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X86 vs ARM 架构同台竞技: 生物大数据大规模并行计算(如何将WGS全基因组计算成本降到1美元)

因此,如何在云平台上选择合适的硬件配置,从而平衡计算成本与分析速度,成为了值得探索的问题。...为此,Oracle甲骨文云发布了相应的评测文章,该测试项目使用了OCI提供的最新的 ARM 和 x86计算实例,利用OCI硬件资源分配与优化机制,搭配Sentieon软件进行了一系列的运算耗时和云成本估算的基准测试...测试结果显示,Sentieon DNAseq在OCI的大部分ARM实例上实现了30x WGS的整体分析成本低于1美元,最低在ARM-S实例上处理NovaSeq 30x WGS成本0.9美元。...此外,凭借 ARM 强大的计算速度和及更低的成本优势,OCI 的 ARM 实例可为用户提供性价比最佳的解决方案, 30X WGS 数据样本的FASTQ-to-VCF 分析,计算成本不到 1 美元。...Sentieon软件安装简单,开箱即用,并且提供了与ARM和x86指令集适配的版本。使30X WGS 数据样本在OCI 实例上的计算成本压缩到每个样本 1 美元以下,处理时间缩短到近一小时。

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    白话 CRC

    下面是具体的计算过程: (1)首先把生成多项式转换成二进制数,由P(X) = X4 + X3 + 1可以知道,它一共是5位(总位数等于最高位的幂次加1,即 4+1=5),然后根据多项式各项的含义(多项式只列出二进制值为...(2)因为生成多项式的位数为 5,根据前面的介绍,得知 CRC 校验码的位数为4(校验码的位数比生成多项式的位数少1)。...目前不同版本的 CRC 已经有标准的二进制多项式,下面给出常用 CRC 版本: 名称 多项式 表示法 应用举例 CRC-8 X8+X2+X+1 0x107 CRC-12 X12+X11+X3+X2+X...others; also known as CRC-16 and CRC-16-ANSI CRC-CCITT X16+X12+X5+1 0X11021 ISO HDLC, ITU X.25, V.34.../V.41/V.42, PPP-FCS CRC-32 X32+X26+X23+X22+X16+X12+X11+X10+X8+X7+X5+X4+X2+X+1 0x104C11DB7 ZIP, RAR, IEEE

    2.6K10

    2023-12-02:用go语言,如何求模立方根? x^3=a mod p, p是大于等于3的大质数, a是1到p-1范围的整数

    2023-12-02:用go语言,如何求模立方根? x^3=a mod p, p是大于等于3的大质数, a是1到p-1范围的整数常数, x也是1到p-1范围的整数,求x。...p过大,x不能从1到p-1遍历。 答案2023-12-02: 灵捷3.5 大体步骤如下: 1.判断是否存在模立方根。有0,1,3个根这三种情况。 1.1.求p-1和3的最大公约数gcd(p-1,3)。...big.NewInt(0) p.SetString("FFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFEFFFFFC2F", 16...big.NewInt(0) p.SetString("FFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFFEBAAEDCE6AF48A03BBFD25E8CD0364141", 16...) c3 := big.NewInt(0) c1.Mul(x.a, y.c) //x.a*y.c c1.Mod(c1, p) c2.Mul(x.b, y.b) //x.b

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    使用CRC20算法对IP五元组hash键值计算

    利用crc32,crc16,sha,md5等进行key值计算 c. 其他3 在相应的key值位置分配内存,并存储数据     如:得到的key为100,那么a100=malloc(...)...,存储数据2 crc算法介绍crc算法是用来校验使用,可以自行查看crc算法的一些介绍,目前利用此算法进行hash也不少,本方法提出crc20算法来进行hash计算,crc的生成多项式有下:名称生成多项式简记式...CRC-4x^4+x+13CRC-12x^12+x^11+x^3+x+1-CRC-16x^16+x^15+x^2+18005CRC-ITU**x^16+x^12+x^5+11021CRC-20x^20+...+x^8+x^6+11EDC6F413 利用CRC20多项式来计算五元组hash利用CRC20多项式来计算五元组(源IP 源端口 目的IP 目的端口 协议)的hash,取得计算得来的值的后20位作为key...// CRC20生成多项式x^20+x^12+x^8+1即:01101 CRC32:04C11DB7Lstatic unsigned int crc_table[256];unsigned int get_sum_poly

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    理解Groth16,一些细节上的说明

    但是,对于不熟悉密码学[3]的,或者说如何使用密码学的思想来解决问题的票友们来说,文章中的一些逻辑上的跨度还是大了一些。...在 Groth16 的流程中,我们首先需要把计算问题拍平成电路的形式。在这一步骤中,我们会将原始的计算问题,解构成电路的形式(Circuit)。这个电路和原始的计算问题是等价。...V 神的原文只描述了这一步骤的目标是把向量的内积计算转化为多项式的形式,以及如何进行拉普拉斯插值求多项式。所以第一次读到这里的时候,我感觉一头雾水。...image.png 当 x 取 1 时,上面的多项式就等于验证第一个门电路是否满足 R1CS 约束;当 x 取 2 时,上面的多项式就等于验证第二个门电路是否满足 R1CS 约束。以此类推。...现在我们已经将实际的值转换成了多项式,根据 x 的取值的不同,来描述不同的 R1CS 约束。

    1.2K10

    使用点对点信道的数据链路层

    本文将系统介绍数据链路层的通信方式、帧封装机制以及如何使用循环冗余检验 (CRC) 实现差错检测,确保无比特差错的传输。...这种填充技术确保无论数据的比特组合如何,都能无误传输,实现透明传输。5 差错检测①误码率 (BER) 在数据传输过程中,比特可能出现错误(如 1 被误判为 0,或 0 被误判为 1)。...计算步骤:对数据 (M) 进行模 2 运算,将其扩展为 (k + n) 位。用事先选定的多项式 (P)(长度为 (n + 1) 位)对扩展后的数据进行除法,得到商 (Q) 和余数 (R)。...以下是常见的生成多项式: CRC-16:(X^{16} + X^{15} + X^2 + 1) CRC-CCITT:(X^{16} + X^{12} + X^5 + 1) CRC-32:(X^{32...} + X^{26} + X^{23} + X^{22} + X^{16} + X^{12} + X^{11} + X^{10} + X^8 + X^7 + X^5 + X^4 + X^2 + X +

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    QR 二维码纠错码(三)

    2^0 = 1 2^1 = 2 2^2 = 4 2^3 = 8 2^4 = 16 2^5 = 32 2^6 = 64 2^7 = 128 QR 二维码说明中指出采用以 100011101 为模的运算(...例如 16 * 32 = 2^4 * 2^5 = 2^(4+5) = 2^9 上面计算过 2^9 = 58,因此 16*32 在 GF(256) 以 285 为模的逐字节算法下等于 58。...第一个多项式是信息多项式,即使用数据码中的码字作为系数得到的多项式,例如如果数据码中的码字转化为整数是 25,218 和35,那么信息多项式将会是 25x^2 + 218x +35。...QR 二维码规范中列出了从 2 个开始到 68 个的生成多项式。尽管 QR 二维码总是需要超过 2 个纠错码/块,本篇只展示如何计算 2 个纠错码的过程,因为其它计算过程也是相似的。...x^15 + 91 * x^14 + ... + 17 * x^0 生成多项式 由于现在采用 1-M 二维码,通过纠错表我们可以查到需要生成 10 个纠错码,通过生成多项式的链接我们可以自动计算出,10

    2.3K20

    数值优化—三种复杂函数数值积分方法实例演示

    自然而然就想该函数如何在不求积分项原函数的情况下计算出积分项的具体值。在抓耳挠腮之际想起了公众号的一篇推文:蒙特卡洛法应用。可以直接求函数指定区间的面积,相当于求积分。...,[0 3]); set(axes1,'FontSize',12,'FontWeight','bold','LineWidth',1.5); 之前同伴在给大家分享蒙特卡洛算法计算面积的时候,过冷书吐槽算法算复杂积分精度不好.../(exp(x)-1).^2; p=polyfit(x,y,5); f= p(1)*x.^5 + p(2)*x.^4 + p(3)*x.^3 + p(4)*x.^2 + p(5)*x + p(6); syms...hold(axes1,'on'); % 使用 plot 的矩阵输入创建多行 plot1 = plot([x' x'],[y' f']); set(plot1(1),'DisplayName','$$\frac...,但是我们绘制多项式和原函数的比较图时,根本无法看出两者差别,也说明了多项式替换可用但是存在较大误差,使用时要进行多方分析,实际若x:0~2 偏差会更加明显。

    2.9K11

    CRC码计算及校验原理的最通俗诠释

    本书将于12月底出版上市,敬请留意!!...前者可以随机选择,也可按国际上通行的标准选择,但最高位和最低位必须均为“1”,如在IBM的SDLC(同步数据链路控制)规程中使用的CRC-16(也就是这个除数一共是17位)生成多项式g(x)= x16...-16生成多项式g(x)=x16 + x15 + x5 +1(对应二进制比特串为:11000000000100001)。...下面是具体的计算过程: (1)首先把生成多项式转换成二进制数,由G(X) = X4 + X3 + 1可以知道(,它一共是5位(总位数等于最高位的幂次加1,即4+1=5),然后根据多项式各项的含义(...下面大家做一个练习,假设CRC生成多项式为G(X) = X5 + X4 +X+1,要发送的二进制序列为100101110,求CRC校验码是多少。

    1.7K20

    串口通信(二) 数据校验

    校验数据:根据奇偶校验的规则,我们统计接收到的8位二进制数据中的1的个数,发现有5个1,因此1的个数是奇数,说明接收到的数据出现了错误。...示例 假设要对以下4个十六进制数进行校验和计算:0x12, 0x34, 0x56, 0x78。 数据总和为0x12 + 0x34 + 0x56 + 0x78 = 0x174。...计算方式 选择一个固定的多项式作为生成多项式,如CRC-16多项式0x8005; 将数据的最高位添加一个0,得到一个比数据位数多1的新数据序列; 将生成多项式左移n位,其中n等于数据序列的长度; 用新数据序列除以生成多项式...示例 假设需要对数据0x12, 0x34, 0x56, 0x78进行CRC校验,生成多项式为CRC-16多项式0x8005: 数据序列为0x12345678; 在数据序列的末尾添加一个0,得到0x123456780...Adler-32校验:是一种比CRC校验速度更快的校验方法,使用两个16位整数进行运算,能够检测多达32位的传输错误。 串口传输补位 在串口通信中,数据通常以字节为单位进行传输。

    1.7K10

    latex()、ploy2sym()、symsum()的妙用

    做具体计算的时候需要把它写入Matlab中,按照阅读习惯你总是会写成这样: y=log(n1/(x1*n1+x2*n2*m21))+x2*((n2*m21)/(x1*n1+x2*n2*m21)-(n1*...m12)/(x2*n2+x2*n1*m12)) ......-(x2^2/2)*((c1*m21^2*log(m21))/(x1+x2*m21)^2-(c2*m12*log(m12)/(x2*n2+x1*n1*m12)^2)) 有人问我你这个输入对不对,有没有错误...左边方框给出了我们拟合结果,对于初入新手而言多项式已经确定,任务完成,过冷水在经常使用工具箱拟合时颇感不便,每次确定好系数后都需要手敲系数重新输入公式真的好麻烦,一点都不自动化,于是自己就总结出了一套小技巧.../(exp(x)-1).^2; p=polyfit(x,y,5); f=poly2sym(p) f = - (7818024459947303*x^5)/2305843009213693952 + (6155067065834809

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    一文讲透CRC校验码-附赠C语言实例

    1、多项式公式 对于CRC标准除数,一般使用多项式(或二项式)公式表示,如下图中除数11011(poly值为0x1b)的二项式为G(X)=X4+X3+X+1,X的指数就代表了该bit位上的数据为1,(最低位为...但实际上,不同的厂家经常采用不同的标准算法,这里列出了一些国际常用的模型表: 名称 多项式 表示法 应用举例 CRC-8 X8+X2+X+1 0X107 CRC-12 X12+X11+X3+X2+X+...others; also known as CRC-16 and CRC-16-ANSI CRC-CCITT X16+X12+X5+1 0X11021 ISO HDLC, ITU X.25, V.34.../V.41/V.42, PPP-FCS CRC-32 X32+X26+X23+X22+X16+X12+X11+X10+X8+X7+X5+X4+X2+X+1 0x104C11DB7 ZIP, RAR, IEEE...对于数据1110 0101(16#E5),以指定除数11011求它的CRC校验码,其过程如下: ? 使用上面计算的校验和和消息数据,可以创建要传输的码字。 ?

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    ​史上解释CRC最清楚的文章

    那么CRC的核心算法就是如何通过一堆“发送数据”,来计算“多余的若干数据”。 CRC采用的策略是用除法求余数,这就是CRC算法的本质。...,参见下图示例 好了,这里我们先给一个例子,我们来计算0x1C的CRC8的校验结果: 如上图,在这个示例中: CRC8的多项式是x8+x2+x+1,对应的除数就是二进制100000111 被除数是0x1C...我们再把上面CRC8的例子分解开来看,把CRC校验码如何计算的细节讲清楚: 第一步,我们列出除数,被除数。 第二步,CRC8的输入数据反转为False,所以0x1C仍然是:00011100。...CRC16-modbus,多项式:x16+x15+x2+1,输入数据反转,输出数据反转,初始值0xFFFF,输出异或值0x0000。 0x1C的CRC16-modbus校验码为0x89EB。...CRC5-usb,多项式:x5+x2+1,输入数据反转,输出数据反转,初始值0x1F,输出异或值0x1F。 0x1C的CRC5-usb校验码为0x0D。

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    4.算法类(1) --Matlab多项式曲线拟合预测新冠病毒感染人数

    选择了2020/1/18到2/3日的数据 x1 = [1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16]; % 累计天数 x2 = [1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15...对多项式进行曲线拟合可以使用polyfit函数,该函数能够很好地进行曲线拟合,用法MATLAB程序代码为: p =polyfit(x,y,n) 其中,x为横坐标,在本文中,为自2020-01-18开始的天数...拟合代码实现如下(使用polyval函数预测每日感染人数): order = 4; p1 =polyfit(x1, y1, order); % 累计 四次函数 p2 =polyfit(x2,...'*') hold on; plot(add, y2, 'o') grid on; ---- 4、数据分析与预测 通过将1月18日统计数据开始后的天数代入函数,使用polyval函数计算每日的感染人数...代码全文: clc clear close all x1 = [1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16]; % 累计天数 x2 = [1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15

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