在r编程中，如何从levels 50+的巨大因子变量中创建因子？ - 腾讯云开发者社区 - 腾讯云

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【R语言】因子在临床分组中的应用

前面给大家简单介绍了 ☞【R语言】R中的因子（factor）今天我们来结合具体的例子给大家讲解一下因子在临床分组中的应用。我们还是以TCGA数据中的CHOL（胆管癌）这套数据为例。...关于这套临床数据的下载可以参考 ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) 前面我们也给大家介绍过一些处理临床数据的小技巧 ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验，复现临床paper...stage I，stage II，stage III和stage IV四个分期接下来我们试着把组织病理分期从四个组合并成两个组，并转换成因子方法一、使用gsub函数前面也给大家介绍过☞R替换函数...,"stage I/II","stage III/IV","stage III/IV")) stage 可以得到跟上面使用gsub一样的结果接下来我们试着把组织病理分期从四个组合并成三个组，并转换成因子...II","stage III/IV","stage III/IV")) stage 可以得到跟gsub一样的结果参考资料： ☞【R语言】R中的因子（factor） ☞如何从TCGA数据库下载

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R语言基础教程——第3章：数据结构——因子

因子变量可归结为名义型、有序型或连续型变量。名义型变量是没有顺序之分的类别变量。类别（名义型）变量和有序类别（有序型）变量在R中称为因子（factor）。...因子在R中非常重要，因为它决定了数据的分析方式以及如何进行视觉呈现。...因子（factor)是R语言中比较特殊的一个数据类型，它是一个用于存储类别的类型，举个例子，从性别上，可以把人分为：男人和女人，从年龄上划分，又可以把人分为：未成年人（=18）。...因子具有因子水平（Levels），用于限制因子的元素的取值范围，R强制：因子水平是字符类型，因子的元素只能从因子水平中取值，这意味着，因子的每个元素要么是因子水平中的字符（或转换为其他数据类型），要么是缺失值...通常情况下，在创建数据框变量时，R隐式把数据类型为字符的列创建为因子，这是因为R会把文本类型默认为类别数据，并自动转换为因子。前面我们在讲数据框时，就有提到。

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Day4：R语言课程（向量和因子取子集）

查看R的数据结构从数据结构中对数据进行子集化。...我们使用的R中的函数将取决于我们引入的数据文件的类型（例如文本，Stata，SPSS，SAS，Excel等）以及该文件中的数据如何分开或分隔。下表列出了可用于从常见文件格式导入数据的函数。...编程语言如Fortran，MATLAB和R从1开始计数，符合人类的思维模式。C系列中的语言（包括C ++，Java，Perl和Python）从0开始计算，因为这对计算机来说更简单。...---- 因子的relevel 我们已经简要地讨论了一些因子，但只有在实战之后，这种数据类型才会变得更加直观。稍微绕道而行，了解如何在一个因素中重新定义类别。...这体现在它们在str()中输出的方式以及在各个类别的编号在因子中的位置。注意：当您需要将因子中的特定类别作为“基础”类别（即等于1的类别）时，需要重新调整。

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左手用R右手Python系列——因子变量与分类重编码

今天这篇介绍数据类型中因子变量的运用在R语言和Python中的实现。因子变量是数据结构中用于描述分类事物的一类重要变量。其在现实生活中对应着大量具有实际意义的分类事物。...以下将分别讲解在R语言和Python中如何生成因子变量、如何将数值型变量转换为因子变量、以及如何对因子变量进行重编码。...factor(x, levels,labels=levels,ordered=) 以上参数中，x即是我们将要转换的变量，levels是将要设定的因子水平（可选参数，省略则自动以向量中的不重复对象为因子水平...除了直接在生成序列或者数据框时生成因子变量之外，也可以通过一个特殊的函数pd.Categorical来完成在序列和数据框中创建因子变量。...最后做一个小总结：关于因子变量在R语言和Python中涉及到的操作函数; R语言：创建因子变量： factor 转换因子变量： as.factor as.numeric(as.character)

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【基础】R语言2：数据结构

数据类型数值型：用于直接计算加减乘除字符串型：可以进行连接，转换，提取等逻辑型：真或假日期型等R对象R语言中的变量可以赋值给变量的任何事物，包括常量、数据结构、函数甚至图形对象都拥有某种模式，描述此对象是如何储存的...=1,to=100,length.out=10) # 输出个数为10 ##rep函数：重复数列 rep(a,b) #重复b次a标量与其他编程语言类似R语言是向量化编程a=2向量索引正负整数索引length...rownames=c("R1","R2","R3")cnamesdimnames(m)=list(rownames,cnames)数组#创建数组dim(x)=c(2,2,5)矩阵的索引# 矩阵下标访问m...(NA)的元素值集合 #ordered：取真值时表示因子水平是有次序的(按编码次序)cut()函数连续取值的变量，可以用cut()函数将其分段，转换成因子使用breaks()参数指定分点，最小分点要小于数据的最小值...c dtable()函数——统计频数table(sex)## sex## 男女 ## 3 2tapply()函数可以按照因子分组然后每组计算另一变量的概括统计h <- c(165, 170, 168

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R语言中的因子型变量

因子与因子水平 R语言的数据类型中，因子（Factor）型比较特殊，也让许多初学者感到难以理解。...eg:五个用户月均通话次数分别是（15, 1, 63, 19, 122），存储在变量calls_num中。此时calls_num是一个数值型变量，有五个值，且理论上每个值的取值范围是0到+∞。...R语言实现创建因子 R语言中，通过factor()函数建立因子型变量。...可以看出，calls_num为数字型，经过转化后，f_calls_num变为因子型。Levels表示因子水平。这里还需要注意的一点是，R默认创建数据框时，将文本类型存储为因子型。...可以用注释部分代码实现相同的效果。删除多余因子水平在实际应用中，会出现实际取值范围小于因子水平。为了满足特定的运算或提升存储效率，可以使用droplevels()函数删除多余因子水平。

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R数据科学|第十一章内容介绍

使用forcats处理因子因子在 R 中用于处理分类变量。从历史上看，因子远比字符串更容易处理。因此，R 基础包中的很多函数都自动将字符串转换为因子。...library(tidyverse) library(forcats) 创建因子假设我们想要创建一个记录月份的变量： x1 <- c("Dec", "Apr", "Jan", "Mar") 使用字符串来记录月份有两个问题...要想创建一个因子，必须先创建一个有效列表： month_levels <- c( "Jan", "Feb", "Mar", "Apr", "May", "Jun", "Jul", "Aug", "Sep...", "Oct", "Nov", "Dec" ) 现在就可以创建因子了： y1 levels = month_levels) y1 #> [1] Dec Apr Jan Mar...在创建因子时，将水平设置为unique(x)，或者在创建因子后再对其使用fct_inorder()函数，也可以达到这个目的： f1 levels = unique(x1))

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R语言的数据结构与转换

任何数据分析的第一步都是按照所需要的格式创建数据集。在 R 中，这个任务包括两个步骤：首先选择一种数据结构来存储数据，然后将数据输入或者导入这个数据结构中。...下面介绍 R 中用于存储数据的多种数据结构。 R 的数据结构在大多数情况下，结构化的数据是一个由很多行和很多列组成的数据集。在 R 中，这种数据集被称为数据框。...名义型变量是没有顺序关系的分类变量，例如人的性别、血型、民族等。而有序型变量是有层级和顺序关系的分类变量，如患者的病情（较差、好转、很好）。名义型变量和有序型变量在 R 中称为因子（factor）。...因子在 R 中非常重要，它决定了数据的展示和分析方式。数据存储时因子经常以整数向量形式存储。所以在进行数据分析之前，经常需要将它们用函数 factor( ) 转换为因子。...因子的属性可以使用函数 levels( ) 查看： levels(sex.f) # 'Male''Female' 改变因子水平的排列顺序 → 改变参考组在统计模型中，对于因子型变量，R 会将其第一个水平当作参考组

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《Kaggle项目实战》泰坦尼克：从R开始数据挖掘(一)

恩，你也许会（自然而然的）觉得使用Excel有些尴尬，使用Python又有些难，那阅读本文是非常明智的。我将向您介绍一种免费且强大的统计编程语言R，并教会您如何用它进行预测分析。...本指南适用于毫无R编程经验、或者编程经验十分少的人。我不会讲解所有的语法，但当你看完本教程后，你也许想继续扩大视野。这里有一些更广泛的教程。假如你更想阅读书籍，我强烈推荐R语言编程艺术。...第一部分：R入门欢迎来到《泰坦尼克：从R开始数据挖掘》的第一部分，本部分将指导你完成R中的基本部分：加载数据并浏览数据。首先安装一个R，以及它的官方IDE：RStudio。...你可能会觉得预览与电子表格十分相似，二者的主要区别是你只能通过R编程语言与预览进行交互。你将看到数据列与我们之前在Kaggle下载页面看到的变量是一一对应的。以相同的方式导入test.csv数据集。...这非常接近我们从prop.table()函数的结果中预期的死亡率。下一课，我们将着眼于从其他可用变量中获得更多信息，从而提高模型准确性。第2部分的链接在此！

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基础知识 | R语言绘图基础之柱形图

R语言绘图基础之简单柱形图在视觉性吸引方面,人类绝对是动物界的另类。当一张一张数据分析的统计表摆在眼前时，人们并不能快速的洞察其中的关系。...01 创建数据框 #mydata数据框的创建，创建方式见往期文章基础知识 | R语言数据管理之变量创建。...#此处直接从mydata中提取子集，提取方式详见往期文章基础知识 | R语言数据管理之数据集取子集。...⚠️要实现X轴变量的降序，需要改变因子向量的水平顺序，一定要对表格或者因子向量排序后，再改变其水平顺序，才能使得X轴的类别顺序能够匹配Y轴变量的降序呈现。...mydata1$Citylevels=mydata1$City[order$ix]) #根据“Age”的排序结果设定因子向量的水平顺序。

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数据分析必备：掌握这个R语言基础包1%的功能让你事半功倍！（附代码）

这个包最重要的任务其实并不是进行数据导入，而是为编程和开发R包提供非常实用的工具函数。...比如，出发地origin后的3 levels就是表示其有3个因子水平。只是出发地是否属于因子类型的数据还有待商榷，而read.csv默认将所有的字符型数据都读成了因子型。数据中的实际观测值。...这里使用paste0来创建新的变量名称。paste0可以理解为胶水函数，用于将需要的字符串粘合在一起。这里演示的意思是创建6个以V开头，从V1到V6的字符串作为变量名。...下面只演示在导入数据的过程中，如何进行简单的默认值、空白预处理，代码如下： > flights_uneven 中Extract的一种，在R的使用过程中，这是必须掌握和理解的函数之一。编辑：王菁校对：林亦霖

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R语言入门 Chapter05 | 因子

——荀子这篇文章讲述的是R语言中关于数据框的相关知识。希望这篇R语言文章对您有所帮助！...如果您有想学习的知识或建议，可以给作者留言~ Chapter05 | 因子在R中名义型变量和有序性变量称为因子，factor。...这些分类变量的可能值称为一个水平，level，例如good，better，best，都称为一个leve。由这些水平值构成的向量就称为因子。...: blue green red # 有序性变量也可以作为因子 # 不定义levels时levels自动去重 > week <- factor(c("Mon","Fri","Thu","Wed","...4、cut()函数 cut函数可以将连续性变量x分割为n个水平的因子 > num <- c(1:100) > num [1] 1 2 3 4 5 6 7 8

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R语言教程(2)—— 数据结构

R中自带了大量的数据集供大家在学习中联系。在开始介绍数据结构之前，先简单介绍以下如何查看及使用这些数据集，之后在介绍数据结构时，也会大量使用到这些数据集。...R中的数据结构：向量、标量矩阵数组列表数据框因子时间序列 ······ 接下来我们将一一介绍这些对象的概念、以及如何创建、访问、修改并运算这些对象。...，之前搜索包的时候，包名需加引号，否则就会将字符串当作对象（变量或者函数）在R中搜索，就会提示找不到。...8因子因子这个概念对于学习R至关重要，这是统计学中比较常用的概念，在介绍因子之前，需要了解一下常用的变量分类：名义型变量（分类数据）有序性变量（顺序数据）连续型变量（数值型数据） 8.1 定义...因子，在R中名义型变量和有序型变量称为因子，factor。

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R语言实战.2

浏览器很卡顿，把我卡出去了，我没有拿到数据集在R中，对象（object）是指可以赋值给变量的任何事物，包括常量、数据结构、函数，甚至图形。...在同一个数据框中可以存储不同类型（如数值型、字符型）的变量。数据框将是你用来存储数据集的主要数据结构。因子（factor）是名义型变量或有序型变量。它们在R中被特殊地存储和处理。...类别（名义型）变量和有序类别（有序型）变量在R中称为因子（factor）。因子在R中非常重要，因为它决定了数据的分析方式以及如何进行视觉呈现。 ? ? ? $是用来选取一个变量时用的符号 ?...另外，针对此向量进行的任何分析都会将其作为有序型变量对待，并自动选择合适的统计方法。对于字符型向量，因子的水平默认依字母顺序创建。...数值型变量可以用levels和labels参数来编码成因子。

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R 程序与数据

2.R程序的分析结果上述已经提过， R 语言分析在一个名字为结果名的包中，想要知道结果，只要如果你想知道 Lg 的内容。直接再输入以下命令，就出来结果了。...也可以利用2.R数据的类型R数据的类型可以从两个角度进行分类，一种是根据数据值本身的特性，或者统计学上所说的变量值属性来进行判断;第二种角度，根据变量特性进行判断。...在R语言中分类变量我们称之为因子(factor)。主要包括:字符型变量;整数型变量:1、2;逻辑性变量。医学数据库最常见的分类变量类型是整数型变量。...4 3在f2数据集产生过程中，函数加了条件levels。...加levels的意思是，对里面因子1,2,3,4的排列顺序重新调整，在这个例子中，２这个—类别是放在最前面的，在以后统计分析中，作为对照组。

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一文总结R语言常用的数据结构！！！

以下是数据结构的分类及结合使用实例的详细解释。向量（Vector）向量是 R 中最基本的数据结构，用于存储一组相同类型的数据（数值型、字符型或逻辑型）,比如变量的取值范围、分类标签等。...R 中的多维同质数据结构，可以扩展到二维以上（矩阵是数组的特殊形式），适合存储和操作高维数据，比如图像处理中的像素值。...它存储离散的分类值，同时包含其可能的取值（levels），因子可以通过函数factor()创建。特点：用于存储分类变量；有序因子表示等级关系。...# 创建因子 factor_example <- factor(c("Low", "Medium", "High", "Low")) # 查看因子取值 levels(factor_example) #...，这些数据结构在程序中都是结合使用，要清楚掌握每个数据结构的特点，才能实现高效地数据预处理。

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数据分析必备：掌握这个R语言基础包1%的功能，你就很牛了

这个包最重要的任务其实并不是进行数据导入，而是为编程和开发R包提供非常实用的工具函数。...比如，出发地origin后的3 levels就是表示其有3个因子水平。只是出发地是否属于因子类型的数据还有待商榷，而read.csv默认将所有的字符型数据都读成了因子型。数据中的实际观测值。...这里使用paste0来创建新的变量名称。paste0可以理解为胶水函数，用于将需要的字符串粘合在一起。这里演示的意思是创建6个以V开头，从V1到V6的字符串作为变量名。...下面只演示在导入数据的过程中，如何进行简单的默认值、空白预处理，代码如下： > flights_uneven 中Extract的一种，在R的使用过程中，这是必须掌握和理解的函数之一。有话要说? Q: 你用过哪些R语言包？欢迎留言与大家分享

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【视频】主成分分析PCA降维方法和R语言分析葡萄酒可视化实例|数据分享

在本文中，我们将讨论如何通过使用 R编程语言使用主成分分析来减少数据维度分析葡萄酒数据。...自然，线上的点仍然比原始 2D 空间中的点更接近，因为您正在失去区分它们的维度。但在很多情况下，通过降维实现的简化超过了信息的损失，损失可以部分或全部重构。在我们之前的示例中，我们只有一个主成分。...原始特征通常显示出显着的冗余，这也是主成分分析在降维方面如此有效的主要原因。 R语言主成分分析（PCA）葡萄酒可视化：主成分得分散点图和载荷图我们将使用葡萄酒数据集进行主成分分析。...# 看一下数据 head(no) 输出转换和标准化数据对数转换和标准化，将所有变量设置在同一尺度上。...y, factr = f) # 用数据和因子创建数据框 ellipses <- dlply(edf, .

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【R语言】rep函数生成差异表达分组变量

前面给大家介绍了☞【R语言】rep函数的使用，今天我们来举几个数据分析中的应用，例如差异表达分析时，样本类型变量，我们就可以使用rep函数来生成。...c("normal","tumor","tumor","normal","tumor","normal","tumor") 方法二、巧用因子，事半功倍 ☞【R语言】R中的因子（factor） ☞【R语言...】因子在临床分组中的应用我们不用敲完整的样本类型名字，用数字来代替，然后再用factor转回来。...方法三、登堂入室，活学活用我们联合使用，strsplit函数+factor函数在方法二中，我们相当于还是要用c()先创建一个数值向量，逗号还是要敲的。...参考资料： ☞【R语言】rep函数的使用 ☞ GEO芯片数据差异表达分析 ☞【R语言】R中的因子（factor） ☞【R语言】因子在临床分组中的应用

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全网最全 | R语言中的方差分析汇总

数据来源这里，我们使用的数据来源于R包agridat，它是讲农业相关的论文，书籍中相关的数据收集在了一起，更加符合我们的背景。...「建模：」 Y变量：yield 因子：nf 「R中的建模代码：」 m1 = aov(yield ~ nf, data=dat) m1为模型保存的名称 aov为R中的方差分析代码 yield为数据中的...「建模：」 Y变量：yield 因子1：trt 因子2：period 区组：block 「R中的建模代码：」 m3 = aov(yield ~ block +trt +period, data=dat)...「建模：」 Y变量：yield 因子1：trt 因子2：period 区组：block 「R中的建模代码：」 m4 = aov(yield ~ block +trt*period, data=dat)...「建模：」 Y变量：yield 因子1：trt 因子2：period 因子3：cow 区组：block 「R中的建模代码：」 m5 = aov(yield ~ block + trt*period +

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