参见：https://zhuanlan.zhihu.com/p/146355865[1] 与别人分享代码时，常常会因为不同人机器的R与R 包的版本差异，而导致了出现报错。...，在使用其他设备或平台的R 时，都可以避免版本产生的问题。...还有其他一些操作，可以创建一个用户自己的R 包分支： Manage ad-hoc local repositories (note that these are a separate entity from CRAN-like...checkpoint可以： 创建一个快照文件夹~/.checkpoint用来存包。...扫描我们的项目文件夹，通过library() and require()来确定我们用了哪些包 从MRAN 安装包install.packages()到我们自己的快照文件夹 将我们的CRAN镜像指向MRAN
但主要针对的是两个场景： 别人让你帮忙安装别人安装不上的R 包，你帮ta 测试一下； 别人包安装不上，你安上了，别人还安不上，急的人家跳jiojio，你的头皮也直挠挠。...你以为你是谁啊~ 这里推荐使用pacman 62-R工具指南-18-用pacman管理你的R包[2] 中的p_temp 方法： > p_temp(aprof) trying URL 'http://cran.rstudio.com...你是个好人，我来帮你安好打包给你 之前介绍了63-R工具指南-19-用packrat把包分享给其他人[3] 这个工具。...从理论上来说，如果我们可以成功调用其中的内容，那么打包给的其他人，其他人解压这个文件夹后，在目录下进入packrat 模式即可。 其他操作 你还能想到其他的sao 操作吗？...把包分享给其他人: 63-R工具指南-19-用packrat把包分享给其他人.md
前往 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/ 下载新的版本，鼠标点击安装。 ?...用'contributors()'来看合作者的详细情况 用'citation()'会告诉你如何在出版物中正确地引用R或R程序包。...pacman’ was installed before R 4.0.0: please re-install it 错误: 没有"install.packages"这个函数 错误: package ‘packrat...在系统目录下我们可以看到 2 个不同的 R 版本，所以 3.6 可以安心地删除了。...splines tcltk base codetools grDevices methods parallel stats tools 删除
创建 R 包的过程既有趣又富有挑战性，尤其是在首次创建时。我开始学的是创建包的基本结构和流程。 当我编码完包后，我就学会了如何将它发布在 CRAN 上共享给其他社区成员。...将包提交至像 CRAN 之类的主要仓库时需通过严格的质量测试。 不断进行更新。如果包的维护人员在 CRAN 上的更新活动不活跃，他的包就会被遗弃。 4....在给你的包命名时，你可以使用全部小写（如 predictoR）或者我们在这使用的驼峰式大小写。我建议你在给包命名时不要使用下划线。还有，选择合适的子目录存储该项目。 ?...Suggests 包含运行例子或生成文档时可能需要的库。这个包最后的描述文件如下所示： ? 进入 R 文件夹，你会发现已生成 hello.R script。...在创建完源码包后，你可提交在此（https://cran.r-project.org/submit.html）提交在 CRAN 上发布此包的申请。
这是一个教程类型的笔记 在GitHub上发布R包时，需要遵循一定的结构和包含特定的文件。...**data/**： 如果包中包含数据集，它们应该放在这个文件夹中。 **inst/**： 包含安装时需要复制到包的安装目录的额外文件，如示例代码、数据文件等。....gitignore： 指定Git版本控制中忽略的文件和文件夹。 .travis.yml 或其他CI配置文件： 配置持续集成服务，如Travis CI。...cran-comments.md： 如果提交到CRAN，这个文件包含CRAN检查员的评论和作者的回复。...在GitHub上发布R包，虽然没有严格的规则，但遵循一些最佳实践和社区约定可以使你的包更加规范、易于使用和维护。
在edX你可以找一些微软的Introduction to R Programming（R编程导论），这是一门8小时的课程，它主要讲了R最基本的内容已经R的基本语法。...其它的R包，如ggplot2这样的包，不会自动帮你装好，需要你手动安装它们。...很多的R包都已经在CRAN，一个其服务端遍布全世界各地，并且全世界是对R的代码和文档进行同步更新和储存的网络进行过整理并且可以从CRAN那里得到它们。...一旦面对这样的情况，确认一下packrat（查看录像课程）或者checkpoint。...或者，这里有foreign包，它不仅可把SAS、STATA和SPSS格式的文件导入到R，而且还可以进行更多格式的文件导入到R中，如Systat和Weka。
无论你当前的工作目录在哪里，绝对路径都能指向一个唯一的文件或文件夹位置。...它不从根目录开始，而是从当前工作目录出发，指向目标文件或文件夹。相对路径更常用于项目中，便于文件随项目一起移动。...其优点是确保在同一台机器上不同的 R 会话中使用相同的变量设置，适用于长期的配置和工作环境管理。如果只想为某个项目或会话调整变量，可能不太适合。...镜像 镜像（Mirror） 是指在不同地理位置上维护的，内容是原始站点（如 CRAN）的复制版本。...镜像服务器提供了与原始服务器相同的数据和文件，但位于不同的物理位置，目的是通过分布式服务器网络来提高下载速度和可用性，特别是在不同区域的用户访问时。
实际上，单细胞转录组测序的每个细胞都处在某个特定的分化状态，因此可将每个细胞都看作整个连续分化发育程序中的快照。...下面就为大家详细展示如何在SeqGeq™中获取Monocle以及使用它进行拟时序分析。...进入The Comprehensive R Archive Network（CRAN）网站https://cran.r-project.org/ 下载电脑兼容的R版本。...如电脑已安装R，则不必重新安装。 运行Monocle 选中目标细胞群，打开Workspace-Plugin-Monocle插件，指定基因进行Monocle运算。 ? 结果解读 ?...Plugin文件夹中。
Differential Expression为分析单细胞数据专用，在SeqGeq™中，选中基因及聚类参数（如kmeans），计算得到每个cluster差异表达的基因。...二、如何在FlowJo® SeqGeq™安装iCellR - 下载iCellR插件 进入FlowJo®和SeqGeq™插件网站FlowJoexchange, 下载最新版iCellR插件。...进入The Comprehensive R Archive Network（CRAN）网站https://cran.r-project.org/ 下载电脑兼容的R版本。...如电脑已安装R，则不必重新安装。...- 关联软件 将FlowJo®SeqGeq™与R安装的位置和软件安装目录下 Plugin文件夹的位置进行关联，并将下载好的插件包中的iCellR.jar文件复制至关联的Plugin文件夹中。
在本指南中，我们将学习如何在运行Ubuntu 14.04的腾讯CVM上设置R. 如果CVM运行的是其他操作系统，则大多数指令仍然适用，但您可能需要修改某些命令。完成本指南后大约需要10-15分钟。...当被问及我们是否确定要下载软件包时，我们使用该-y标志自动回答“ 是”。 sudo apt-get -y install r-base 此时，您应该在腾讯CVM上安装最新的R版本。...我们还将指定repos参数，以便从RStudio CRAN存储库下载包，这与我们下载R本身时使用的相同。...上但不在CRAN上。...与CRAN软件包一样，在安装GitHub软件包时，您需要从系统shell运行该命令，以使所有用户都可以使用该软件包。让我们尝试安装shinyjsGitHub包，它可以为shiny包添加功能。
1.1 R 的安装 进入CRAN 官方网站，选择对应平台的版本。...但是如果任务比较复杂，代码量比较大，则应该将代码写在 R 脚本中，保存脚本时，通常以.R结尾。...可以用函数ls()列出当前工作空间中的所有对象，或者使用rm()函数删除某个对象。rm(list = ls())命令会删除当前工作空间中的所有对象。...退出 R 时，如果选择保存工作空间，R 将会在工作空间所有文件夹中创建两个新文件。所有运行过的命令都被保存到一个名为“.Rhistory”的文件中，所有对象被保存到名为“.Rdata”的文件中。...当 R 重新启动后，将自动恢复上一次保存的工作环境以及使用过的命令。建议不保存工作空间，因为代码才是最重要的，命令和对象都可以通过代码重新生成。
有关于GitHub上面的R包，由于其本质上只是一个源码R包，因此其和CRAN的安装基本上并无不同，本文只会略有所提。...如果需要查找旧版本的R包，需要先找到此R包在CRAN上的主页地址，方法如下： 打开R packages列表页面 在CRAN主页https://cran.r-project.org/，找到左侧的Packages...此外，它也支持其他自定义的操作： 网址安装 同样是从网络上安装，但是是指定的R包的网址而不是包名，比如： 在ROCR包主页上的Package source处找到右侧的链接，右击 -> 复制链接地址，拿到...本地文件/文件夹安装R包时都是需要指定repos=NULL的，也就是上一句应该是： install.packages("https://cran.r-project.org/src/contrib/ROCR...如果是解压后的R包，且解压到了当前工作目录，解压后文件夹名是ROCR # 必须加上repos=NULL, 因为无法推断出ROCR是一个文件夹 install.packages("ROCR", repos
其中一个原因是某些规则（如 expr 和 term）是左递归的，而 pgen 还不足以聪明地解析。...（这也不完全正确，因为语法在技术上并不会导致歧义；但我们先不管它，因为我想不到更好的词来表达。那么 pgen 是如何做决定的呢？...它会为每条语法规则计算出一个叫做 FIRST 组的东西，如果在给定的点上，FIRST 组出现了重叠选项，它就会抱怨）（译注：抱怨？应该指的是解析不下去，前文译作了罢工）。...PEG 解析器的经典实现中使用了一个叫作“packrat parsing”（译注：PackRat，口袋老鼠）的东西，它不仅会在解析之前将整个程序加载到内存中，而且还能允许解析器任意地回溯。...综上所述，我现在的想法是看看能否为 CPython 创造一个新的解析器，在解析时，使用 PEG 与 packrat parsing 来直接构建 AST，从而跳过中间解析树结构，并尽可能地节省内存，尽管它会使用无限的前向缓冲
="b",]test[test$Species=="a"|test$Species=="c",]test[test$Species %in% c("a","c"),]矩阵不支持$删除#删除 rm(l)#...删除一个rm(df1,df2)#删除多个rm(list = ls()) #清空下载包options("repos"=c(CRAN="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn.../CRAN/"))#设置镜像#1.CRAN的直接installinstall.packages("tidyr")#2.BiocManager的包要在它里面下install.packages('BiocManager...require(string))install.packages("stringr")包是否下载成功的唯一标准是library()没有error，当提示package not available时，原因可能为...proj的文件夹内的文件时，写全路径多用tabfread函数读取快且遇空行不易出错引用自生信技能树马拉松课程小洁老师R语言基础
这篇文章主要描述如何在 Ubuntu 20.04 上安装 R。 一、前提条件 在继续这篇指南之前，请确保你满足下面的前提条件： 你的系统拥有至少 1G RAM. 否则，请创建 swap 文件。...二、在 Ubuntu 上安装 R 包含在默认的 Ubuntu 软件源中的 R 软件包经常都是过时的。我们将会从CRAN软件源中安装 R。...R 已经在你的 Ubuntu 机器上被安装好了，你可以开始使用它了。...如果你不使用 sudo 启动 R 时，这将仅仅对当前用户有效。...四、总结 我们已经向你展示了，如何在 Ubuntu 20.04 上安装 R，以及 如何编译安装 R 软件包。
1.文档编写目的 ---- 继上一章如何在Redhat中配置R环境后，我们知道对于多数企业来说是没有外网环境的，在离线环境下如何安装R的包，能否搭建R的私有源对R的包进行管理。...本文档主要讲述如何在Redhat中安装R的包及搭建R的私有源。...x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4’ (as ‘lib’ is unspecified) trying URL 'https://mirror.las.iastate.edu/CRAN...（如：设置R启动时加载的包、设置编辑器、制表符宽度等） 5.测试R私有源 ---- 1.进入R控制台，执行包安装命令 [ec2-user@ip-172-31-21-45 etc]$ R R version...---- 推荐关注Hadoop实操，第一时间，分享更多Hadoop干货，欢迎转发和分享。 [583bcqdp4x.gif] 原创文章，欢迎转载，转载请注明：转载自微信公众号Hadoop实操
删除项目的svn信息 其他错误提示 主干及分支管理 如何在主干上创建分支 代码合并 svn是一款代码管理器，一般用于局域网内的多人协同开发。...这样别人才能知道你干了什么： 方法三：（推荐） 在VS上加入，并提交代码。这种方式会避开debug等文件的导入，避免每次提交代码，都带有debug文件提交。...更新或者提交代码 更新是从仓库更新代码到本地 提交时从本地提交到仓库 ps:最好每次提交前先获取最新代码。个人喜欢开始工作前先更新，然后提交的时候再更新后提交，避免冲突。...删除项目的svn信息 在项目文件夹，设置显示隐藏文件，可以看到有一个.svn的文件夹，删除，则工程不再和svn联系。...如何在主干上创建分支 在主干文件夹右键鼠标： 代码合并 VS或者主干代码文件夹下，右击鼠标，打开合并的界面： 合并的源填写的是需要从哪个地址合并过来到当前项目上 成功后，该项目需要commit代码
当你使用git commit命令时，每个文件都会被提交——这也包括不需要或不应该提交的文件。 你可能希望Git忽略特定的文件，但是没有Git ignore命令来实现这个目的。...例如，在macOS上，Finder生成一个. ds_store文件，其中包括用户对文件夹外观和显示的首选项，例如图标的大小和位置。...从项目中使用的编程语言或框架自动生成的文件，以及编译后的特定于代码的文件，如.o文件。 包管理器生成的文件夹，比如npm的node_modules文件夹。...test/example.md 最好的做法是创建一个.gitignore文件，其中包含创建新存储库时要忽略的所有文件和不同的文件模式——在提交之前。 Git只能忽略尚未提交到存储库的未跟踪文件。...(如果是文件夹需要添加-r选项): git rm --cached .env git rm命令和–cached选项一起从存储库中删除文件，但不删除实际的文件。
因此，本文以 Ubuntu 为例分享一下 R 在 Linux 等操作系统上的特定版本安装和 rstudio-server 中 R 版本的切换。...事实上 rserver.conf 配置文件控制 Workbench 的 rserver 进程的行为，用来调整身份认证、HTTP 和授权选项等设置8。.../root/miniconda3/envs/R4.2/bin/Rll /root/miniconda3/envs/R4.2/bin/R# 注意, 在任何情况下都不应该由用户手动写入`/usr/lib`文件夹...-s /root/miniconda3/envs/R4.2/lib/R/bin/R /usr/lib/R# rm -rf /usr/lib/R注意，在任何情况下都不应该由用户手动写入/usr/lib文件夹...如果已经创建了并引起了 dpkg 和 apt 的报错，就删除创建的软连接。
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