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    Python在生物信息学中的应用:在字节串上执行文本操作

    如何在字节串(Byte String)上执行常见的文本操作(例如,拆分、搜索和替换)。 解决方案 字节串支持大多数和文本字符串一样的内置操作。...>>> re.split(b'[:,]',data) # Notice: pattern as bytes [b'FOO', b'BAR', b'SPAM'] >>> 讨论 大多数情况下,几乎所有能在文本字符串上执行的操作都可以在字节串上进行...另外,字节串并没有提供一个美观的字符串表示,因此打印结果并不美观,除非首先将其解码为字符串。....' >>> print(s.decode('ascii')) Hello World >>> 最后总结一下,通常来说,如果要同文本打交道,在程序中使用普通的文本字符串就好,不要使用字节串。...参考 《Python Cookbook》第三版 http://python3-cookbook.readthedocs.org/zh_CN/latest/

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    五分钟入门Python自然语言处理(一)

    NLTK是Python的自然语言处理工具包,在NLP领域中,最常使用的一个Python库。 什么是NLP? 简单来说,自然语言处理(NLP)就是开发能够理解人类语言的应用程序或服务。...下一步,将文本转换为tokens,像这样: ? 统计词频 text已经处理完毕了,现在使用Python NLTK统计token的频率分布。 可以通过调用NLTK中的FreqDist()方法实现: ?...处理停用词 NLTK自带了许多种语言的停用词列表,如果你获取英文停用词: ? 现在,修改下代码,在绘图之前清除一些无效的token: ? 最终的代码应该是这样的: ?...文本没有Tokenize之前是无法处理的,所以对文本进行Tokenize非常重要的。token化过程意味着将大的部件分割为小部件。...这是你可能会想,这也太简单了,不需要使用NLTK的tokenizer都可以,直接使用正则表达式来拆分句子就行,因为每个句子都有标点和空格。 那么再来看下面的文本: ?

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    Python NLP 入门教程

    本文简要介绍Python自然语言处理(NLP),使用Python的NLTK库。NLTK是Python的自然语言处理工具包,在NLP领域中,最常使用的一个Python库。 什么是NLP?...处理停用词 NLTK自带了许多种语言的停用词列表,如果你获取英文停用词: 现在,修改下代码,在绘图之前清除一些无效的token: 最终的代码应该是这样的: 现在再做一次词频统计图,效果会比之前好些,...文本没有Tokenize之前是无法处理的,所以对文本进行Tokenize非常重要的。token化过程意味着将大的部件分割为小部件。...因为每个句子都有标点和空格。...在此NLP教程中讨论的所有步骤都只是文本预处理。在以后的文章中,将会使用Python NLTK来实现文本分析。 我已经尽量使文章通俗易懂。希望能对你有所帮助。

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    Python数据容器:集合

    前言在 Python 中,数据容器是组织和管理数据的重要工具,集合作为其中一种基本的数据结构,具有独特的特性和广泛的应用。本章详细介绍了集合的定义、常用操作以及遍历方法。...移除元素后结果为{'C', 'B'}③随机取出元素:从集合中随机取出一个元素,得到一个元素的结果,同时集合本身被修改,元素被移除。...', 'best',请按如下要求操作:1.定义一个空集合2.通过for循环遍历列表3.在for循环中将列表的元素添加至集合4.最终得到元素去重后的集合对象,并打印输出my_list = ['新闻', '...in my_list: # 在for循坏中将列表元素添加至集合 my_set.add(element)print(f"列表的内容为{my_list}")print(f"通过for循坏得到的集合为...{my_set}")输出结果:列表的内容为'新闻', '传播', '新闻', '传播', 'Hi', 'Python', 'Hi', 'Python', 'best'通过for循坏得到的集合为{'Hi'

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    精品教学案例 | 基于TextRank的新闻摘要(Python实现)

    M[i][j] 初始化为 1/所有网页数量 在我们的例子中,矩阵 M 被初始化为: 最后,矩阵中的元素将会根据算法在不断的迭代中得到更新,从而得到页面排序 2.2 TextRank算法 在大致了解PageRank...我们感兴趣的是文章的文本内容。可以将一些文本打印出来,看看它们是怎样的。 df['article_text'][0] 现在我们有两个选择:为每篇文档单独创建一篇摘要,或者为所有文章创建一篇摘要。...我们也可以用词袋模型或者TF-IDF方法来为句子构建特征向量,但是这些方法忽略了句子中单词的顺序,而且这样的特征向量通常维数过高。...nltk.download('stopwords') from nltk.corpus import stopwords stop_words = stopwords.words('english') 我们先定义一个清除句子中停用词的方法...4.7 句子的向量表示 我们先取出句子中单词对应的词向量,每个词向量的维度是100维,将它们相加再取平均,得到的向量就用来表示这个句子。

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    python内存管理与垃圾回收

    内存管理与垃圾回收 内存管理 python官方文档-内存管理 我们在python还是需要尽量避免手动管理内存,应该交给python自动管理。...标记-清除 我们来举个例子说明标记-清除的原理。对于数值,字符串是不存在循环引用的。循环引用只会出现在容器对象中。...关于标记-清除的更多信息参考:https://zhuanlan.zhihu.com/p/51095294 分代回收 对标记清除中的链表进行优化,将那些可能存在循引用的对象拆分到3个链表,链表称为:0/1.../2三代,每代都可以存储对象和阈值,当达到阈值时,就会对相应的链表中的每个对象做一次扫描,除循环引用各自减1并且销毁引用计数器为0的对象。...引用计数器为0时,不会真正销毁对象,而是将他放到一个名为 free_list 的链表中,之后会再创建对象时不会在重新开辟内存,而是在free_list中将之前的对象来并重置内部的值来使用。

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    Python循环怎么给enumerate和for做对比

    在Python编程中,循环是一项常见的任务,而for循环是最常见的一种。然而,Python提供了enumerate函数,它允许在迭代过程中访问元素的同时获得它们的索引。...它的基本语法如下:python复制代码for element in collection: # 在此处处理元素for循环遍历集合中的元素,对每个元素执行相同的操作。...fruits列表中的元素,并将每个水果打印到控制台。...: {index}, Fruit: {fruit}")在上面的示例中,enumerate函数将每个水果的索引和元素组合成一个元组,并将它们打印到控制台。...for循循环的语法更简单,不涉及元组的解包,而enumerate需要在循环中使用元组解包。适用场景使用for循环当只关心元素本身,而不需要索引信息。这在简单的遍历任务中很有用。

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    6个实例,8段代码,详解Python中的for循环

    你可以通过在print语句的后面添加逗号“,”将输出限制在同一行显示(如果指定打印的字符很多,则会“换行”),代码如下所示: 当你希望通过一行而不是多行显示文本中的内容时,可以使用上述形式的代码。...它的输出如下所示: 04 在for循环中使用split()函数 Python 支持各种便捷的字符串操作相关函数,包括split()函数和join()函数。...在需要将一行文本分词化(即“分割”)为单词,然后使用for循环遍历这些单词时,split()函数非常有用。 join()函数与split()函数相反,它将两个或多个单词“连接”为一行。...通过使用split()函数,你可以轻松地删除句子中多余的空格,然后调用join()函数,使文本行中每个单词之间只有一个空格。 1....在每个循环中当wordCount是偶数的时候就输出一次换行,这样每打印两个连续的单词之后就换行。清单5 的输出如下所示: 3.

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    关于“Python”的核心知识点整理大全6

    例如,在游戏中,可能需要 将每个界面元素平移相同的距离;对于包含数字的列表,可能需要对每个元素执行相同的统计运 算;在网站中,可能需要显示文章列表中的每个标题。...使用单数和复数式名称, 可帮助你判断代码段处理的是单个列表元素还是整个列表。 4.1.2 在 for 循环中执行更多的操作 在for循环中,可对每个元素执行任何操作。...在for循环中,想包含多少行代码都可以。在代码行for magician in magicians后面,每个 缩进的代码行都是循环的一部分,且将针对列表中的每个值都执行一次。...在for循环中,想包含多少行代码都可以。实际上,你会发现使用for循环对每个元素执行众 多不同的操作很有用。 4.1.3 在 for 循环结束后执行一些操作 for循环结束后再怎么做呢?...例如,你可能使用for循 环来初始化游戏——遍历角色列表,将每个角色都显示到屏幕上;再在循环后面添加一个不缩进 的代码块,在屏幕上绘制所有角色后显示一个Play Now按钮。

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    Python NLP入门教程

    目录[-] 本文简要介绍Python自然语言处理(NLP),使用Python的NLTK库。NLTK是Python的自然语言处理工具包,在NLP领域中,最常使用的一个Python库。...,修改下代码,在绘图之前清除一些无效的token: clean_tokens = list() sr = stopwords.words('english') for token in tokens:...文本没有Tokenize之前是无法处理的,所以对文本进行Tokenize非常重要的。token化过程意味着将大的部件分割为小部件。...这是你可能会想,这也太简单了,不需要使用NLTK的tokenizer都可以,直接使用正则表达式来拆分句子就行,因为每个句子都有标点和空格。 那么再来看下面的文本: Hello Mr....在此NLP教程中讨论的所有步骤都只是文本预处理。在以后的文章中,将会使用Python NLTK来实现文本分析。 我已经尽量使文章通俗易懂。希望能对你有所帮助。

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    异步,同步,阻塞,非阻塞程序的实现

    线程在同步调用下,也能非阻塞(同步轮循非阻塞函数的状态),在异步下,也能阻塞(调用一个阻塞函数,然后在函数中调用回调,虽然没有什么意义)。 下面,我会慢慢实现一个异步非阻塞的sleep。...最后利用Python的特性,将callback调用方式改为yield的伪同步调用。...tasks.append([gen2,timer2]) while tasks: for task in tasks: try: next(task[1]) # 不断的轮循每个生成器关连的...上面的代码中,在一个while循环中轮循timer的状态。由于timer存在于wait中。所以需要把timer“提取”出来。...由于my_sleep在新线程中执行,所以它不会阻塞住主线程。 在my_sleep结束时,调用回调函数。使得任务继续进行。 也就是说,在每个要处理阻塞的地方,都人为的把函数切成三个部分: 1.

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    Python NLP入门教程

    本文简要介绍Python自然语言处理(NLP),使用Python的NLTK库。NLTK是Python的自然语言处理工具包,在NLP领域中,最常使用的一个Python库。 什么是NLP?...,修改下代码,在绘图之前清除一些无效的token: clean_tokens = list() sr = stopwords.words('english') for token in tokens:...文本没有Tokenize之前是无法处理的,所以对文本进行Tokenize非常重要的。token化过程意味着将大的部件分割为小部件。...这是你可能会想,这也太简单了,不需要使用NLTK的tokenizer都可以,直接使用正则表达式来拆分句子就行,因为每个句子都有标点和空格。 那么再来看下面的文本: Hello Mr....在此NLP教程中讨论的所有步骤都只是文本预处理。在以后的文章中,将会使用Python NLTK来实现文本分析。 我已经尽量使文章通俗易懂。希望能对你有所帮助。 END.

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    GPT-2生成《神奇宝贝》动漫台词

    爬虫位于crawler_bulbapedia.py文件上,运行时将创建一个名为data / pokeCorpusBulba的文件夹,它将每个情节存储在单独的文本文件中。 尚未准备好将数据提供给模型。...另一个名为prepare_corpus.py的脚本将清除文本并将它们全部合并到一个名为train.txt的文件中,准备与GPT-2一起使用。...基本上,语言模型会尝试从句子中预测下一个单词,可以继续从模型中获取预测以生成新文本,将最后的预测作为新输入来获取越来越多的单词。...在Internet上为该模型提供推论并不是一件容易的事,因为文本生成非常占用内存。 基本上,服务器结构会回答指向端口5000的GET请求。...Gabriela Melo的图表 WSGI协议的目的是为使用Python编写的Web应用程序创建通用接口。

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    Transformer模型训练教程02

    使用Python的NLTK或SpaCy等库,可以进行文本tokenize。然后过滤语料,移除过长和过短的句子。随后构建词表,一般限制词表大小在5万以内,对生僻词使用"UNK"表示。...将文本转化为词表索引的序列,统一句子长度为固定值,短句后补PAD,长句截断。为了训练,我们生成输入序列和目标序列,输入SHIFT右移一个位置。这样就得到了Transformer的训练样本。...二、环境配置Transformer依赖较新的深度学习框架,这里我们使用TensorFlow 2.x版本。可以在GPU服务器或笔记本上安装,也可以使用云服务中的GPU资源。...前馈网络通常是两个Dense层的堆叠。最后用Add和LayerNormalization连接起来。在模型编译时,需要准备Mask遮蔽和位置编码层。还要定义自定义的训练损失为稀疏分类交叉熵。...在训练循环中,从tf.data队列中按批次读取数据,采用teacher forcing方式。将模型输出与目标计算交叉熵损失。

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    Python NLP快速入门教程

    NLTK是Python的自然语言处理工具包,在NLP领域中,最常使用的一个Python库。 什么是NLP? 简单来说,自然语言处理(NLP)就是开发能够理解人类语言的应用程序或服务。...,修改下代码,在绘图之前清除一些无效的token: 1clean_tokens = list() 2sr = stopwords.words('english') 3for token in tokens...文本没有Tokenize之前是无法处理的,所以对文本进行Tokenize非常重要的。token化过程意味着将大的部件分割为小部件。...这是你可能会想,这也太简单了,不需要使用NLTK的tokenizer都可以,直接使用正则表达式来拆分句子就行,因为每个句子都有标点和空格。 那么再来看下面的文本: 1Hello Mr....在此NLP教程中讨论的所有步骤都只是文本预处理。在以后的文章中,将会使用Python NLTK来实现文本分析。 完毕。 ----

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