大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。 文章目录 一、在anconda prompt中创建新的conda环境。...二、查看虚拟环境是否成功建立 三、进入虚拟环境 四、安装第三方依赖包 五、查看当前环境已安装的包是否于requirements.txt相同 一、在anconda prompt中创建新的conda环境。...conda create -n E8519 python=3.6 选择“y” 二、查看虚拟环境是否成功建立 conda env list 三、进入虚拟环境 activate E8519 四、安装第三方依赖包...切换工作目录到requirements.txt所在目录，在用pip安装requirements.txt中的包。...cd E:\python #例如 pip install -r requirements.txt 五、查看当前环境已安装的包是否于requirements.txt相同 pip list 发布者：全栈程序员栈长
本文的绝大部分都为解决问题的思路，如果只想知道如何安装特定版本号（每次提交的唯一标识），可以直接翻到文末。...结合该读者是最近才装的RNAseqStat，这就很有可能是永和在对包进行调整的时候出了问题，我们前往永和RNAseqStat[1]的界面，进入R，找到代码更新历史，发现在一个多月前，该部分代码（enhance_volcano.R...因为RNAseqStat没有发布不同的release，我以为只能等永和更新了，但永和提到了一种安装以前版本R包的方法。...由于github上每一次包的更新都会有所记录，我们便可以通过每次提交的唯一标识下载以前更新的包。 我们可以通过以下命令查看我安装的是哪一版的RNAseqStat。...，该bug已于昨天连夜被永和修复，大家可以放心安装新版本。
之前的一篇文章，我给出了关于多线程应用的几个例子： 都是基于Java里面Lock锁实现的，分别是： （1）两个线程轮流打印奇数和偶数 （2）多个线程模拟买票 （3）模拟生产者消费者 今天再抛砖引玉，思考一下如何在多个线程中...，轮流打印特定顺序的信息多少次。...但是呢，他们必须是有顺序，也就是说A打印完之后，才能打印B，B打印完后才行打印C，这就涉及线程协作和通信的知识了，A线程打印完毕之后，要通知B线程打印，B线程打印完之后要通知C线程打印，如果有多轮的话，...ok，主要的逻辑基本理清了，我们看下如何用代码实现，先看核心的类： 定义了共享的监视器对象，计数器，共享变量，然后定义了三个方法分别负责打印A,B,C，功能的实现主要用了synchronized + 监视器的...monitor.notifyAll(); } } } } 然后，我们看下，main方法如何编写
这是我写Ng的dp作业做的准备，好像需要安装特定版本的tensorflow 根据https://blog.csdn.net/ccgcccccc/article/details/89058445的配置要求来配置文件...tensorflow之后，可能有tensorflow-base, tensorflow等包。...安装好后打开anaconda navigator，将base改为tensorflow 以下是以后会用到的对虚拟环境的操作： 查看虚拟环境 conda env list conda info -e 使用虚拟环境...Linux：source activate env_name Windows：[conda] activate env_name 退出虚拟环境 Linux：source deactivate Windows...：[conda] deactivate 删除虚拟环境 conda remove -n env_name --all pycharm中使用特定的conda虚拟环境 Pycharm找到设置： 参考链接
安排新来的实习生整理最简单的GEO数据库的表达量芯片数据处理代码，有一个拼图的需求，不知道为什么实习生找到了一个customLayout包，但是无法安装和使用它，所以求助了我。...退出历史舞台的R包 ： packageurl <- 'https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/customLayout/customLayout..._0.3.2.tar.gz' install.packages(packageurl, repos=NULL, type="source") 大概率是缺这个退出历史舞台的R包的相关依赖包，比如我电脑就缺了一个...，需要先单独安装它依赖的包即可 ： 单独安装 是不是很简单啊！...需要基本生信背景知识 当然需要读者具备计算机基础知识，我把它粗略的分成基于R语言的统计可视化，以及基于Linux的NGS数据处理： 《生信分析人员如何系统入门R(2019更新版)》 《生信分析人员如何系统入门
许多Python项目中都包含了requirements.txt文件，该文件记录了当前程序的所有依赖包及其精确版本号。...生成requirement.txt文件 pip freeze > requirements.txt 安装requirement.txt文件依赖 pip install -r requirements.txt...除了使用pip命令来生成及安装requirement.txt文件以外，也可以使用conda命令来安装。...conda install --yes --file requirements.txt 但是这里存在一个问题，如果requirements.txt中的包不可用，则会抛出“无包错误”。...| pip install 也可以这样子操作 导出到.yml文件 conda env export > freeze.yml 直接创建conda环境 conda env create -f
目前我发现想要用bsub命令指定在特定的conda虚拟环境中运行脚本有两种办法：1. 在运行目标命令前使用source命令加载虚拟环境。...例如下面要运行base环境中的spades.py命令：#BSUB -q 5220r#BSUB -n 1,48#BSUB -J spades_hq#BSUB -o spades_hq.out#BSUB -...使用conda run命令指定目标环境，但此方法仍在开发中，使用需谨慎。...要实现同上的效果，如下：#BSUB -q 722080tiib#BSUB -n 1,48#BSUB -J spades_clean#BSUB -o spades_clean.out#BSUB -e spades_clean.errconda
的版本） 激活虚拟环境 conda activate （虚拟环境名） 退出虚拟环境 conda deactivate (虚拟环境名) 克隆一个虚拟环境 conda create -n （新虚拟环境名）...--clone （旧虚拟环境名） 删除虚拟环境 conda remove –name （虚拟环境名） –all 虚拟环境中包的管理命令 查看已有的包 conda list ☕安装虚拟环境的特定包 conda...install （包名） 安装指定版本的包 conda install （包名）=（版本） 删除虚拟环境中特定包 conda remove （包名） 更新虚拟环境特定包 conda update （包名...） 搜索虚拟环境中特定包 conda search （包名） 实例：创建一个虚拟环境并进行一些简单的操作 打开anaconda Powershell Prompt 开始—anaconda–anaconda...Powershell Prompt 查看python版本号 输入python --version查看python的版本号 添加清华镜像源 添加清华的镜像源，方便之后的一些操作（非常建议提前加入镜像源
虚拟环境和包 — Python 3.10.5 文档） WIndows下安装过程比较简单，去官网下载安装包按照提示安装即可（史上最全最详细的Anaconda安装教程_OSurer的博客-CSDN博客_anaconda...激活虚拟环境 conda activate env_name 例: conda activate py36 3. 退出虚拟环境 conda deactivate 1....使用conda 安装包 conda install 要安装的包名 例：conda install numpy 4....可以通过提供包名称后跟 == 和版本号来安装特定版本的包： python -m pip install requests==2.6.0 pip uninstall 后跟一个或多个包名称将从虚拟环境中删除包...pip show 将显示有关特定包的信息：pip list 将显示虚拟环境中安装的所有软件包：pip freeze 将生成一个类似的已安装包列表，但输出使用 pip install 期望的格式。
做生信常常用的一些包只支持老版本的R，一些新开发的包又只支持最新的R，这里我们用conda建立多个版本的R环境。...-n new_env(环境名） 环境的查看： conda env list 如需要安装特定版本的软件: conda install 软件名=版本号 最新Python的安装： conda create...py37 #或者 source activate py37 退出环境： conda deactivate #或者 source deactivate py37 创建不同版本R环境： conda create...-n r36 r=3.6 安装特定版本R conda install -c r r=3.6 #或 conda install r=3.6 conda来安装R的packages https://docs.anaconda.com...安装的包： conda list 删除已安装的软件或者包： conda remove -n 环境名 软件名 #卸载指定软件: conda remove 软件名 更新某个软件: conda update
/），生成一个.condarc配置文件，在使用conda安装包时，会从添加的镜像源中查找。...或 pip install --upgrade --ignore-installed tensorflow 安装tensorflow时，因为下载比较慢，我们选用清华镜像的包命令，这是一个临时路径，也可以指定安装的版本号...__path__ 8.退出tensorflow环境 deactivate 三、 conda命令：环境的创建与删除 Conda命令 1.查看自己配置的环境 conda env list 2.配置一个新的环境...conda create -n 环境的名字 python=版本号 3.进入和退出环境 activate 环境名 #激活环境 deactivate #退出环境 4.删除环境 conda...env remove -n 环境名 四、包（第三方库）的安装与卸载 1.查看安装的包 conda list 2.安装包 pip install 包名 3.删除包 conda remove --name
4.为确认您的conda环境是最新的，请输入： conda update conda conda update anaconda 你可能需要给一些包安装更新。 5.确认您的SciPy环境。...下面的脚本将打印您需要用于机器学习开发的关键SciPy库的版本号，如： SciPy、NumPy、Matplotlib、Pandas、Statsmodels和Scikit-learn。...您可以使用conda命令更新特定的库; 以下是将scikit-learn更新到最新版本的示例。 输入： conda update scikit-learn ?...conda-forge tensorflow 或者，您可以选择使用pip和特定版本的tensorflow为您的平台进行安装。...创建一个脚本，该脚本打印每个库的版本号，就像我们上面为安装SciPy环境所做的那样。 # theano import theano print('theano: %s' % theano.
其使用 conda 创建环境，以便分隔使用不同 Python 版本和不同程序包的项目。...安装 此处跳过安装anaconda，如有需要可参考anaconda安装、介绍、使用 使用 验证conda已被安装 conda --version 创建新环境 conda create --name...如果要安装指定的版本号，则只需要在包名后面以=和版本号的形式执行。...查看所有的环境 conda info --env 管理和使用环境 activate test_conda_env 退出环境 deactivate 删除环境(不要乱搞事情) conda remove...-n test_conda_env --all ok，这篇关于如何创建Python项目环境的文章就暂时先告一段落。
pip: pip freeze conda: conda list
参考的地址:https://zhuanlan.zhihu.com/p/32925500 conda 基础命令: 1.验证conda已被安装 conda --version 终端上就会以conda 版本号的形式显示当前安装...conda的版本号。...▫ 即安装在环境中的包名。名称两边不加尖括号“”。 ① 如果要安装指定的版本号，则只需要在包名后面以 = 和版本号的形式执行。...获取当前环境中已安装的包信息 conda list 执行上述命令后将在终端显示当前环境已安装包的包名及其版本号。 3....pip可以安装一些conda无法安装的包；conda也可以安装一些pip无法安装的包。因此当使用一种命令无法安装包时，可以尝试用另一种命令。
是一个安装、管理python相关包的软件，还自带python、Jupyter Notebook、Spyder，有管理包的conda工具，非常有用。 二、如何安装Anaconda？ ... conda create -n env_name package_name #创建名为env_name的新环境，并在该环境下安装名为package_name 的包，可以指定新环境的版本号，例如... activate env_name #切换至env_name 环境 deactivate name #退出环境（返回默认环境） conda info -e #显示所有已经创建了的环境...–name env_name –all #删除环境 conda list #查看所有已经安装的包 conda install package_name #在当前环境中安装包 conda...3）如何使用虚拟环境？ 创建、激活、退出、删除。详见上面的命令，不再赘述。 注：新创建的环境除了python自带的一些官方包之外是没有其它包的，是一个比较干净的环境。
你要的gatk ---- conda简介 Conda 是一个开源的软件包管理系统和环境管理系统，用于安装多个版本的软件包及其依赖关系，并在它们之间轻松切换。...已添加的channel在哪里查看 vim ~/.condarc 利用conda安装生物信息软件 安装命令 conda install gatk 搜索需要的安装包 提供一个网址,用于事先查找想安装的软件存不存在...gatk 如需要安装特定的版本 conda install 软件名=版本号 conda install gatk=3.7 这时conda会先卸载已安装版本，然后重新安装指定版本。.../deactivate 就退出当前的环境了 创建软件的软链接 跟着命令一路敲到这里的小旁友们估计发现了，现在退出conda环境之后之前安装的软件全都GG了，敲命令没法执行了！ 怎么办呢！...新的环境 退出环境 如上面的截图提到的，只要 conda deactivate 2019-6-28 update: 如何删除和重命名一个已存在的环境 删除环境 删除也很容易的 conda remove
解决问题： 当一个程序需要使用Python 2.7版本，而另一个程序需要使用Python 3.6版本，如何同时使用这两个程序？...2）“开始 → Anaconda3（64-bit）→ 右键点击Anaconda Prompt → 以管理员身份运行”，在Anaconda Prompt中输入conda list，可以查看已经安装的包名和版本号...验证conda已被安装 conda --version 终端上将会以conda 版本号的形式显示当前安装conda的版本号。...即安装在环境中的包名。名称两边不加尖括号“”。 如果要安装指定的版本号，则只需要在包名后面以=和版本号的形式执行。...获取当前环境中已安装的包信息 conda list 执行上述命令后将在终端显示当前环境已安装包的包名及其版本号。 3.
参考：https://www.cnblogs.com/xrblog/p/11839393.html 安装Anaconda 从官网下载，这里选择的是Python3.7版本的图形化安装包 安装后，在命令行中输入...conda --version，如果安装成功，会显示版本号 但我并没有显示，所以根据Anaconda之Python环境配置(Mac版)配置了环境变量： 首先，找到Anaconda的安装路径下bin文件的位置...python=version # 切换环境 source activate EnvName # 退出环境 conda deactivate # 移除指定的环境 conda remove -n EnvName...--all 包管理部分命令 # 包管理 # 查看当前环境中的包 conda list # 查看指定环境下的包 conda list -n EnvName # 查找指定的包 conda search PacketName...# 安装指定的包 conda install PacketName # 卸载指定的包 conda remove PacketName # 对于一些conda不支持的包，如easyDict conda
GF65-Thin-9SEXR：本台计算机的主机名5.19.0-32-generic：Linux 内核的版本号22.04.1：系统版本x86_64：基于x86架构的64位处理器二、安装Anaconda1...添加环境变量终端输入命令： sudo gedit ~/.bashrc在最后一行添加：export PATH="/home/yz/anaconda3/bin:$PATH"其中/home/yz/anaconda3要替换成你自己的安装路径保存后退出...验证安装新开终端，输入：source ~/.bashrc此时终端会显示进入conda的base环境再输入：conda -V终端会显示Anaconda版本号三、配置Anaconda1....：conda config --show-sources退出conda环境：conda deactivate rnaseqconda deactivate base四、R语言相关工具下载与安装1....安装R语言工具包官网：The Comprehensive R Archive Network点击Ubuntu版本官网显示只有Ubuntu的LTS版本才有R语言的全面支持按照官网说明依次运行命令：sudo
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