在Python或R中获得选择主成分个数的BIC/AIC图可以通过以下步骤实现:
numpy
和sklearn
库,对于R,可以使用stats
和factoextra
库。sklearn.decomposition.PCA
类,通过指定主成分个数来拟合数据集。在R中,可以使用stats::princomp
函数。sklearn.decomposition.PCA.explained_variance_
属性和numpy
库中的linalg.slogdet
函数来计算BIC和AIC值。在R中,可以使用stats::princomp
函数的BIC
和AIC
属性。matplotlib.pyplot
库进行绘图。在R中,可以使用factoextra::fviz_screeplot
函数。下面是Python和R的示例代码:
Python代码:
import numpy as np
from sklearn.decomposition import PCA
import matplotlib.pyplot as plt
# 准备数据
data = ...
# 进行主成分分析
pca = PCA()
pca.fit(data)
# 计算BIC和AIC值
n_components = range(1, len(data.columns)+1)
bic = []
aic = []
for n in n_components:
pca.n_components = n
pca.fit(data)
log_likelihood = -np.sum(np.log(pca.explained_variance_))
num_params = n * (n + 1) / 2
bic.append(log_likelihood + 0.5 * num_params * np.log(len(data)))
aic.append(log_likelihood + num_params)
# 绘制BIC/AIC图
plt.plot(n_components, bic, label='BIC')
plt.plot(n_components, aic, label='AIC')
plt.xlabel('Number of Components')
plt.ylabel('BIC/AIC Value')
plt.title('BIC/AIC Plot for Selecting Number of Components')
plt.legend()
plt.show()
R代码:
library(stats)
library(factoextra)
# 准备数据
data <- ...
# 进行主成分分析
pca <- princomp(data)
# 计算BIC和AIC值
n_components <- 1:length(data)
bic <- numeric(length(n_components))
aic <- numeric(length(n_components))
for (i in n_components) {
pca_i <- princomp(data, cor = TRUE, scores = TRUE)
log_likelihood <- -sum(log(pca_i$sdev^2))
num_params <- i * (i + 1) / 2
bic[i] <- log_likelihood + 0.5 * num_params * log(length(data))
aic[i] <- log_likelihood + num_params
}
# 绘制BIC/AIC图
fviz_screeplot(pca, addlabels = TRUE, ylim = c(0, 1), select = "bic")
fviz_screeplot(pca, addlabels = TRUE, ylim = c(0, 1), select = "aic")
注意:上述代码中的data
变量表示包含要进行主成分分析的数据集。请根据你的实际情况替换为相应的数据。
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