首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

基于Polya-Gamma方案的贝叶斯logistic回归CRAN软件包

是一个用于实现基于Polya-Gamma分布的贝叶斯logistic回归模型的软件包。该软件包提供了一种灵活且高效的方法来进行贝叶斯推断,特别适用于处理二分类问题。

Polya-Gamma分布是一种特殊的概率分布,它在贝叶斯统计中被广泛应用于处理潜在变量的积分。基于Polya-Gamma方案的贝叶斯logistic回归CRAN软件包利用了这种分布的特性,通过对潜在变量的积分进行近似,从而实现了高效的贝叶斯推断。

该软件包的优势包括:

  1. 灵活性:基于Polya-Gamma方案的贝叶斯logistic回归CRAN软件包提供了灵活的建模框架,可以适应不同的数据和问题类型。用户可以根据实际需求进行模型的定制和调整。
  2. 高效性:该软件包利用了Polya-Gamma分布的特性,通过近似方法实现了高效的贝叶斯推断。这使得在处理大规模数据和复杂模型时,能够更快地进行计算和分析。
  3. 可扩展性:基于Polya-Gamma方案的贝叶斯logistic回归CRAN软件包可以与其他工具和库进行集成,扩展其功能和应用范围。用户可以根据需要添加额外的功能和算法。

该软件包适用于各种应用场景,特别是在二分类问题中的贝叶斯推断和预测中。例如,在医学研究中,可以使用该软件包来建立和分析患者的疾病风险模型。在金融领域,可以利用该软件包进行风险评估和预测。在市场营销中,可以使用该软件包来进行用户行为分析和个性化推荐。

腾讯云提供了一系列与云计算相关的产品和服务,其中包括云服务器、云数据库、云存储等。这些产品可以为用户提供可靠的基础设施和强大的计算能力,以支持他们在云计算领域的应用和开发需求。具体关于腾讯云产品的介绍和详细信息,您可以访问腾讯云官方网站:https://cloud.tencent.com/

页面内容是否对你有帮助?
有帮助
没帮助

相关·内容

机器学习(14)——朴素算法思想:基于概率预测公式朴素算法示例:文本数据分类

朴素很直观,计算量也不大,在很多领域有广泛应用, 算法思想:基于概率预测 逻辑回归通过拟合曲线(或者学习超平面)实现分类,决策树通过寻找最佳划分特征进而学习样本路径实现分类,支持向量机通过寻找分类超平面进而最大化类别间隔实现分类...当然这个例子在如今影视剧中少多了,好人也有发出坏笑时候. 公式 再给出公式之前先介绍一下学派。 学派很古老,但是从诞生到一百年前一直不是主流。主流是频率学派。...频率学派权威皮尔逊和费歇尔都对学派不屑一顾,但是学派硬是凭借在现代特定领域出色应用表现为自己赢得了半壁江山。 学派思想可以概括为先验概率+数据=后验概率。...image.png 朴素算法 朴素(Naive Bayes, NB)是基于“特征之间是独立”这一朴素假设,应 用贝叶斯定理监督学习算法 对应给定样本X特征向量x1,x2,......image.png 朴素按照数据先验概率不同可以分为高斯朴素,伯努利朴素,多项式朴素

13.7K62

入门 | 线性回归方法解释和优点

选自TowardsDataScience 作者:William Koehrsen 机器之心编译 参与:Geek AI、刘晓坤 本文对比了频率线性回归线性回归两种方法,并对后者进行了详细介绍,分析了线性回归优点和直观特征...本文是我介绍线性回归一次尝试。我会对线性回归频率派方法做一个简要回顾,介绍解释(Bayesian interpretation),并查看将其应用于简单数据集结果。...然而,如果有一个很小数据集,我们可能希望将估计表示为一个可能值分布。这就是估计起作用地方。 线性回归学派观点来看,我们使用概率分布而非点估计来构建线性回归。...如果事先没有没有任何预估,我们可以为参数使用无信息先验,比如一个正态分布。 后验分布:使用线性回归结果是一个基于训练数据和先验概率模型参数分布。...线性回归反映了学派处理问题框架:我们先构造一个初始估计,并且随着收集到更多数据,不断改进估计。

1.1K80
  • 榕树集--基于优化抗体设计

    前言: 今天介绍一篇发表于23年文章,Khan等人开发了名为AntBO工具,这是一种利用组合优化来进行抗体设计方法。...优化(Bayesian optimization , BO)提供了强大机制来解决前述问题。BO使用高斯过程(GPs)作为黑盒替代模型,将对领域先验经验纳入到序列空间搜索中。...当数据点具有相同方差时,BO选择具有最高均值估计数据点,从而利用解决方案。BO这种属性使作者能够开发一种高效进行抗体设计方案。...Fig 4: AntBO可以设计出在可发展性得分方面表现多样抗体 局限性: 值得注意是,Khan等人开发AntBO是第一个展示将组合优化用于抗体设计问题框架。...采用基于预设氨基酸间距和90°角3D格点表示,这在许多情况下对抗体与感兴趣抗原结合配置限制较大。

    14210

    基于算法文本分类算法

    一般X和C关系是不确定,可以将X和C看作是随机变量,P(C|X)称为C后验概率,与之相对,P(C)称为C先验概率。...根据公式,后验概率P(C|X)=P(X|C)P(C)/P(X),但在比较不同C值后验概率时,分母P(X)总是常数,忽略掉,后验概率P(C|X)=P(X|C)P(C),先验概率P(C)可以通过计算训练集中属于每一个类训练样本所占比例...,容易估计,对类条件概率P(X|C)估计,这里我只说朴素贝叶斯分类器方法,因为朴素假设事物属性之间相互条件独立,P(X|C)=∏P(xi|ci)。...二者计算粒度不一样,多项式模型以单词为粒度,伯努利模型以文件为粒度,因此二者先验概率和类条件概率计算方法都不同。...后记:文本分类是作为离散型数据,以前糊涂是把连续型与离散型弄混一块了,朴素用于很多方面,数据就会有连续和离散,连续型时可用正态分布,还可用区间,将数据各属性分成几个区间段进行概率计算,测试时看其属性值在哪个区间就用哪个条件概率

    92140

    MCMCrstan回归模型和标准线性回归模型比较

    p=25453 现在有了对方法概念理解,我们将实际研究使用它回归模型。为了简单起见,我们从回归标准线性模型开始。然后添加对采样分布或先验更改。...我们目标是一个分布,而不是一个点估计。 这个模拟过程被称为马尔科夫链蒙特卡洛,简称MCMC。这个过程具体细节使许多编程语言/方法与众不同。...然而,方法曾经需要很长时间,即使是像这样标准回归,这也许是分析在过去几十年里才流行起来主要原因;我们根本没有机器来有效地做这件事。...bets = extract$beta 除了制作数据列表和产生特定语言模型代码初始设置之外,相对于标准模型,运行回归模型并不一定需要太多时间。...---- 本文摘选《R语言MCMCrstan回归模型和标准线性回归模型比较》。

    99010

    更节能,基于忆阻器机器

    推理可以解决这些问题,但它计算成本很高,而且与神经网络不同,它不会自然地转化为基于忆阻器架构。...比目前使用硬件解决方案更节能。 机器架构是通过编写定律来获得,这种方法使它实现通过分布式内存和随机计算原理变得自然,允许电路仅使用本地内存和最少数据移动来运行。...在此,研究人员提出了一个可以在硬件中完全实现基于忆阻器系统。...图示:机器一般架构。(来源:论文) 为了验证基于忆阻器推理可行性,在混合 CMOS/电阻式随机存取存储器工艺中制作了原型电路。...未来,由这组研究人员创建基于忆阻器机器可以帮助提高 AI 模型能效,同时还可能激发其他类似解决方案开发。它可能对安全关键型应用特别有用,例如用于监控工业设施安全医疗传感器或电路。

    22130

    基于朴素自然语言分类器

    从中看出,军事类文章相对偏少,体育类文章偏多。 ? ? 朴素介绍 贝叶斯定理 贝叶斯定理是关于随机事件 A 和 B 条件概率: ?...按这些术语,贝叶斯定理可表述为: 后验概率 = (相似度 先验概率)/标淮化常量 概率观 一般学院派概率观可以称作频率主义。...然后如果执行次数很多很多,频率会趋向于一个固定值,就是这个事件概率。理论基础是中心极限定理。 概率观与此很不同。主观主义认为,概率就是个人对某个事件发生可能性一个估计。...朴素贝叶斯分类器 分类器基本原理: 对一个多维输入向量x,根据公式,有: ? 条件独立性假设: ?...放到自然语言分类器应用中理解,就是在给定文本类别的条件下,文本中出现概率是相互独立。朴素之所以“朴素”,就是因为条件独立性假设是一个较强假设。于是: ? ?

    1.3K50

    朴素基于概率论分类模型

    ,分为no概率值更大,所以通过朴素分类就将该数据点划分为no。...从上面的例子可以看出,朴素假设样本特征相互独立,而且连续型特征分布符合正态分布,这样假设前提是比较理想化,所以称之为"朴素",因为实际数据并不一定会满足这样要求。...在scikit-learn中,根据数据先验分布,提供了以下多种朴素方法 1. GaussianNB, 基于高斯分布朴素 2....MultinomialNB, 基于多项式分布朴素 3. BernoulliNB,基于二项分布朴素 4....CategoricalNB, 基于离散型朴素 以GaussianNB为例,用法如下 >>> from sklearn.datasets import load_iris >>> from sklearn.model_selection

    81810

    使用python手写Metropolis-Hastings算法线性回归

    在学习计算解马尔可夫链蒙特卡洛(MCMC)模拟时,最简单方法是使用PyMC3,构建模型,调用Metropolis优化器。...线性回归包含了几十个概念和定义,这使得我们整个研究成为一种折磨,并且真正发生事情。...算法介绍 假设θ=[a,b,σ]是算法上面的参数向量,θ '是一组新参数建议,MH比较参数(θ '和θ)两个竞争假设之间因子(似然和先验乘积),并通过条件建议分布倒数缩放该因子。...这里一种解决方案是通过只保留一小部分参数来细化历史记录(例如,只保留1 / 10已接受提议,并丢弃其余)。 传统线性回归相比如何呢?...标准误差也可以这样说,这样也进一步证明了我们对 MCMC 实现是可行。 请注意,这不是最好解决方案,而只是一个解决方案。因为确实存在并推荐更好先验和建议分布选择。 迭代可视化?

    64510

    R语言中block Gibbs吉布采样多元线性回归

    p=11617 ---- 在这篇文章中,我将对多元线性回归使用blockGibbs采样,得出blockGibbs采样所需条件后验分布。然后,对采样器进行编码,并使用模拟数据对其进行测试。...模型 假设我们有一个样本量主题。多元回归假设该向量是从多元正态分布中提取 ,通过使用恒等矩阵,我们假设独立观察结果。 ? 到目前为止,这与多元正态回归相同。...模型是通过指定为一个先验分布得到 。在此示例中,我将在以下情况下使用 先验值 ? block Gibbs 在对采样器进行编码之前,我们需要导出Gibbs采样器 每个参数后验条件分布。 ?...似乎能够获得这些参数合理后验估计。为了确保估计器正常工作,我对1,000个模拟数据集重复了此过程。 这将产生1,000组后验均值和1,000组95%置信区间。...这个想法将线性回归推广到GLM。 在本文中概述线性情况下,可以更灵活地对协方差矩阵建模。相反,假设协方差矩阵是对角线且具有单个公共方差。这是多元线性回归同方差假设。

    77920

    回归、分类与聚类:三大方向剖解机器学习算法优缺点(附Python和R实现)

    2.1 Logistic 回归(正则化) Logistic 回归是与线性回归相对应一种分类方法,且该算法基本概念由线性回归推导而出。...优点:输出有很好概率解释,并且算法也能正则化而避免过拟合。Logistic 模型很容易使用随机梯度下降和新数据更新模型权重。 缺点:Logistic 回归在多条或非线性决策边界时性能比较差。.../web/packages/kernlab/index.html 2.5 朴素 朴素(NB)是一种基于贝叶斯定理和特征条件独立假设分类方法。...本质上朴素模型就是一个概率表,其通过训练数据更新这张表中概率。为了预测一个新观察值,朴素算法就是根据样本特征值在概率表中寻找最大概率那个类别。...优点:即使条件独立性假设很难成立,但朴素算法在实践中表现出乎意料地好。该算法很容易实现并能随数据集更新而扩展。 缺点:因为朴素算法太简单了,所以其也经常被以上列出分类算法所替代。

    2.9K50

    基于偏差校正似然参数估计

    也许我们很幸运,并且对K₀大小有一些先验知识;也许我们对赢得彩票最有可能赔率有一些先入为主观念。包含此类先入之见标准方法是采用范式,并通过先验概率“校正”可能性: ?...选择超参数λ,使其最符合我们对K先验,而后验分布则是在观察到证据后对我们对参数知识进行建模。范式从惯常论转向论:我们已经从想象K作为具有未知但确定性值参数转移到K作为随机变量。...由于我们缺乏对其“真值”了解,所以我们选择“随机”(使用引号是因为对于理论来说,这个实体已经放弃了对本体论承诺)。...但是,在本文中,我们不会采用绝对频率主义或主义,而是提出一种实用组合。 尽管如此,点估计还是有意义,因为我们拥有最高可信度,最大后验估计器(MAP): ?...总结 对于这个简单示例,我们已经表明,通过使用先验信息来校正参数估计中似然性偏差,可能意味着对小样本量估计准确性和鲁棒性进行了改进。

    40610

    基于朴素文本分类算法「建议收藏」

    大家好,又见面了,我是你们朋友全栈君。 基于朴素文本分类算法 摘要:常用文本分类方法有支持向量机、K-近邻算法和朴素。其中朴素具有容易实现,运行速度快特点,被广泛使用。...关键字:朴素;文本分类 第1章 原理 1.1 公式[1] 已知某条件概率,如何得到两个事件交换后概率,也就是在已知P(A|B)情况下如何求得P(B|A)。...1.3朴素贝叶斯分类器 朴素分类是一种十分简单分类算法,叫它朴素分类是因为这种方法思想真的很朴素,朴素思想基础是 这样:对于给出待分类项,求解在此项出现条件下各个类别出现概率...黄志刚, 基于中文垃圾邮件过滤系统设计与实现, 2007, 电子科技大学. [3]. 马世军, 姚建与乔文, 基于理论垃圾邮件过滤技术....王科, 基于中文邮件分类关键技术研究, 2008, 南京邮电大学.

    77620

    基于组合优化自动化抗体设计

    作者设计了一种组合优化框架 AntBO ,可实现抗体 CDRH3 区域高效计算设计。并使用 Absolut! 软件套件对 AntBO 进行基准测试与评分。...在文章中,作者将 CDRH3 区域设计称为抗体设计。 图1:抗体结构以及CDR区示意图 目前主流生成式模型已被用于从序列数据集中生成候选抗体。具体来说有自回归模型、变分自编码器或生成对抗网络。...作者团队着手利用最小数量实验迭代测量中抗体序列亲和力最大信息,使用 BO(优化) 生成对潜在更高亲和力序列知情预测。并且利用 Absolut!...是最先进计算模拟套件,最接近于现实复杂环境,它考虑了抗原和抗体生物物理特性,以创建抗原和抗体可行结合模拟。...3 基于组合优化抗体设计 第二部分中黑盒函数 f 具有以下特性:a) 评估成本高,b) 没有解析解,c) 可能不可微。为了规避这些问题,作者团队使用优化(BO) 来解决优化问题。

    52420

    R语言MCMC:Metropolis-Hastings采样用于回归估计

    候选分布 Q(X'| X)是给定候选X状态X'条件概率, 和 接受分布 α(x'| x)条件概率接受候选状态X'-X'。我们设计了接受概率函数,以满足详细平衡。...基于正态分布且均值和方差相同gammaMetropolis-Hastings独立采样 从某种状态开始xt。代码中x。 在代码中提出一个新状态x'候选 计算“接受概率” ?...x <- 3*a/b vec[1] <- x 选择方案 如果候选密度与目标分布P(x)形状匹配,即q(x'| xt)≈P(x')q(x'|),则该算法效果最佳。xt)≈P(x')。...---- 示例2:回归估计 Metropolis-Hastings采样用于估计回归模型。 ?...posterior <- function(param){ return (likelihood(param) + prior(param)) } Metropolis算法 该算法是从 后验密度中采样最常见统计应用之一

    1.2K20

    详解基于朴素情感分析及Python实现

    朴素 1、贝叶斯定理 假设对于某个数据集,随机变量C表示样本为C类概率,F1表示测试样本某特征出现概率,套用基本公式,则如下所示: ?...对于多个特征而言,公式可以扩展如下: ? 分子中存在一大串似然值。当特征很多时候,这些似然值计算是极其痛苦。现在该怎么办?...这个假设是认为各个特征之间是独立,看上去确实是个很不科学假设。因为很多情况下,各个特征之间是紧密联系。然而在朴素大量应用实践实际表明其工作相当好。...其次,由于朴素工作原理是计算P(C=0|F1...Fn)和P(C=1|F1...Fn),并取最大值那个作为其分类。而二者分母是一模一样。...而如果通过增加一个大于 0 可调参数 alpha 进行平滑,就叫 Lidstone 平滑。 ? 基于朴素情感分类 原始数据集,只抽了10条 ?

    1.8K80

    基于朴素分类模型及代码示例 | 机器分类

    贝叶斯分类器是一类分类算法总称,分类均以贝叶斯定理为基础,朴素分类中简单实用一种,是基于贝叶斯定理与特征条件独立假设分类方法。...有时使用概率要比那些硬规则有效多,准则和贝叶斯定理就是利用已知值来估计未知概率方法。使用概率论进行分类,首先从一个最简单概率分类器开始,进而给出一些假设来学习朴素贝叶斯分类器。...算法基础是概率问题,分类原理是通过某对象先验概率,利用公式计算出它后验概率(对象属于某一类概率),选取具有最大后验概率类作为该对象所属类。...(1)朴素贝叶斯分类器 分类原理是通过某对象先验概率,利用公式计算出它后验概率(对象属于某一类概率),选取具有最大后验概率类作为该对象所属类。...(2)基于朴素文档分类模型 整个文档看成是实例,而文档中元素相应构成特征。我们可以观察文档中出现词,并把每个词出现与否相应作为特征,进而构造分类器对文档进行分类。

    52220

    机器学习算法之旅

    最流行回归算法是: 普通最小二乘回归算法(Ordinary Least Squares Regression, OLSR) 线性回归算法(Linear Regression) 逻辑回归算法(Logistic...Decision Stump) M5 条件决策树(Conditional Decision Trees) 算法 Bayesian-Algorithms.png 方法是那些显式应用贝叶斯定理问题...最流行算法是: 朴素(Naive Bayes) 高斯朴素(Gaussian Naive Bayes) 多项式朴素(Multinomial Naive Bayes) 平均单个相关估计量...(Averaged One-Dependence Estimators, AODE) 信仰网络(Bayesian Belief Network , BBN) 网络Bayesian Network...CRAN任务视图: 机器学习和统计学习: R语言中每个机器学习软件包支持所有软件包和所有算法列表. 让你深入了解所有内容以及人们用于日常分析内容.

    1.4K50

    深度学习——基于PyMC3变分推理

    在这篇博客中,我将展示如何使用PyMC3中变分推理来拟合一个简单神经网络。我还将讨论桥接概率编程与深度学习能够为将来研究开创怎样有趣途径。...这种方法本质上是方法,所以我们可以指定先验来告知和约束我们模型,并得到后验分布形式不确定性估计。使用MCMC采样算法,我们可以从后验中抽样灵活地估计这些模型。...这种桥接可以让概率编程被运用于一系列更广泛有趣问题中,我相信它同样能在深度学习方面有所创新。比如: 预测中不确定性:我们下面将会看到,神经网络告诉我们它预测中不确定性。...例如,非参数化可以用来灵活调整隐藏层大小和形状,根据在训练过程中碰到问题最佳地扩展网络架构。目前,这需要昂贵超参数优化和大量系统知识。...PyMC3中神经网络 生成数据 首先,我们生成一些小型数据——一个简单二元分类问题,非线性可分。

    5.3K50
    领券