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如何随机选择vcf文件中的变异位点

现在做群体基因组的论文大部分会公开自己论文分析中的变异检测结果,通常是vcf文件,我们自己可以把vcf文件下载下来试着复现论文中的内容,有时候vcf文件过大,每一步处理起来都会花费比较长的时间。...有时候就想把这个vcf文件缩小,随机选择一部分。 查了一下,没有找到现成的工具或者脚本。尝试自己写脚本,没有思路。...这个函数随机生成一个小于1的数,如果我们想要随机取vcf文件中的10%,就设置random.random()随机数种子 random.seed(123)。...运行 python randomSelectRowsFromVCF.py tiny.vcf tiny.out.vcf 1 123 四个位置参数分别是 输入文件 输出文件 随机选取的比例(0-100)

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    Java 如何从一个 List 中随机获得元素

    概述 从一个 List 中随机获得一个元素是有关 List 的一个基本操作,但是这个操作又没有非常明显的实现。 本页面主要向你展示如何有效的从 List 中获得一个随机的元素和可以使用的一些方法。...选择一个随机的元素 为了从一个 List 中随机获得一个元素,你可以随机从 List 中获得一个索引的下标。 然后你可以使用这个随机的下标使用方法 List.get() 来随机获得元素。...在多线程环境中选择随机下标 在多线程环境中,如何使用单一的 Random 类实例,将会导致可能在这个实例中每一线程都访问到相同的结果。...有时候,你可能希望从 List 中选择一些元素,但是这些选择的元素是可以重复的。...如果你希望你选择的元素是不重复的话,你可以在选择后将选择后的元素从 List 中移除。

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    Java 如何从一个 List 中随机获得元素

    概述 从一个 List 中随机获得一个元素是有关 List 的一个基本操作,但是这个操作又没有非常明显的实现。 本页面主要向你展示如何有效的从 List 中获得一个随机的元素和可以使用的一些方法。...选择一个随机的元素 为了从一个 List 中随机获得一个元素,你可以随机从 List 中获得一个索引的下标。 然后你可以使用这个随机的下标使用方法 List.get() 来随机获得元素。...在多线程环境中选择随机下标 在多线程环境中,如何使用单一的 Random 类实例,将会导致可能在这个实例中每一线程都访问到相同的结果。...有时候,你可能希望从 List 中选择一些元素,但是这些选择的元素是可以重复的。...如果你希望你选择的元素是不重复的话,你可以在选择后将选择后的元素从 List 中移除。

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    教你如何快速从 Oracle 官方文档中获取需要的知识

    https://docs.oracle.com/en/database/oracle/oracle-database/index.html 如图,以上从 7.3.4 到 20c 的官方文档均可在线查看...:https://docs.oracle.com/cd/E11882_01/server.112/e40402/toc.htm 这里以 11g R2 官方文档为例: 今天来说说怎么快速的从官方文档中得到自己需要的知识...SQL language Reference ,这个文档中包括 Oracle数据库中SQL 语句的语法( plsql不包含在内)。比如说create table语法、函数、表达式都在这里有描述。...有监听相关的疑问可以在这个文档中找到答案。 Backup and Recovery User’s Guide ,文档中描述了 rman 的各种用法。...提供一个比较简单的例子,可以在 java 存储过程中输入下面的代码: { element = list[i]; #sql { INSERT INTO DIR_LIST

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    如何优雅的从Array中删除一个元素

    从JavaScript数组中删除元素是开发人员经常遇到的常见编程范例。与许多JavaScript一样,这并不像它应该的那么简单。...实际上有几种方法可以从一个数组中删除一个或多个元素 - 在这个过程中不会撕掉你的头发 - 所以让我们一个接一个地浏览它们。...使用splice删除一个元素() 这个方法是在卸下,更换,和/或添加数组中的元素的通用方式。它与其他语言中的splice()函数类似。基本上,你采取一个数组并有选择地删除它的一部分(又名“拼接”)。...要从数组中的特定索引中删除一个元素: ["bar", "baz", "foo", "qux"] list.splice(2, 1)// Starting at index position 2, remove...结论 归结起来,在JavaScript中从数组中删除元素非常简单。命名约定起初可能有点奇怪,但是一旦你做了几次,你就可以不经过深思熟虑(或者第二次看这篇文章)。

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    在Scrapy中如何利用CSS选择器从网页中采集目标数据——详细教程(上篇)

    点击上方“Python爬虫与数据挖掘”,进行关注 /前言/ 前几天给大家分享了Xpath语法的简易使用教程,没来得及上车的小伙伴可以戳这篇文章:在Scrapy中如何利用Xpath选择器从网页中采集目标数据...——详细教程(上篇)、在Scrapy中如何利用Xpath选择器从网页中采集目标数据——详细教程(下篇)。.../CSS基础/ CSS选择器和Xpath选择器的功能是一致的,都是帮助我们去定位网页结构中的某一个具体的元素,但是在语法表达上有区别。...,反之亦成立,当然也可以同时在一个爬虫文件将两个或者多个选择器进行交叉使用。...获取到整个列表之后,利用join函数将数组中的元素以逗号连接生成一个新的字符串叫tags,然后写入Scrapy爬虫文件中去。

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    在Scrapy中如何利用CSS选择器从网页中采集目标数据——详细教程(下篇)

    点击上方“Python爬虫与数据挖掘”,进行关注 /前言/ 前几天给大家分享了Xpath语法的简易使用教程,没来得及上车的小伙伴可以戳这篇文章:在Scrapy中如何利用Xpath选择器从网页中采集目标数据...——详细教程(上篇)、在Scrapy中如何利用Xpath选择器从网页中采集目标数据——详细教程(下篇)、在Scrapy中如何利用CSS选择器从网页中采集目标数据——详细教程(上篇)。...之前还给大家分享了在Scrapy中如何利用CSS选择器从网页中采集目标数据——详细教程(上篇),没来得及上车的小伙伴可以戳进去看看,今天继续上篇的内容往下进行。...可以看到收藏数是存在一个字符串中,所以当提取到数据之后,还需要利用正则表达式对其进一步的提取。 10、根据网页结构,我们写出CSS表达式,如下图所示。 ?...CSS选择器从网页中采集目标数据——详细教程(上篇) 在Scrapy中如何利用Xpath选择器从网页中采集目标数据——详细教程(下篇) 在Scrapy中如何利用Xpath选择器从网页中采集目标数据——详细教程

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    如何从 Java 的 List 中删除第一个元素

    概述 在这个实例中,我们将会演示如何删除在 Java 中定义的 List 的第 1 个元素。...linkedList.add("cow"); linkedList.add("goat"); } ArrayList 根据我们创建的 List,我们来演示在 ArrayList 中删除第一个元素...assertThat(list, not(contains("cat"))); } 通过上面的代码我们可以了解到,我们使用了 remove(index) 这个方法来删除我们需要处理的 List 中的第一个元素...LinkedList 却是使用的是指针(points),这个指针的意思就是每一个元素使用指针来指向下一个元素,同时还使用一个指针来指向前一个元素。...结论 在本文中,我们对如何对 List 中的第一个元素进行删除进行了说明和讨论。 并且针对 List 接口的 2 个实现来分别了解了不同的时间复杂度。

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    如何使用React和Firebase搭建一个实时聊天应用

    1.创建一个React项目打开终端,运行以下命令来创建一个名为react-chat的React项目:npx create-react-app react-chat这个命令会在当前目录下生成一个名为src...然后,在终端中运行以下命令来安装这两个依赖项:npm install firebase react-firebase-hooks3.使用Firebase Authentication在src文件夹下打开...firestore模块,并创建一个firestore对象:import { firestore } from "...../firebase";const firestore = firestore();然后,在src文件夹下打开Chatbox.js文件,在其中导入firestore模块,并使用它来获取聊天室消息数据:import...您可以参考以下资料来了解更多的细节和教程:React官方文档Firebase官方文档react-firebase-hooks库socket.io官方文档我正在参与2023腾讯技术创作特训营第四期有奖征文

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    知识分享之Golang——Bleve中如何定义一个自定义文档映射对象

    知识分享之Golang——Bleve中如何定义一个自定义文档映射对象 背景 知识分享之Golang篇是我在日常使用Golang时学习到的各种各样的知识的记录,将其整理出来以文章的形式分享给大家,来进行共同学习...在bleve中可以使用Field特性进行实现,下面我们先进行一个简单的实现 // 获取一个自定义文档映射对象,这样便于我们对于其增加一些特定的field func getDocumentMapping(...) *mapping.DocumentMapping { // 首先我们创建一个默认文档集合 document := bleve.NewDocumentMapping() //...("title", title) return document } 通过这段代码我们就可以获取到一个DocumentMapping 对象,这个文档集合中具有authorName、createTime...至此我们就定义好了一个自定义的文档集合,在我们bleve.New时可以将该对象放入进去即可在索引存储时使用了。

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    【面经】面试官:如何以最高的效率从MySQL中随机查询一条记录?

    好了,说了这么多,今天给大家分享一篇有关MySQL的经典面试题:如何以最高的效率从MySQL中随机查询一条记录? 面试题目 如何从MySQL一个数据表中查询一条随机的记录,同时要保证效率最高。...从这个题目来看,其实包含了两个要求,第一个要求就是:从MySQL数据表中查询一条随机的记录。第二个要求就是要保证效率最高。 接下来,我们就来尝试使用各种方式来从MySQL数据表中查询数据。...方法二 看来对于大数据量的随机数据抽取,性能的症结出在ORDER BY上,那么如何避免?方法二提供了一个方案。...然后执行: SELECT * FROM foo LIMIT [0到num_rows之间的一个随机数],1 上面这个随机数的获得可以通过后台程序来完成。此方法的前提是表的ID是连续的或者自增长的。...一个15万余条的库,查询5条数据,居然要8秒以上 搜索Google,网上基本上都是查询max(id) * rand()来随机获取数据。

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    骑上我心爱的小摩托,再挂上AI摄像头,去认识一下全城的垃圾!

    大数据文摘出品 来源:medium 编译:曹培信 垃圾管理是现代城市一个非常有挑战性的任务,每个地区都有其独特的垃圾产生模式,但无论产生垃圾的种类和数量如何变化,优化垃圾的收集方式是降低成本、保持城市清洁的重要手段...对于相机,我选择了最强大的一个,AGX Xavier系列,考虑到我们必须运行垃圾检测和人模糊,这是一个比较稳妥的选择。 ?...垃圾的GPS坐标通过简单的gpsd接口从usb模块读取,将数据存储在Google Firestore实时数据库中,这样本地的Google firebase SDK就被用于客户端应用程序开发。...我们选择Ionic+Angular进行前端开发和谷歌的Firestore坐标实时数据库。...Google Firebase则可以让我们将每个GPS点左边作为一个嵌套的集合/文档存储。

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    Firestore 多数据库普遍可用:一个项目,多个数据库,轻松管理数据和微服务

    此外,Firestore 的 云监控指标和统计信息 现在可以在数据库级别进行聚合。...现在可以在单个项目中管理多个 Firestore 数据库,每个文档数据库都具有隔离性,确保数据的分离和性能:谷歌云声称一个数据库的流量负载不会对项目中的其他数据库性能产生不利影响。...PrivateGPT 的全栈开发者 Francisco Durdin Garcia 曾在 2018 年问道: 在 Firebase 的同一个控制台中是否可以为 Firestore 数据库创建多个实例(每个项目一个...我看到 Firebase 实时数据库可以这样做,但我没有看到 Firestore 可以这样做的可能性。...Liu 和 Nguyen 补充道: 在创建过程中需要谨慎选择数据库资源名和位置,因为这些属性在创建后无法更改。不过你可以删除现有数据库,随后使用相同的资源名在不同的位置创建新数据库。

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    我们弃用 Firebase 了

    的确,纯从性能上讲,在 AWS/Azure/ GCP 上构建的定制化原生服务包优于 Firebase 套件。但是,当我们考虑到开发时间和维护成本时,Firebase 通常是一个合乎逻辑的选择。...Firestore 的文档 / 集合架构:它迫使人们仔细考虑数据建模。它还反映了一个直观的导航方案。 Firestore 中的关系数据也是如此。...云 Firestore 安全规则写起来很有趣,在考虑客户端 - 服务器安全方面,这是一个可靠的模型。 开箱即用的身份验证很不错。(不过,在我们看来,其内置的 Firebase 邮件验证体验很糟糕)。...直接从 Google Cloud Console 下载。 GCP 似乎正在蚕食 Firebase 开发环境。 从运营的角度来看,这是合理的。...根据 Cloud Function 部署文档:Firebase 错误只能在 Google Cloud 上解决。

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