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如何在netcdf文件中重新排序/重新组织变量属性?

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相关·内容

netcdf4-python 模块详解

只有当重新链接 netcdf 库时,才可以通过 netCDF3 客户端读取,同时也可以通过HDF5客户端读取。 netCDF4 模块可以读取和写入上述格式文件。...netcdf 文件的 Groups 版本4的 netcdf 支持按层级来划分数据,这类似文件系统的目录。Groups 可以包含变量,维度和属性,同时也可以包含其他 groups。..., analyses netcdf 文件的维度 netcdf根据维度信息创建所有变量的大小,所以在创建变量之前必须要创建维度信息。...netcdf 文件属性 netcdf 文件包含了两种类型的属性:全局属性变量属性。前者提供的是组或整个数据集的信息,后者提供的是组变量的信息。...= True;complevel 表示压缩速度和效率(1表示速度最快,但压缩比最小,9表示速度最慢,但压缩比最高);设置 shuffle = False,将关闭 HDF5 的 shuffle 过滤,在重新排序字节进行压缩之前会对数据块进行逐行扫描

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  • 基于netcdf库的nc文件读写

    文件和数据I/O函数 nc文件I/O操作包括文件的读写以及从内存获取数据的函数,涉及上述操作时,还有一些辅助函数:比如控制打开文件对象定义模式,来操作文件的函数,以及查询函数(查询变量数,变量维度,全剧属性以及记录维度...如果是打开已有文件,对已有文件进行编辑时,添加新变量,维度,属性等信息,需要进入定义模式,然后修改完成后,为了保证文件的内容是最新的,可使用nc_sync/nf_sync等函数更新文件。...[1] 属性操作函数 netCDF文件属性操作通常是给文件添加全局属性或者给变量添加属性。...NetCDF属性操作包括: •属性获取函数:获取属性值•属性查询函数:用于查询变量或者全局/组的属性信息•属性添加函数:此类函数提供了大量的添加属性操作,而且针对不同的数据类型,提供了特定的函数•...其它功能函数:比如删除/重命名属性 组操作函数 NetCDF关于组的操作是在NetCDF4添加的,不支持NetCDF3 classic和64-bit offset文件

    4.4K22

    SQL Server 重新组织生成索引

    随着时间的推移,这些修改可能会导致索引的信息分散在数据库(含有碎片)。当索引包含的页的逻辑排序(基于键值)与数据文件的物理排序不匹配时,就存在碎片。...REBUILD [ WITH ( [ ,...n]) ] 指定将使用相同的列、索引类型、唯一性属性排序顺序重新生成索引。...ALTER INDEX 不能用于对索引重新分区或将索引移到其他文件组。此语句不能用于修改索引定义,添加或删除列,或更改列的顺序。...如果索引所在的文件组脱机或设置为只读,则无法重新组织重新生成索引。如果指定了关键字 ALL,但有一个或多个索引位于脱机文件组或只读文件,该语句将失败。...重新组织索引 使用最少系统资源重新组织索引。通过对叶级页以物理方式重新排序,使之与叶节点的从左到右的逻辑顺序相匹配,进而对表和视图中的聚集索引和非聚集索引的叶级进行碎片整理。重新组织还会压缩索引页。

    2.6K80

    Python指定时间、经纬度读取NC数据

    本文介绍基于Python语言的netCDF4库,读取.nc格式的数据文件,并提取指定维(时间、经度与纬度)下的变量数据的方法。   ...同时,在我们之前的文章Python批量读取NC数据的时间维信息,就介绍过基于netCDF4库,对一个文件夹下大量.nc格式数据文件的某一维的信息加以提取的方法。...而在本文中,我们则是同样基于netCDF4库,读取.nc文件,并提取指定维(Dimensions,也就相当于是自变量)下的变量(Variables,也就相当于是因变量)的具体数值。   ...,这将显示要读取的.nc格式数据文件的基本信息,变量、维、属性等——这里具体打印出来的情况如下图所示。   ...、变量与其他参数)——其中我们重点观察数据的因变量(也就是上图中的swvl1),需要留意一下其后不同维的排序顺序,在后面我们按照维提取变量数据的时候会用到。

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    用Python批处理指定数据-以WRF输出结果为例演示按照指定维度合并(附示例代码)

    我们希望能够把所有的数据或者某个我们关心的变量单独提取出来,让其按照指定的维度,时间维度来排序并整合成一个文件。...下面我就分享一下我在日常科研为了解决这个问题而写的代码,供大家参考使用(代码很简单, 大家只需要把文件名、路径改成自己的就可以用了)。...#导入库 import numpy as np import xarray as xr import os from netCDF4 import Dataset #选择 notebook 所在文件夹...= 'wrfout_d01': #通过索引选择想要的数据,可以按照需要进行更改 continue list_names.append(ncfile) #将模拟结果文件名按照时间进行排序...这里用了concat函数,具体大家可以见从xarray走向netCDF处理(四):合并与计算进行了解。

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    xarray | 序列化及输入输出

    当要在一个文件写入多个组时,传入 mode = 'a' 给 to_netcdf ,从而确保每一次调用都不会删除文件。 除非执行一系列计算操作,否则 netCDF 文件的值是不会加载到内存的。...如果变量有一个无效的 'units' 或 'calendar' 属性的话,此转换过程会失败。此时,可以手动关闭解码过程。...写入编码数据 你也可以自定义 xarray 如何为 netCDF 文件的每个数据集变量提供编码信息。encoding 参数接收包含编码信息的键值对字典。...如果不指定编码信息的话,xarray 会使用默认的编码属性信息;如果指定的话,这会更有利于额外的处理操作,尤其是压缩操作。 当存储文件时,这些属性信息会保存为每一个变量属性。..._FillValue:当保存 xarray 对象到文件时,xarray 变量的 Nan 会映射为此属性包含的值。这在转换具有缺省值的浮点数为整数时就显得非常重要了。

    6.4K22

    使用Python处理NetCDF格式文件

    NetCDF 数据的特性包括: 自描述性:即 netCDF 文件包括关于其中所含数据的信息,捕获数据元素的时间以及使用的测量单位。...NetCDF 文件处理工具 其中列出的ncdump可以查看NetCDF文件变量属性等信息,ncview,panoply可以对NetCDF文件变量进行简单的可视化,如果需要对NetCDF文件进行裁剪...as nc sns.set_context('talk', font_scale=1.2) # 设置图形属性 # read NetCDF file fn = 'air.sig995.2012.nc...:读取netcdf格式文件 其余代码段的解释在上述代码已经给出,文末也给出了Notebook和数据链接,Notebook中有更多更详细的代码和解释。...Notebook也给出了使用 scipy 读取 netcdf 文件的示例。 ? 图1 无数据循环 ?

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    气象数据处理:NetCDF文件处理

    所谓自描述就是自带属性信息,这和一般的雷达基数据格式不同,一般的雷达数据也是二进制的,但不是自描述的,而是需要额外的数据格式文档来说明数据格式,而NetCDF文件包含了描述变量和维度的元数据信息。...通常包含以下三个部分: 维度 变量 属性 维度部分记录的是每个变量的维度名及长度,而变量包含了维度,属性(如数据单位)信息及变量的值。属性部分包含了一些额外信息,比如文件创建者等。...nc数据: # 加载库 import netCDF4 as nc data = nc.Dataset("wrfout_v2_Lambert.nc", "r") # 输出文件变量 print(data.variables.keys...= data.variables["SST"][1, :, :] scipy scipy 库的io模块同样提供了 netcdf 文件处理方法,其所使用的外部模块和 netCDF4-python 使用的相同...读取数据之前,可以先查看以下文件包含了哪些信息: ncinfo('F:\wrfout_v2_Lambert.nc'); ? 数据信息为结构体,其中包含了各维度信息,包含的变量属性等信息。

    4.7K22

    如何使用Python创建NetCDF文件

    之前介绍过如何使用Python处理NetCDF格式文件,这次介绍一下如何创建NetCDF文件。...使用netcdf4-python创建netCDF格式文件通常按照如下流程: 1) 打开/创建netCDF文件对象 2) 定义数据维度 3) 基于定义的维度创建变量 4) 存储数据到变量 5) 为变量和数据集添加属性...定义维度时需要注意:netCDF格式文件存在一个特殊维度:记录维度(record dimension)/无限维度(unlimited dimension),通常是无限大小的,这与常规的经纬度等维度不同...添加数据 添加数据没什么可说的,按照定义的变量和维度将对应的数据添加到对应变量即可。注意变量维度和数据类型。 添加属性 添加属性时分为全局属性变量属性。...全局属性是对应整个文件属性,顾名思义,变量属性就是对应每个变量属性。 在创建nc文件时,属性是可选的。但是为了更为明确的表述文件变量的信息通常要添加属性,也建议添加属性

    14.6K41

    解析nc格式文件,GRB格式文件的依赖包edu.ucar.netcdfAll的api 学习

    3 数据访问层对象模型 3.1 Dataset Dataset = 数据集 数据集可以是 netCDF、HDF5、GRIB 等文件、OPeNDAP 数据集、文件集合或可通过 netCDF API 访问的任何其他内容...我们有时使用术语CDM 数据集来表示任何这些可能性,并强调数据集不必是 netCDF 格式的文件。...3.3 Variable Variable = 变量 变量是数据的容器。它有一个数据类型、一组定义其数组形状的维度,以及一组可选的属性。它使用的任何共享维度都必须在同一组或父组。...3.5 Attribute 属性具有名称和值,并将任意元数据与变量或组相关联。...您可以通过调用read()或其变体从变量获取数组。数组是矩形的( Fortran 数组)。每个 DataType 都有一个专门的 Array 类型。

    1.3K40

    如何批量提取wrfout变量存为nc

    在气象学,WRF(Weather Research and Forecasting Model)是一个常用的数值天气预报模型,它可以提供丰富的气象变量数据来帮助我们理解和预测天气现象。...为了更好地处理WRF模型输出数据(当然因为wrfout文件太大了!),我们经常需要批量提取其中的变量,并将提取的数据保存为NetCDF格式(.nc文件),这样可以方便我们后续的分析和可视化操作。...将投影对象转换为字符串以便作为 NetCDF 属性使用。...将投影对象转换为字符串,以便可以将其作为 NetCDF 属性使用 :param xarray_array: xarray.DataArray :param mode: 文件打开模式,默认为...默认为 None :param encoding: 编码设置,默认为 None """ xarray_array_out = xarray_array.copy() # 从变量删除坐标信息

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    数据转换 | 如何将nc文件转为mat文件

    NetCDF(Network Common Data Form)是一种广泛用于存储多维科学数据的文件格式,而MAT文件是MATLAB的二进制文件格式,用于存储变量数据。...Python提供了强大的库支持,xarray和scipy.io.savemat,使得这种转换变得简单且高效 代码结构 加载nc文件:使用xarray库的open_dataset函数打开nc文件,这会返回一个...Dataset对象,其中包含了文件的所有变量和相关元数据。...保存为mat文件:使用scipy.io.savemat函数将NumPy数组保存到MAT文件。你需要指定输出文件名和要保存的变量字典。...wrfout3385/wrfout_d02_2022-07-14_0700.nc' # 使用xarray打开NetCDF文件 ds = xr.open_dataset(nc_file) # 选择你想要的变量

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    C++读取NC数据所得结果有异常的解决方法

    此外,关于Visual Studio配置C++语言netCDF库的方法,大家可以参考Visual Studio配置C++netCDF库;关于Python语言读取.nc数据的方法,大家可以参考Python...这一个步骤,在Python语言的netCDF,应该是会自动帮我们处理(好像是这样的,因为之前用Python语言读取.nc格式文件的时候,都没有注意到过这个scale和offset);而在C++语言的...netCDF,就需要我们自行手动处理了。   ...因此,在用C++语言netCDF库读取.nc格式的栅格文件时,如果我们是第一次读取它,那么可以通过如下的代码,获取其变量属性。...当然,这里也需要注意,有些.nc格式的数据,其变量也可能不含有scale_factor和add_offset这两个属性的,如下图所示;所以我们都可以用本文前述的代码,先获取其属性,看看到底有没有scale_factor

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    wrf-python 详解之如何使用

    变量 除了输出诊断变量外,wrf.getvar函数也可以用来提取常规的WRF输出的netCDF 变量。...为了在输出数组包含所有文件的所有时间,设置 timeidx 参数为 wrf.ALL_TIMES(或设置为 None)。...如果 timeidx 是单个值,那么将假设时间索引取自所有文件所有时间的连接。 注意:执行 wrf.getvar 时并不会进行排序,也就是说在执行函数之前应在序列按时间对文件进行排序。...如果指定值的话,那么从每个文件中提取变量时,指定值将应用于每个文件。在具有多个时刻的多个文件,这样做可能是没有意义的,因为每个文件的第 n 个索引可能表示不同的时刻。...# 从 netcdf 文件获取地图对象 cart_proj = get_cartopy(wrfin=ncfile) # 从文件获取地理边界,默认使用 XLAT, XLONG # 提供变量名,可以获取其栅格边界

    20.2K1012

    Visual Studio配置C++netCDF

    其次,将前述netCDF-C++库的可执行文件打开,如下所示。   打开后,即可开始安装;安装过程,主要注意以下几个界面的设置即可——首先,如下图所示,选择第二项,即为所有用户添加系统变量。   ...将上述这个netcdf文件重命名,修改为netcdfcpp.h,如下图所示。   接下来,进入需要调用netCDF库的C++项目,在其名称上右键,并选择“属性”,如下图所示。...image-20240304131312932   随后,在属性的“VC++ 目录”一栏,分别配置“包含目录”和“库目录”。   ...在其中,将可执行文件安装路径lib文件夹下的netcdf.lib文件放入,如下图所示。   ...首先,复制上面这个字段,随后打开项目的属性,选择“C/C++”一栏的“预处理器”,然后将这个字段复制到“预处理器定义”即可。   接下来,执行大家的代码。

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    sql server索引功能资料

    随着时间的推移,这些修改可能会导致索引的信息分散在数据库(含有碎片)。当索引包含的页的逻辑排序(基于键值)与数据文件的物理排序不匹配时,就存在碎片。...重新组织重新生成索引 在“对象资源管理器”,展开包含您要重新组织索引的表的数据库。 “表”文件夹。 展开要为其重新组织索引的表。 “索引”文件夹。 “重新组织”。...重新组织的所有索引 在“对象资源管理器”,展开包含您要重新组织索引的表的数据库。 “表”文件夹。 展开要为其重新组织索引的表。...“索引”文件夹,然后选择“全部重新组织”。 “重新组织索引”对话框,确认正确的索引位于“要重新组织的索引”。...重新生成索引 在“对象资源管理器”,展开包含您要重新组织索引的表的数据库。 “表”文件夹。 展开要为其重新组织索引的表。 “索引”文件夹。 “重新组织”。

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