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箱线图的生物学含义

2.箱线图的组成 箱形图使用第25,50和75百分位数(也称为下四分位数(Q1),中位数(m或Q2)和上四分位数(Q3),以及四分位数范围(IQR = Q3-Q1,涵盖50%的中央数据)来反映样本的分布...四分位数不受异常值影响,并保留了中央数据和分布的信息。因此,对于不对称或不规则形状的种群分布以及具有极端异常值的样本,优于平均值和标准差。...用四分位数绘制箱形图的是一个公认的惯例:永远不应使用箱子或线来显示平均值、标准差或标准误。中位数不一定在箱子中心,两边延伸的线也不一定是对称的。...1.5×IQR1.5乘数对应±2.7σ(其中σ是标准差),覆盖了99.3%的正态分布数据。 延伸线之外的异常值可以单独绘制。 箱形图构造需要至少n = 5(越多越好)的样本,尽管某些软件不检查这一点。...图b是直方图和箱线图、几种类箱线图可视化的比较,条形图通常仅展示了平均值和标准差,箱线图从下往上,依次展示了数据集的五个指标:最小值,小四分位数,中位数,上四分位数和最大值。

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使用Python进行描述性统计

散点图可用来对两组数据的关系进行描述。在没有分析目标时,需要对数据进行探索性的分析,箱形图将帮助我们完成这一任务。   ...在此,我们使用一组容量为10000的男学生身高,体重,成绩数据来讲解如何使用Matplotlib绘制以上图形,创建数据的代码如下: View Code 3.2 频数分析 3.2.1 定性分析(柱状图、饼形图...#创建散点图 #第一个参数为点的横坐标 #第二个参数为点的纵坐标 pyplot.scatter(heights, weights) pyplot.xlabel('Heights...,体重这一变量的确是由身高变量通过线性回归产生,绘制出来的散点图如下: 3.4 探索分析(箱形图)   在不明确数据分析的目标时,我们对数据进行一些探索性的分析,通过我们可以知道数据的中心位置,发散程度以及偏差程度...使用Matplotlib绘制关于身高的箱形图的代码如下: 1 from matplotlib import pyplot 2 3 #绘制箱形图 4 def drawBox(heights): 5 #创建箱形图

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    使用Python进行描述性统计

    散点图可用来对两组数据的关系进行描述。在没有分析目标时,需要对数据进行探索性的分析,箱形图将帮助我们完成这一任务。   ...3.3 关系分析(散点图)   在散点图中,分别以自变量和因变量作为横纵坐标。当自变量与因变量线性相关时,在散点图中,点近似分布在一条直线上。...#创建散点图 #第一个参数为点的横坐标 #第二个参数为点的纵坐标 pyplot.scatter(heights, weights) pyplot.xlabel('Heights...3.4 探索分析(箱形图)   在不明确数据分析的目标时,我们对数据进行一些探索性的分析,通过我们可以知道数据的中心位置,发散程度以及偏差程度。...3.5 回顾 方法 说明 bar 柱状图 pie 饼形图 hist 直方图&累积曲线 scatter 散点图 boxplot 箱形图 xticks 设置柱的文字说明 xlabel 横坐标的文字说明 ylabel

    3.1K52

    R语言数据挖掘实战系列(3)

    如果数据服从正态分布,在3σ原则下,异常值被定义为一组测定值中与平均值的偏差超过三倍标准差的值。如果数据不服从正态分布,也可以用远离平均值的多少倍标准差来描述。         (3)箱型图分析。...箱型图提供了识别异常值的一个标准:异常值通常被定义为小于QL-1.5IQR或大于QU+1.5IQR的值。...2.定性数据的分布分析         对于定性变量,通常根据变量的分类类型来分组,可以采用饼形图和条形图来描述定性变量的分布。...,如盒图可以表示多个样本的均值,误差条形图能同时显示下限误差和上限误差,最小二乘拟合曲线图能分析两变量间的关系。...作图函数名 作图函数功能 barplot() 绘制简单条形图 pie() 绘制饼形图 hist() 绘制二维条形直方图,可显示数据的分配情形 boxplot() 绘制样本数据的箱型图 plot() 绘制线性二维图

    1.1K30

    《python数据分析与挖掘实战》笔记第3章

    另外提供的基本参数还有平均值(mean)、标准差(std)、最小值(min)、最大值(max)以及1/4、1/2、3/4分位数(25%、50%、75%)。 异常值检测箱型图 ?...(4) boxplot 功能:绘制样本数据的箱形图。...或者DataFrame的plot()方法,并用kind参数指定箱形图 (box)。...其中,盒子的上、下四分位数和中值处有一条线段。箱形末端延伸出去的直线称为须, 表示盒外数据的长度。如果在须外没有数据,则在须的底部有一点,点的颜色与须的颜色相同。...实例:绘制样本数据的箱形图,样本由两组正态分布的随机数据组成。其中,一组数据均值为0,标准差为1,另一组数据均值为1,标准差为1。绘制结果如图3-16所示。

    2.2K20

    我用Python的Seaborn库,绘制了15个超好看图表!

    同时也保持着与Python生态系统的高度兼容性,可以轻松集成到Python数据分析以及机器学习的工作流程中。 今天,小F就给大家介绍如何使用Seaborn制作15种不同类型的可视化图表。...具体图表类型,包含条形图、散点图、直方图、折线图、小提琴图、箱线图、热力图、点图、密度图、计数图、分簇散点图、特征图、Facet Grid、联合分布图、分类图。 首先使用pip安装Seaborn。...小提琴图 小提琴图表示数据的密度,类似于散点图,并像箱线图一样表示分类数据。 数据的密度越大的区域越胖。小提琴形状表示数据的核密度估计,形状在每个点的宽度表示该点的数据密度。...箱线图 箱线图由一个箱形图和两个须状图组成。 它表示四分位数范围(IQR),即第一和第三四分位数之间的范围。中位数由框内的直线表示。 晶须从盒子边缘延伸到最小值和最大值的1.5倍IQR。...网格中的每个图都可以定制为不同类型的图,例如散点图、直方图或箱形图,具体取决于要可视化的数据。 在这里,制作了每个物种花瓣长度的图表。

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    这3个Seaborn函数可以搞定90%的可视化任务

    Relplot relplot函数用于创建关系图,即线图和散点图。这些图提供了变量之间关系的概述。 让我们首先创建单位价格和总数列的散点图。我们指定数据和列名。kind参数用于选择绘图类型。...Catplot 使用catplot函数创建分类图,如箱形图、条形图、带状图、小提琴图等。总共有8个不同的分类图可以使用catplot函数生成。 箱形图用中位数和四分位数表示变量的分布。...下面是每个产品线单价栏的箱形图。...“width”参数调整框的宽度。 以下是箱形图的结构: ? 中位数是所有点都排序后的中间点。Q1(第一或下四分位数)是下半部分的中位数,Q3(第三或上四分位数)是上半部分的中位数。...我们还可以创建一个条形图来检查不同产品线的单价。与使用方框不同,条形图用一个点表示每个数据点。因此,它就像数字和分类变量的散点图。 让我们为branch和total列创建一个条形图。

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    计算与推断思维 十三、预测

    蓝线附近的散点图上的点的高度都大致在 -2 到 3 的范围内。红线太高,无法命中中心。 所以 45 度线不是“均值图”。该线是下面显示的绿线。 两条线都经过原点(0,0)。...标准单位下的回归直线 绿色的“均值图”线被称为回归直线,我们将很快解释原因。 但首先,让我们模拟一些r值不同的橄榄形散点图,看看直线是如何变化的。 在每种情况中,绘制红色 45 度线作比较。...事实证明,无论散点图的形状如何,最小二乘直线的斜率和截距都与我们开发的公式相同。 我们在《小女人》的例子中看到了它,但是让我们以散点图显然不是橄榄形的例子来证实它。...为了了解这种估计方法的效果如何,数据科学家必须知道估计值距离实际值多远。 这些差异被称为残差。 残差就是剩下的东西 - 估计之后的剩余。 残差是回归线和点的垂直距离。 散点图中的每个点都有残差。...另一种解释r的方式 我们可以重写上面的结果,不管散点图的形状如何: 互补的结果是,无论散点图的形状如何,拟合值的标准差是观察值y的标准差的一个比例。比例是|r|。

    2.4K10

    统计02:怎样描绘数据

    从物理的角度上来看,平均值和标准差所带的单位,都和原始数据相同。在多数统计案例中,大部分的群体数据会落在平均值加减一个标准差的范围内。 还有一些参数要通过对群体成员进行排序才能获得。...饼图 我们将以2011年几个国家的GDP数据为例子,看看如何绘制经典的饼图和条形图。...在应用中,还可以通过散点的大小来表示三维的数据。这种进化了的散点图称为泡泡图(bubble plot)。除了散点的大小,泡泡图有时还会用散点的颜色来表达更高维度的信息。 我们来看泡泡图的一个例子。...还有一些绘图是为了呈现群体参数,比如箱形图(box plot)。比如湘北高中身高数据绘制成箱形图: ? 如图中标注的,箱形图体现的主要是中位数和四分位数。...比如,我们可以在直方图中标出平均值和标准差: ?

    1.6K70

    统计02:怎样描绘数据

    从物理的角度上来看,平均值和标准差所带的单位,都和原始数据相同。在多数统计案例中,大部分的群体数据会落在平均值加减一个标准差的范围内。 还有一些参数要通过对群体成员进行排序才能获得。...饼图 我们将以2011年几个国家的GDP数据为例子,看看如何绘制经典的饼图和条形图。...在应用中,还可以通过散点的大小来表示三维的数据。这种进化了的散点图称为泡泡图(bubble plot)。除了散点的大小,泡泡图有时还会用散点的颜色来表达更高维度的信息。 我们来看泡泡图的一个例子。...还有一些绘图是为了呈现群体参数,比如箱形图(box plot)。比如湘北高中身高数据绘制成箱形图: ? 如图中标注的,箱形图体现的主要是中位数和四分位数。...比如,我们可以在直方图中标出平均值和标准差: ?

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    统计02:怎样描绘数据

    从物理的角度上来看,平均值和标准差所带的单位,都和原始数据相同。在多数统计案例中,大部分的群体数据会落在平均值加减一个标准差的范围内。 还有一些参数要通过对群体成员进行排序才能获得。...饼图 我们将以2011年几个国家的GDP数据为例子,看看如何绘制经典的饼图和条形图。...在应用中,还可以通过散点的大小来表示三维的数据。这种进化了的散点图称为泡泡图(bubble plot)。除了散点的大小,泡泡图有时还会用散点的颜色来表达更高维度的信息。 我们来看泡泡图的一个例子。...还有一些绘图是为了呈现群体参数,比如箱形图(box plot)。比如湘北高中身高数据绘制成箱形图: ? 如图中标注的,箱形图体现的主要是中位数和四分位数。...比如,我们可以在直方图中标出平均值和标准差: ?

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    Python数据分析之数据探索分析(EDA)

    没有任何限制下要求,真实直观地表现数据分布的本来面貌;箱形图判断异常值的标准以四分位数和四分位距为基础,四分位数具有一定的鲁棒性:多达25% 的数据可以任意元而不会扰动四分位数,所以异常值不能对这个标准施加影响...小提琴图查看异常值 小提琴图Violin Plot是用来展示多组数据的分布状态以及概率密度。这种图表结合了箱形图和密度图的特征,主要用来显示数据的分布形状。跟箱形图类似,但是在密度层面展示更好。...、直方图或帕累托图直观地显示其分布 。...,其定义为标准差与平均值之比。...四分位数间距(InterQuartile Range, IQR) ----第三四分位数与第一四分位数的差距,值越大说明变异程度越大。四分位距通常是用来构建箱形图,以及对概率分布)的简要图表概述。

    3.8K50

    创建吸引人的统计图表:Seaborn 库的实用指南与示例

    as plt示例 1:散点图散点图是一种用于显示两个变量之间关系的常见图表。...示例 2:箱线图箱线图是用于展示数据分布情况的常见图表,它显示了数据的中位数、四分位数、最大值和最小值。...plt.show()这将生成一个联合分布图,展示了总账单和小费之间的联合分布情况,并且通过六边形箱展示了数据的密度分布。...示例 15:分类箱线图分类箱线图用于展示多个分类变量和一个数值变量之间的关系,以箱线图的形式显示数据的分布情况。...通过示例演示了各种常用的图表类型,包括散点图、箱线图、直方图、线性回归图、热力图、分面网格、条形图、密度图、小提琴图、成对关系图、线性矩阵图、分类散点图、线性模型图、联合分布图、分类箱线图等。

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    一文掌握小提琴图的所有画法

    通常密度会随附一种叠加的图表类型,如箱形图,以提供一些其他的数据信息,即矩形上下边框代表第一个和第三个四分位数,中间点是中位数。 小提琴图可以用来观察数据的分布情况,也可用于比较多个组之间的分布。...#p值校正方法 notchwidth = 0.5, #对于有缺口的箱形图,缺口相对于主体的宽度(默认为0.5) linetype = "solid", title = "Fuel efficiency...这里的小提琴图是箱形图和核密度图的组合。...轴加粗显示 ) 2. library(hrbrthemes)#ggplot2的主题和相关组件包 library(viridis) #是Matplotlib的新默认颜色映射 ggplot...legend.position="none" #不加图例 ) + coord_flip() #翻转坐标 ggnormalviolin ggnormalviolin是使用ggplot2根据指定的均值和标准差创建正态分布的小提琴图的方法

    2.8K31

    从零开始的异世界生信学习 GEO数据库数据挖掘--GEO背景知识简介

    相关性热图 用来显示哪些样本相似性高 每个色块表示两个样本的相关性,图片为关于对角线对称的 差异基因热图 2.散点图和箱线图 图片 箱形图(Box-plot)又称为盒须图、盒式图或箱线图,是一种用作显示一组数据分散情况资料的统计图...图片 图片 箱线图的上边缘和下边缘并不是数据中的最大值和最小值 图片 箱形图提供了一种只用5个点对数据集做简单总结的方式。这5个点包括中点、Q1、Q3、分部状态的高位和低位。...箱形图很形象的分为中心、延伸以及分布状态的全部范围。 箱形图中最重要的是对相关统计点的计算,相关统计点都可以通过百分位计算方法进行实现。...箱形图的绘制步骤: 1、画数轴,度量单位大小和数据批的单位一致,起点比最小值稍小,长度比该数据批的全距稍长。 2、画一个矩形盒,两端边的位置分别对应数据批的上下四分位数(Q3和Q1)。...相同值的数据点并列标出在同一数据线位置上,不同值的数据点标在不同数据线位置上。至此一批数据的箱形图便绘出了。统计软件绘制的箱形图一般没有标出内限和外限。

    1.7K10

    52个数据可视化图表鉴赏

    主要指的是技术上较为高级的技术方法,而这些技术方法允许利用图形、图像处理、计算机视觉以及用户界面,通过表达、建模以及对立体、表面、属性以及动画的显示,对数据加以可视化解释。...异常值可绘制为单个点。箱线图是非参数图:它们显示统计总体样本的变化,而无需对潜在的统计分布进行任何假设。框的不同部分之间的间距表示数据的分散度(扩散)和偏度,并显示异常值。...24.六边形平铺地图 六边形平铺地图是一种使用六边形表示地理区域的图,以防止具有较大地理区域产生偏移。 25.直方图 直方图是显示分布形状的图表。...31.网络图 这种类型的可视化显示了事物是如何通过使用节点/顶点和链接线来表示它们的连接而相互连接的,并有助于说明一组实体之间的关系类型。 32.压缩气泡图 使用压缩气泡图在一组圆圈中显示数据。...用两组数据构成多个坐标点,考察坐标点的分布,判断两变量之间是否存在某种关联或总结坐标点的分布模式。散点图将序列显示为一组点。值由点在图表中的位置表示。类别由图表中的不同标记表示。

    5.9K21

    特征工程之异常值处理

    离群值处理标准差法MAD法箱形图法图像对比法BOX-COX转换参考文章 离群值处理 标准差法 又称为拉依达准则(标准差法),适用于有较多组数据的时候。...标准差本身可以体现因子的离散程度,是基于因子的平均值μ而定的。...在离群值处理过程中, 可通过用μ±nσ来衡量因子与平均值的距离 公式:假设有近似服从正态分布离散数据X=[x1,x2,…,xn],其均值μ与标准差σ分别为: , 如何衡量数值是否为离群值?...箱形图法 理论部分 概念:箱形图由最小值、下四分位值(25%),中位数(50%),上四分位数值(75%),最大值这5个关键的百分数统计值组成的。 如何通过箱形图判断异常值呢?...BOX-COX转换 优势: Box 和 Cox在1964年提出的Box-Cox变换可使线性回归模型满足线性性、独立性、方差齐性以及正态性的同时,又不丢失信息,此种变换称之为Box—Cox变换。

    2.4K31

    总结了50个最有价值的数据可视化图表

    这用于可视化 X 和 Y 之间的关系以及单独的 X 和 Y 的单变量分布。这种图经常用于探索性数据分析(EDA)。 7....边缘箱形图(Marginal Boxplot) 边缘箱图与边缘直方图具有相似的用途。然而,箱线图有助于精确定位 X 和 Y 的中位数、第 25 和第 75 百分位数。 8....箱形图(Box Plot) 箱形图是一种可视化分布的好方法,记住中位数、第 25 个第 45 个四分位数和异常值。但是,您需要注意解释可能会扭曲该组中包含的点数的框的大小。...包点+箱形图(Dot+Box Plot) 包点+箱形图(Dot+Box Plot)传达类似于分组的箱形图信息。此外,这些点可以了解每组中有多少数据点。 28....华夫饼图(Waffle Chart) 可以使用 pywaffle 包 创建华夫饼图,并用于显示更大群体中的组的组成。 注:需要安装 pywaffle 库 32.

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