首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

何在Python从01构建自己的神经网络

在本教程,我们将使用Sigmoid激活函数。 下图显示了一个2层神经网络(注意,当计算神经网络的层数时,输入层通常被排除在外。) image.png 用Python创建一个神经网络类很容易。...神经网络训练 一个简单的两层神经网络的输出ŷ : image.png 你可能会注意,在上面的方程,权重W和偏差b是唯一影响输出ŷ的变量。 当然,权重和偏差的正确值决定了预测的强度。...从输入数据微调权重和偏差的过程称为训练神经网络。 训练过程的每一次迭代由以下步骤组成: · 计算预测输出ŷ,被称为前馈 · 更新权重和偏差,称为反向传播 下面的顺序图说明了这个过程。...请注意,为了简单起见,我们只显示了假设为1层神经网络的偏导数。 让我们将反向传播函数添加到python代码。...为了更深入地理解微积分和链规则在反向传播的应用,我强烈推荐3Blue1Brown编写的本教程。

1.8K00
  • 您找到你想要的搜索结果了吗?
    是的
    没有找到

    再谈T细胞:起源、分化和分群

    病原体通过血液循环进入被膜下淋巴结,被巨噬细胞内吞并分解成可溶性小分子抗原(蛋白抗原)。抗原识别、结合Naïve B细胞膜表面受体后,部分B细胞上调表达CCR7,并迁移至次级淋巴滤泡组织。...在接受有序、规范的“培训”之后,成熟T细胞进入血液,转移至外周淋巴组织(脾脏、淋巴结等),在接受刺激后,再分化为效应性或记忆性T细胞,参与适应性免疫。 ? T细胞为什么从骨髓迁移至胸腺发育、成熟?...在T细胞发育早期,敲除 Notch1基因后, 胸腺细胞呈现出B细胞谱系的表型,而Notch1基因存在时,胸腺细胞呈现为T细胞谱系的表型。上述研究说明,Notch信号通路是T细胞活下来的必要条件。...PD-1有两个配体:PD-L1和PD-L2(PD-L1、PD-L2与B7-1、B7-2结构高度同源,在活化的APC表面表达)。 5....那么,如何在体内和体外检测CTL的功能呢?体内检测CTL功能的方法: 1)体内细胞毒性杀伤实验; 2)抗原肽-MHC分子四聚体技术; 3)ELISPOT; 4)LDH释放法。 ?

    6.4K31

    胸腺基质的单细胞转录谱揭示胸腺髓质中新的细胞异质性

    鉴定了三种上皮细胞(EPCAM和KRT8作为一般上皮标记物和FOXN1、PSMB11、LY75、CLDN4、AIRE、IVL, NEUROD1 , MYOD1作为特定亚群的标志物), 一种间细胞 (...内皮细胞还表达细胞外基质和粘附分子,纤连蛋白 ( FN1 ) 和LGALS3,它们已被证明可调节胸腺细胞迁移。...、 SIX1)但缺乏 cTECs 或 mTECs 的功能基因 神经内分泌(BEX1、NEUROD1) 肌肉样肌样(MYOD1、DES) 髓鞘+上皮细胞(SOX10、MPZ) 在成人胸腺检测到的 cTEC...与胎儿和出生后组织相比,一些富含未成熟 TEC-2 的基因(IGFBP5、NNMT、MAOA、DPYS、FKBP5、GLUL)在成人细胞的表达明显高于胎儿和出生后组织。...分别分析了胎儿、出生后和成人样本,结果表明,在胎儿和出生后组织中都产生cTECs lo cTECs hi的转变 鉴于 Notch 信号在调节其他组织谱系选择的关键作用,作者看了参与该途径的基因的表达

    1.1K10

    人-胸腺肿瘤组织细胞悬液制备流程

    分享是一种态度 注 | 以上操作指南中涉及的消化酶以及实验方法仅供参考,实际应用过程请根据具体情况进行细节上的调整。 背景介绍 胸腺属于中枢淋巴器官,分左右两,表面有薄层结缔组织被膜。...被膜结缔组织呈片状伸入胸腺内部形成小叶间隔,将实质分割成许多不完全分离的胸腺小叶。每个小叶都有皮质和髓质两部分,皮质内胸腺细胞密集,髓质则含较多胸腺上皮细胞。...胸腺瘤起源于胸腺上皮细胞,是最常见的前上纵隔原发性肿瘤。 对于胸腺瘤组织的单细胞悬液一般使用美天旎公司的肿瘤组织试剂盒制备。...胸腺组织示意图 实验仪器及耗材 实验步骤 准备肿瘤解离试剂盒的酶混合液,将100µL的H酶、500 µL的R酶和25 µL的A酶加入4.4mL RPMI 1640培养基。...运行gentle MACS解离器的h_Tumor_01程序。 程序终止后,将C管从gentle MACS解离器上拆下。 使用MACS mix试管旋转器在37℃下连续旋转C管30 min。

    1.3K30

    人类胸腺发育的细胞图谱揭示了T细胞组库的形成

    在非经典的胸腺 T 细胞,作者注意到了一种 CD8αα+ T,以表达 GNG4 为特征,定位于胸腺髓质周围,它们高表达 XCL1,并且与 XCR+ 树突状细胞共定位。...: 作者首先宽泛地定义细胞类型(淋巴细胞、髓细胞等),并计算每种类型在选定的对比组之间的比例 如果一次比较的所有细胞类型均来自同一个分选门,则将比例简单定义为:特定类型细胞数 / 细胞总数 如果细胞来自不同的分选门...作者还注意两群 EpCAM+ 细胞:肌样 TEC(MYOD1, MYOG)和神经内分泌样 TEC(NEUROD1, NEUROG1, CHGA),定位于胸腺髓质。...此外,作者注意另一群由非编码 RNA(MIR155HG)定义的不同于终末分化 Treg 及 Treg(diff) 的细胞,注释为 T(agonist) ,其表达 IL2RA 但低表达 FOXP3,与小鼠胸腺...作者还注意 CD8αα+ T(I) 表达 XCL1,可能和 DC1(XCR1)的募集与活化有关 最后,作者利用 smFISH 验证了上述发现 ?

    3.5K51

    综述:变温动物的适应性免疫

    某些免疫特征,免疫球蛋白M(IgM)的结构和功能,以及胸腺、脾脏、常规αβT细胞受体(TCRs)和MHCⅡ类分子的存在,将在本综述较为详细地描述,在几乎所有的有颚类脊椎动物(gnathostomes...5 IgD and IgW antibodies IgD,长期以来被认为是脊椎动物中新发现的一种,实际上非常古老,它可以追溯有颚类的起源,一种在软骨鱼中发现的同种异型,叫做IgW(Fig 3)。...粘膜同工型,哺乳动物的经典IgA,描述如下。 与多年来的想法不同,轻链(L)分歧为κ 和 λ可追溯有颚类的起源。在大多数的变温动物,有第三条原始性L链,σ,它在爬行动物丢失。...Fig 4 14 The thymus 胸腺存在于所有的有颚类,通常有典型的皮质和髓质组织。它可以从一个小叶一个多甚至不连续的结构,取决于所观察的物种或发育阶段。...Fig 5 16 T helper cell subsets 哺乳动物T辅助细胞表型分类在过去10年从经典的Th1和Th2细胞范式扩展包括Th17细胞、T滤泡辅助细胞(Tfh)、调节t细胞(Treg

    2.3K30

    NATURE|人类突变特征

    Indels特征1 (ID1)主要由胸腺嘧啶的插入和删除组成,ID2主要由胸腺嘧啶缺失组成,均在长(≥5)胸腺嘧啶单核核苷酸重复序列(图2)。...然而,胞嘧啶-胞嘧啶二核苷酸的胞嘧啶缺失在ID13并不明显,这可能反映了胸腺嘧啶相对于紫外光诱导的胞嘧啶二聚体的优势。ID6和ID8特征主要是≥5-bp删除(图2)。...SBS1和SBS5突变的数量与年龄有关,并且在不同类型的组织中表现出不同的比率,这证实了之前的报告。SBS40在多种癌症也与年龄有关,不过,鉴于它与SBS5的相似性,不能排除错误归因。...DBS2、DBS4与年龄相关,与正常细胞的活性一致,当结合它们的图谱时,它们的谱与在正常小鼠细胞中发现的DBS突变谱非常相似。ID1、ID2、ID5、ID8在多种组织均与年龄相关。...ID8主要由≥5 bp缺失组成,其边界处没有或有1 bp的微同源性,可能是由于由非同源端连接机制修复的DNA双链断裂。结果表明,多个突变过程在正常细胞运行。

    2.2K20

    单细胞测序—PBMC注释的细胞类型

    在血液循环的单核细胞可以迁移到组织,分化为巨噬细胞或树突状细胞,参与吞噬病原体、清除细胞残骸并呈递抗原。自然杀伤细胞(NK细胞,Natural Killer Cells):占PBMC的5-15%。...这些细胞在启动和协调适应性免疫反应起核心作用。迁移与存活:Naive CD4 T 细胞主要在二级淋巴器官(淋巴结和脾脏)循环,等待遇到它们特异性的抗原。...以下是B细胞的几种主要分类:(1)B-1 细胞B-1细胞是B细胞的一类独特群体,主要存在于腹腔和胸腔。表面标志为CD5+(B-1a 细胞)或CD5-(B-1b 细胞)。...迁移与组织驻留:单核细胞在血液循环时间较短(约1-3天),之后迁移到组织,分化为巨噬细胞或树突状细胞,成为组织驻留的免疫细胞。...发育起源和分化T细胞:T细胞从骨髓的造血干细胞分化而来,迁移到胸腺中进一步发育成熟。在胸腺,T细胞接受正选择和负选择,以确保其能够识别抗原并避免对自体组织产生反应。

    34120

    Nat Biotechnol 恭喜胡鹏、邱琪丨吴昊团队开发同时检测DNA 5hmC5mC修饰的单细胞测序技术

    哺乳动物细胞,DNA胞嘧啶甲基化可以被TET家族蛋白氧化,进而去甲基化,从而动态调控基因组的胞嘧啶修饰( 图1a, b)【1】。...然而如何在单细胞水平对这两种DNA修饰进行定量检测还是一个挑战。...这项技术的核心是通过化学脱氨和APOBEC3A (A3A) 酶促脱氨两个步骤(图2a),将未修饰的胞嘧啶 (C) 和甲基化修饰的胞嘧啶(5mC)分别转化为尿嘧啶(U)或胸腺嘧啶(T),并在最终的测序结果中转化为胸腺嘧啶...研究团队首先将酶促脱氨的步骤加入snmC-seq建库流程【4】,开发了检测单细胞内5hmC位点的snhmC-seq技术(图2a)。...作者利用单细胞核CH甲基化的相似性对神经元细胞进行再次聚类,进一步鉴定8种细胞亚型,并对这些细胞亚型5mC和5hmC水平进行了定量分析。

    34130

    非常全面!如何选择合适的模型?

    我们如何在各种实际情况下做出恰当的选择呢?...其层次化的结构可以捕捉图像的局部全局的信息,对于图像识别任务具有很高的准确度。 b....自然语言处理 适用模型:循环神经网络(RNN)、Transformer(BERT、GPT等) 原因:RNN可以处理序列数据,捕捉文本的上下文信息。...例如,对于高维稀疏数据,可以选择使用稀疏模型稀疏线性模型、支持向量机等。 在线学习:值得一提的事,如果业务数据变化等情况,有在线学习迭代模型的需求,选择深度学习模型是一个不错的选择。 5....常见的模型融合方法,Bagging、Stacking与Boosting。 常用的效度评估指标如下: 分类评估指标:准确率、召回率、F1分数等。

    37810

    27场机器学习面试后,来划个概念重点吧

    logistic 回归 现实世界绝大多数问题都涉及分类,比如图像标注、垃圾邮件检测、预测明天是否为晴天等。这里介绍的第一个分类算法是 logistic 回归。...模型集成 顾名思义,集成的核心思想是将一组模型组合在一起,以获得性能更高的模型,就像在管弦乐队组合乐器一样。这一部分就讲述了如何在机器学习获得和谐的「声音」。...视频回顾地址:https://app6ca5octe2206.h5.xiaoeknow.com/v1/course/alive/l_5f715443e4b005221d8ea8e3 第二讲:使用Amazon...视频回顾地址:https://app6ca5octe2206.h5.xiaoeknow.com/v1/course/alive/l_5f715d38e4b0e95a89c1713f 第三讲:DGL图神经网络及其在...视频回顾地址:https://app6ca5octe2206.h5.xiaoeknow.com/v1/course/alive/l_5f715d6fe4b005221d8eac5d © THE END

    31720

    20种小鼠器官的单细胞转录组学研究构建了一个Tabula Muris

    所有的器官都用流式细胞仪将单个细胞分选平板,许多器官也被装载到微流控液滴。...发现来自不同器官的细胞经常混合在一起,54个簇中有25个包含(至少5个)来自不同器官的细胞。例如,簇3和48每个包含来自5个或更多器官的内皮细胞。...主要分析概述 T细胞细分 为了展示一个跨器官研究常见细胞类型的例子,分析了所有标记为T细胞的FACS细胞,揭示了5个簇 0簇包括以RAg(Rag1,Rag2)和TdT(DNTT)表达为特征的VDJ重组的胸腺细胞...第4簇包含主要增殖的胸腺T细胞,这可能代表VDJ重组后的前T细胞的扩张。簇1-3主要包含单个阳性T细胞(CD4+或CD8a+)。...所有T细胞按来源器官(脂肪、肺、骨髓、四肢肌肉、脾或胸腺)着色-图C;根据CD4和CD8的表达将T细胞分类为4类-图D 全局转录因子分析 使用数据集中表达的1,016个转录因子,通过对每种细胞类型的平均基因表达谱进行聚类

    18610

    程序员必备的50道数据结构和算法面试题

    解决数组问题的关键是,你要对数组这种数据结构有一个深刻的认识,同时还要了解基本的程序流程循环、递归以及基本的操作符。...下面是一些经常问到和数组相关的面试题,你可以拿来练习: 1、在一个给定的从1100的整型数组,如何快速找到缺失的数字? 2、如何找到一个给定的整型数组的重复数字?...5、如何检查字符仅包含数字字符? 6、如何在字符串中找到重复字符? 7、如何对给定字符串的元音及辅音进行计数? 8、如何计算给定字符传中特定字符出现的次数? 9、如何找到一个字符串的全排列?...4、如何在给定二叉树上实现序遍历? 5、不使用递归情况下如何使用序遍历输出给定二叉树所有节点? 6、如何实现后序遍历算法? 7、如何不使用递归实现二叉树的后续遍历?...8、如何输出二叉搜索树的所有节点? 9、如何在给定二叉树中计算节点数目? 10、如何在给定数组执行二分搜索?

    3.2K11

    程序员必备的50道数据结构和算法面试题

    解决数组问题的关键是,你要对数组这种数据结构有一个深刻的认识,同时还要了解基本的程序流程循环、递归以及基本的操作符。...下面是一些经常问到和数组相关的面试题,你可以拿来练习: 1、在一个给定的从1100的整型数组,如何快速找到缺失的数字? 2、如何找到一个给定的整型数组的重复数字?...5、如何检查字符仅包含数字字符? 6、如何在字符串中找到重复字符? 7、如何对给定字符串的元音及辅音进行计数? 8、如何计算给定字符传中特定字符出现的次数? 9、如何找到一个字符串的全排列?...4、如何在给定二叉树上实现序遍历? 5、不使用递归情况下如何使用序遍历输出给定二叉树所有节点? 6、如何实现后序遍历算法? 7、如何不使用递归实现二叉树的后续遍历?...8、如何输出二叉搜索树的所有节点? 9、如何在给定二叉树中计算节点数目? 10、如何在给定数组执行二分搜索?

    4.3K20

    大脑中的先天RNN或许会对人工RNN提供新见解

    编辑 | 萝卜皮 循环神经网络(RNN)旨在在计算机上学习序列模式,但尚不清楚 RNN 如何在哺乳动物大脑的本机网络形成。...在 sMO ,颗粒下层的神经元比颗粒上层的神经元接收到更强的输入。 研究人员还展示了体内证据,结果表明当 MP 神经元化学遗传沉默时,从情绪区域 sMO 的通信被取消。...RNN 的主要特点包括:1、三个单元之间的连接是单向的(输入→隐藏→输出);2、在隐藏单元内形成自反馈连接。 近期的研究强调了循环回路对体内放大和反馈抑制的重要作用。...研究人员首先描述了 mPFC 运动皮层投射(MP)神经元的层流和区域特异性分布,其中 L5 MP 神经元从 BLA 接收到比其 L2/3 对应物更强的输入。...在 mPFC ,L5 MP 神经元是 PT-CStr 神经元,而 L2/3 对应物是皮质皮质(CC)神经元,投射到运动皮层。从 BLA 和 IC MP 神经元的连接是单向的。

    26820

    特定长度的DNA排列

    1 问题 DNA的四种碱基元素是腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)和胸腺嘧啶(T),在不考虑碱基之间的配对,如何输出特定长度下,所有的组合、以及组数。...2 方法 读取用户输出的数字,做特定的长度 引入copy,使用copy模块的deepcopy()函数来深拷贝一个对象, 它可以用来深度复制一个对象。...利用循环拼接的方法,实现任意长度碱基对的排列 通过实验、实践等证明提出的方法是有效的,是能够解决开头提出的问题。...代码清单 1 mport copy #输入特定长度 loop=int(input("请输入特定长度(1-4):")) param=["A","G","C","T"] all_str=[''] # 循环.....TTTTTTTTTTTT] for i in range(1,loop+1): temp_list=copy.deepcopy(all_str) all_str=[] for a

    11010

    Science | The Tabula Sapiens:人类的多器官、单细胞转录组图谱

    循环组织相比,本文还观察在皮肤、子宫和乳腺等实体组织中表调节蛋白(EREG)表达升高的共同特征。...2个)、皮肤(2个)、胸腺(2个)、舌头(2个)、子宫(1个)和脉管系统(2个)。...这些数据概括了组织特异性血管标志物,眼睛的LCN1,前列腺的ABCG2和肝脏的OIT3。...快速分裂的祖细胞具有最高的循环指数,而内皮细胞和间质细胞的循环指数较低,这些细胞大部分是静止的(图5A)。 图5:细胞状态的动态变化。...肠组织,瞬时扩增细胞和隐窝干细胞在肠隐窝迅速分裂,产生绒毛的终分化细胞类型。这些细胞的循环指数最高,而最终分化的细胞类型(杯状细胞)的循环指数最低。

    49820

    DeepMind 推出贝斯 RNN,语言建模和图说生成超越传统 RNN

    这种技术并不仅限于循环神经网络(RNN),还可以更广泛地应用于训练贝斯神经网络。...背景:将贝斯方法用于训练,增加 RNN 不确定性和正则化 循环神经网络(RNN)在一系列广泛的序列预测任务上取得了业内最高水平的性能(Wu et al., 2016; Amodei et al., 2015...在这项工作,我们将通过将贝斯方法用于训练,考察如何在 RNN 增加不确定性和正则化。 ? 贝斯方法为 RNN 提供了另一种表达不确定性的方法(通过参数)。...这种技术可以在其他变分贝斯模型更广泛地应用。 我们展示了如何将 Backprop By Bayes(BBB)有效应用于 RNN。...第 4 节推导出了用于 RNN 的 Bayes by Backprop,而第 5 节描述了后验的锐化。第 6 节简要回顾了相关工作。第 7 节做了实验评估,最后在第 8 节进行讨论并得出结论。

    1.4K60

    斯超参数优化原理(Python)

    bounds = np.array([[1e-3, 1e3], [1e-5, 1e-1]]) Step 4: 定义获取函数 这一步定义了我们之前讨论过的获取函数,并确定在搜索空间中要评估的下一个点。...在这个具体的例子,获取函数是期望改进(Expected Improvement, EI)函数。它测量目标函数在当前最佳观测值的基础上的期望改进,考虑当前替代模型(高斯过程)。...初始化样本和替代函数 在开始贝斯优化循环之前,我们需要使用一些初始样本初始化高斯过程替代模型。...Step 6: 运行贝斯优化循环 我们终于来到了贝斯优化循环。在这一步,贝斯优化循环将运行指定次数(n_iter)。...结论 在本文中,我们介绍了机器学习流水线的超参数优化,并深入探讨了超参数优化的世界,详细讨论了贝斯优化以及为什么它可能是一种相对于基本优化器(网格搜索和随机搜索)更有效的微调策略。

    65710
    领券