在R函数中将列表转换为数据框列 - 腾讯云开发者社区

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R 数据整理（二：将文本数据转换为数据框或列表）

这时候就祭出readLines 函数。...类似py 中的readlines 方法，同样，R 的函数也会逐行（识别） x_line <- readLines("MsigDB/h.all.v7.2.symbols.gmt") ps：发现对于gmt...已经有成熟的函数read.gmt 了：纯文本-> 列表果然文本按照换行符分隔为50个向量，readLines 会按照换行符分隔读取，每个换行符读取一个元素： > length(x_line) [...： x_split <- strsplit(x_line, "\t") 每个向量会被按照指定符号切割，每个向量会被转换为列表对象，列表中的元素为按照换行符拆开的一个个元素。...HALLMARK_MITOTIC_SPINDLE" [5] "HALLMARK_WNT_BETA_CATENIN_SIGNALING" [6] "HALLMARK_TGF_BETA_SIGNALING" 纯文本-> 数据框

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3.9生信

matrix ：矩阵，整个表只允许一种数据类型 data.frame：数据框，每一列只允许一种数据类型可以根据生成的函数或者用class或者is族函数判断。...数据框取子集 a.$ df1$gene #删掉“gene”，按tab键，可以提示出表格的全部列名小技巧：在今后把 df1$gene 看作一个整体，是一个向量，这样不容易产生困惑。...","r2","r3","r4") 修改行名 d.只修改某一行/列的名 colnames(df1)【2】 = "CHANGE" 将第二列的名字改为CHANGE e.两个数据框的连接merge merge...：转置：t(m) 行变列，列变行转换：as.data.frame(m) 转换为数据框列表列表新建和取子集新建 q = list(m1 = matrix(1:9, nrow = 3),...q【【2】】 names函数获取元素名字 names(m1) names(test1) names 函数不仅仅能对列表使用，还可以对数据框使用（返回列名）。

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R语言的数据结构与转换

下面介绍 R 中用于存储数据的多种数据结构。 R 的数据结构在大多数情况下，结构化的数据是一个由很多行和很多列组成的数据集。在 R 中，这种数据集被称为数据框。...所以在进行数据分析之前，经常需要将它们用函数 factor( ) 转换为因子。 # 先定义了一个变量 sex 表示性别，假设其取值 1 表示男性，2 表示女性。...1.6 数据框数据框（dataframe）是一个由行和列组成的二维结构，其中行表示观测（observation）或记录（record），列表示变量（variable）或指标（indicator）。...与矩阵不同的是，数据框里不同的列可以是不同模式（数值型、字符型等）的数据。数据框可以通过函数 data.frame( ) 创建。...在进行数据分析时，分析者需要对数据的类型熟稔于心，因为数据分析方法的选择与数据的类型是有密切联系的。R 提供了一系列用于判断某个对象的数据类型的函数，还提供了将某种数据类型转换为另一种数据类型的函数。

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天意R笔记|新手必须掌握的R语言基础

（五）列表列表是R语言中一种灵活且强大的数据结构，允许存储不同类型的数据对象，如数值、字符、逻辑值，甚至是向量、矩阵、数组或数据框等。...（六）数据框数据框（data frame）是R语言中特别常用的数据结构，用于存储表格形式的数据。数据框中的每一列代表一个变量，可以是不同的数据类型（如数值、字符或逻辑值），每一行表示一个观测值。...数据框可以通过 data.frame() 函数创建，各列的长度必须相同。数据框类似于电子表格，是进行统计分析和数据可视化的基础工具，能够灵活处理包含不同类型变量的数据集。...9.矩阵转置函数： t()函数可以对矩阵进行转置，如t(A)将矩阵A转置。 10.矩阵维数函数： dim()函数用于返回或设置矩阵的维数。...尽管处理超大数据时有性能挑战，通过抽样或结合分布式计算，R语言仍能胜任复杂分析任务。其基础数据对象和高级数据结构如向量、矩阵、数组、因子、列表和数据框，提供了灵活的数据组织方式。

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快速掌握apply函数家族推荐这篇文档

❝apply 家族是 R 语言中常用的函数，用于对列表、数组或其他类型的数据进行循环操作。 ❞ apply 家族包括以下几个函数： ❝lapply：用于遍历列表中的每一个元素，并对其执行函数操作。...sapply：与 lapply 类似，但它自动将结果转换为向量、矩阵或数组。 apply：用于对矩阵或数组的行、列或其他维度进行循环操作。...6 9 例子 2：使用 apply 函数将矩阵转置下面的代码使用 apply 函数将矩阵转置： # 创建矩阵 x <- matrix(1:9, nrow = 3) # 使用 apply 函数将矩阵转置...x, function(x) x^2) %>% sum [1] 55 例子 4：使用 tapply 函数根据性别分组并求平均身高假设我们有以下数据，表示不同性别的人的身高： # 创建数据框 df...总结 ❝apply 家族是 R 语言中常用的函数，用于对列表、数组或其他类型的数据进行循环操作。它们包括 lapply、sapply、apply 和 tapply 函数，每个函数都有各自的用途。

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自学攻略 | R语言数据类型和数据结构

R语言的数据类型：数据的“本质属性” 在R中，每个数据都有其特定的数据类型，这决定了R如何存储和处理它。理解数据类型是后续构建数据结构的基础。...数据框（Data Frame）：最常用的表格型数据结构定义：数据框是R中最常用、最灵活的表格型数据结构。它类似于一个电子表格，每列可以是不同的数据类型，但每列内的元素必须是同种类型。...列表（List）：最灵活的数据“容器” 定义：列表是R中最灵活的数据结构，可以存储任意类型、任意长度的R对象。它可以是向量、矩阵、数据框，甚至可以是另一个列表。...R的向量是同质的，如果强制将数值和字符混合，所有元素会被强制转换为字符型。 PCA矩阵转置问题： prcomp() 函数默认期望输入数据的行是观测值（通常是样本），列是变量（通常是基因）。...因此，如果你的原始矩阵是基因在行、样本在列，就需要转置。如果矩阵中存在字符型数据，prcomp() 函数会报错，因为它只能处理数值型数据。

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Day3

注意事项：数据分析每一步都要有检查，代码不报错，不代表真的没错，需要检查目的是否达到数据框data.frame-**二维，与表格类似，每列是向量，只允许一种数据类型新建用代码新建df1 列的内容), 列名 =向量(列的内容))###由已有数据转换或处理得到读取表格文件df2 R语言内置数据属性dim(df1)#维度nrow(...(df1)2 数据框的连接/合集-mergemerge(test1,test2,by="共同列的列名")merge(test1,test3,by.x = "name",by.y...= "NAME")# name为test1需要合并的列的列名矩阵matrix -**二维，只允许一种数据类型新建转置-t()转换为数据框: as.data.frame...()画热图pheatmap::pheatmap()列表list:可装万物新建数据框按逻辑值取子集删除变量

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python下的Pandas中DataFrame基本操作（二），DataFrame、dict、array构造简析

跟其他类似的数据结构相比（如R的data.frame），DataFrame中面向行和面向列的操作基本上是平衡的。...one', 'two'], columns=['year', 'state']) year state one 1 2 two 3 4 4:Python中将列表转换成为数据框有两种情况...：第一种是两个不同列表转换成一个数据框，第二种是一个包含不同子列表的列表转换成为数据框。...第一种：两个不同列表转换成为数据框 from pandas.core.frame import DataFrame a=[1,2,3,4]#列表a b=[5,6,7,8]#列表b c={"a" : a,...7 3 4 8 第二种：将包含不同子列表的列表转换为数据框 from pandas.core.frame import DataFrame a=[[1,2,3,4],[5,6,7,8]]#包含两个不同的子列表

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R语言数据框、矩阵、列表的创建、修改、导出

数据框数据框的创建数据框来源主要包括用代码新建(data.frame)，由已有数据转换或处理得到(取子集、运算、合并等操作)，读取表格文件(read.csv,read.table等)及R语言内置数据函数...2的元素赋值修改数据框的连接merge函数可连接两个数据框，通过指定公共列使具有相同元素的行的列合并*merge函数可支持更复杂的连接，但通过inner_join等更为简便，后述test1 数据框t(m) #转置行与列，数据框转置后为矩阵as.data.frame(m) #将矩阵转换为数据框列表列表内有多个数据框或矩阵，可通过list函数将其组成一个列表l 数据iris的前5行，前4列，并转换为矩阵，赋值给a。...rownames(a)换为1:nrow(a)# 4.探索列表取子集l[2]

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R语言常见函数知识点梳理与解析 | 精选分析

) 5、complete.cases( ) 判断对象中是否数据完全 6、grep（）找出所数据框中元素所在的列值（仅数据框中） 7、assign（）通过变量名的字符串来赋值 8、 split（）根据因子变量拆分数据框...22、输入输出 23、工作环境 24、简单统计量 25、时间序列【往期回顾】 R语言 | 第一部分：数据预处理 R语言|第2讲：生成数据 R语言常用的数据输入与输出方法 | 第三讲 R语言数据管理与...这一函数在去除数据框中缺失值时很有用。.../向量 split（x，f）；x 可以为向量或者数据框，f 为对应的因子，函数以列表的形式返回 > x = data.frame(matrix(1:10,nrow = 5)) > MorFM = c("...18、数组相关 array：建立数组 matrix：生成矩阵 data.matrix：把数据框转换为数值型矩阵 lower.tri：矩阵的下三角部分 mat.or.vec：生成矩阵或向量 t：矩阵转置

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生信课程note-3

class3数据框、矩阵和列表向量-一维：表格—二维：matrix 矩阵-二维，只允许一种数据类型；data.frame数据框-二维，每列只允许一种数据类型。...list列表：可装万物向量矩阵数据框数字列表。用class可以判断是矩阵或数据框，还可以用is族函数来判断。...#重点：数据框#1.数据框来源# （1）用代码新建# （2）由已有数据转换或处理得到# （3）读取表格文件（对数据框操作）# （4）R语言内置数据（可以直接使用的的数据框）heatmap(volcano...c("r1","r2","r3","r4")#只修改某一行/列的名colnames(df1)[2] 数据框的连接test1 转置行变列m换为数据框必须要赋值矩阵画热图： pheatmap::pheatmap(m)

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生信入门马拉松之R语言基础-数据框、函数(Day 3)

Day3正式内容-数据框、矩阵和列表 Vector向量-一维；表格-二维 matrix矩阵：只允许一种数据类型 data.frame数据框：每列只允许一种数据类型，每列单独提取出来是一个向量 list列表...：包容万物，可将以上数据类型打包到一起根据生成函数判断对象的数据类型；用class()函数判断数据类型数据框来源：代码建、已有数据转换、读取文件、R语言的内置数据使用内置数据集volcano,tab...6 9 思考一下数据转化代码和输出结果的区别 m矩阵转变数据框后查看m的数据类型 t(m)#给矩阵转置，行变为列，列变为行 ## [,1] [,2] [,3] ## a 1 2 3...## 3 3 6 9 is.data.frame(m) ## [1] FALSE m矩阵转变数据框后赋值给aa后查看aa的数据类型 t(m)#给矩阵转置，行变为列，列变为行 ## [,1] [,2...(iris[,i],col = iris[,5]) }#编写函数，可以对iris数据框的列批量画图 crazy(4)#第4列 Tip: 当一个代码需要复制粘贴3次或以上，就应该写成函数或使用循环 Day3

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【生信技能树培训笔记】R语言基础（20230112更新）

是否为字符型数据as族函数实现数据类型之间的转换as.numeric()将其他数据类型转换为数值型as.logical() 将其他数据类型转换为逻辑型as.character() 将其他数据类型转换为字符型本节函数...数据框要求每一列只能有一种数据类型，且数据框只是R语言内部的一个数据，不是一个文件。- 数据框单独拿出来的一列是一个向量，视为一个整体。一个向量可以出自数据框的一列，也可以用代码生成。...见R_01项目中02_exercise.R练习第6题。> # 6.向量g中有多少个元素在向量s中存在(要求用函数计算出具体个数)？...(m) #将矩阵转换成数据框的数据结构 a b c1 1 4 72 2 5 83 3 6 9重点：将数据框或举证转置之后，其数据结构都是矩阵。...#取数据框最后一列（不知道具体列数）> df1[,ncol(df1)] #函数ncol()求出数据框的总列数，最后一列即为第“总列数”列。

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从零开始的异世界生信学习 R语言部分 02 数据结构之数据框、矩阵、列表

数据框 data.frame 数据框约等于表格：1.数据框不是一个具体文件，只是R语言内部的一个数据；2.数据框每一列只能有一种数据类型图片新建和读取数据框 #新建和读取数据框 df1 <- data.frame...df1[,3] df1[,ncol(df1)] #ncol()函数统计列数，一共多少列，就是取最后一列 #如何取数据框除了最后一列以外的其他列？...增加一列在$后面写一个不存在的列名表示增加一列 df1$p.value <- c(0.01,0.02,0.07,0.05) df1 #改行名和列名 rownames(df1) r1",..."r2","r3","r4") #只修改某一行/列的名 colnames(df1)[2] <- "CHANGE" # | 或符号前后不可以连接字符，只能用于数字，逻辑值两个数据框的连接 test1 转置，行变列，列变行，行名和列名都跟着变换 as.data.frame(m) #将转换为数据框 #作图 pheatmap::pheatmap(m) #使用pheatmap包中的pheatmap

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生信技能树数据挖掘笔记

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GEO数据挖掘-基于芯片

根据交集重新排序表达矩阵和临床信息数据框：exp = exp[, s]重新排列表达矩阵 exp 的列，使其顺序与交集 s 中的样本顺序一致。...解析4.2.1 dat = as.data.frame(t(exp))将表达矩阵 exp 转置后转换为数据框。...在基因表达数据分析中，表达矩阵 exp 通常是一个二维矩阵，其中：行代表基因。列代表样本。为了进行主成分分析（PCA）等分析，需要将矩阵转置，以便样本成为行，基因成为列。...ids：要处理的数据框。symbol：指定根据哪一列进行去重（这里是 symbol 列）。.keep_all = TRUE：表示在去重时，保留所有列的数据。...具体来说，在默认情况下，distinct 函数只返回去重后的 symbol 列，不会保留 probe_id 等其他列的数据。

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R语言的常用函数速查

一、基本 1.数据管理 vector：向量 numeric：数值型向量 logical：逻辑型向量character；字符型向量 list：列表 data.frame：数据框c：连接为向量或列表 length...数组 array：建立数组 matrix：生成矩阵data.matrix：把数据框转换为数值型矩阵lower.tri：矩阵的下三角部分 mat.or.vec：生成矩阵或向量t：矩阵转置 cbind：把列合并为矩阵...rbind：把行合并为矩阵diag：矩阵对角元素向量或生成对角矩阵aperm：数组转置 nrow, ncol：计算数组的行数和列数dim：对象的维向量 dimnames：对象的维名row/colnames...sweep：计算数组的概括统计量aggregate：计算数据子集的概括统计量 scale：矩阵标准化matplot：对矩阵各列绘图 cor：相关阵或协差阵Contrast：对照矩阵 row：矩阵的行下标集...统计分布每一种分布有四个函数：d――density（密度函数），p――分布函数，q――分位数函数，r――随机数函数。比如，正态分布的这四个函数为dnorm，pnorm，qnorm，rnorm。

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Day3 学习简单作图数据框列表矩阵

==取子集g[seq(2,100,2)]g[c(F,T)] #用逻辑值挑选，会选出T所在的内容# 3.向量g中有多少个元素在向量s中存在(要求用函数计算出具体个数)？...rep函数中的each为一个向量重复完再执行下一个向量的重复，而换成times则为整体的重复（abcdabcd）数据框与矩阵matrix 只允许一种数据类型data.frame 每列只允许一种数据类型数据框...，R语言或者R包里自带的，无需赋值即可使用(不全是数据框哦)irisclass(iris)#顺便了解一下其他数据结构的内置数据heatmap(volcano) #热图函数火山图参数，系统内置class...merge(test1,test3,by.x = "name",by.y = "NAME") #不用专门修改名字，by.x/y函数解决 # 优先选择改数据，在R里面修改数据矩阵和列表不支持$m 换为数据框#列表可以用$x <- list(m1 = matrix(1:9, nrow = 3), m2 = matrix(2:9,

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R语言-基础

R的使用在Rstudioy中新建项目（R project） File-New Project-New Directory-New Project-Directory name-Creat...数据结构（向量、数据框、矩阵、列表）字符型向量必须加引号（单双皆可）不能为中文值逻辑型（logical）包括TRUE(T)、FALSE(F)、 NA(缺失值）判断数据类型的函数class（）数据框单独拿出来一列是向量...("4") #转换为数值型数据 as.logical() #转换为逻辑型数据 as.character() #转换为字符型数据 3.1向量 3.1.1向量的生成（1...按条件 df$scoredf$score > 0, 数据框按照逻辑取子集，TURE对应的行/列留下，FALSE对应的行/列丢掉。...=5]#取gene的方式，类似于向量取子集 df1[,length(df1)] #获取最后一列数据 df1[,-length(df1)] #删除最后一列数据数据框修改 df1[3,3] <- 5 #改一个格

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R语言入门系列之一

在R中对象（object）是指可以赋值给变量（variable）的任何事物，在R语言中使用对象来存储数据也即储存变量，对象类型有标量、向量、矩阵、数组、数据框、列表。...数据框元素索引有三种方法，第一种为通过列的序号索引，第二种通过列名字索引，第三种通过$变量名索引，如下所示：可以使用attach()函数来将数据框添加到当前平台，这样就可以直接使用列名字或变量名来调用数据框中的数据...变量类型不同，在统计中其处理方法也不同（例如RDA、CCA等），结果也不相同。由于因子的存在，数据分组信息等都可以转换为一个变量，从而使得数据框可以存储远多于矩阵的数据。...1.4列表列表（list）是R中最复杂的一种数据类型。列表是一些对象的有序集合，这些对象可以是向量、矩阵、数据框，甚至其他列表。...函数），因此列表在R中非常重要。

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R 数据整理（二：将文本数据转换为数据框或列表）

3.9生信

R语言的数据结构与转换

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R语言数据框、矩阵、列表的创建、修改、导出

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