2023年11月，《Nature Communications》发表了一种基于人工智能（AI）的预筛查工具——MSInuit，用于从苏木精-伊红 (H&E) 染色的载玻片中检测MSI。...MSIntuit是一种基于人工智能的工具，可用于临床实践中对CRC患者的常规H&E玻片进行MSI预筛查。该方法的一个关键技术优势是使用SSL从组织学图像中提取特征。...使用这种方法，能够在不需要任何标签的情况下，在400万张CRC组织学图像上训练一个适合组织学的特征提取器。...，尺寸为112×112μm（224×224px，分辨率为0.5 MPP）；最后一步包括从每个tile中提取特征。...最后，MSI-PCR用于确认MMR-IHC的可疑病例，以确保dMMR/MSI标签的准确性，并在模型训练期间在未使用的两种不同扫描仪上进行验证。
Apache Phoenix的基本介绍 Apache Phoenix主要是基于HBase一款软件, 提供了一种全新(SQL)的方式来操作HBase中数据, 从而降低了使用HBase的门槛, 并且 Phoenix...提供标准的SQL以及完备的ACID事务支持 通过利用HBase作为存储，让NoSQL数据库具备通过有模式的方式读取数据，我们可以使用SQL语句来操作HBase，例如：创建表、以及插入数据、修改数据、删除数据等...Phoenix通过协处理器在服务器端执行操作，最小化客户机/服务器数据传输 Apache Phoenix可以很好地与其他的Hadoop组件整合在一起，例如：Spark、Hive、Flume以及MapReduce...子句中的谓词推送到服务器端 通过协处理器执行聚合查询 用于提高非行键列查询性能的二级索引 统计数据收集，以改进并行化，并指导优化之间的选择 跳过扫描筛选器以优化IN、LIKE和OR查询 行键加盐保证分配均匀...官方性能测试 上述两张图是从Phoenix官网拿下来的，这容易引起一个歧义。
对于事务表时间戳是不可控的。事务管理器分配时间戳，在提交后该分配的时间戳变成hbase cell时间戳。 5 schema Apache Phoenix支持通过DDL命令进行表创建和版本化增量更改。...将空的键值添加到每个行的第一列族中，以最小化查询project的大小。 对于只读VIEW，所有列系列必须已经存在。对HBase表进行的唯一修改是增加用于查询处理的Phoenix协处理器。...对旧数据进行快照查询将根据您连接的时间（基于CurrentSCN属性）提取并使用正确的模式。 6 变更 ALTER TABLE命令可以修改phoenix表。...如果您正在查询一个十亿行的表，您希望在服务器端执行尽可能多的计算，而不是将十亿行传输到客户端进行处理。另一方面，一些查询必须在客户端上执行。...这可以防止客户端缓冲受DELETE影响的行，以便Phoenix可以直接在区域服务器上删除它们，而无需将其返回给客户端。
； Hive 创建外部表，仅记录数据所在的路径， 不对数据的位置做任何改变； 在删除表的时候，内部表的元数据和数据会被一起删除， 而外部表只删除元数据，不删除数据。...temp.source_sys_key = t0.source_sys_key AND temp.legal_company = t0.legal_company ) where temp.jobid = '106'; // 在创建表的时候通过从别的表中查询出相应的记录并插入到所创建的表中...动态分区表 有这么一个需求，将一张Hive分区表里面的数据做一些筛选，然后通过筛选出来的数据通过 INSERT OVERWRITE TABLE 这种模式将原先表的数据覆盖，以下是SQL INSERT OVERWRITE...finally: connection.close() getTotalSQL() 筛选CSV中的非文件行 AND CAST( regexp_replace (sour_t.check_line_id...WHERE中的子查询 在hive中的子查询会有各种问题，这里的解决方法是将子查询改成JOIN的方式 先看一段在MySQL中的SQL，下不管这段SQL从哪来的，我也不知道从哪里来的 SELECT
从客户端，我们支持在线（在初始化来自4.8.0+版本的phoenix客户端的连接时）和离线（使用psql工具）在4.8.0之前创建的本地索引的升级。...index.builder.threads.max 用于从主表更新构建索引更新的线程数 增加此值克服了从底层HRegion读取当前行状态的瓶颈。...该工具将所有无效行写入文件或输出表PHOENIX_INDEX_SCRUTINY。无效行是在目标表中没有相应行或在目标表中具有不正确值的源行（即覆盖的列值）。...无效行是在目标表中没有相应行或在目标表中具有不正确值的源行（即覆盖的列值）。 该工具具有跟踪其状态的工作计数器。...请注意，无效的行 - 坏的行数=孤行的数量。这些计数器连同其他作业元数据一起被写入表PHOENIX_INDEX_SCRUTINY_METADATA。
Ozone支持350TB的密集型节点配置，与HDFS相比，当前的可用存储容量增加了350％， 并将存储成本降低了50％。 SDX –安全与治理 Ranger审核筛选器可提供更好的审核管理。...Ranger Audit筛选器有助于使用JSON定义的筛选器来控制捕获的审核事件，以便仅通过包含相关事件来简化审核量。...自动将旧的放置规则（队列映射）转换为新的基于JSON的格式 从单个页面创建新的放置规则，该规则允许配置所有选项： 在7.1.6之前的版本中，客户可以使用绝对模式（将资源按单位分配）或相对模式（将资源分配为总可用资源的百分比...静态队列具有规则和表达式以及预先创建的目标队列和用户映射。动态队列允许基于规则和表达式自动创建队列。可通过YARN队列管理器UI轻松启用此功能。...HBase构建的横向扩展RDBMS 星型模式支持和演化模式支持 视图和二级索引支持 全面支持Apache Omid 通过Phoenix 5.1，我们添加了复杂的x行，x表事务支持（开箱即用地支持TPC-C
但是，Phoenix 的抽象还没有完成，例如为了实现访问控制，您需要在包含 Phoenix 数据的底层 HBase 表上设置 ACL。 ? 是否有适用于 Phoenix JDBC 服务器的大小指南？...对于 CREATE TABLE，我们将创建任何尚不存在的元数据（表、列族）。我们还将为每一行添加一个空键值，以便查询按预期运行（无需在扫描期间投影所有列）。...从 Phoenix 2.1 版开始，Phoenix 支持对可变和不可变数据进行索引。请注意，Phoenix 2.0.x 仅支持对不可变数据进行索引。...Upsert 这个测试表中的行，Phoenix 查询优化器会选择正确的索引来使用。...为什么 Phoenix 在执行 upsert 时会添加一个空的/虚拟的 KeyValue？ 需要空的或虚拟的 KeyValue（列限定符为 _0）以确保给定的列可用于所有行。
从 0.94 版本开始, HBase 开始支持二级索引. HBase 索引有多种放方案, 我们今天要做的是使用 Phoenix 给 HBase 添加二级索引. 二....Phoenix 索引分类 Phoenix 索引分全局索引和局部索引 1. 全局索引 global index 是默认的索引格式。 适用于多读少写的业务场景。...创建全局索引的方法: CREATE INDEX my_index ON my_table (my_col) 2.局部索引 local index 适用于写操作频繁的场景。...索引数据和数据表的数据是存放在相同的服务器中的，避免了在写操作的时候往不同服务器的索引表中写索引带来的额外开销。 查询的字段不是索引字段索引表也会被使用，这会带来查询速度的提升。 ...所以在写操作频繁的字段上不适合建立Global index。 2. 创建索引总结 1.
Get操作可以根据行键从表中获取特定行的数据，而Put操作可以将数据写入表的指定行。 批量读写（Scan和Batch Put）：HBase支持批量读写操作，可以一次性读取或写入多行数据。...Scan操作可以按照一定的条件扫描表中的多行数据，而Batch Put操作可以一次性写入多行数据。 全表扫描（Scan）：通过Scan操作，可以遍历整个表的数据，按照指定的条件进行过滤和筛选。...请注意，在使用 Java API 进行预分区时，需要先建立与 HBase 的连接，并通过 HBase 管理器（Admin）执行表的创建操作，并设置 setSplitKeys(splitKeys) 方法来指定分区点...Phoenix Phoenix是一个开源的基于Apache HBase的关系型数据库引擎，它提供了SQL接口来访问HBase中存储的数据。...可以使用 Phoenix 提供的 SQL 语法创建表和定义模式。
由于LOCAL INDEX和元数据表是存在一张表中，故它更多的适用于写多读少的场景中，并且该特性使得主表的数据量不能过大。...目前索引创建支持同步和异步两种方式同步索引数据，同步创建索引的意思是若当前的表有数据那么创建索引的过程就是一个同步索引数据的一个过程，它会把所有的主表的数据转化成索引数据，全部同步完成以后的再将索引表的状态置成...目前为止Phoenix4.12支持了检查主表和索引表数据一致工具。由于前面所说一些列限制，就导致Phoenix创建所以的时候不能超过一定数量，目前索引个数默认不建议超过10个。...从图中可以了解，平均每天的增长量为1亿+，峰值为5亿，每张主表有8+张索引表，所以是多维度生成报表。其中主要应用到了Phoenix的二级索引的功能，通过二级索引做一些多维度的查询和分析。...案例二就是物联网，它的特点就是数据量大，写多读少，它的数据来自多个传感器，它每天的写入数据都是5亿+的数据量。
HBase本身只提供基于行键和全表扫描的查询，而行键索引单一，对于多维度的查询困难。 二级索引的本质就是建立各列值与行键之间的映射关系。...虽然HBase在数据存储层中集成了MapReduce,能够有效用于数据表的分布式计算。...Coprocessor方案(Phoenix等） 其实从0.94版本开始，HBase官方文档已经提出了hbase上面实现二级索引的一种路径: 基于Coprocessor(0.92版本开始引入，达到支持类似传统...Functional indexes(函数索引)：索引不局限于列，支持任意的表达式来创建索引。 Global indexes(全局索引)：适用于读多写少场景。...通过维护全局索引表，所有的更新和写操作都会引起索引的更新，写入性能受到影响。在读数据时，Phoenix SQL会基于索引字段，执行快速查询。
Get操作可以根据行键从表中获取特定行的数据，而Put操作可以将数据写入表的指定行。批量读写（Scan和Batch Put）：HBase支持批量读写操作，可以一次性读取或写入多行数据。...Scan操作可以按照一定的条件扫描表中的多行数据，而Batch Put操作可以一次性写入多行数据。全表扫描（Scan）：通过Scan操作，可以遍历整个表的数据，按照指定的条件进行过滤和筛选。...请注意，在使用 Java API 进行预分区时，需要先建立与 HBase 的连接，并通过 HBase 管理器（Admin）执行表的创建操作，并设置 setSplitKeys(splitKeys) 方法来指定分区点...> 4.16.0-HBase-2.4创建 Phoenix 表： 在 HBase 中创建 Phoenix 表。...可以使用 Phoenix 提供的 SQL 语法创建表和定义模式。
表内容或查询结果的自定义过滤器，包括基于单元格值的过滤。 查询结果按列排序。 应用过滤和排序导出数据。 基于选定行生成SQL语句。 所选列的基本统计信息。 6....可视化分析复杂的SQL查询。 9. 元数据管理 提供数据库连接树，其元数据结构可向下到最低级别：表、视图、列、索引、过程、触发器、存储实体（表空间、分区）和安全实体（用户、角色）。...全局和本地过滤器，能够按名称筛选数据库对象。 10. 数据传输 将数据导出到一个文件或另一个数据库表，如果目标表不存在，可以选择创建该表。...支持的文件格式包括：CSV、HTML、XML、JSON、XLS、XLSX。也可以直接从CSV文件将数据导入数据库表，在向导中设置列映射和数据类型。可将数据传输配置另存为任务并随时运行。 11....从CDH所在主机（任一）下载phoenix client jar文件。
Cloudera的运营型数据库为您提供了各种工具，例如计划分析器，可以最佳地利用您的计算资源。 Cloudera的OpDB提供了各种基于成本和基于规则的优化器。您可以根据用例使用不同的优化器。...支持的索引类型 索引在OpDB中用作从其主要数据访问路径访问数据的正交方式。OpDB中的Apache Phoenix自动使用索引来为查询服务。Phoenix支持全局和本地索引。...使用Cloudera Search，近实时索引允许搜索数据库中的数据-在索引创建中不需要显式的列或属性-并将其映射到主键。基于主键的第二个GET允许快速检索该行。...每个全局索引都存储在其自己的表中，因此不会与数据表位于同一位置。全局索引是涵盖索引。仅当该查询中的所有列都包含在该索引中时，它才用于查询。...您可以更新所有数据，包括内存中的列存储，而无需同步机制。 服务器集群和限制 默认情况下，Cloudera的OpDB是一个集群解决方案，可扩展到数十亿行和数百万列。
如果优化HBase，基于Phoenix的应用程序同样也会受益，从而获得更好的性能。例如Phoenix实现了主键的加盐 - 因此HBase用户不用考虑Rowkey的设计。...在CDH中从安全和治理角度，Phoenix使用HBase ACLs来实现Phoenix表的基于角色访问控制。同时Cloudera Navigatior也会捕获Phoenix的审计信息。...适用于什么样的工作负载 Phoenix支持与HBase相同的用例场景，主要是低延迟，高并发的工作负载。...Phoenix，GeoMesa以及JanusGraph和OpenTSDB都可以共存于一个HBase集群中。 Q) 如何创建和使用索引？...Q) 做索引的column数量有限制吗？ 与RDBMS一样，HBase的二级索引其实就是使用另一张索引表来实现的，这张表包含索引和源数据的链接。
Hbase数据构建结构化的数据形式 可以用SQL来实现处理 实现 将Hbase表中每一行对应的所有列构建一张完整的结构化表 如果这一行没有这一列，就补null Hive：通过MapReduce来实现 Phoenix...：通过Hbase API封装实现的 总结 原因：满足各种应用场景下，对于Hbase使用的方式，基于SQL方式会更加通用 实现：将整张表的数据构建结构化形式，每一行没有列就补null 原理：将SQL转换成了...让Hbase监听原表，原表更改一条，Hbase自动对索引表更改一条 缺点：开发比较麻烦 方案三：第三方工具 Phoenix：将所有协处理器都封装好了 支持SQL 支持自动二级索引的构建及维护 create...index 总结 需求：必须根据不同的查询条件，创建不同的索引表，并且维护所有索引表与原始数据表的同步 解决：通过Phoenix自带的协处理器来实现 知识点08：Phoenix的介绍 功能 专门基于...中默认会将所有字符转换为大写，如果想要使用小写字母，必须加上双引号 知识点11：Phoenix的语法：DDL：Table 需求 实现基于SQL的数据表管理：创建、列举、查看、删除 分析 step1：列举当前所有的表
Operational Database 是一种基于 Apache HBase 的关系型和非关系型数据库，旨在支持使用大数据的 OLTP 应用程序。...Rager 提供安全密钥管理，使用 Ranger KMS 服务的密钥管理员可以单独登录。Apache Ranger 还提供了非常需要的安全功能，例如开箱即用的列屏蔽和行过滤。...Apache Phoenix 实施了最佳实践优化，使软件工程师能够开发基于 HBase 的下一代数据驱动应用程序。...使用 Phoenix，您可以使用标准 JDBC API、ODBC、Phoenix DB API 以典型 DDL/DML 语句的形式创建表并与之交互。...在 COD Web 界面中，单击创建数据库。 从列表中选择要在其中拥有数据库的环境。 在数据库名称字段中提供数据库的名称。 单击创建数据库。 结果 显示信息页面，显示数据库的状态。
假设我们的输入文件中总共有50行，首先对50行进行标记，并并行地形成键值对(每个节点并行执行的任务);只有在此之后，减速器才会开始聚合。...04 HBase HBase是一个运行在Hadoop HDFS之上的NoSQL列族数据库。HBase是为处理具有数十亿行和数百万列的大型存储表而开发的，具有容错能力和水平可伸缩性。...请参阅下面的示例Phoenix查询示例，该查询从employee表检索记录。如果您分析查询，您会发现它与SQL相似，并且易于编写和理解。...其优点在于Phoenix提供了一些特性，比如跳过全表扫描、提高整个系统的性能、服务器/客户机端并行化、过滤器下推和Phoenix查询服务器，从而将处理与应用程序、事务和辅助索引解耦。...传统的基于sql的工具的重要性和Phoenix的作用 13 几十年来，SQL一直是与关系数据库系统交互的主要工具。人们熟悉并熟悉这种技术及其语法。
对比使用Phoenix组件和原生Hbase查询的时间性能 之前对于使用Phoenix查询Hbase大表数据一直卡死，于是搁置了好久，昨晚终于尝试了一下，完美搞定，本节文章来使用4种方法对比Hbase...1.基本理论 HBase是一个分布式的基于列存储的非关系型数据库。 HBase不是关系型数据库，而是一个在hdfs上开发的面向列的分布式数据库，不支持sql。 HBase统计使用count。...查询按照rowkey查询，适合存储结果，不适合做sum、count、表连接等复杂查询，而SQL则适合多表连接，查询组合等。...phoenix，操作的表及数据，存储在hbase上。phoenix只是需要和Hbase进行表关联起来。然后再用工具进行一些读或写操作。...Phoenix查询时间为2015.033秒，大约33分钟左右。 3.总结 综上可得出，速度快慢：协处理器>Phoenix查询>间隔count>普通count>全表scan。
及多版本的功能及含义 Namespace：命名空间，类似于数据库的设计，用于区分不同的业务表 Rowkey：行健，类似于主键的设计，唯一标识一条数据并且作为Hbase中的唯一索引 ColumnFamily...、负责管理集群的从节点、元数据以及所有Region的分配 从节点：HRegionServer：存储节点，负责实现所有数据的存储，管理Region，构建分布式内存 问题10：请简述Table表与RegionServer...Phoenix是一个专门为Hbase设计的SQL on Hbase的工具 底层通过Hbase API和大量的协处理器实现 可以实现基于SQL访问Hbase以及构建维护二级索引等功能 问题19：什么是二级索引...如果查询的字段在索引表中，直接从索引表返回结果 问题23：什么是本地索引？...创建覆盖索引，会自动基于原表构建一个列族来实现索引存储 原表的数据中：多了一个索引列族 特点 不论查询字段是否是索引字段，都会走索引 将索引与数据存储在同一台RegionServer，提高索引读写性能
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