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更强的可视化:最全ggplot2扩展包整理

本期为大家分享一个网站 ggplot2 extensions - gallery,该网站中包含了若干使用ggplot2及其扩展包实现的可视化案例,并附有详细绘图步骤和R语言代码。...ggrepel 提供避免标签重叠的功能,特别适用于散点图和其他需要标记数据点的图形。...gganimate:直观展示数据的动态变化过程。 ggsignif 可视化统计显著性标记。...ggfortify 更方便地处理和绘制多种类型的统计图形。 ggExtra 向 ggplot2 散点图添加边际密度图或直方图。 ggradar 使用 ggplot2 构建雷达图。...gggenes:绘制基因组图谱,通过简单而灵活的方式来可视化基因组注释数据。 ggblend 用于混合、复制、调整、转换和合成 ggplot2 层的运算代数。

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    R包reshape2 |轻松实现长、宽数据表格转换

    二、什么是宽表格和长表格 示例数据说明:例子使用内置于R中的空气质量数据集(airquality)。...当我们转换数据并且每个单元格有多个值时,还需要使用fun.aggregate=告知dcast以什么方式重新组合数据,是平均值(mean)、中位数(median)还是总和(sum)。...下面我们试试以平均值来重新组合数据,并使用参数na.rm=TRUE来删除空值NA。...recharts 交互式可视化CanvasXpress 聚类分析factoextra LDA分析、作图及添加置信-ggord 解决散点图样品标签重叠ggrepel 添加P值或显著性标记ggpubr Alpha...添加P值或显著性标记ggpubr Alpha多样性稀释曲线rarefraction curve 堆叠柱状图各成分连线画法:突出组间变化 冲击图展示组间时间序列变化ggalluvial 桑基图riverplot

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    路径分析图「建议收藏」

    模块名称用10 pt大小,使用Arial字体。草图如下: 4.3 精修图-路径图 将4.2路径图作为模板,其他水层或样点可在此基础上进行修改。...中的总效应柱状图依次复制到4.1路径图的AI画板中,各柱状图设置为上边缘对齐; 柱状图中横坐标修改为对应模块名称,并将柱状图颜色修改为与路径图4.2中相对应的颜色; 柱状图的x和y轴坐标刻度数字字体大小设置为...9 pt,x和y轴坐标轴标题设置为10 pt; 微调柱状图边界和大小使柱状图与4.3中路径图宽度相同,且右对齐; 检查x和y轴刻度数字是否在刻度线中心,x和y轴坐标轴的标题等是否与图形中心对齐...最终效果图如下: 将组合图在180*135 mm(包括了2mm的出血或天地边)画板中调至合适大小,图中路径系数最终字体大小为6.5 pt,block变量框中字体大小为7 pt,柱状图坐标轴刻度及R2字体大小为...技术问题寻求帮助,首先阅读《如何优雅的提问》学习解决问题思路,仍未解决群内讨论,问题不私聊,帮助同行。

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    以太网用户侧接口(以太网协议转换方案)

    这个问题的答案取决于以下几点:在共模扼流圈附近,接地层中的随机位移电流(噪声)如何表现,磁铁是否集成到连接器中,以及磁铁和RJ45之间是否需要机箱接地以确保EMI保护和隔离。...所有这些设计目标都可以通过选项1-3以不同的方式实现。多个接地层的布置/耦合,或单个连续接地层的使用,将决定通过传播噪声电流看到的隔离、ESD保护和阻抗水平。...从接地平面耦合回磁性元件并进入系统平面的 PHY 侧的共模噪声将以容性或感性方式进行。理想情况下,磁性元件应具有低漏电感和低漏电容/返回接地层的寄生电容。...在这里,您有两个独立的接地部分:系统接地和 PCB 中连接到机箱接地的平面区域。您如何确保它们保持相同的潜力?机箱接地区域应连接到其他接地,以消除这些区域之间的电位差。...与我合作的设计人员选择使用图 8 中的分割方法连接到 RJ45 连接器的接地层(分立磁性元件的选项 2),或者仅将系统接地连接到 RJ45(无论磁性元件放置如何)。

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    绘图技巧 | 这么漂亮的桑葚图你确定不来看看怎么做的?(附练习数据)

    它是一种特定类型的流程图,图中延伸的分支的宽度对应数据流量的大小,通常应用于能源、材料成分、金融、零售等数据的可视化分析(来源于网络)。接下来小编就带你如何使用R轻松绘制桑基图。...R-ggalluvial绘制实例 得益于ggplot2 强大的绘制功能,在R绘图生态系统中也存在一个包专门用于绘制桑基图-ggalluvial,也是ggplot2的拓展包,大家使用起来也十分方便。...ggalluvial可为两种数据绘制桑基图,其中一种就是宽数据,这里使用官网提供的例子来看一下宽数据绘图过程: library(ggalluvial) library(tidyverse) library...数据分析习惯了,刚开始学习的同学也可以这样操作了),有基础的同学可以使用管道(%>%) 功能。...其他工具绘制 在选择使用ggalluvial包进行绘制之前,我也查阅了其他绘图工具,如R-easyalluvial和R-networkD3等包,下面我给出其官网的部分可视化结果供大家参考。

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    冲击图(alluvial diagram)是流程图

    From PLoS ONE 5(1): e8694 (2010) ggalluvial是一个基于ggplot2的扩展包,专门用于快速绘制冲击图(alluvial diagram),有些人也叫它桑基图(.../ggalluvial/vignettes/ggalluvial.html 安装 以下三种方装方式,三选1: 显示帮助文档 使用vignette查看演示教程 接下来我们的演示均基于此官方演示教程,我的主要贡献是翻译与代码注释...展示性别与舱位和年龄的关系及存活率比例 我们发现上图居然画的是宽表格模式下的数据,而通常ggplot2处理都是长表格模式,如何转换呢?...长表格数据 主要列说明: x, 主要的分类,即X轴上每个柱 stratum, 主要分类中的分组 alluvium, 连接图的索引 5....分类学门水平相对丰度实战 绘制分组对应的分类学,有点像circos 组间各丰度变化,如果组为时间效果更好 Reference Jason Cory Brunson (2017). ggalluvial

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    硬件工程师必须掌握的PCB叠层设计内容

    每个走线层都必须有一个邻近的参考层(电源或地层);   2....单、双层板通常使用在低于10KHz的低频模拟设计中:   1)在同一层的电源走线以辐射状走线,并最小化线的长度总和;   2)走电源、地线时,相互靠近;在关键信号线边上布一条地线,这条地线应尽量靠近信号线...另外,电源或地层上的铺铜之间应尽可能地互连在一起,以确保DC和低频的连接性。   ...5.Ground 地层   6.Signal 3 带状线走线层,好的走线层   7.Power 地层,具有较大的电源阻抗   8.Signal 4 微带走线层,好的走线层   3、最佳叠层方式,由于多层地参考平面的使用具有非常好的地磁吸收能力...5.Ground 地层   6.Signal 3 带状线走线层,好的走线层   7.Ground 地层,较好的电磁波吸收能力   8.Signal 4 微带走线层,好的走线层   对于如何选择设计用几层板和用什么方式的叠层

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    ADC数字地DGND、模拟地AGND的谜团!

    更复杂的是,混合信号IC具有模拟和数字两种端口,因此如何使用适当的接地技术就更加茫然。此外,混合信号IC有的具有相对较低的数字电流,而另一些具有高数字电流。...由于接地层的屏蔽作用,电路对外部EMI / RFI的敏感性也降低了。 接地层还允许使用需要可控阻抗的传输线技术(微带或带状线)来传输高速数字信号或模拟信号。...左侧示例中,典型的0.1 μF贴片陶瓷电容借助过孔直接连接到PCB背面的接地层,并通过第二个过孔连接到IC的GND引脚上。...大多数系统中,4层也嫌不足,还需要其他层用于信号和电源的走线。 多卡混合信号系统 在多卡系统中,降低接地阻抗的最佳方式是使用“母板”PCB作为卡间互连背板,从而为背板提供连续接地层。...缓冲寄存器和其他数字电路应接地并去耦至PC板的数字接地层。请注意,模拟与数字接地层间的任何噪声均可降低转换器数字接口上的噪声裕量。由于数字噪声抗扰度在数百或数千毫伏水平,因此一般不太可能有问题。

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    69-R可视化12-用easylabel轻松手动添加标记

    参考: easylabel (r-project.org)[1] 前言 先前我介绍过ggrepel 这个包:[[67-R可视化11-用ggrepel更加美观的添加标记(火山图的实现)]] 其实现的文本标记更加美观...制作假数据: my_packages<- c("RColorBrewer", "paletteer", "ggplot2", "ggpubr", "tidyverse", "ggrepel...这里因为以火山图为例,先使用火山图绘图函数easyVolcano :需要注意这里的数据框的行名需要是基因名 # 开始之前修改一下数据框 DEG$new_P <- -log10(DEG$P_value)...,也是y轴; ylim 是整个坐标轴y 的边界范围; xlim 同上,超过这两个边界的点会被标记为outlier; colScheme 为指定的颜色版; vline 标记y 轴线段,用于分割结果,类似之前的...geom_hline 操作; 接下来我们就可以在shiny 中交互添加了: 在shiny 界面,你还可以对标签的位置进行个性化设置: 此外,除了在图上标记,还有一个非常有意思的筛选框,你可以通过输入基因名的方式标记

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    PCB座子排针排母连接器,对EMC的影响

    这种辐射会干扰周围的敏感设备,特别是高频噪声源或高速信号。1.2 传导干扰传导干扰发生在连接器的信号线或电源线通过连接器与其他电路连接时。...由于连接器的接触电阻和不完全的接触,会产生噪声传导,导致电磁干扰通过PCB的电源层或信号层传播到其他电路部分。...1.3 接地问题不良接地:连接器的引脚和PCB之间可能存在接地问题,尤其是在复杂的多层PCB中,连接器的接地引脚和地层可能没有良好的连接,导致地电位差异或地回流问题。...2.2 合理布局与接地合理的PCB布局:在设计时,应确保信号线和电源线与接地层的接触良好,避免通过连接器引入电磁干扰。信号线应远离高频噪声源,并确保信号线与地层之间 的电气距离尽量短。...2.4 减少串扰布局设计:在多排引脚的连接器中,应尽量隔离高速信号和低速信号,避免它们之间的耦合。可以通过 屏蔽地层或接地线来减少串扰。

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    三组(连续)桑基图绘制(含百分比)学习

    桑基图(Sankey Diagram) 是一种用于可视化数据流的图表类型,常用于展示数据、能量、物料、资金或其他资源在系统中不同部分之间的流动和分配情况。...桑基图的主要组成部分节点(Nodes):代表系统中的不同部分或类别,例如部门、阶段或类别等。流线(Flows):连接不同节点的线条,表示资源或数量从一个节点流向另一个节点。...制作桑基图的工具R语言:ggplot2、ggalluvial、ggsankey、networkD3等包都支持绘制桑基图。...Python:可以使用Plotly、matplotlib、Holoviews等库。在线工具:如Excel、Google Data Studio、Tableau等可视化工具也支持桑基图的制作。...百分比需要手动调整,其实蛮麻烦的。调整标签的垂直对齐 (vjust) 和水平对齐 (hjust):通过修改 vjust 可以控制标签和百分比的上下移动。

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    PCB多层板-电源分割

    一般就是顶层 大通孔 内电层:也叫平面层或负片层,是内部电源和地层(并通过通孔与各层贯通的层),内电层使用“线条”图元进行分割。...我觉得就是借鉴了图像学里面的定义 负片效果:凡是画线条的地方印刷板的敷铜被清除,没有画线条的地方敷铜反而被保留。放置在这些层面上的走线或其他对象是无铜的区域,也即这个工作层是负片的。...信号层采取正片的方式处理,电源层和地线层采取负片的方式处理,可以在很大程度上减小文件数据量的大小和提高设计的速度。...GND为顶层布线提供参考平面;敏感信号层应该与一个内电层相邻(内部电源/地层),利用内电层的大铜膜来为信号层提供屏蔽。 电路中的高速信号传输层应该是信号中间层,并且夹在两个内电层之间。...显然,方案 3 电源层和地层缺乏有效的耦合,不应该被采用。 那么方案 1 和方案 2 应该如何进行选择呢? 一般情况下,都会选择方案 1 作为 4层板的结构。

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    Cell杂志同款:单细胞亚群组间差异基因排序气泡图

    还有两个拼在一起的效果如下: 数据背景 这个图的数据作者直接提供了,在补充材料的表S7中:https://www.cell.com/cms/10.1016/j.cell.2020.06.001/attachment.../b3655739-fad8-4fbb-8bc8-1df95c45a954/mmc4.xlsx 读取进来并简单处理: rm(list=ls()) ## 使用西湖大学的 Bioconductor镜像 options...标记基因如下: 绘图 使用ggplot2绘图: library(ggprism) library(RColorBrewer) library(circlize) colors <- colorRampPalette...                  min.segment.length = 0,  # 长度大于0就可以添加引线                   hjust = 1.2,             # 文本标签的右侧与指定位置对齐...segment.alpha=0.8,       # 文本标签中连接线段的透明度                   nudge_y=-0.1             # 在y轴方向上微调标签位置

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    【直播回顾】轻松入门数据可视化

    本书的具体介绍请查阅前文: 《Excel 数据之美--科学图表与商业图表的绘制》上市啦 TableauSoftware致力于帮助人们查看并理解数据。Tableau帮助任何人快速分析、可视化并分享信息。...超过42,000家客户通过使用Tableau在办公室或随时随地快速获得结果。数以万计的用户使用TableauPublic 在博客与网站中分享数据。...地理统计制图实用指南(http://spatial-analyst.net/book/download)提供了关于如何使用R及其他工具分析空间数据的可免费下载的电子书。...R语言数据可视化方法 如需绘制这些不同类型的图表,我们主要使用R ggplot2及其拓展包extension,比如ggrepel、ggally、ggalluvial等包;也还会使用lattice、plot3D...R中ggplot2包的geom_path()和geom_polygon()等函数,结合地理空间坐标系可以使用DataFrame格式的数据,绘制不同投影下的世界与国家地图。

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    交换机PCB板布局布线注意事项

    9、去偶电容的布局要尽量靠近IC的电源管脚,并使之与电源和地之间形成的回路最短。10、元件布局时,应适当考虑使用同一种电源的器件尽量放在一起, 以便于将来的电源分隔。...电源层和地层之间的EMC环境较差,应避免布置对干扰敏感的信号。    有阻抗控制要求的网络应尽量按线长线宽要求布线。(二)四种具体走线方式1、时钟的布线:    时钟线是对EMC 影响最大的因素之一。...在多层板中,对去耦电容的位置一般要求不太高,但对双层板,去藕电容的布局及电源的布线方式将直接影响到整个系统的稳定性,有时甚至关系到设计的成败。...在双层板设计中,一般应该使电流先经过滤波电容滤波再供器件使用。在高速电路设计中,能否正确地使用去耦电容,关系到整个板的稳定性。...对混合电路,也有将模拟与数字电路分别布置在印制板的两面,分别使用不同的层布线,中间用地层隔离的方式。

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    如何控制PCB电路板生产中的质量问题?

    PCB电路板的生产质量直接影响电子产品的性能和稳定性,因此控制PCB生产过程中的质量问题至关重要。...以下从设计、原材料、生产工艺、质量检测和管理几个方面详细论述如何全面控制PCB生产质量问题: 1、设计阶段的质量控制 优化电路设计 采用专业的PCB设计工具(如Altium Designer、Cadence...进行充分的信号完整性分析(SI)和电磁兼容性分析(EMC),减少信号干扰和串扰。 根据产品需求合理选择多层板结构,优化电源地层布局,避免电流回路干扰。...蚀刻工艺 使用高纯度蚀刻液,并定期更换。 控制蚀刻速度,避免铜线蚀刻过度或不足。 钻孔和电镀 精确控制钻孔位置及尺寸,避免偏孔和毛刺。 电镀厚度均匀性控制,确保孔铜完整性,避免孔壁断裂。...层压及热压 确保多层板芯材对齐,防止分层、气泡和偏移。 精确控制热压温度、压力和时间。 表面处理 不同处理方式(如HASL、沉金、镀锡等)需根据产品应用选择,确保焊接性和抗氧化性能。

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