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    脚本分享——对fasta文件中的序列进行排序和重命名

    小伙伴们大家下午好,我是小编豆豆,时光飞逝,不知不觉来南京工作已经一年了,从2018年参加工作至今,今年是我工作最快乐的一年,遇到一群志同道合的小伙伴,使我感觉太美好了。...今天是2022年的最后一天,小编在这里给大家分享一个好用的脚本,也希望各位小伙伴明年工作顺利,多发pepper。‍...pip install biopython pip install pandas 查看脚本参数 python Fasta_sort_renames.py -h 实战演练 # 只对fasta文件中的序列进行命令...python Fasta_sort_renames.py -a NC_001357.1.fna -p scoffold -s F -a rename_fasta.fna # 对fasta文件中序列根据序列长短进行排序...,并对排序后的文件进行重命名 python Fasta_sort_renames.py -a NC_001357.1.fna -p scoffold -s T -a rename_fasta.fna

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    【科技】机器学习和大脑成像如何对嘈杂环境中的刺激物进行分类

    AiTechYun 编辑:nanan 学习识别和分类对象是一种基本的认知技能,可以让动物在世界上发挥作用。例如,将另一种动物识别为朋友或敌人,可以决定如何与之互动。...然而,如果动物与环境分离,那么动物通常无法获得理想的物体。同样的物体通常会以不同的视角,如部分的阻碍,或在不理想的光照条件下,都有可能受到影响。因此,在噪声和退化条件下进行分类研究是必要的。 ?...大脑是如何在退化的条件下处理分类刺激物的?...为了解开这两个可能性,研究人员在Purdue MRI设施中进行扫描,同时对具有不同透明度水平的面具覆盖的新颖抽象刺激物进行分类。...全脑分析的结果表明, SVM可以区分最恶化的视觉条件和其他两个(退化)查看条件。 通过对SVM学习模式的分析,发现后视区V1、V2、V3和V4在不同的观测条件下是最重要的。

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    Mysql基础

    八、排序 ASC :升序(默认) DESC :降序 可以按多个列进行排序,并且为每个列指定不同的排序方式: SELECT * FROM mytable ORDER BY col1 DESC, col2...十三、分组 分组就是把具有相同的数据值的行放在同一组中。 可以对同一分组数据使用汇总函数进行处理,例如求分组数据的平均值等。 指定的分组字段除了能按该字段进行分组,也会自动按该字段进行排序。...SELECT col, COUNT(*) AS num FROM mytable GROUP BY col; GROUP BY 自动按分组字段进行排序,ORDER BY 也可以按汇总字段来进行排序。...主索引是聚簇索引,在索引中保存了数据,从而避免直接读取磁盘,因此对查询性能有很大的提升。...缺点:查询视图时,必须把视图的查询转化成对基本表的查询) https://www.cnblogs.com/chenpi/p/5133648.html 8 数据库查询语句很慢,如何优化(索引、优化sql

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    Oracle高级查询-imooc

    第1章 课程概述  1-1 Oracle高级查询课程概述 (05:14) 第2章 分组查询 本章介绍分组函数的概念和应用,以及GROUP BY子句和HAVING子句的使用。  ...(13:51) 第4章 子查询 本章介绍如何使用子查询以及子查询的类型。  ...:05)  4-8 [Oracle] 主查询和子查询不是同一张表 (05:40)  4-9 [Oracle] 子查询的排序问题 (09:09)  4-10 [Oracle] 主查询和子查询的执行顺序 (...找到员工表中工资最高的前三名:  select * from (select * from emp order by sal desc ) where rownum<=3; 8、一般先进行子查询再执行主查询...需要进行两个表的连接查询,为两个表都取别名 使用instr(a,b)函数,该函数的含义为:如果字符串b在字符串a里面,则返回的是b在a中的位置,即返回值大于0 需要用到分组查询 使用wm_concat

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    Mysql基础

    八、排序 ASC :升序(默认) DESC :降序 可以按多个列进行排序,并且为每个列指定不同的排序方式: SELECT * FROM mytable ORDER BY col1 DESC, col2...十三、分组 分组就是把具有相同的数据值的行放在同一组中。 可以对同一分组数据使用汇总函数进行处理,例如求分组数据的平均值等。 指定的分组字段除了能按该字段进行分组,也会自动按该字段进行排序。...SELECT col, COUNT(*) AS num FROM mytable GROUP BY col; GROUP BY 自动按分组字段进行排序,ORDER BY 也可以按汇总字段来进行排序。...主索引是聚簇索引,在索引中保存了数据,从而避免直接读取磁盘,因此对查询性能有很大的提升。...缺点:查询视图时,必须把视图的查询转化成对基本表的查询) https://www.cnblogs.com/chenpi/p/5133648.html 8 数据库查询语句很慢,如何优化(索引、优化sql

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    第36次文章:数据库查询语句

    2、笛卡尔乘积现象 表1 有m行,表2 有n行, 结果= m*n行。 发生原因:没有有效的连接条件。 如何避免:添加有效的连接条件。...(2)按功能分类: 内连接:等值连接、非等值连接、自连接 外连接:左外连接、右外连接、全外连接 交叉连接 二、sql92语法 由于在sql语法中,仅仅支持内连接,所以我们对sql92语法标准的介绍仅限于内连接的三种方式...排序条件】 【注】:【】中的内容均为可选项目,根据用户自己的需求进行添加。...分别是emp表和dept表的部门编号进行关联,dept表的与city表的位置标号location_id 相关联。...3、示例 我们根据上面的分类,对每一类给出一个典型案列,结合其语法和结果一起分析 #1、标量子查询 #案例:查询最低工资大于1号部门最低工资的部门id和其最低工资 select MIN(salary)

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    MySQL数据库进阶-SQL优化

    专栏系列:MySQL数据库进阶 前言 在看此篇前,建议先阅读MySQL索引,对索引有个基本了解:MySQL数据库进阶-索引-CSDN博客 在进行SQL优化前,我们必须先了解SQL查询的性能分析,为什么这条...语句执行过程中表如何连接和连接的顺序。...(简单表,即不适用表连接或者子查询)、PRIMARY(主查询,即外层的查询)、UNION(UNION中的第二个或者后面的查询语句)、SUBQUERY(SELECT/WHERE之后包含了子查询)等...,把每行的主键id值都取出来,返回给服务层,服务层拿到主键后,直接按行进行累加(主键不可能为空) count(字段):没有not null约束的话,InnoDB引擎会遍历整张表把每一行的字段值都取出来...服务层对于返回的每一层,放一个数字 1 进去,直接按行进行累加 count(*):InnoDB 引擎并不会把全部字段取出来,而是专门做了优化,不取值,服务层直接按行进行累加 按效率排序:count

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    面试 SQL整理 常见的SQL面试题:经典50题

    ] group by 分组 [每门课程:按课程号分组] having 对分组结果指定条件 [没有] order by 对查询结果排序[按平均成绩升序排序:asc,平均成绩相同时,按课程号降序排列:desc...分组 [没有] having 对分组结果指定条件 [] order by 对查询结果排序[查询结果按按分数降序排列]; */ select 学号 from score where 课程号='04' and...[学生选修人数(超过2人的课程才统计):每门课程学生人数>2] order by 对查询结果排序[查询结果按人数降序排序,若人数相同,按课程号升序排序]; */ select 课程号, count(学号...查询条件[成绩 < 60] group by 分组[没有] having 对分组结果指定条件[没有] order by 对查询结果排序[没有] limit 从查询结果中取出指定行[没有]; select...student] where 查询条件[用到运算符in] group by 分组[没有] having 对分组结果指定条件[没有] order by 对查询结果排序[没有] limit 从查询结果中取出指定行

    2.7K10

    sql语句面试经典50题_sql基础知识面试题

    ] group by 分组 [每门课程:按课程号分组] having 对分组结果指定条件 [没有] order by 对查询结果排序[按平均成绩升序排序:asc,平均成绩相同时,按课程号降序排列:desc...分组 [没有] having 对分组结果指定条件 [] order by 对查询结果排序[查询结果按按分数降序排列]; */ select 学号 from score where 课程号='04' and...[学生选修人数(超过2人的课程才统计):每门课程学生人数>2] order by 对查询结果排序[查询结果按人数降序排序,若人数相同,按课程号升序排序]; */ select 课程号, count(学号...查询条件[成绩 < 60] group by 分组[没有] having 对分组结果指定条件[没有] order by 对查询结果排序[没有] limit 从查询结果中取出指定行[没有]; select...student] where 查询条件[用到运算符in] group by 分组[没有] having 对分组结果指定条件[没有] order by 对查询结果排序[没有] limit 从查询结果中取出指定行

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    常见的SQL面试题:经典50例

    ] group by 分组 [每门课程:按课程号分组] having 对分组结果指定条件 [没有] order by 对查询结果排序[按平均成绩升序排序:asc,平均成绩相同时,按课程号降序排列:desc...分组 [没有] having 对分组结果指定条件 [] order by 对查询结果排序[查询结果按按分数降序排列]; */ select 学号 from score where 课程号='04' and...<60] group by 分组 [每个学生的平均:按学号分组] having 对分组结果指定条件 [限制条件:课程数目>2,汇总函数count(课程号)>2] order by 对查询结果排序[没有]...没有] having 对分组结果指定条件[没有] order by 对查询结果排序[没有] limit 从查询结果中取出指定行[没有]; select 学号  from score where 成绩 分组[没有] having 对分组结果指定条件[没有] order by 对查询结果排序[没有] limit 从查询结果中取出指定行[没有]; select 学号,姓名 from student

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    面试中经常被问到的 50 个 SQL 题,必须拿下!

    查询条件 [没有] group by 分组 [每门课程:按课程号分组] having 对分组结果指定条件 [没有] order by 对查询结果排序[按平均成绩升序排序:asc,平均成绩相同时,按课程号降序排列...分组 [没有] having 对分组结果指定条件 [] order by 对查询结果排序[查询结果按按分数降序排列]; */ select 学号 from score where 课程号='04' and...[学生选修人数(超过2人的课程才统计):每门课程学生人数>2] order by 对查询结果排序[查询结果按人数降序排序,若人数相同,按课程号升序排序]; */ select 课程号, count(学号...where 查询条件[成绩 < 60] group by 分组[没有] having 对分组结果指定条件[没有] order by 对查询结果排序[没有] limit 从查询结果中取出指定行[没有];...[学生表:student] where 查询条件[用到运算符in] group by 分组[没有] having 对分组结果指定条件[没有] order by 对查询结果排序[没有] limit 从查询结果中取出指定行

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    常见的SQL面试题:经典50例

    查询条件 [没有] group by 分组 [每门课程:按课程号分组] having 对分组结果指定条件 [没有] order by 对查询结果排序[按平均成绩升序排序:asc,平均成绩相同时,按课程号降序排列...分组 [没有] having 对分组结果指定条件 [] order by 对查询结果排序[查询结果按按分数降序排列]; */ select 学号 from score where 课程号='04' and...[学生选修人数(超过2人的课程才统计):每门课程学生人数>2] order by 对查询结果排序[查询结果按人数降序排序,若人数相同,按课程号升序排序]; */ select 课程号, count(学号...where 查询条件[成绩 < 60] group by 分组[没有] having 对分组结果指定条件[没有] order by 对查询结果排序[没有] limit 从查询结果中取出指定行[没有];...[学生表:student] where 查询条件[用到运算符in] group by 分组[没有] having 对分组结果指定条件[没有] order by 对查询结果排序[没有] limit 从查询结果中取出指定行

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    平平无奇SQL面试题:经典50例

    查询条件 [没有] group by 分组 [每门课程:按课程号分组] having 对分组结果指定条件 [没有] order by 对查询结果排序[按平均成绩升序排序:asc,平均成绩相同时,按课程号降序排列...[学生选修人数(超过2人的课程才统计):每门课程学生人数>2] order by 对查询结果排序[查询结果按人数降序排序,若人数相同,按课程号升序排序]; */ select 课程号, count(学号...where 查询条件[成绩 < 60] group by 分组[没有] having 对分组结果指定条件[没有] order by 对查询结果排序[没有] limit 从查询结果中取出指定行[没有];...[学生表:student] where 查询条件[用到运算符in] group by 分组[没有] having 对分组结果指定条件[没有] order by 对查询结果排序[没有] limit 从查询结果中取出指定行...在这个查询结果中,每一行表示了某个学生某一门课程的成绩。比如第一行是'学号0001'选修'课程号00001'的成绩,而其他两列的'课程号0002'和'课程号0003'成绩为0。

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    MySQL中的ROW_NUMBER窗口函数简单了解下

    这个顺序号是基于窗口函数的 ORDER BY 子句进行排序的,可以根据指定的排序顺序生成连续的整数值。ROW_NUMBER() 在分页、去重、分组内排序等场景中非常有用。...去除重复数据:可以利用 ROW_NUMBER() 来给每一行打上唯一标识,之后选择每组的第一行,从而有效地去除重复数据。分组内排序:可以按组对数据进行排序,并为每个组中的行分配一个行号。...这个场景通常用于比如给每个订单中的商品按价格排序,并为每个订单挑选排名第一的商品。数据排名:使用 ROW_NUMBER() 可以为查询结果中的数据进行排名,适用于例如学生成绩排名、销售业绩排名等场景。...示例 1:为每个订单中的商品按价格排名可以为每个订单中的商品按价格进行排序,并为每个商品分配一个排名。...分组排序:对每个分组内的数据进行排序并生成排名。数据排名:计算排名或为数据按某种规则分配顺序。

    6.8K10

    MySQL优化特定类型的查询(书摘备查)

    当MySQL知道括号中的表达式永远不会为null的时候,它就会按这种方式工作。最明显的例子就是count(*),它是count的一种特例,它不会把通配符*展开成所有列,而是忽略所有列并统计行数。...通常来说,索引也是优化它们的最重要手段。 当不能使用索引时,mysql有两种优化group by的策略:使用临时表或文件排序进行分组。任何一种方式对于特定的查询都有可能是高效的。...如果要对联接进行分组,那么通常对表的ID列进行分组会更加高效,例如下面的查询效率就不够高: select actor.first_name, actor.last_name, count(*) from...除非定义了order by,否则mysql会自动对group by里面的列进行排序。因此,如果显示包括一个含有相同列的order by子句,则对mysql的实际执行性能没有什么影响。...一个提高效率的简单技巧就是在覆盖索引上进行偏移,而不是对全行数据进行偏移。可以将从覆盖索引上提取出来的数据和全行数据进行联接,然后取得需要的列。这样更有效率。

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