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GWAS分析基因注释:区间范围匹配

「老师需求如下:」 图1是SNP上下游区间,图2是基因上下游区间,想以图1为标准,将区间内有基因行放到右边。...「换到基因注释领域,看一下相关需求:」 1,显著性SNP位点,取上下游50k位点,作为候选区间 2,将候选区间有基因,匹配到SNP右边 「处理注意:」 1,显著SNP在上下游区间时,可能会有交叉...上面的信息中,有些SNP匹配到了多个基因,也就是基因是有重复。 如果我们想看每个SNP匹配基因情况,可以用上面的结果 如果我们想看一下共有多少无重复基因匹配,就需要对SNP区间先合并 4....基因注释不同玩法 把上面SNP区间,作为显著性SNP上下游信息,把基因信息作为gff基因文件,就可以进行基因注释了! 上面的玩法都可以做。...「注意,将gff格式整理为:染色体,开始位置,结束位置,基因信息; snp区间整理为:染色体,开始区间,结束区间」 可以实现功能: 每个SNP区间内基因 每个SNP全进内基因个数 合并SNP区间内基因

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    如何将元素插入数组指定索引?

    修改数组是一种常见操作,这里,我们来讨论如何在 JS 中数组任何位置添加元素。...元素可以添加到数组三个位置 开始/第一个元素 结束/最后元素 其他地方 接着,我们一个一个过一下: 数组对象中unshift()方法将一个或多个元素添加到数组开头,并返回数组新长度: const...它创建新副本,且不影响原始数组。 与以前方法不同,它返回一个新数组。 使用该方法,要连接值始终位于数组末尾。...deleteCount -从start 删除数组中可选项目数。如果省略,则start所有项目都将被删除。 item1, item2, ...-从start 添加到数组可选项目。...---- 代码部署可能存在BUG没法实时知道,事后为了解决这些BUG,花了大量时间进行log 调试,这边顺便给大家推荐一个好用BUG监控工具 Fundebug。

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    使用Redis数组实现布隆过滤

    建议先关注、点赞、收藏再阅读。图片使用Redis数组实现布隆过滤器步骤在Redis中创建一个位数组,可以使用RedisBitmaps数据结构。...确定使用哈希函数个数,可以选择多个哈希函数来减少误判率。将待判断元素通过各个哈希函数进行哈希计算,得到多个哈希值。分别将这些哈希值对应数组位置置为1,表示该元素存在于布隆过滤器中。...')) # 输出 False布隆过滤限制和缺陷误判率:布隆过滤器存在一定误判率,即判断某个元素存在时可能产生误判,但判断某个元素不存在时是准确。...存储空间:使用布隆过滤器需要占用较多存储空间,因为需要创建一个较大数组。删除困难:布隆过滤器中元素删除操作比较困难,因为多个元素可能共享同一个位,删除一个元素可能会影响其他元素判断结果。...不支持动态扩容:布隆过滤数组大小是固定,不支持动态扩容操作。哈希函数选择:布隆过滤效果受到哈希函数选择和质量影响,需要选择合适哈希函数来减少误判率。

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    根据规则过滤数组重复数据

    今天有一个需求,有一些学生成绩数据,里面包含一些重复信息,需要从数组对象中过滤掉重复数据。 例如,有一个包含学生成绩数组,其中每个学生成绩可能出现多次。...我们需要从这个数组过滤掉重复成绩,只保留每个学生最高分数。 可以使用 Array.prototype.filter() 方法来过滤数组重复数据。...该方法接受一个回调函数作为参数,判断数组每个元素是否满足某个条件。如果回调函数返回 true,则该元素将被保留在新数组中。否则,该元素将被过滤掉。...我们还可以使用 Array.prototype.filter() 方法来根据更复杂规则过滤数组重复数据。 例如,我们可以根据对象某个属性来过滤掉重复数据。...未经允许不得转载:Web前端开发资源网 » 根据规则过滤数组重复数据

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    多表关联查询过滤条件写在on与where区别

    ,然后再对过滤数据进行连接。...on后面,先对两表进行过滤,再进行left join,显示结果集与写在where后面是不同,连接方式还是左外连接,显示t1过滤全部数据。...而且因为t2表过滤数据比t1表少,CBO把t2表当成了驱动表。...(4)左表谓词放在where后面,右表放在on后面: 这种情况转换为左外连接,也是先对两表过滤再关联。 总结 1.对于内连接inner join,两个表谓词条件放在on与where后面相同。...2.对于left join: 左表谓词放在on不会对左表数据进行过滤,依然显示左表全部数据,放在where后面才会对左表进行过滤 右表谓词不管放在on还是where都会对右表先过滤再连接

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    【NumPy 数组过滤、NumPy 中随机数、NumPy ufuncs】

    python之Numpy学习 NumPy 数组过滤 从现有数组中取出一些元素并从中创建新数组称为过滤(filtering)。 在 NumPy 中,我们使用布尔索引列表来过滤数组。...布尔索引列表是与数组索引相对应布尔值列表。 如果索引处值为 True,则该元素包含在过滤数组中;如果索引处值为 False,则该元素将从过滤数组中排除。...因为新过滤器仅包含过滤数组有值 True 值,所以在这种情况下,索引为 0 和 2、4。...创建过滤数组 在上例中,我们对 True 和 False 值进行了硬编码,但通常用途是根据条件创建过滤数组。...ufuncs 还接受其他参数,比如: where 布尔值数组或条件,用于定义应在何处进行操作。 dtype 定义元素返回类型。 out 返回值应被复制到输出数组。 什么是向量化?

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    java反转数组_Java中如何将数组反转?Java数组反转2种方法(代码示例)「建议收藏」

    大家好,又见面了,我是你们朋友全栈君。 数组操作Java数组如何反转输出?下面本篇文章就给大家介绍2种在java中实现数组反转简单方法。有一定参考价值,希望对大家有所帮助。...方法一:使用循环,交换数组中元素位置 使用循环,在原数组中交换元素位置:第一个元素与最后一个元素交换,第二个元素与最后一个元素交换,依此类推,直到结束。...数组arr[]从第一个元素迭代,将其中每个元素从后面放置在新数组中,即从最后一个元素迭代新数组。这样,数组arr[]所有元素都将反向放置在新数组中。然后,我们从头迭代新数组并输出数组元素。...实现代码:public class reverseArray { /* 反转数组并将其存储在另一个数组函数*/ static void reverse(int a[], int n) { int...: 10 20 30 40 50 反转数组是: 50 40 30 20 10 以上就是本篇文章全部内容,希望能对大家学习有所帮助。

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