内存无法容纳的超大数据集,使用Bloom Filter可以实现高效地去重和查询。...内存受限情况下处理大数据问题,需要深入理解数据结构与算法的特性,权衡时间空间效率的平衡,设计出针对特定问题的优化方案。本文给出了一种基于Bloom Filter解决大整数去重问题的设计思路。
本文链接:https://blog.csdn.net/weixin_42449444/article/details/85316270 题目描述: 输入一个int型整数,按照从右向左的阅读顺序,返回一个不含重复数字的新的整数...输入描述: 输入一个int型整数。 输出描述: 按照从右向左的阅读顺序,返回一个不含重复数字的新的整数。...输入样例: 9876673 输出样例: 37689 解题思路: 题目关键字“从右往左”,无脑利用queue先进先出的特点。用map记录输出过的数字,防止重复的数字被输出。...; while(n) { q.push(n%10); n /= 10; } map m; //用map记录输出过的整数...,防止输出重复的数字 while(!
1. 2的补码 在计算机中,整数是用2的补码表示的,其定义如下(非官方定义,自己总结的): 最高位(首位)是符号位,为0代表正数,为1代表负数 对于非负整数(大于等于0的整数),其补码等于原码(也就是说...根据前面介绍的转换规则,转为十进制后为-1234。 二、整数在程序中的表示 本章以下面的代码为例,看看整数在汇编代码和运行期的形态。...整数在内存中的表示 通过gdb可以看到变量signed_int和unsigned_int在内存中的信息如下所示: ?...整数比较大小 下面的代码,大家都知道为啥输出结果不一样,因为右边的int被提升为unsigned int,-12345被解析成了4294954951,所以大于1。 但类型转换是如何做到的呢?...除了编译器没人关心数据类型(解释型语言除外),它根据不同的类型使用不同的指令。 四、参考资料 如何实现减法 arm指令集简介 arm状态寄存器 arm中的比较指令cmp arm中的跳转指令
提取不重复的整数 2. 描述 题目描述 输入一个int型整数,按照从右向左的阅读顺序,返回一个不含重复数字的新的整数。...输入描述: 输入一个int型整数 输出描述: 按照从右向左的阅读顺序,返回一个不含重复数字的新的整数 示例1 输入 9876673 输出 37689 3....实现方法 3.1 方法 1 3.1.1 思路 将数字转换为字符串; 然后初始化一个列表,从右向左遍历字符串,然后将 list 中不存在的元素加入,存在的元素则跳过; 将列表转换为字符串; 将字符串转换为整形并最终返回...提取不重复的整数 */ public class Main { public static void main(String[] args) { Scanner input...,按照从右向左的阅读顺序,返回一个不含重复数字的新的整数。
import java.io.IOException; import java.io.OutputStream; import java.util.Random; /** 测试随机生成前N个不重复的整数...TestRandom { public static void main(String[] args) { randomNumber2File("e:/random.txt"); } /** 根据提供的路径生成相应的随机数...TODO Auto-generated catch block e.printStackTrace(); } } } } /** 利用随机生成数组的索引实现随机...,并通过交换实现不重复 @param n @return */ public static int[] ranInt(int n) { int[] arr = new int[n]; int...i++){ arr[i] = i+1; } for(i = 1; i < n; i++){ randomIndex = ranIndex(0, i); //交换当前元素和生成的随机元素
一、前言 昨天分享了一个文章,Python中如何获取列表中重复元素的索引?,后来【瑜亮老师】看到文章之后,又提供了一个健壮性更强的代码出来,这里拿出来给大家分享下,一起学习交流。...= 1] 这个方法确实很不错的,比文中的那个方法要全面很多,文中的那个解法,只是针对问题,给了一个可行的方案,确实换个场景的话,健壮性确实没有那么好。 二、总结 大家好,我是皮皮。...这篇文章主要分享了Python中如何获取列表中重复元素的索引的问题,文中针对该问题给出了具体的解析和代码演示,帮助粉丝顺利解决了问题。...最后感谢粉丝【KKXL的螳螂】提问,感谢【瑜亮老师】给出的具体解析和代码演示。
我们知道在 Java 的 List 中是允许对象或者元素是重复的。 不允许重复的集合,我们可以使用 set。...在有时候,我们希望 List 集合中的内容是不重复的,所以我们需要对 List 进行一次去重。 使用 Guava 其实有多个办法来去重,相对简单实用点的可以使用 Guava。...Sets.newHashSet(townsName)); logger.debug("Town Count Clean - [{}]",townsName.size()); 上面代码就是简单的把...List 设到 HashSet 中,然后再转换为 List。...上面的内容为测试的问题,第一步是使用 FileUtils 将文本中的内容读取到 List 列表中。 https://www.ossez.com/t/java-list/13247
2023-05-01:给你一个整数 n ,请你在无限的整数序列 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, ...中找出并返回第 n 位上的数字。...输入:n = 11输出:0解释:第 11 位数字在序列 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, ... 里是 0 ,它是 10 的一部分。...2.实现函数 findNthDigit,其输入为整数 n,表示要查找的数字在整数序列中的位置。根据 under 数组,找到包含第 n 个数字的区间长度 len,并返回调用子函数 number 的结果。...如果 offset 等于 0,则说明已经到达最低位,直接返回路径经过的值中的第 nth 个数字;否则,计算出当前节点 cur 取值(这可能需要根据 offset 来进行特殊处理),根据 all 和 offset...4.在 main 函数中,定义一个整数变量 n 表示要查找的数字在整数序列中的位置,调用 findNthDigit 函数查找第 n 个数字,并输出结果。
Golang 错误处理最让人头疼的问题就是代码里充斥着「if err != nil」,它们破坏了代码的可读性,本文收集了几个例子,让大家明白如何优化此类问题。...实际上真正的源头是它们的参数 io.Writer,因为直接调用 io.Writer 的 Writer 方法的话,方法签名中有返回值 error,所以每一步 fmt.Fprint 和 io.Copy 操作都不得不进行重复的错误处理...error,但是我们单独保存了一份 error,并且在方法内部判断一旦有问题就立刻返回,有了这些准备工作,新版的 WriteResponse 不再有重复的错误判断,只需要在最后检查一下 error 即可...类似的做法在 Golang 标准库中屡见不鲜,让我们继续看看 Eliminate error handling by eliminating errors 中提到的一个关于 bufio.Reader 和...通过对以上几个例子的分析,我们可以得出优化重复错误处理的大概套路:通过创建新的类型来封装原本干脏活累活的旧类型,同时在新类型中封装 error,新旧类型的方法签名可以保持兼容,也可以不兼容,这个不是关键的
我们可能会出现这种情况,某个表原来设计不周全,导致表里面的数据数据重复,那么,如何对重复的数据进行删除呢? ...重复的数据可能有这样两种情况,第一种时表中只有某些字段一样,第二种是两行记录完全一样。 一、对于部分字段重复数据的删除 先来谈谈如何查询重复的数据吧。 ...你叫我们执行这种语句,那不是把所有重复的全都删除吗?而我们想保留重复数据中最新的一条记录啊!大家不要急,下面我就讲一下如何进行这种操作。 ...在oracle中,有个隐藏了自动rowid,里面给每条记录一个唯一的rowid,我们如果想保留最新的一条记录, 我们就可以利用这个字段,保留重复数据中rowid最大的一条记录就可以了。 ...,可以考虑建立临时表,讲需要判断重复的字段、rowid插入临时表中,然后删除的时候在进行比较。
在日常开发中,作为一个JavaScript开发者,我们经常需要检查对象中某个键是否存在。这看似简单,但其实有多种方法可供选择,每种方法都有其独特之处。...本文将介绍几种检查JavaScript对象键的方法,并比较它们的性能。...==) 可读性不如其他方法 容易拼写错误'undefined' 使用in操作符 in操作符允许我们检查键是否存在于对象中: if ('name' in user) { console.log(user.name...); } 这种方法只会返回对象自身拥有的键,而不会检查继承的属性: 只检查自身键,不包括继承的 方法名清晰,容易理解 缺点是hasOwnProperty需要方法调用,在性能关键的代码中可能会有影响。...理解这些不同方法的细微差别是检查JavaScript键的关键。根据具体需求选择合适的工具,除非性能至关重要,否则应优先考虑可读性。
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