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    「R」第一个Shiny应用(一) hello world

    Shiny 是一个开源的 R 包,它为使用 R 构建 Web 应用提供了一个优雅有力的 Web 框架。Shiny 帮助你在不需要前端知识的条件下将数据分析转变为可交互的 Web 应用。...使用下面命令进行安装: install.packages("shiny") 然后将包载入当前 R 会话: library(shiny) Hello world 示例 在几种创建 Shiny 应用的方式中...如何运行 如果使用 RStudio: 点击文档工具栏的 Run App 按钮。 使用 Cmd/Ctrl + Shift + Enter 快捷键。...如果没有使用 Rstudio: 使用 source() 运行 app.R 代码脚本。 将含 app.R 的目录传入 shiny::runApp() 。...停止 运行后 R 会话会处于忙碌状态,需要用以下方式停止: RStudio 中点击工具栏中的停止图标。 R 控制台中键入 Ctrl + C。 关闭 Shiny 应用窗口。

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    R语言从入门到精通:Day1

    R具有高度可移植性,可在多种操作系统下运行,如Windows、MacOS、多种Linux和UNIX等。换句话说,你在Windows里面写的代码,拷贝到Mac电脑中,一模一样运行。...【科研猫·绘图】缤纷版·韦恩图(带R代码分享); 【科研猫·绘图】优雅版·小提琴图(带R代码分享); 【科研猫·绘图】看·箱线图·如何美丽动人(代码分享)。...那么,RStudio又是什么呢?它是R代码的一个编辑器,而且是一款非常强大的编辑器,其官方网址:https://www.rstudio.com/。编辑器是个什么东西呢?...RStudio是一款专门针对R语言而生的IDE,R自带的环境操作起来不是方便,而Rstudio很好地解决了这个问题,除了最基础的语法高亮、自动补全、查错等功能,而且它还具有代码调试、可视化等其他功能,支持纯...R脚本、Rmarkdown (脚本文档混排)、Bookdown (脚本文档混排成书)、Shiny (交互式网络应用)等,你甚至可以用它来编写一个R包。

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    Java 在 Linux 上的守护进程:如何优雅地终止和管理自启动程序??

    在 Linux 环境下,kill 命令是最常见的用于终止进程的方式,但如果不正确地使用,可能会导致进程意外中断或数据丢失。守护进程与 Java 程序什么是守护进程?...在 Java 中,可以通过两种方式将程序作为守护进程运行:使用第三方工具(如 nohup 或 systemd)启动 Java 程序。编写 Java 代码,手动控制守护进程的生命周期。...通过 kill 命令优雅地终止守护进程为了安全地终止一个守护进程,可以使用 kill 命令发送不同的信号给进程。...这种方式确保了即使通过 kill -SIGTERM 终止进程,Java 程序也能够优雅退出。...希望能够优雅地关闭守护进程,避免数据丢失或任务中断。不适用场景:非长期运行的任务,或无需后台运行的程序。不需要处理复杂关闭流程的应用场景,如简单的短期脚本任务。

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    R 语言绘制热图的 10 种方法

    R 语言下载地址为:https://cran.r-project.org/,通常我们使用页面更加优雅的 RStudio,下载地址为:https://www.rstudio.com/。...R 语言是开源的,世界各地的开发者们不断地添砖加瓦,分享自己的智慧,截至到目前,R 里面可用的包达到 11987 个,这几乎让 R 语言强大到不可思议。...(shiny 是 RStudio 开发的一款用于构建交互式网页 app 的 R 包,shiny 的构建有点复杂,这里暂且略过,因此只讲解 d3heatmap) 按照惯例,我们还是试一试下面的代码: 你会得到以下这幅图...图 8. d3heatmap 绘制的交互式热图 六、heatmaply 包里面的 heatmaply 函数 heatmaply 也是交互式的。尝试以下代码: 图 9....首先介绍了 4 种绘制非交互式热图的包,其次介绍了 4 种绘制交互式热图的包,最后介绍了 lattice 和 ggplot2 绘图系统中绘制热图的方法。

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    Java - 探究Java优雅退出的两种机制

    Java优雅停机_ ShutdownHook 机制 Java的优雅停机通常通过注册JDK的ShutdownHook来实现,当系统接收到退出指令时,首先标记系统处于退出状态,不再接收新的消息,然后将积压的消息处理完...Java优雅停机_ 信号量机制 除了注册ShutdownHook,还可以通过监听信号量并注册SignalHandler 的方式实现优雅退出。...使用步骤 通过监听信号量并注册SignalHandler的方式实现优雅退出的步骤如下: 创建SignalHandler对象: 首先,需要创建一个实现了sun.misc.SignalHandler接口的信号处理器对象...Code 演示如何通过监听信号量并注册SignalHandler实现优雅退出 。...对于采用注册SignalHandler实现优雅退出的程序,在handle接口中一定要避免阻塞操作,否则它会导致已经注册的ShutdownHook无法执行,系统也无法退出 。

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    (数据科学学习手札66)在ubuntu服务器上部署shiny

    的流程进行详细的说明; 二、环境配置 2.1 服务器配置说明   我使用的服务器是阿里云ECS,ubuntu 16.04,2核8G内存,40G系统盘,如果条件允许的话,建议内存不要选择过小,否则在编译安装一些R包如raster...官网说明页面中的deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu xenial-cran35添加进文件中,按esc后,再按shift+:,输入wq完成写入并退出过程...-amd64.deb   同样的方式,我们用pscp上传Rstudio Server的安装包到刚才的目录下执行下列语句: sudo gdebi rstudio-server-1.2.1335-amd64...可以看到熟悉的界面,就是个在线版的Rstudio,可以通过它来方便地修改服务器上的R代码。...如图所示位置添加上两行语句用于设置shiny应用出错时显示具体错误信息,保存退出,重新访问刚才的页面: ?

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    2023.4生信马拉松day1-R与Rstudio

    R语言相关课程安排1.R与Rstudio2.数据类型3.数据结构4.函数和R包5.文件读写6.绘图7.应用专题day1课程——R与Rstudio图片1.R和Rstudio的介绍-R语言:用函数处理数据;...变量列表);(4)文件/图片/帮助/包的集成展示-命令提示符 >有命令提示符的时候才能“说话”,才能输入;2.创建 Rproject-R project用于管理不同的项目,双击文件名.Rproj后可以打开Rstudio...3.新建脚本file - new file - R script-脚本的保存和关闭脚本的关闭点击脚本名旁边的小xx;默认关闭后保存到文件名.Rproj所在目录(工作目录);图片4.与R的交互方式-(1)...通过控制台窗口交互可以直接在控制台键入简单命令,但session关闭的时候会全部清空-(2)在脚本编辑器中交互在脚本编辑器中编辑好之后,所有命令都会记录下来,可以逐行运行或者选中运行;加 # 号进行注释后...还要看运行结果是否符合逻辑符合预期-(5)太长时间卡住不动:点击红色圈圈中止运行或者重启session-(6)出现+号:说明代码没输完整,还需要继续输入命令补全,或者按ESC键退出,然后重新输入命令-(

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    radian | 一款21世纪的R语言编辑器

    (它潜在的意思是Rstudio不是21世纪的编辑器啦?不想引起对立,但是我要说,radian在终端下使用真香!) ?...然后运行下面命令: 1 出现下面的日志说明安装成功: 3. radian初体验 在终端下,输入radian,然后进入交互界面: ?...4. radian的特点 特点:6 跨平台,运行在Windows、macOS和Linux上 shell模式:点击;进入shell方式,进入R编程界面 这个功能,太强了,不用退出,...推荐设置radian 终端中,快速输入: 然后将下面代码copy进去,保存,退出。 <- 快捷键:Esc + - %>% 快捷键:Esc + m 这两个符号,设置快捷键。...(比如运行R CMD INSTALL还是少不了的) 加入: alias r="radian" 然后保存,退出。 测试,在终端中键入:r,就可以进入radian了: ?

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    R医学科研:R语言简介

    1.2 RStudio RStudio 是目前最受欢迎的 R 语言集成开发环境之一。可从RStudio 主页免费下载其 Desktop 版本。...df中 1.3.1.4 简单练习 初学者可以通过练习《An Introduction to R》手册中附录 A 的例子感受 R 语言的工作方式,从而消除陌生感: 启动 RStudio; 在控制台输入help.start...1.3.2 脚本 一些简单的,非重复的任务,可以直接在控制台下执行,比如通过install.package()安装 R 包。...退出 R 时,如果选择保存工作空间,R 将会在工作空间所有文件夹中创建两个新文件。所有运行过的命令都被保存到一个名为“.Rhistory”的文件中,所有对象被保存到名为“.Rdata”的文件中。...1.3.3.2 RStudio 项目 数据分析的最佳实践是为每一个任务都创建一个 RStudio 项目,这有明显的好处: 将所有任务相关的文件放在一起,如输入数据、R 脚本、分析结果等; 项目中可以使用相对路径

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    R语言入门之工作空间与R包

    R语言是一个交互式界面,上翻和下翻键可以用来查看历史指令。...这里我建议大家使用RStudio,因为RStudio提供非常强大的R语言高度可视化操作界面,你可以在RStudio里写R代码,也可以写Python代码,同时可以使用Rmarkdown来写自己的文档。...保存你的历史指令 savehistory(file="myfile") # 文件默认会以".Rhistory"结尾 # 调用你的历史指令 loadhistory(file="myfile") # 同样地,...object list,file="myfile.RData") # 将工作空间加载到当前进程中 # 如果你不指定路径,那默认保存在当前的工作目录 load("myfile.RData") q() # 退出...但是这样的路径在R中是错误的,因为R将“\”作为转义符,正确的路径应该是c:\\my documents\\myfile.txt或c:/mydocuments/myfile.txt,这里我推荐使用第二种表达方式

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    c++反射深入浅出 - 基于反射的Lua中间层实现

    本篇中, 我们将以lura库为例(笔者之前项目使用的Lua的 bridge实现), 介绍如何以C++反射作为基础设施, 以更简洁的方式来实现一版lua的bridge....相关的函数调用方式差异非常大, 无法有效的无性能损耗的情况下进行统一....小建议: 大家写lua/c++交互代码的时候, 可以如示例中一样, 在注释中给出每行api调用后stack发生的变化, 这样能够清晰的知道当前栈的情况 , 整个交互代码的实现会变得更简单, 也有利于其他小伙伴阅读理解相关的代码...所以lura的实现选用了更简洁和易于维护的方式....当然, 这也是得益于c++反射底层打底, bridge的重点落在了了机制串接和lua/c++交互上, 对应代码的理解复杂度直线下降, 定制性和可维护性也高了非常多.

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    如何在Ubuntu 18.04上使用devtools安装R包

    准备 要继续学习本教程,您需要一台Ubuntu 18.04服务器: 一台已经设置好可以使用sudo命令的非root账号的Ubuntu服务器,并且已开启防火墙。...步骤1 - 为devtools安装系统依赖项 我们将从交互式shell安装devtools,但在此之前,我们需要安装这些系统依赖项: sudo apt install build-essential libcurl4...GitHub包由author(rstudio)及其名称(shiny)定义,您可以从主项目页面的GitHub URL中找到它:https://github.com/rstudio/shiny。...我们首先需要执行几个系统级任务,因此我们将使用以下命令或使用CTRL-D退出监视器: q() 其中任何一个都会提示您保存工作区图像,R的工作环境包括用户定义的对象。...这不是我们的目的,所以你可以安全地输入n。 由于我们将使用Web浏览器查看Shiny可以执行的示例,因此我们将确保允许Web流量。

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    C++反射:全方位解读Lura库的前世今生!

    导语 | 本文我们将以lura库为例,介绍如何以C++反射作为基础设施,以更简洁的方式来实现一版lua的bridge,主要围绕lura库的前世今生来逐步展开。...tolua++的方式相对简单直接,通过自动生成大量的中间代码来将c++函数转换为lua c function,生成的代码量虽然比较多,但对比用模板的方式,因为不需要考虑模板的包装,小的功能扩展会简单直白不少...小建议: 大家写lua/c++交互代码的时候,可以如示例中一样,在注释中给出每行api调用后stack发生的变化,这样能够清晰的知道当前栈的情况,整个交互代码的实现会变得更简单,也有利于其他小伙伴阅读理解相关的代码...所以lura的实现选用了更简洁和易于维护的方式。...当然,这也是得益于c++反射底层打底,bridge的重点落在了了机制串接和lua/c++交互上,对应代码的理解复杂度直线下降,定制性和可维护性也高了非常多。

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    转录组RNA-Seq使用docker+bioconda搭建分析环境

    基于docker构建环境 笔者使用docker的方式属于网上不推荐的方式,类似于虚拟机镜像。原因就是懒得去编写dockerfile,感觉太麻烦。...get_docker.sh --mirror Aliyun 极速安装docker-compose #从以下网址下载docker-compose,将docker-compose文件放在path变量目录下如:...如果可以连接上则第一步构建完成,我们commit创建自己的镜像,打开终端 docker commit first ubuntu20.04-ssh:1.00 第二阶段:安装bioconda构建基础生信镜像 退出并删除之前运行的容器...#退出之前的容器 root@80cb4d36be59# exit #删除该容器 docker rm first 编写docker-compose.yml文件,并使用docker-compose启动容器...docker-compose.yml文件目录下运行docker-compose up启动容器 并查看输出日志,看是否存在错误 使用ssh登录镜像,并安装bioconda #这里使用127.0.0.1地址登录

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