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UseGalaxy.cn生信云|零代码使用Tiverse优雅地处理数据集

Dplyr Join two tables join 函数用于根据指定的键将两个数据框连接起来,可以根据共同的变量将数据框进行合并,支持多种连接操作,如内连接、左连接、右连接和外连接等。...Dplyr Slice select rows by position slice 函数用于按行数进行切片,能够从数据框中提取特定的行,支持根据行数或行号选择需要的行,也支持使用负数表示从末尾开始计算的行数...Dplyr Filter keep rows that match a condition filter 函数用于根据条件筛选数据行,能够仅保留满足条件的观测,支持根据指定的条件表达式对数据框进行灵活的行筛选操作...Tidyr Pivot Longer from wide pivot_longer 函数用于将宽格式数据转换为长格式数据,能够根据用户指定的列将数据框中的多个列整理成一对 “名-值” 对,便于进一步的分析和处理...Tidyr Pivot Wider from long pivot_wider 函数用于将长格式数据转换为宽格式数据,能够将数据框中的一列分成多个列,根据指定的列名进行展开,使得数据以更直观的宽格式形式呈现

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    数据处理|R-dplyr

    dplyr包实现数据的清洗处理,包括数据整合、关联、排序、筛选、汇总、分组等。...1)安装、加载dplyr包、准备数据 install.packages("dplyr") #加载dplyr包 使用dplyr包处理数据前,建议先将数据集转换为tbl对象。...data(iris) #本文使用iris示例数据集。 2)数据记录筛选(行筛选) filter函数:按指定条件筛选符合条件中逻辑判断要求的数据记录。...sample_n(mtcars, 50, replace = TRUE) #随机有重复的取50行数 10)数据联结 dplyr包也提供了数据集的连接操作,如左连接、右连接、内连接等: inner_join...11)数据合并 dplyr包中也添加了类似cbind()函数和rbind()函数功能的函数,它们是bind_cols()函数和bind_rows()函数。

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    day6-乙醇-学习R包

    学生信为啥要学R语言:R语言拥有丰富的图表和Biocductor上面的各种生信分析R包。 如何安装和加载R包 1....”) 或BiocManager::install(“R包名”) 取决于要安装的包存在于CRAN网站还是Biocductor 加载R包 用library(“R包名”)加载R包,记得先有安装了,才可以加载使用...dplyr包的学习 五个基本函数 首先构建一个储存数据的变量 test 图片 mutate() 用于新增一列数据 select(),按列筛选 按列号筛选 按列名筛选 图片 filter()筛选行 图片...%>% (cmd/ctr + shift + M) count统计某列的unique值 dplyr处理关系数据 內连inner_join,取交集 图片 左连left_join 图片 全连full_join...图片 半连接:semi_join 图片 反连接:anti_join 图片 简单合并:相当于base包里的cbind()函数和rbind()函数;注意,bind_rows()函数需要两个表格列数相同,而

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    Day6-学习dplyr_R包

    Day6-学习dplyr_R包加载包library(dplyr)示例数据直接使用内置数据集iris的简化版:test dplyr五个基础函数1....mutate(),新增列2.select(),按列筛选,列名列号都可以.select(数据框,列号/列名)3.filter()筛选行filter(数据框,列名==想筛选的值的行)4.arrange()...,按某1列或某几列对整个表格进行排序arrange(数据框, 排序的列名),desc从小到大排序参数5.summarise():汇总正在上传图片...dplyr两个实用技能1:管道操作 %>% (cmd.../ctr + shift + M)2:count统计某列的unique值dplyr处理关系数据1.內连inner_join,取交集2.左连left_join3.全连full_join4.半连接:返回能够与...y表匹配的x表所有记录semi_join5.反连接:返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_join6.简单合并:bind_rows()函数需要两个表格列数相同,而bind_cols()函数则需要两个数据框有相同的行数

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    Day6 呦呦鹿鸣—学习R包

    (2)按列名筛选select(test, Petal.Length, Petal.Width)iris %>% select(Species, Sepal.Length)3.filter()筛选行/返回具有匹配条件的行可以按照某分类变量的值进行数据筛选...arrange(test, Sepal.Length)#默认从小到大排序mtcars %>% arrange(cyl, disp)5.summarise():汇总,对数据进行汇总操作,结合group_by使用实用性强...\ 将多个值减少到单个值summarise(test, mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length)) # 计算Sepal.Length的平均值和标准差summarise(group_by...(test, Species),mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length)) # 先按照Species分组,计算每组Sepal.Length的平均值和标准差dplyr两个实用技能...anti_jointest1中去除交叉部分的列表anti_join(x = test2, y = test1, by = 'x')6.简单合并bind_rows(test1,test2)函数需要两个表格列数相同

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    单细胞转录组 | 细胞亚群人工注释

    细胞亚群注释有机器注释(注释结果不一定百分百可靠)和人工注释(主观性强)。 本期我们将介绍如何进行人工注释。 本文框架 1. 安装包 如果已经安装,此步请跳过。...test.use:检验方法; only.pos:仅返回表达倍数大于0的基因(默认为 FALSE); logfc.threshold:类群中基因的平均表达量相对于所有其他类群的平均表达量的最小log2倍数。...wilcox" , only.pos = TRUE, logfc.threshold = 0.25) 输出文件: p_val:P值;...5.2 筛选每个cluster中表达前10的基因 # 筛选p_val<0.05的基因 all.markers =cluster_markers %>% dplyr::select(gene,everything...()) %>% dplyr::filter(p_val<0.05) # 将avg_log2FC排名前10的基因筛选出来 top10 = all.markers %>% group_by(cluster)

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    学习R包

    R包是多个函数的集合,具有详细的说明和示例。...使用一个R包:先安装,再加载,最后使用实操代码(依旧以dplyr为例)options("repos"=c(CRAN="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"...dplyr包有很多函数,为了防止dplyr包中的函数名与其他函数产生冲突,使用时前面加上“包名::”dplyr五个基础函数mutate(),新增列select(),按列筛选按列号筛选注意筛选内容与表格内容的统一...+ shift + M)同时执行三件事(加载任意一个tidyverse包即可用管道符号)count统计某列的unique值dplyr处理关系数据即将2个表进行连接內连inner_join,取交集左连left_join...注意返回的表的不同反连接:返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_join注意返回的表的不同简单合并在相当于base包里的cbind()函数和rbind()函数;注意,bind_rows()函数需要两个表格列数相同

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    生信入门day6分野—R包的使用

    mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")对应中科大源当然可以换成其他地区的镜像包的安装install.packages("包")BiocManager::install("包“)包的加载以下两个都可以使用...")library(dplyr)dplyr 五个基本函数mutate()新增列mutate(test,new=Sepl.Lengh*Sepal.Width)select()按列筛选按列号筛选select...(test,1)按列名筛选select(test,Sepal.Length)筛选行filter()按某1列或者某几列对整个表格进行排序arrange()汇总sunnarise()dplyr的实用技能管道操作...%>% 该命令可以用ctrl+shift+M 可以将前一行输出的结果传递给后一行作为输入统计某列的值count()dplyr处理关系数据inner_join内连取交集left_jion左连full_join...全连bind_rows()两个表格列数相同 bind_cols()两个数据框有相同的行数

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    Day6 R包安装和学习

    使用一个包,是需要先安装再加载,才能使用包里的函数。以“dplyr”为例。...dplyr五个基础函数1.mutate(),新增列mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width)2.select(),按列筛选(1).按列号筛选(2).按列名筛选...(3).filter()筛选行(4).arrange(),按某1列或某几列对整个表格进行排序(5).summarise():汇总dplyr两个实用技能1:管道操作 %>% (cmd/ctr + shift...+ M)2:count统计某列的unique值dplyr处理关系数据1.內连inner_join,取交集2.左连left_join3.全连full_join4.半连接:返回能够与y表匹配的x表所有记录...semi_join5.反连接:返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_join6.简单合并在相当于base包里的cbind()函数和rbind()函数;注意,bind_rows()函数需要两个表格列数相同

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    Day6-梦琪

    Day6-2023.12.02学习R包-dplyr是R中用来进行数据操作的一个包,提供了一些功能强大,易于使用的函数,这些函数对于数据探索分析和数据操作而言非常实用,dplyr主要用于数据清理,包括重命名...、排序、筛选、聚合等。...")或者 BiocManager::install(“包”)安装包library(dplyr) 加载包 library函数是加载和使用R语言中的函数库和扩展包二、dplyr的五个基础函数mutate(...、dpylr的两个实用技能管道操作符:管道符 %>% ,符号左侧表示数据的输入,右侧表示下游数据处理环节count统计某列的unique值四、dplyr处理关系数据(即将2个表进行连接)1.內连inner_join...')5.反连接:返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_joinanti_join(x = test2, y = test1, by = 'x')6.简单合并bind_rows()函数需要两个表格列数相同

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    R数据科学|第九章内容介绍

    使用dplyr处理关系数据 在实际应用中,我们常会涉及到多个数据表,必须综合使用它们才能找到关键信息。存在于多个表中的这种数据统称为关系数据。...本章中的很多概念都和SQL中的相似,只是在dplyr中的表达形式略微不同。一般来说,dplyr 要比 SQL 更容易使用。...处理关系数据有三类操作: 合并连接:向数据框中加入新变量,新变量的值是另一个数据框中的匹配观测。 筛选连接:根据是否匹配另一个数据框中的观测,筛选数据框中的观测。...筛选连接 筛选连接匹配观测的方式与合并连接相同,但前者影响的是观测,而不是变量。筛选连接有两种类型: semi_join(x,y):保留x表中与y表中的观测相匹配的所有观测。 ?...集合操作 集合操作都是作用于整行的,比较的是每个变量的值。集合操作需要x和y具有相同的变量,并将观测按照集合来处理。 操作 作用 intersect(x,y) 返回既在x表,又在y表中的观测。

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