首页
学习
活动
专区
圈层
工具
发布

脚本分享——对fasta文件中的序列进行排序和重命名

小伙伴们大家下午好,我是小编豆豆,时光飞逝,不知不觉来南京工作已经一年了,从2018年参加工作至今,今年是我工作最快乐的一年,遇到一群志同道合的小伙伴,使我感觉太美好了。...今天是2022年的最后一天,小编在这里给大家分享一个好用的脚本,也希望各位小伙伴明年工作顺利,多发pepper。‍...pip install biopython pip install pandas 查看脚本参数 python Fasta_sort_renames.py -h 实战演练 # 只对fasta文件中的序列进行命令...python Fasta_sort_renames.py -a NC_001357.1.fna -p scoffold -s F -a rename_fasta.fna # 对fasta文件中序列根据序列长短进行排序...,并对排序后的文件进行重命名 python Fasta_sort_renames.py -a NC_001357.1.fna -p scoffold -s T -a rename_fasta.fna

6.6K30

怎样在 SQL 中对一个包含销售数据的表按照销售额进行降序排序?

在当今数字化商业的浪潮中,数据就是企业的宝贵资产。对于销售数据的有效管理和分析,能够为企业的决策提供关键的支持。而在 SQL 中,对销售数据按照销售额进行降序排序,是一项基础但极其重要的操作。...想象一下,您面前有一张庞大的销售数据表,其中记录了各种产品在不同时间、不同地点的销售情况。...如果能够快速、准确地按照销售额从高到低进行排序,那么您就能一眼看出哪些产品是销售的热门,哪些可能需要进一步的营销策略调整。 首先,让我们来了解一下基本的 SQL 语法。...在实际应用中,可能会有更复杂的需求。...无论是为了制定销售策略、评估市场表现,还是优化库存管理,都能从有序的数据中获取有价值的信息。 总之,SQL 中的排序操作虽然看似简单,但却蕴含着巨大的能量。

1.4K10
  • 您找到你想要的搜索结果了吗?
    是的
    没有找到

    MongoDB基础之BSON数据类型

    MongoDB在保留JSON基本的键值对特性的基础上,添加了其他一些数据类型。在不同的编程语言下这些类型的表示有些差异。...通常,在序列化和反序列化BSON时,每种编程语言的驱动程序都会从语言的字符串格式转换为UTF-8。可以轻松地将大多数国际字符存储在BSON字符串中。...4、Objects MongoDB对BSON对象的比较使用以下顺序: 1.按照键值对在BSON对象中出现的顺序递归比较它们。 2.比较关键字段名称。 3.如果关键字段名称相等,则比较字段值。...4.如果字段值相等,则比较下一个键/值对(返回步骤1)。没有下一个字段的对象小于有下一个字段的对象。 5、日期和时间戳 在3.0.0版本中进行了更改,将日期对象放在时间戳对象之前排序。...例如:{}和{a : null}进行比较,那么在比较的时候,a字段和空文档将视为等价的。 7、BinData MongoDB按BinData以下顺序排序: 首先,比较数据的长度或大小。

    10.1K30

    MongoDB基础之BSON数据类型

    MongoDB在保留JSON基本的键值对特性的基础上,添加了其他一些数据类型。在不同的编程语言下这些类型的表示有些差异。...通常,在序列化和反序列化BSON时,每种编程语言的驱动程序都会从语言的字符串格式转换为UTF-8。可以轻松地将大多数国际字符存储在BSON字符串中。...4、Objects MongoDB对BSON对象的比较使用以下顺序: 1.按照键值对在BSON对象中出现的顺序递归比较它们。 2.比较关键字段名称。 3.如果关键字段名称相等,则比较字段值。...4.如果字段值相等,则比较下一个键/值对(返回步骤1)。没有下一个字段的对象小于有下一个字段的对象。 5、日期和时间戳 在3.0.0版本中进行了更改,将日期对象放在时间戳对象之前排序。...例如:{}和{a : null}进行比较,那么在比较的时候,a字段和空文档将视为等价的。 7、BinData MongoDB按BinData以下顺序排序: 首先,比较数据的长度或大小。

    4.7K10

    关联式容器set和map

    一.容器 在C++中容器大致可以分为两种,分别是:序列式容器和关联式容器。...三. multiset multiset与set的不同就在于multiset允许键值冗余(可以存在相同的值),因此它只是简单的排序 但是因为multiset中会存在相同的值,所以有些接口在set中显得有些鸡肋...大部分情况插入键值都是使用make_pair map的迭代器和list的十分类似,都是通过在类中内嵌一个指针来实现的,所以这里在访问map中的元素时还可以使用->的访问方式(和list类似,这里其实调用了两次...insert 在之前的搜索树和set中因为不允许键值冗余所以插入的返回值就是一个bool值,这里却给了一个迭代器,文档中对返回值这样说:如果不存在这个元素,那么返回的迭代器是新插入的元素的迭代器...返回的答案应该按单词出现频率由高到低排序。如果不同的单词有相同出现频率, 按字典顺序 排序。

    29420

    Redis系列(一):Redis的五种基本数据类型操作命令操作实战应用场景

    在常见用途中,可以用户缓存json序列化的字符串、序列化对象或者二进制jpg图像。...命令 HSET hash-key sub-key1 value1:添加键值对 HGET hash-key key1:获取指定散列键的值 HGETALL hash-key:获取散列中包含的所有键值对 HDEL...每个 value都被赋予一个 score,代表这个 value 的排序权重,使得集合中的元素能够按score进行有序排列。ZSet通过哈希表实现的,所以添加,删除,查找的复杂度都是 O(1)。...zset 1 2 2 > zrange zset 0 -1 # 按 score 排序列出,参数区间为排名范围 1) "a" 2) "b" 3) "c" > zrevrange zset 0 -1 #...粉丝列表:score可以是关注时间,以关注时间进行排序 权重分配:可以用sorted set来做带权重的队列

    42510

    Java集合框架详解

    集合框架的主要目的是提供一种统一的方式来处理对象的集合,简化编程工作,提高代码的可读性和可维护性。核心接口Collection:最基本的集合接口,它是一个序列,可以包含重复的元素。...TreeSet:Set接口的实现,基于红黑树实现,可以按照自然顺序或自定义顺序对元素进行排序。HashMap:Map接口的实现,基于哈希表实现,不保证映射的顺序。...LinkedHashMap:继承自HashMap,内部使用链表维护键值对的插入顺序。TreeMap:Map接口的实现,基于红黑树实现,可以按照自然顺序或自定义顺序对键进行排序。...`Set` 接口的实现,它会按照元素的自然顺序进行排序。...: " + map.get("Java")); // 打印所有键值对(按自然顺序) System.out.println("所有键值对(按自然顺序):");

    13610

    JAVA常用API整理

    void remove() 删除上次访问的元素 Java库中具体集合 ArrayList 一种可以动态增长和缩减的索引序列 LinkedList 一种可以在任何位置进行高效插入和删除操作的有序序列...java.util.ProrityQueue 优先级队列中的元素可以按任意顺序插入,却总是按照排序的顺序进行检索。优先级队列由堆实现。...堆是一个可以自我调整的二叉树,对树执行添加和删除操作,可以让最小元素移动到根(最小堆),而不必花费时间对元素进行排序 4、Map接口 Map,图,是一种存储键值对映射的容器类,在Map中键可以是任意类型的对象...中元素既可以按照它们插入图的顺序排序,也可以按它们最后一次被访问的顺序排序。...在实际使用中,如果更新图时不需要保持图中元素的顺序,就使用HashMap,如果需要保持图中元素的插入顺序或者访问顺序,就使用LinkedHashMap,如果需要使图按照键值排序,就使用TreeMap。

    2.2K41

    List Set Map比较

    List按对象进入的顺序保存对象,不做排序或编辑操作。 Set对每个对象只接受一次,并使用自己内部的排序方法(通常,你只关心某个元素是否属于Set,而不关心它的顺序–否则应该使用List)。...LinkedHashSet : 具有HashSet的查询速度,且内部使用链表维护元素的顺序(插入的次序)。于是在使用迭代器遍历Set时,结果会按元素插入的次序显示。...HashMap使用了特殊的值,称为“散列码”(hash code),来取代对键的缓慢搜索。“散列码”是“相对唯一”用以代表对象的int值,它是通过将该对象的某些信息进行转换而生成的。...所有Java对象都能产生散列码,因为hashCode()是定义在基类Object中的方法。 HashMap就是使用对象的hashCode()进行快速查询的。此方法能够显著提高性能。...TreeMap : 基于红黑树数据结构的实现。查看“键”或“键值对”时,它们会被排序(次序由Comparabel或Comparator决定)。TreeMap的特点在于,你得到的结果是经过排序的。

    1.2K40

    Python 的数据结构

    一旦创建了元组,元组中的对象就不能修改了,但对于元组中的可变对象,可以在原位进行修改; 可以用加号运算符将元组串联起来; 元组乘以一个整数,像列表一样,会将几个元组的复制串联起来(对象本身并没有被复制,...对应于列表中每一项的键会被计算一次,然后在整个排序过程中使用。 默认值 None 表示直接对列表项排序而不计算一个单独的键值。...(value)进行排序: # 创建一个字典 dict_data = {'a': 15, 'ab': 6, 'bc': 16, 'da': 95} #对字典按值(value)进行排序(默认由小到大)...list 的 sort 方法返回的是对已经存在的列表进行操作(原地排序),而内建函数 sorted 方法返回的是一个新的 list,而不是在原来的基础上进行操作。...它更为常见的名字是哈希映射或关联数组。它是键值对的大小可变集合,键和键值都是 Python 对象。创建字典的方法之一是使用尖括号,用冒号分割键和键值。

    3.7K20

    再谈基数排序-分治思想:对比计数|基数|桶|堆|希尔|快速|归并

    基数排序,最先开始以为很复杂,其实就是正对正整数,先按照个位数大小对数组进行排序,再百位、千位、万位……基数排序概述基数排序 (Radix Sort) 其原理是将整数按位数切割成不同的数字,然后对每个位数上的数字进行分别比较...针对数组arr,计算arr[i]之前有多少个元素,则唯一确定了arr[i]在排序后数组中的位置。...基数排序:根据键值的每位数字来分配桶;一般用于长度相同的元素组成的数组。基数排序可以看做是进行多趟桶排序。...N是特定的,然后把数组的每一项数字num放到 num/[(max-min+1)/N]的桶中并对桶中数据排序,然后按桶序依次取数基数排序,比如三位以内的数组,那么,就 个位、十位、百位分组(逻辑桶),然后先百位对数据排序...把小于基准值的放在左边,大于基准值的放在右边。归并排序,对半分数组,排序,将已有序的子序列合并。即:对n个元素进行排序。分解为先对n/2,在对n/2个元素排序,最后合并的问题。

    49220

    JavaScript中一些鲜为人知的知识

    在JavaScript中,我们通常使用Map()来创建字典,但是有时我们希望字典的键值对在插入后能够按键进行排序。在这种情况下,Map()并不能满足我们的需求,但是对象却可以。...对象的排序机制在JavaScript中,对象是一种非常灵活的数据结构,我们可以用大括号{}创建一个对象。而当对象的键是数字且数字>= 0(非分数)时,JavaScript会自动按照升序对键进行排序。...但是,请注意,如果键是分数,JavaScript会将它们视为字符串,此时对象的排序会按照插入的顺序进行。...代码示例以下是一个JavaScript代码示例,生成一个包含随机值的对象,并通过Object.keys()和Object.values()获取键和值,最后按顺序输出:const list = {};const...Object.values(list);for (let i = 0; i 键值对的对象

    11600

    JavaScript 对象与 Hash 表

    遍历此链式数组,分别取出Key与给定的Key比较,若找到与给定key相等的Key,即在此hash表中存在此要查找的键值对,此后便可以对此键值对进行相关操作;若找不到,即为不存在此键值对...JavaScript 对象 Value 存储形式 在JavaScript高级程序设计(第三版)中,是这么描述属性的:属性在创建时都带有一些特征值,JavaScript引擎通过这些特征值来定义他们的行为。...在 JavaScript 中变量分为基本类型和引用类型(对象类型),分别对应着两种不同的存储方式–栈存储和堆存储。...而对象类型内存大小不固定,无法在栈中维护,所以 JavaScript 就把对象类型的变量放到堆中,让解释器为其按需分配内存,而通过对象的引用指针对其进行访问,因为对象在堆中的内存地址大小是固定的,因此可以将内存地址保存在栈内存的引用中...总结 在 JavaScript 中对象是以 Hash 结构存储的,用 键值对表示对象的属性,Key 的数据类型为字符串,Value 的数据类型是结构体,即对象是以 <String

    2.1K20

    2.Redis数据库基础数据类型介绍与使用

    1 Hash (哈希) 描述:hash 是一个键值(key=>value)对集合,是一个string类型的 field 和 value 的映射表,hash 特别适合用于存储对象,每个 hash 可以存储...2^32 -1键值对(40多亿)。...,且不允许重复的成员,集合是通过哈希表实现的; 不同的是每个元素都会关联一个double类型的分数 redis正是通过分数来为集合中的成员进行从小到大的排序 zset的成员是唯一的,但分数(score)...,分数从高到低排序 (17)ZREVRANK key member #返回有序集合中指定成员的排名,有序集成员按分数值递减(从大到小)排序 (18)ZSCORE key member #返回有序集中,...收到 EXEC 命令后进入事务执行,事务中任意命令执行失败,其余的命令依然被执行。 在事务执行过程,其他客户端提交的命令请求不会插入到事务执行命令序列中。

    90220

    【C++】关联式容器——map和set的使用

    关联式容器:也是用来存储数据的,与序列式容器不同的是,其里面存储的是结构的键值对,在数据检索时比序列式容器效率更高 ---- 二、键值对 用来表示具有一一对应关系的一种结构,...在内部,set中的元素总是按照其内部比较对象(类型比较)所指示的特定严格弱排序准则进行排序。...在map中,键值key通常用于排序和惟一地标识元素,而值value中存储与此键值key关联的内容。...在内部,map中的元素总是按照键值key进行比较排序的。...\4. map中通过键值访问单个元素的速度通常比unordered_map容器慢,但map允许根据顺序对元素进行直接迭代(即对map中的元素进行迭代时,可以得到一个有序的序列)。

    35230

    【自考】数据结构第六章查找,期末不挂科指南,第10篇

    作为一种数据结构,查找表的逻辑结构是集合,对查找表进行的操作包括 查找表中的某一元素,读取表中特定数据元素,插入和删除一个数据元素等。 若对查找表只进行前两项操作,则称此类查找表为 静态查找表。...但是查找长度与键值在顺序表中的位置有关,且差别很大。例如,若键值在顺序表的第n个位置上,则查找长度为1,而如果键值在顺序表的第1个位置上,查找长度为n。...基于上述内容引入一个新的概念,叫做“查找成功时的平均查找长度(记作ASL)” 它的定义是这样的:为找到数据元素在查找表中的位置,与给定值进行比较的键值个数的期望值。...$,C~i~表示在找第i个元素时,与给定值已进行比较的键值个数。...H及其对应的散列表L,则对每个数据元素X,函数值H(H.Key)就是X在散列表L中的存储位置,这个存储位置也称为散列地址。

    70920

    Python编程思想(16):压缩与排序列表

    在某些场景下,程序需要进行反向遍历,此时可通过 reversed函数,该函数可接收各种序列(元组、列表、区间等)参数,然后返回一个“反序排列”的迭代器,该函数对参数本身不会产生任何影响。...前面的文章提到过,字符串其实也是序列,因此也可通过该函数实现在不影响字符串本身的前提下,对字符串中的字符进行反序遍历,代码如下: s = 'hello, lining' result = [x for...'l', 'e', 'h'] 与 reversed函数类似的还有 sorted函数,该函数接收一个可迭代对象作为参数,返回一个对元素排序的列表,演示代码如下: a=[12,35,-3.2,5.3,91,3.61...5.3, 3.61, -3.2] 在调用 sorted函数时,还可传入一个key参数,该参数可指定一个函数来生成排序的关键值,比如希望根据字符串长度排序,则可为key参数传入len函数,代码如下:...'] 在这段代码中,result2使用了reverse参数,让c列表按字符串长度倒序排列。

    57120

    C++漫溯键值的长河:map && set

    在数据检索时比序列式容器效率更高 键对值中的 key 表示键值,value 表示与 key 对应的信息 SGI-STL中关于键值对的定义: template struct...元素总是 const ),但是可以从容器中插入或删除它们 在内部,set 中的元素总是按照其内部比较对象(类型比较)所指示的特定严格弱排序准则进行排序 set 容器通过 key 访问单个元素的速度通常比...中的元素可以重复,set 是中 value 是唯一的 使用迭代器对 multiset 中的元素进行遍历,可以得到有序的序列 multiset 中的元素不能修改 在 multiset 中找某个元素,时间复杂度为...key, T>value_type 在内部,map 中的元素总是按照键值 key 进行比较排序的 map 中通过键值访问单个元素的速度通常比 unordered_map 容器慢,但 map 允许根据顺序对元素进行直接迭代... value_type; 在内部,multimap 中的元素总是通过其内部比较对象,按照指定的特定严格弱排序标准对 key 进行排序的。

    14800
    领券