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如何利用全新的决策树集成级联结构gcForest做特征工程并打分?

(注:级联数量自动确定可以有助于控制模型的复杂性,实际上在每一级的输出结果都用ground truth label来训练的,这里和CNN的理解不同,CNN认为特征是逐层抽象的,而本文在每一层都直接拿label...从正/负训练样例中提取的所有特征向量被视为正/负实例;它们将被用于生成类向量:从相同大小的窗口提取的实例将用于训练完全随机树森林和随机森林,然后生成类向量并连接为转换后的像素。...更重要的是,gcForest 具有少得多的超参数,并且对参数设置不太敏感;实际上在我们的实验中,通过使用相同的参数设置在不同的域中都获得了优异的性能,并且无论是大规模还是小规模的数据,它的工作都很好。...如果是RandomForest,就直接调用RandomForest的打分函数,得到该基学习器返回的一个map,其中包含特征名称和得分,这里用一个临时变量保存,等到下一层获取RandomFores打分函数得到的另一个...Xi代表RandomForest中第i个特征的得分,Yi代表XGBoost中第i个特征的得分,这两个值虽然不是一个量纲,但是通过处以它们全部特征之和就可以得到该特征在它的模型中的相对特征,最后通过设置w1

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R语言从入门到精通:Day16(机器学习)

-- 测试数据和代码见文末客服二维码 在上一次教程中,我们介绍了把观测值凝聚成子组的常见聚类方法。其中包括了常见聚类分析的一般步骤以及层次聚类和划分聚类的常见方法。...有监督机器学习基于一组包含预测变量值和输出变量值的样本单元,将全部数据分为一个训练集和一个验证集,其中训练集用于建立预测模型,验证集用于测试模型的准确性。...最终的决策树如图6所示。 图6,经典决策树示意图。 ? 最终,可以得到对测试集的预测准确率为94%。 条件推断树与经典决策树类似,但变量和分割的选取是基于显著性检验的,而不是纯净度或同质性一类的度量。...randomForest包中的函数randomForest()可用于生成随机森林。函数默认生成500棵树,并且默认在每个节点处抽取sqrt(M)个变量,最小节点为1。...在上面的例子中,randomForest包根据传统决策树生成随机森林,而party包中的函数cforest()则可基于条件推断树生成随机森林(当预测变量间高度相关时,基于条件推断树的随机森林可能效果更好

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    R 集成算法③ 随机森林

    在得到森林之后,当有一个新的输入样本进入的时候,就让森林中的每一棵决策树分别进行一下判断,看看这个样本应该属于哪一类(对于分类算法),然后看看哪一类被选择最多,就预测这个样本为那一类。...这样使得在训练的时候,每一棵树的输入样本都不是全部的样本,使得相对不容易出现over-fitting。 然后进行列采样。...这里需要说明的是,如果不指定y值,则随机森林将是一个无监督的模型; xtest和ytest用于预测的测试集; ntree指定随机森林所包含的决策树数目,默认为500; mtry指定节点中用于二叉树的变量个数...rf为randomForest对象,需要说明的是,在构建随机森林模型时必须指定计算临近矩阵,即设置proximity参数为TRUE; fac指定随机森林模型中所使用到的因子向量(因变量); palette...应用 将数据集分为训练集和测试集,并查看数据集基本属性。

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    R语言泰坦尼克号随机森林模型案例数据分析|附代码数据

    Bagging会对您的训练集中的行进行随机抽样。使用样本函数很容易在R中进行模拟。假设我们想在10行的训练集上进行装袋。...随机森林不是查看整个可用变量池,而是仅采用它们的一部分,通常是可用数量的平方根。在我们的例子中,我们有10个变量,因此使用三个变量的子集是合理的。...combi$FamilyID2 <- combi$FamilyID > combi$FamilyID2 <- factor(combi$FamilyID2) 我们已经降到了22级,所以我们很好地将测试和训练集分开...,安装并加载包 randomForest: > install.packages('randomForest') 设置随机种子。...> fit randomForest( ) 我们强制模型通过暂时将目标变量更改为仅使用两个级别的因子来预测我们的分类,而不是method="class"像使用那样指定。

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    【R语言进行数据挖掘】决策树和随机森林

    在建立模型之前,iris(鸢尾花)数据集被分为两个子集:训练集(70%)和测试集(30%)。使用随机种子设置固定的随机数,可以使得随机选取的数据是可重复利用的。...下面我们将会使用默认的参数设置去建立决策树,至于具体的参数设置可以通过?party查看函数文档。下面的代码中,myFormula公式中的Species(种类)是目标变量,其他变量是独立变量。...在图1中,每一个叶子的节点的条形图都显示了观测值落入三个品种的概率。在图2中,这些概率以每个叶子结点中的y值表示。...由上图的结果可知,即使在决策树中,仍然有误差,第二类和第三类话仍然会被误判,可以通过输入print(rf)知道误判率为2.88%,也可以通过输入plot(rf)绘制每一棵树的误判率的图。...最后,在测试集上测试训练集上建立的随机森林,并使用table()和margin()函数检测预测结果。

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    「Workshop」第二十六期 随机森林

    生成结点 判断1:所有训练集样本是否属于同一种类别 判断2:所有的训练集属性特征取值都否都相同 从属性中选择最优划分属性 选择属性: ?...D是样本集,a是属性 根据最优划分属性的每个取值,生成各个分支,得到样本子集,判断3:如果样本子集为空,那么分支的类别标记为整个训练集中样本最多的类 在三种情况下递归返回: 当前结点下的样本全部属于同一类...当前属性为空/所有样本在所有属性上取值相同,划分不了样本——设当前结点为叶节点,类为该结点下最多的类 当前结点包含的样本为空,不能划分——设当前结点为叶节点,类为父结点下最多的类 3....多变量决策树 对属性的线性组合进行测试,非叶节点线性分类器,也就是说不是找最优划分属性,而是建立合适的线性分类器。 ? 集成学习 1. 基本概念 通过构建并结合多个学习器来完成学习任务。...随机森林 基本概念 是以决策树为基学习器构建Bagging集成的基础上,进一步在决策树的训练过程中引入了随机属性选择。

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    R语言︱决策树族——随机森林算法

    随机深林和支持向量机都是非参数模型(复杂度随着训练模型样本的增加而增大)。相较于一般线性模型,就计算消耗来看,训练非参数模型因此更为耗时耗力。分类树越多,需要更耗时来构建随机森林模型。...随机森林在训练模型上要更为简单。你很容易可以得到一个又好且具鲁棒性的模型。随机森林模型的复杂度与训练样本和树成正比。支持向量机则需要我们在调参方面做些工作,除此之外,计算成本会随着类增加呈线性增长。...假设输入样本为N个,那么采样的样本也为N个。这样使得在训练的时候,每一棵树的输入样本都不是全部的样本,使得相对不容易出现over-fitting。...如果样本中的个体是完全相同类别的,那么系统的熵为0;如果样本是等划分的(50%-50%),那么系统的熵为1。...模型中关于数据结构的要求: `randomForest`函数要求为数据框或者矩阵,需要原来的数据框调整为以每个词作为列名称(变量)的数据框。

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    「R」逻辑回归、决策树、随机森林

    有监督学习基于一组包含预测变量和输出变量的样本单元。将全部数据分为一个训练数据集和一个验证数据集,其中训练集用于建立预测模型,验证集用于测试模型的准确性。...在样本单元中,概率大于.5的被分为恶性肿瘤类,概率小于等于.5的被分为良性肿瘤类。 最后给出预测与实际情况对比的交叉表(混淆矩阵,confusion matrix)。...其具体算法如下: 选定一个最佳预测变量将全部样本单元分为两类,实现两类中的纯度最大化(即一类中良性样本单元尽可能多,另一类恶性样本单元尽可能多)。...代码内容中给出了实际类别与预测类别的交叉表。整体来看,准确率还是非常高的。 条件推断树 条件推断树与传统决策树类似,但变量和分割的选取是基于显著性检验的,而不是纯净度或同质性一类的度量。...randomForest包根据传统决策树生成随机森林,而party包中的cforest()函数可以基于条件推断树生成随机森林。当预测变量间高度相关时,基于条件推断树的随机森林可能效果更好。

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    机器学习之随机森林(R)randomFordom算法案例

    因此,随机森林的训练过程可以总结如下: (1)给定训练集S,测试集T,特征维数F。...S(i),作为根节点的样本,从根节点开始训练 (3)如果当前节点上达到终止条件,则设置当前节点为叶子节点,如果是分类问题,该叶子节点的预测输出为当前节点样本集合中数量最多的那一类c(j),概率p为c(j...注:有关分类效果的评判标准,因为使用的是CART,因此使用的也是CART的评判标准,和C3.0,C4.5都不相同。...#将数据集分为训练集和测试集,并查看数据集基本属性。数据为R自带IRIS数据 ? #选取randomforest –mtry节点值,对应误差最小为2,一般可默认。通常也是2记得。...由上图的结果可知,OOB误差为2.8%,同时在随机森林中,第二类和第三类仍然有误差,会被误判,也可以通过输入plot(rf)绘制每一棵树的误判率的图。 #看重要性 ?

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    机器学习之随机森林(R)randomFordom算法案例

    因此,随机森林的训练过程可以总结如下: (1)给定训练集S,测试集T,特征维数F。...S(i),作为根节点的样本,从根节点开始训练 (3)如果当前节点上达到终止条件,则设置当前节点为叶子节点,如果是分类问题,该叶子节点的预测输出为当前节点样本集合中数量最多的那一类c(j),概率p为c(j...注:有关分类效果的评判标准,因为使用的是CART,因此使用的也是CART的评判标准,和C3.0,C4.5都不相同。...#将数据集分为训练集和测试集,并查看数据集基本属性。数据为R自带IRIS数据 ? #选取randomforest –mtry节点值,对应误差最小为2,一般可默认。通常也是2记得。...由上图的结果可知,OOB误差为2.8%,同时在随机森林中,第二类和第三类仍然有误差,会被误判,也可以通过输入plot(rf)绘制每一棵树的误判率的图。 #看重要性 ?

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    机器学习之随机森林

    保持准确性,即使训练数据有一些缺失。 与未标记数据(无监督学习)一起工作,用于聚类,数据视图和异常值检测。 在自助采样过程中使用输入数据的样本。在这里,三分之一的数据不是用于训练,而是用于测试。...这些样本被称为“包外样本”,关于这些样本的错误被称为“包外错误”(out-of-bag error)。这种类型的错误显示与训练显示的单独数据集相同的错误率,因此不需要单独的测试数据集。...我们会得到一个关于二维数组的数组作为训练实例和INT型数组作为返回值。...获取数据后,我们使用smile.operators 包中的randomForest() 方法,这个将返回一个RandomForest 类的实例。...这里testInstances 和 testResponseVaues 是从同一个测试数据集中提取,如下所示: val weatherTest = read.arff("src/main/resources

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    R语言randomForest包的随机森林分类模型以及对重要变量的选择

    随机森林通过对对象和变量进行抽样构建预测模型,即生成多个决策树,并依次对对象进行分类。最后将各决策树的分类结果汇总,所有预测类别中的众数类别即为随机森林所预测的该对象的类别,分类准确率提升。...随机森林工作过程可概括如下: (1)假设训练集中共有N个对象、M个变量,从训练集中随机有放回地抽取N个对象构建决策树; (2)在每一个节点随机抽取m变量,将其作为分割该节点的候选变量,每一个节点处的变量数应一致...相较于其它分类方法,随机森林通常具有如下优势: 分类准确率通常更高; 能够有效处理具有高维特征(多元)的数据集,而且不需要降维; 在处理大数据集时也具有优势; 可应用于具有大量缺失值的数据中; 能够在分类的同时度量变量对分类的相对重要性...()函数从训练集中有放回地随机抽取84个观测点,在每棵树的每个节点随机抽取36个变量,从而生成了500棵经典决策树。...再使用训练集和测试集评估分类器性能。

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    R 交叉验证①

    在机器学习中,交叉验证是一种重新采样的方法,用于模型评估,以避免在同一数据集上测试模型。交叉验证的概念实际上很简单:我们可以将数据随机分为训练和测试数据集,而不是使用整个数据集来训练和测试相同的数据。...K折交叉验证(k-fold cross-validation)首先将所有数据分割成K个子样本,不重复的选取其中一个子样本作为测试集,其他K-1个样本用来训练。...共重复K次,平均K次的结果或者使用其它指标,最终得到一个单一估测。这个方法的优势在于,保证每个子样本都参与训练且都被测试,降低泛化误差。其中,10折交叉验证是最常用的。...英文名叫做10-fold cross-validation,用来测试算法准确性。是常用的测试方法。将数据集分成十分,轮流将其中9份作为训练数据,1份作为测试数据,进行试验。...AUC为最优的训练集与测试集划分。

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    mlr3的校准曲线也是一样画!

    mlr3verse) ## Loading required package: mlr3 library(mlr3pipelines) library(mlr3filters) 建立任务 然后是对数据进行划分训练集和测试集..." 很多人喜欢在训练集中使用10折交叉验证,但其实这对于提高模型表现没什么用~尤其是临床预测模型这个领域~ 因为你的模型表现好不好很大程度上取决于你的数据好不好!...Predicted Probability", y= "Observed Probability")+ theme_minimal() plot of chunk unnamed-chunk-14 是不是和上一篇中的...没错,就是一样的,就是这么简单,想怎么画就怎么画 ! 测试集的校准曲线 先把模型用在测试集上,得到预测结果,然后画图!...生存资料的怎么搞? 关于这两个问题,可以翻看我之前的推文: 二分类资料校准曲线的绘制 生存资料校准曲线的绘制

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    文本情感分析:特征提取(TFIDF指标)&随机森林模型实现

    由于tf受高频词影响较大,我们暂时将其排除,根据上面的统计逻辑发现正向样本中某个词语的df和负向样本的相同,因为我们并没有把正负样本分开统计,所以在这种情况下使用df建模基本上不可能将正负样本分开,只有选...构建随机森林模型时需要将每一个词汇作为一个变量或者维度,这样矩阵会变得异常稀疏,但我们先不讲究这些,在企业内做数据挖掘建模时,第一目标不是追求模型统计上的完美性,而是在测试集和训练集上的稳定性和准确性。...aggregate相当于把每个文档的词去重了一下,不是ID去重,在不同文档中也可能存在相同的词。..., randomForest中的参数,importance设定是否输出因变量在模型中的重要性,如果移除某个变量,模型方差增加的比例是它判断变量重要性的标准之一,proximity参数用于设定是否计算模型的临近矩阵...答:dcast重排的时候,是按照term的名称大小写的顺序来写的,所以肯定和训练集的结构是一致的! 为什么图5中,一些词语的Id为0,而dcast之后,不存在0id的个案呢?

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    R语言︱情感分析—基于监督算法R语言实现(二)

    由于tf受高频词影响较大,我们暂时将其排除,根据上面的统计逻辑发现正向样本中某个词语的df和负向样本的相同,因为我们并没有把正负样本分开统计,所以在这种情况下使用df建模基本上不可能将正负样本分开,只有选...构建随机森林模型时需要将每一个词汇作为一个变量或者维度,这样矩阵会变得异常稀疏,但我们先不讲究这些,在企业内做数据挖掘建模时,第一目标不是追求模型统计上的完美性,而是在测试集和训练集上的稳定性和准确性。...aggregate相当于把每个文档的词去重了一下,不是ID去重,在不同文档中也可能存在相同的词。..., randomForest中的参数,importance设定是否输出因变量在模型中的重要性,如果移除某个变量,模型方差增加的比例是它判断变量重要性的标准之一,proximity参数用于设定是否计算模型的临近矩阵...答:dcast重排的时候,是按照term的名称大小写的顺序来写的,所以肯定和训练集的结构是一致的! 为什么图5中,一些词语的Id为0,而dcast之后,不存在0id的个案呢?

    1.8K20

    R语言泰坦尼克号随机森林模型案例数据分析

    随机森林不是查看整个可用变量池,而是仅采用它们的一部分,通常是可用数量的平方根。在我们的例子中,我们有10个变量,因此使用三个变量的子集是合理的。为决策树中的每个节点更改可用变量的选择。...我们可以使用R函数而不是布尔逻辑的子集is.na(),而它是倒数!is.na()(爆炸符号表示“不是”)。此子集是否缺少值。...安装并加载包 randomForest: > install.packages('randomForest') 因为该过程具有我们之前讨论过的两个随机源,所以在开始之前在R中设置随机种子是个好主意。...> fit randomForest( ) 我们强制模型通过暂时将目标变量更改为仅使用两个级别的因子来预测我们的分类,而不是method="class"像使用那样指定。...让我们尝试一下条件推理树的森林。他们使用统计测试而不是纯度测量以稍微不同的方式做出决定,但每棵树的基本构造非常相似。 所以继续安装并加载party包。

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    R语言随机森林RandomForest、逻辑回归Logisitc预测心脏病数据和可视化分析|附代码数据

    这两个测试(Chi-square和Phi相关)在大量的观察中基本上得出相同的结果,因为一个是基于正态分布的,另一个是基于t分布的。 2.5 多重共线性的双变量分析 该模型的真正问题在于共线性现象。...有缺失值的记录被从数据集中省略,模型显示变量男性、年龄、cigsPerDay、totChol、sysBP和葡萄糖是显著的,而prevalentHyp在某种程度上是显著的。  .... , family = "binomial") 在第二个模型实例中,重要变量与前一个模型实例相同。 一个非常重要的问题是,如何衡量这两个模型实例的性能以及如何比较它们?...我们可以看到,在50到1000棵树的范围内,RandomForest模型的最高精度可以通过设置CV方法的树数等于400来获得。图中的红线显示了我们从逻辑回归模型实例中得到的最佳CV精度。...然而,正如我之前提到的,这些模型是为了教育和机器学习的实践,而不是为了医学预测!所以,我认为这些模型是有价值的。

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    数据分享|WEKA信贷违约预测报告:用决策树、随机森林、支持向量机SVM、朴素贝叶斯、逻辑回归

    建模和模型优化 随机森林 Weka操作 打开预处理后的训练集,在classifier模块中选择CVParameterSelection,并选择RandomForest决策分类树算法,寻找最佳参数。...CART分类树算法每次仅对某个特征的值进行二分,而不是多分,这样CART分类树算法建立起来的是二叉树,而不是多叉树。...对生成的决策树做预测的时候,假如测试集里的样本A落到了某个叶子节点,而节点里有多个训练样本。则对于A的类别预测采用的是这个叶子节点里概率最大的类别。...对比剪枝结果,发现各项指标剪枝优于不剪枝,而不剪枝的ROI大于剪枝的模型。 调整矩阵: 输出结果中,混淆矩阵相同。...ID3 weka操作 相同步骤,target名义变量设置,cost sensitive 设置,将假阳性错误的代价敏感度提高,选择ID3算法,结果如下,Recall 为75.2%,ROI 为1550000

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    临床预测模型机器学习-随机森林树RSF(RandomForestRandomForestSRC)算法学习

    决策树的生成: 每棵树是从训练集数据中随机抽样生成的,这个抽样是有放回的。 每棵树在节点分裂时随机选择部分特征,以减少树之间的相关性并增强模型的泛化能力。...袋外(OOB)误差估计:在随机森林中,不需要额外的交叉验证/测试集来估计模型的泛化误差。每棵树在训练时有一部分数据未被使用,作为 OOB 数据。...在决策树中,基尼不纯度(Gini Impurity)用于衡量一个节点的“纯度”——也就是说,节点中样本的类别有多么一致。基尼不纯度越低,节点中的样本越趋于相同的类别。...Proximities(接近度): 接近度是随机森林中的一种重要工具。通过记录数据对在相同终端节点出现的频次,构成一个 N×NN \times NN×N 矩阵,并在所有树中取平均值进行归一化。...对于大数据集,接近度矩阵可能超出内存限制,可以只保留最近邻的接近度。当有测试集时,也可以计算测试集和训练集之间的接近度,额外的计算量适中。

    22010
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