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基因组选择和SNP分析在ASREML-SA中的实现方法

基因组选择在育种中的应用, 其基础是常规的系谱动物模型, 动物模型也可以很复杂, 看一下asreml的说明书就知道了, 有300多页, 据我了解, 其厚度可以用这个公式表示: ?...这个教程是asreml在基因组选择和分子育种中的应用, 下面是我的读书笔记....简介 这篇文档的主要目标是介绍ASReml在基因组分析中的实现方法, 它假定读者有一定的统计基础....相关的R包, 参考wgaim包 在下一章节中, 我们将对GS的延伸方法: Fast Bayes A进行介绍. 4, 基因组选择的其它方法 EM BayesA-like方法, 参考 Sun et al....PEV会给出标记的标准误, 结果不可靠 基因型的GBLUP在.sln中, mark的效应在.mef中, 标记的权重(weight)在.mef中, 大效应的标记在.res文件中. 6, asreml基因组选择考虑

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60 种常用可视化图表,该怎么用?

适合用来快速检视数据集中不同类别的分布和比例,并与其他数据集的分布和比例进行比较,让人更容易找出当中模式。...这种图表是直方图的变种,使用平滑曲线来绘制数值水平,从而得出更平滑的分布,并且它们不受所使用分组数量的影响,所以能更好地界定分布形状 。...在量化波形图中,每个波浪的形状大小都与每个类别中的数值成比例。与波形图平行流动的轴用作时间刻度。我们也可以用不同颜色区分每个类别,或者通过改变色彩来显示每个类别的附加定量值。...在每个流程阶段中,流向箭头或线可以组合在一起,或者往不同路径各自分开。我们可用不同颜色来区分图表中的不同类别,或表示从一个阶段到另一个阶段的转换。...卡吉图 卡吉图 (Kagi Chart)能通过一系列线段显示价格表现,进而显示特定资产的一般供需水平。由于与时间无直接关系,它能更清晰地显示重要的价格走势。

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    常用60类图表使用场景、制作工具推荐!

    适合用来快速检视数据集中不同类别的分布和比例,并与其他数据集的分布和比例进行比较,让人更容易找出当中模式。...这种图表是直方图的变种,使用平滑曲线来绘制数值水平,从而得出更平滑的分布,并且它们不受所使用分组数量的影响,所以能更好地界定分布形状 。...在量化波形图中,每个波浪的形状大小都与每个类别中的数值成比例。与波形图平行流动的轴用作时间刻度。我们也可以用不同颜色区分每个类别,或者通过改变色彩来显示每个类别的附加定量值。...在每个流程阶段中,流向箭头或线可以组合在一起,或者往不同路径各自分开。我们可用不同颜色来区分图表中的不同类别,或表示从一个阶段到另一个阶段的转换。...卡吉图 卡吉图 (Kagi Chart)能通过一系列线段显示价格表现,进而显示特定资产的一般供需水平。由于与时间无直接关系,它能更清晰地显示重要的价格走势。

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    可视化图表样式使用大全

    适合用来快速检视数据集中不同类别的分布和比例,并与其他数据集的分布和比例进行比较,让人更容易找出当中模式。 点数图 ?...这种图表是直方图的变种,使用平滑曲线来绘制数值水平,从而得出更平滑的分布,并且它们不受所使用分组数量的影响,所以能更好地界定分布形状 。...在量化波形图中,每个波浪的形状大小都与每个类别中的数值成比例。与波形图平行流动的轴用作时间刻度。我们也可以用不同颜色区分每个类别,或者通过改变色彩来显示每个类别的附加定量值。...在每个流程阶段中,流向箭头或线可以组合在一起,或者往不同路径各自分开。我们可用不同颜色来区分图表中的不同类别,或表示从一个阶段到另一个阶段的转换。...卡吉图 (Kagi Chart)能通过一系列线段显示价格表现,进而显示特定资产的一般供需水平。由于与时间无直接关系,它能更清晰地显示重要的价格走势。

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    60种常用可视化图表的使用场景——(下)

    通过利用定位和比例,气泡图通常用来比较和显示已标记/已分类的圆圈之间的关系。...我们在地图上每个区域以不同深浅度的颜色表示数据变量,例如从一种颜色渐变成另一种颜色、单色调渐进、从透明到不透明、从光到暗,甚至动用整个色谱。 但缺点是无法准确读取或比较地图中的数值。...45、卡吉图 卡吉图 (Kagi Chart)能通过一系列线段显示价格表现,进而显示特定资产的一般供需水平。由于与时间无直接关系,它能更清晰地显示重要的价格走势。...在绘制记数符号图表时,将类别、数值或间隔放置在同一个轴或列(通常为 Y 轴或左侧第一列)上。每当出现数值时,在相应的列或行中添加记数符号。...在词云图上使用颜色通常都是毫无意义的,主要是为了美观,但我们可以用颜色对单词进行分类。

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    60种常用可视化图表的使用场景——(上)

    适合用来快速检视数据集中不同类别的分布和比例,并与其他数据集的分布和比例进行比较,让人更容易找出当中模式。...这种图表是直方图的变种,使用平滑曲线来绘制数值水平,从而得出更平滑的分布,并且它们不受所使用分组数量的影响,所以能更好地界定分布形状 。...在量化波形图中,每个波浪的形状大小都与每个类别中的数值成比例。与波形图平行流动的轴用作时间刻度。我们也可以用不同颜色区分每个类别,或者通过改变色彩来显示每个类别的附加定量值。...在每个流程阶段中,流向箭头或线可以组合在一起,或者往不同路径各自分开。我们可用不同颜色来区分图表中的不同类别,或表示从一个阶段到另一个阶段的转换。...虽然圆堆积看起来漂亮,但不及树形结构图般节省空间(因为圆圈内会有很多空白处),可是它实际上比树形结构图更能有效显示层次结构。 推荐的制作工具有:D3、D3 Zoomable、RAWGraphs。

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    你的气象图何必如此枯燥

    Living Atlas of the World 中提供的许多实时天气资源都提供了自定义数据显示的功能。关键是在服务层选项中寻找更改样式图标,同时探索每个层的属性表。 ?...图层被复制,一个箭头符号被放置在圆形图层的顶部。 使用相同的属性映射(除了将圆圈交换为箭头)可确保两个图层将均匀缩放。 根据风源(度)属性,使用旋转符号选项旋转箭头。...由于圆圈和箭头都是根据风速缩放的,因此地图中的风区略有不同。 还有一些标签指示使用可见范围选项放大时出现的温度、湿度和风速。使用不同的标签偏移选项,以便它们堆叠。...对活跃飓风进行分类 目前太平洋和大西洋有三个活跃的气旋,所以我们也可以从活跃的飓风层中获得一些乐趣。经历了许多飓风(和疏散)后,我喜欢清晰定义风暴强度的飓风预报图。...一般的最佳做法是在深色底图上以高亮度颜色值使用高强度数据值(例如大雨),在浅色底图上使用低亮度以提供最大对比度。

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    你的气象图何必如此枯燥

    Living Atlas of the World 中提供的许多实时天气资源都提供了自定义数据显示的功能。关键是在服务层选项中寻找更改样式图标,同时探索每个层的属性表。...图层被复制,一个箭头符号被放置在圆形图层的顶部。  使用相同的属性映射(除了将圆圈交换为箭头)可确保两个图层将均匀缩放。 根据风源(度)属性,使用旋转符号选项旋转箭头。...由于圆圈和箭头都是根据风速缩放的,因此地图中的风区略有不同。 还有一些标签指示使用可见范围选项放大时出现的温度、湿度和风速。使用不同的标签偏移选项,以便它们堆叠。 ...对活跃飓风进行分类 目前太平洋和大西洋有三个活跃的气旋,所以我们也可以从活跃的飓风层中获得一些乐趣。经历了许多飓风(和疏散)后,我喜欢清晰定义风暴强度的飓风预报图。...一般的最佳做法是在深色底图上以高亮度颜色值使用高强度数据值(例如大雨),在浅色底图上使用低亮度以提供最大对比度。

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    12月的音乐可视化笔记:我从TOP2000歌曲中,分析了这几年流行音乐的变化趋势

    所以我开始在两张榜单中搜索部分匹配的歌曲,只要这首歌曲名和歌手名的所有单词都能被另一张榜单的某一项包含即可。这种方法帮助我又匹配了10%的歌曲。 随后是不好判断的部分。...因此我抓取了所有年份的列表,然后像Top40那样处理了一遍。这个方法匹配了8%左右我确定是在Top40中从未出现的歌曲(但是它们曾经在扩充列表中被提到过)。...起初,我用歌曲在TOP 40榜单的最高排名生成圈圈的大小,用他们在TOP 2000的排名来分配颜色。但是,却生成了大量几乎相同大小的浅灰色圆圈(请看下图),这看起来并不是很漂亮。...然后我把图片旋转25度角使其看起来效果更好,并且放上了注释(使用网络线来对齐行和列)。...是以重叠还是分开的形式? 最后我选择了4个简单的直方图分开展示过去18年里四个时期的数据,为了让这4个图更容易比较,我添加了平滑密度曲线。

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    医学绘图软件Prism中文版软件下载,GraphPad Prism9.3下载安装

    相信它一定会成为你工作中不可或缺的好帮手,帮助你更好地完成数据分析和可视化的任务。 GraphPad Prism 9 核心新功能详解 1. 更高维度的数据!...选择一些要从分析中排除的变量只会丢掉可能有用的信息!PCA就是这样一种“降低维度”的技术,可以用它来减少所需变量的数量,但同时从数据中消除尽可能少的信息。...Prism 9的PCA还包括以下其他功能: 通过平行分析(以及Kaiser方法,总方差阈值方法等)来选择成分。...但是,现在该符号的颜色是连续的,其代表该国家每1000个人的出生率。Prism现在还具有内置的半透明配色方案,以便可以更清晰地看到重叠的符号。 4. 自动将多个比较结果添加到图形中 这就是你想要的!...使用估计图更好地可视化T检验结果 执行t检验时,Prism现在会自动创建分析结果的估计图(Estimation Plots )。在此图上,两组的原始数据都将绘制在左侧的Y轴上。

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    教你在Tableau中绘制蝌蚪图等带有空心圆的图表(多链接)

    我之前遇到过这种情况并且多年来尝试过各种方法,所以我会分享自己一些的尝试和简单的解决方法,用于在Tableau中使用空白圆绘制蝌蚪图等图表。...那么我们如何在Tableau中创建一个相似的图表,并使得空白圆圈里面保持白色(或者任何背景颜色)呢? 不好用的方法 在我介绍解决方案前,我将分享一些自己不太成功的尝试。...那么为什么不创建一个有白色圆心的圆圈在PNG文件里呢?这样做的问题是,当Tableau对保存为具有透明背景的PNG文件中的自定义图形上的颜色编码时,它会改变白色中心的颜色,最后会出现彩色的圆点。...再有就是自定义图形极低的分辨率会使你无法在PDF 或图像中以高分辨率打印或导出它们。 那么如何更改数据?我们可以通过计算来缩短这些线。...以下是Mark的工作簿中建立蝌蚪图的步骤: 移动序列到行 移动销售线到列 移动销售圈到列 右键点击销售圈并选择“双轴” 右键点击第二个y轴并选择“同步轴” 选择所有的标记卡,并移动类别到颜色 在销售线标记卡上

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    R如何与Tableau集成分步指南

    虽然折线图能够显示每个细分市场之间的销售差异,但凹凸图(在上图中)给出了更清晰和简明的相同结果图。 现在让我们尝试自己创建一个: 首先,我们需要根据我们想要对我们的维度进行排名的方式来考虑度量。...现在将订单日期拖到列中并将格式更改为月。在标记窗格中将段拖动到颜色。最后将排名拖到行。 在你现在可以看到的图表中,排名是根据月份数量分配的。但是,我们需要他们在细分市场的基础上。...您会在商标窗格中看到排名和排名(2)?我们将使用这些来创建带圆圈的标签。 要将上述内容转换为双轴图表,请右键单击第二个图表的等级轴并选择双轴。...利润中的负值将向下延伸,而正值则会向上延伸。 图表中每个小条的长度表示利润从一个月到下一个月的变化量。 最后,将利润拖到颜色: ? 您可以继续前进,将颜色更改为两步变化,并清楚地查看上升和下降: ?...2.在Tableau中引入R编程 R的引入使得可以实现更丰富和动态的可视化,这是主要特征之一。R可与Tableau一起用于聚类,预测和预测等技术。

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    2022最简单的教程来咯「建议收藏」

    大家好,又见面了,我是你们的朋友全栈君。 在视频模板的制作过程中我们是有机会用到手机解锁的动效的,AE怎么制作手机解锁动效呢?...今天就来跟大家分享一波BeardChicken大神制作的极具炫酷以及科技感的手机解 AE制作手机解锁动效教程 1.在绘图软件中画好背景、指纹图标以及指纹上方的圆圈,将其导入到AE中,指纹和圆圈生成合成....选择指纹图层,调整[不透明度],K帧,然后再即将结束的位置K帧,不透明度数值调整为0; 4.选择圆圈图层,下拉找到[内容]-[椭圆形]-[椭圆路径],[大小]在0s处K帧,后面放大K帧; 5....[描边宽度]K帧,0s处数值为[0],后面为[2],最后为[0]; 6.圆圈图层添加[摆动路径],[大小]参数在0s处K帧,再往后调大K帧。[详细信息]调整为[1],[点]更改为[平滑]。...“转换控制”窗格],模式选择[相加]; 9.合成图层添加[发光]效果,[颜色A]调整为白色,[颜色B]调整为蓝色,降低[发光阈值],增加[发光半径]和[发光强度]。

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    「数据可视化库王者」D3.js 极速上手到Vue应用

    我们将把 D3和 Vue结合在一起 - 使用 Vue的动态数据绑定,清晰的语法和模块化结构,可以充分发挥 D3的最佳性能。 ? 根据广泛定义,D3可拆分为以下几种分库: ?...用于数据可视化的 D3,其核心在于使用绘图指令装饰数据,从源数据创建新的可绘制数据,生成 SVG路径以及从数据和方法在 DOM中创建数据可视化元素(如轴)的功能。 ?...有许多用于管理DOM的工具,所有这些工具都可以在 D3中集成数据可视化功能。这也是 D3能与 Vue无缝结合的原因之一。 于此,我们不需要从 D3 DOM操作功能开始学起,直接通过实例来入门 D3。...选择和操作 ? 你需要学习的第一件事是如何使用D3.js选择和操作DOM元素。该库在操作DOM方面实际上非常强大,因此理论上可以将其用作 jQuery的替代品。以下代码请逐行添加运行。...D3中有各种比例尺函数,有连续性的,有非连续性的,在本例子中,你将学到 d3.scaleLinear() ,线性比例尺。

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    使用这些不太常用的 CSS 属性,让我在前端布局效率上,又提高了一个层次!

    如果和::before具有相同的颜色,那么小圆圈默认颜色就是 li 的颜色,因此根本不需要伪元素。...我们来看一种更好的方法: li { color: #222; } li::marker { color: #ccc; } 比起上面伪类的方式,这简直不要太爽!...CSS 的columns 属性是一种布局方法,可以将元素划分为列。 一个常见的用例是将段落文本内容分为两行。 但是,最不常见的是我们可以在列之间添加边框。...通过使用object-fit:contain,我可以控制徽标的width和height,并强制将图像包含在定义的宽度和高度中。??...更好的是,我们可以将以上内容包装在@supports中,以避免在不支持对象适配的浏览器中拉伸徽标图像。

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    Photoshop软件应用项目(一)

    2.打开杯子特效图形 在杯子打开的时候,我们可以做一个特效,就是那种有东西冒出来的感觉,可以用空心圆空心几何型,做出来,当然你的这个,要么真的空心,要么和背景颜色一致,然后叫他们摆出一个造型,就可以转为智能对象了...如果你是用,钢笔工具形状绘制的话,可能中间会有白色,这个时候可以用第二种方法 ctrl,左键这个图层,形成这个图层所有元素的选区,新建一个图层,用画笔工具,调整硬边缘硬度为 100%,随意用什么颜色...,只要能和边缘深绿色的圆圈轮廓区分开就行,按住 alt,鼠标右键拖动,调整画笔大小,下图红圈就是画笔的大小,随着你的拖动画笔大小会更改,当它完全贴合里面白色圆圈时,你就可以给他左键绘制一个同样大小的实心圆...,将这五个圆圈都处理过后,在你相见图层上 ctrl,单击一下,形成这个图层所有元素的选区,有了里面的选区后,再次转化为下面有圈圈描边的图层,按 ctrl+X 剪切,剪切的就是这个图层中白色圆圈的形状。...这个方法的原理是,用同样大小的颜色覆盖,你所需要,剪切的地方,利用单击图层形成选取这一特点,形成一个选区,再切换回原来的图层进行剪切,最后,删除用来辅助的那个图层。

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    亲手养成一只自己的动漫主播!单张头像生成动画,可指定姿态或真人视频迁移

    同时,还可以观察到,由于感知损失,PU-P产生了更清晰的图像,这和Park等人所观察到的结果如出一辙。 ? 另一方面,ZH-L1和ZH-P在直接从输入图像复制像素时会产生非常清晰的结果。...因此,与仅使用一种途径的图像相比,完整的配置产生更好的图像。但是,被遮挡部分的输出仍然模糊。下图显示,在4种完整配置中,FU-PP产生了最清晰的结果。...嘴巴在第0帧完全张开,在第30帧完全闭合。在最下面一排,我尝试重新画嘴,以增加嘴和周围皮肤的对比。它的结果是更好的嘴闭合,这意味着脸的形状已经过度适合高对比度的嘴和皮肤颜色。...脸部变形修改图像的区域不能与周围的像素平滑地混合。它们可以被看作是闭着的眼睛和嘴巴周围的圆圈,颜色比周围的皮肤略深。...使用新的训练数据集训练的面部形态设法在不引入黑眼圈的情况下闭上眼睛和嘴巴。 (a)面部变形,在恒定的环境光下进行渲染训练,往往会在闭上的眼睛和嘴巴周围产生深色的圆圈。

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    sparklines迷你图系列4——Evolution(Area)

    今天接着分享Evolution图表类型中的Area图表。 其实就是我们常见的区域图(或者叫面积图),它与折线图(昨天讲到的)都是用来呈现时间序列中的趋势走向和波动范围,进而对事物发展状态做出评价。...Line1;Line2:这两个参数可以给迷你面积图设置一对围绕水平轴分布的上下平行线,你可以理解为正负指标的对比参考线。(自定义的话要定义在指标实际最大值最小值之间)。...ColorPosition;ColorNegative:这两个参数参数就更容易理解了,正值与负值区域填充颜色。(根据sparklines的专属配色代码表查询即可)。...下面是在excel中的sparklines菜单中Area参数设置示例: =areachart(D3:I3,-50,100,-30,50,2112496,5546802) ?...这种迷你图做完之后,至少一段时间内可以作为模板使用,秩序替换数据即可,而且告诉你一个秘密,其实做完的图表是完全矢量独立的图形组合,这就意味着你可以直接将图表复制走,然后解散组合随意更改图表内的细分图形颜色以及将图表放大使用也不会影响清晰度

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