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「R」安装和使用 R 包

问题 你想安装和使用一个 R 包。...方案 如果你正在使用支持 R 的图形界面软件,应该存在通过菜单栏方式安装 R 包的选项(例如,常用的 Rstudio 中,可以点击菜单栏 Tools 中的 Install Packages… 进行 R...这里主要介绍如何用命令行来安装 R 包,如下所示: install.packages("reshape2") # reshap2为包名 在一个新 R 线程中使用该包之前,你必须先导入它。...如果想要将所有已安装的软件包更新为可用的最新版本,使用以下命令: update.packages() 如果你在 Linux 系统上使用 R ,管理员可能已经在系统上安装了一些 R 包,由于普通用户没有更改权限...其他 导入包也可以使用require()函数。下表显示了 R 包安装相关的命令及描述。

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R问题|如何本地安装R包

简介 平常在各种R语言群里,总会遇到关于安装R包的问题,例如:搭载在github上的R包,由于网速(外网)原因而无法下载该怎么办?...这里小编分享下平常逼不得已才使用的“下三滥”方法——直接下载包,通过本地安装。 网上好多解决方案都是基于R gui的,但现实中使用Rstudio这个IDE会更多些。...接下来以gmm包在Rstudio下安装为例: 教程 使用bing搜索该包,找到相应网站[1]。 关键词:R包名称+R,或者可以再加上CRAN。 ?...搜索技巧:R包名称+R 找到Downloads板块,下载对应的压缩包 这里以mac为例 ?...这个方法对一些有很多依赖包的包可能会很头疼,就怕安装完成,他还说你有其他包没安装,那你只能“将错就错”了!

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    如何在Ubuntu 18.04上使用devtools安装R包

    在本教程中,我们将讨论如何安装devtools并使用它直接从GitHub安装R包。...没有服务器的同学可以在这里购买,不过我个人更推荐您使用免费的腾讯云开发者实验室进行试验,学会安装后再购买服务器。 至少 1GB的RAM 安装R 一旦满足这些先决条件,您就可以开始了。...第3步 - 从GitHub安装R包 在这一步中,我们将直接从GitHub安装Shiny的最新开发版本,这是一个R的Web应用程序框架。...首先,我们将中断与服务器CTRL+ C,然后退出将R壳CTRL+ D并重新输入它作为根: sudo -i R 我们可以使用以下命令安装稳定版本,该命令将覆盖我们在前面步骤中完成的GitHub安装。...cat /usr/local/lib/R/site-library/shiny/DESCRIPTION 结论 在本教程中,我们直接从GitHub安装了最新的Shiny软件包,并学习了如何从CRAN重新安装其稳定版本

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    R语言中如何查看安装过的R包

    ,不用查说明文档了…… R语言包,就是别人编写好的程序、函数放到一起,你直接用就可以,不用重新编写,大部分的R包在CRAN中,用install.packages进行安装,还有一些在bioconductor...下面介绍一下如何查看已经安装的R包,应用场景很多,主要就是你想在另外电脑上配置同样的环境时,直接按图索骥就行了。当然,更简单的是把包直接copy进去,安装相同的版本,直接用就行了。...下面介绍几种R包的管理,包括如何查看已经安装的R包,如何查看已经加载的R包,如何安装R包,如何删除R包,如何查看R版本,如何查看R包的版本,所谓的一答解千文,就是说的本篇呀! 1....查看已安装的包 installed.packages() 它会给出来,所有已安装的R包的详细信息,包括包名,路径,版本,优先级,建议等,提取已安装的包名: as.data.frame(installed.packages...安装和卸载R包 安装R包,如果是在CRAN中,直接用install.packages(), install.packages("ggplot2") 加载一下,看看是否成功: > library(ggplot2

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    R包的安装

    2、作用:实现特定的功能,你需要什么功能,安装相应的R包就行。说人话就是使用智能手机,需要使用微信与人聊天,你就按照微信APP,需要上腾讯视频看电视剧,你就安装腾讯视频APP。...R包,使用 “BiocManager::install()来安装 (3)github网站,是R包作者写的,没有经过审核,使用”devtools::install_github...几乎不使用,使用时需要写明R包的作者,就是指明选择谁写的R包。...4、如何安装 安装如上 安装后需加载才能使用,加载的函数“library()”,“require()” 一次安装,每次打开新的窗口时(重启Rstudio)都需要加载。...5、如何实现快速下载 如果官网速度慢,请使用镜像网站 图片 图片 官方网站CRAN网站的镜像使用方法1,Bioconductor网站的镜像使用方法2,方法2也适用CRAN 三、安装R包会遇到问题

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    R语言 | R包安装及向量

    关于R和RStudio安装在这里就不再介绍了,网上有很多相关内容,如果安装过程有困难可以后台私信我。 PS.本次内容为R包安装及初识向量。 ? PART2 R包安装 问:什么是R包?...(对于刚接触R的同学来说可能看起来比较抽象,但是没关系,我们会在后续的学习中慢慢了解R包的概念) 1.R包安装:第一次安装一个包,使用命令install.packages()即可。...#示例:安装ggplot2包 install.packages('ggplot2') install.packages("ggplot2") 值得注意的一点是,包的名称需要放在单引号''或者双引号""...中 2.R包载入:安装完成后,想要调用这个包中的命令、数据等信息,就需要先载入这个包,需要用到的命令为library()。...推荐使用'<-',按住键盘上'Alt'后按'-'可快速打出'<-'。 例:在这里我们命名一个名为data1和data2的向量,把c()括号中的内容赋值给data1,data2。

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    R包来源及安装指定版本R包方法

    说实话,自从之前好好学习了一下入门的R以后,一直没有用过R,很多东西都忘了,还是需要靠做笔记方便日后查阅。 本期讲一下R包的几种来源以及安装指定版本R包的几种方法。 R包来源及安装方法 1....CRAN网站 可以理解为R包的官网,凡是需要通过CRAN下载的R包,都可以通过install.packages("pkg_name")来安装。 2....安装指定版本R包 复现文章或R包的更新与当前的R版本或R代码不兼容时,就需要考虑安装某个特定版本的R包了,这里列一些常见的安装指定版本R包的方法供大家参考。...在装有devtools的基础上,我使用以下命令重新装了0.1.8版本的rvcheck后,顺利的安装了clusterProfiler。...源码安装 在这里也许能找到你需要的R包历史版本。

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    关于r包安装到哪里了以及如何看自己的r包数量

    这个函数主要用于查看和管理 R 包的安装位置。以下是一些使用 .libPaths() 函数的技巧: 查看已配置的包安装路径: .libPaths() 这会返回一个包含当前所有包安装路径的字符向量。...设置默认包安装路径: .libPaths("/path/to/preferred/library") 这会将默认的包安装路径设置为指定路径。这样,每次启动 R 时都会使用这个路径作为默认路径。...在不同的会话中使用不同的包安装路径: 在Linux运行环境里面使用 R 中,每次启动都是一个新的会话。可以通过在启动脚本或命令行中设置 .libPaths() 来在不同的会话中使用不同的包安装路径。...Sys.getenv("R_LIBS_USER") 这会返回 R 默认使用的用户级别包安装路径。...这些技巧可以帮助你更灵活地管理和配置 R 包的安装路径,特别是在需要在多个项目或环境中使用不同的包集时。

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    BiocManager无法安装R包

    每次开展R语言线下学习班,都需要重新发几次:Windows电脑使用Rstudio会有多少错误呢 ,虽然大部分同学都是可以根据我们的教程顺利解决问题,但是不幸的人各有各的不幸。...但是今天有一个学员起初是下载R包无法联网,所以失败,根据我们的经验当然是options(download.file.method = 'libcurl')就轻轻松松解决啦,不过这次居然是仅仅是解决了R自带...R包下载问题,使用BiocManager仍然是无法安装R包,如下所示: ?...='libcurl') 果然,现在在Windows电脑里面R语言的安装R包和下载文件就OK啦。...接下来就继续安装R包吧 使用管理员打开R哦,然后就 options()$repos options()$BioC_mirror options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn

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    R包来源及安装

    说实话,自从之前好好学习了一下入门的R以后,一直没有用过R,很多东西都忘了,还是需要靠做笔记方便日后查阅。 本期讲一下R包的几种来源以及安装指定版本R包的几种方法。 R包的来源 1....CRAN网站 可以理解为R包的官网,凡是需要通过CRAN下载的R包,都可以通过install.packages("包名")来安装 2....Bioconductor 里面多是跟生信相关的R包,通过BiocManager::install("包名")来安装,今天的例子edgeR和limma都可以通过这种方法安装。 3....部分作者在写好R包以后还没来得及上传到CRAN上,便可以在其Github上安装,通过devtools::install_github("用户名/包名")安装 # 综上 install.packages(...安装指定版本R包 复现文章或R包的更新与当前的R版本或R代码不兼容时,就需要考虑安装某个特定版本的R包了,这里列一些常见的安装指定版本R包的方法供大家参考。

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    R包安装方式以及Github包安装报错解决

    R包安装的方式 之前在学习数据挖掘课程的时候,就按照小洁老师教的方法整理过相应的笔记啦,R包安装与使用 那我们先回顾一下,基本的R包安装方法——配置好镜像,然后按照对应的来源安装需要的R包。...BiocManager然后再去安装需要的R包 使用说明 install.packages("BiocManager") #导入BiocManager BiocManager::install(...Github上R包 如果是github上的包,可以采用输入作者名以及R包名字之后使用命令进行安装 安装Github上的包 #使用devtools安装 install.packages('devtools...在使用remotes将R包导入Rstudio中 # 括号里填入R包所在的位置 remotes::install_local("....() #查看已安装的R包 search() #查看已载入的R包 查看已经安装的R包 查看已经载入的R包 R包安装成功的唯一标准:library()没有error——小洁老师

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    R语言入门之R包的安装

    通常来说,R包的安装主要有四种方法,包括:1)从R语言官网上直接下载相关R包并安装;2)从Bioconductor上下载R包并安装;3)从Github上下载R包并安装;4)手动安装R包。...接下来我将和大家分享R包的具体安装: 1)首先获取下载的R包的名字,比如下载metafor这个R包,可以先在官网(https://www.r-project.org/)上找到这个包,了解一下这个包的详细内容和使用说明...,接下来使用: install.packages('metafor') 即可顺利安装该R包。...') 这里需要注意的是,下载Bioconductor的R包需使用BiocManager包里的install函数。...4)关于手动安装R包,也是使用install.packages()函数,但是一般情况下使用较少,这里暂不叙述,如有问题,可以留言提问。

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