“ Kappa”列是 Cohen 的（未加权的）Kappa 统计量在重采样结果中的平均值。 train 适用于特定模型。对于这些模型， train 可以自动创建一个调整参数的网格。...预处理 不会 应用于直接使用object$finalModel 对象的预测 。 对于插补，目前实现了三种方法： _k -_最近邻采用具有缺失值的样本，并 在训练集中找到 _k 个_最接近的样本。...这通常是一个相当准确的模型，可以处理缺失值。当一个样本的预测器需要估算时，其他预测器的值会通过袋装树进行反馈，并将预测值作为新值。这个模型会有很大的计算成本。...number 和 repeats： number 控制_K_折交叉验证中的折叠 次数或用于引导和离开组交叉验证的重采样迭代次数。 repeats 仅适用于重复的 _K_折交叉验证。...包中现有三个函数： best 是选择最大/最小值， oneSE 尝试捕捉精神 Breiman et al (1984)") 并 tolerance 在最佳值的某个百分比容差范围内选择最不复杂的模型。
K& key) 返回哈希桶中关键码为 key 的键值对的个数 注意：unordered_map中key是不能重复的，因此count函数的返回值最大为1 unordered_map...除留余数法--(常用) 设散列表中允许的 地址数为 m ，取一个不大于 m ，但最接近或者等于 m 的质数 p 作为除数， 按照哈希函数： Hash(key) = key%...折叠法--(了解) 折叠法是将关键字从左到右分割成位数相等的几部分(最后一部分位数可以短些)，然后将这 几部分叠加求和，并按散列表表长，取后几位作为散列地址。...数学分析法--(了解) 设有n个d位数，每一位可能有r种不同的符号，这r种不同的符号在各位上出现的频率不一定 相同，可能在某些位上分布比较均匀，每种符号出现的机会均等，在某些位上分布不均匀只...可根据散列表的大小，选择其中各种符号分布均匀的若干位作为散 列地址。
简介 在过去的十年中，RNA-seq 已成为转录组差异表达基因和 mRNA 可变剪切分析不可或缺的技术。正确识别哪些基因或转录本在特定条件下的表达情况，是理解生物反应过程的关键。...在本教程中，将借助许多R包，带你进行一个完整的 RNA-seq 分析过程。...在您的工作目录中，创建两个新目录：meta 和 results。 现在我们需要获取用于分析的文件：Mov10[3]，点击即可下载（不能下载的，可以在文末链接获取）。下载 zip 文件后，您需要解压它。...加载包 分析将使用几个 R 包，一些是从 CRAN 安装的，另一些是从 Bioconductor 安装的。要使用这些包，需要加载包。将以下内容添加到脚本中。...countsFromAbundance 的选项如下： no（默认）：这将采用 TPM 中的值（作为我们的缩放值）和 NumReads（作为我们的“原始”计数）列，并将其折叠到基因级别。
简介在过去的十年中，RNA-seq 已成为转录组差异表达基因和 mRNA 可变剪切分析不可或缺的技术。正确识别哪些基因或转录本在特定条件下的表达情况，是理解生物反应过程的关键。...在本教程中，将借助许多R包，带你进行一个完整的 RNA-seq 分析过程。...在您的工作目录中，创建两个新目录：meta 和 results。现在我们需要获取用于分析的文件：Mov10，点击即可下载（不能下载的，可以在文末链接获取）。下载 zip 文件后，您需要解压它。...加载包分析将使用几个 R 包，一些是从 CRAN 安装的，另一些是从 Bioconductor 安装的。要使用这些包，需要加载包。将以下内容添加到脚本中。...countsFromAbundance 的选项如下：no（默认）：这将采用 TPM 中的值（作为我们的缩放值）和 NumReads（作为我们的“原始”计数）列，并将其折叠到基因级别。
Contact Map只是蛋白质三维结构的高维投影，由于空间限制，每个残基最多只能与6-8个残基接触，对接触图的每一行/每一列中的Contact的数量有很大的限制。...一般来说，Contact Map可以作为能量项整合到传统的蛋白质结构预测算法中，或者通过Contact Map构建距离约束矩阵并通过分子动力学模拟预测结构。...为了使模型能够识别残基的相对位置，增加残基指数的差异作为附加特征。除此之外，测量每个残基对在一个序列中共存的概率以及利用其它程序预测的一些信息构建一维特征，对每个氨基酸残基的性质进行描述。...利用网格搜索法对验证集上各损失项的权值进行优化，避免训练集中引入偏差，选取GDFold与CONFOLD的预测结构性能差异作为目标优化函数。...RaptorX-Contact产生的模型在精度上没有明显的差异。
，截取中间X位作为存储位置(适用于不知道关键字的分布) 折叠法：拆分关键字 随机数法：使用随机数作为存储位置 除留余数法：适用余数作为存储位置 2.2、Hash去重所遇到的问题及解决方法 问题: 通常hash...具有相同散列值的元素会插入相对应的链表中 拉链法的代价不会超过向链表中添加元素，也无需执行再散列 拉链法的实现过程： ?...存入used集合中 used.add(url) new_urls = r.findall(html) # 将新发行未抓取的URL添加到queue中 for...存入used集合中 used.add(url) new_urls = r.findall(html) # 将新发行未抓取的URL添加到queue中 for...“5秒之后自动跳转…”之类的消息，表示在跳转到新URL之前网页需要加载内容 1、客户端重定向 客户端重定向是在服务器将页面内容发送到浏览器之前，由浏览器执行JavaScript完成的页面跳转，而不是服务器完成的跳转
,HOG,LBP) (3).分类器(SVM) 2、基于深度学习的目标检测 d 具体发展 (1).R-CNN Motivation：目标检测进展缓慢，CNN在图片分类中取得重大成功 Contribution...：候选框的重复计算问题 Contribution： 加入RoI池化层、将BB回归融入网络 (4).faster RCNN Motivation： Selective Search作为一个独立的操作，...(3)从剩下的矩形框A、C、E中，选择概率最大的E，然后判断E与A、C的重叠度，重叠度大于一定的阈值，那么就扔掉；并标记E是我们保留下来的第二个矩形框。...边界概率： 计算该行或该列是目标边界的概率（所以，行列两个概率图各选两个极大值，即可得到目标边界） in-out概率： 计算目标在该行或该列的概率（所以，行列两个概率图分别选择最高并且最平滑的区域，即可得到目标的区域...利分布（0-1分布） logistic 回归常用的损失函数交叉熵 In-Out Borders 平衡因子，因为作为边界的行或列较少，所以增大他们的权重。
剩下要做的就是不停的练习，不停的尝试，本文是在学习这个仓库之后的极简总结中。 主要作为一个备忘录使用。 长期更新。。。...o: 这个小o是非常的有用，在当前光标位置的下方自己给新起一行开始输入文本 O: 这个是与小o对应，在当前行的上一行开始新加一行并开始输入文本 s: 删除当前光标处字符，并开始输入内容 S:...(关于寄存器a是寄存标志，8.4内容介绍) 8.3 在输入模式中使用寄存器 输入模式下使用寄存器的命令为： ctrl + r a 这里的a是指寄存器的标志(关于标签a如何添加，下面内容介绍)。...行 17.2 不同的折叠方法 通过:set foldmethod查看折叠方式，默认是手动折叠manual 手动折叠 缩进折叠 表达式折叠 语法折叠 差异折叠 标志折叠...然后分别在四个文件中设置set、call plug等等，即可 折叠vimrc文件 在.vimrc文件顶部添加如下内容 " setup folds {{{ augroup filetype_vim
现在让我们看看结果中存储了哪些信息：res_tableOE %>% data.frame() %>% View()图片我们可以使用 mcols() 函数来提取有关存储在每列中的值代表什么的信息：mcols...结果中的 padj 列代表针对多重检验调整的 p 值，是结果中最重要的一列。通常，padj 的良好起点。...在进行差异表达分析之前，忽略那些很少或根本没有机会被检测为差异表达的基因是有益的。这将增加检测差异表达基因的能力。 DESeq2不会从原始计数矩阵中删除任何基因，因此所有基因都将出现在您的结果表中。...此外，对于需要折叠变化值作为输入的 GSEA 等功能分析工具，您可能希望提供收缩值。...如上所述，可以通过在 lfcShrink() 函数中添加参数类型来更改默认值。对于大多数最新版本的 DESeq2，type="normal" 是默认值，并且是早期版本中的唯一方法。
比较并选择R语言的机器学习模型 在本节中，你将会学到如何客观地比较R语言机器学习模型。 通过本节中的案例研究，你将为皮马印第安人糖尿病数据集创建一些机器学习模型。...它们有： 分类和回归树 线性判别分析 使用径向基函数的支持向量机 K-近邻 随机森林 训练完模型之后，将它们添加到一个list中，然后调用resamples()函数。...此函数可以检查模型是可比较的，并且模型都使用同样的训练方案（训练控制配置）。这个对象包含每个待评估算法每次折叠和重复的评估指标。 下一节中我们使用到的函数都需要包含这种数据的对象。...汇总表（Table Summary） 这是你可以做的最简单的比较，只需要调用summary()函数，并传入resamples()函数值。它会创建一个表格，每行是一种算法，每列是评估指标。...你也可以画出它们之间的差异，但是我发现与上面的汇总表相比并没多大用处。 总结 在这篇文章中你学会了8种不同的技术，可以用来比较R语言机器学习算法模型的估计精度。
当前使用的冷热存储架构，第一天的数据存储在高配的热节点中，磁盘ESSD，之后的数据存在在低配的普通云盘中。...1、具备删除本分区重复数据的能力2、通过ORDER BY排序键判断数据是否重复3、在分区合并的时候删除本分区重复数据，跨分区无法删除重复数据4、手动执行分区合并消耗大量时间 SummingMergeTree...的升级版2、根据ORDER BY排序键聚合数据，并写入表中，本分区相同数据合并3、在分区合并的时候执行聚合计算，跨分区不计算 CollapsingMergeTree 1、折叠合并树通过增加不同sign标志的数据代替删除的方式...，实现行数据的修改与删除2、在合并分区的时候触发3、对写入的数据有严格的顺序要求 VersionedCollapsingMergeTree 1、与CollapsingMergeTree作用相同通过对数据折叠...，完成数据的删除与修改2、通过标志位sign与版本号ver共同完成数据折叠3、对写入的数据没有顺序要求，内部通过ver倒序判断 小结：基于MergeTree衍生引擎提供删除重复数据、汇总聚合、删除与修改的能力
第三列 GErep（必须），它以数字代码表示治疗效果，从1到n, n是治疗效果的级别数。 目标文件中的其他列是可选的。...【注】readMicroRnaAFE函数： 但要求上述函数中所出现的列在txt内均存在； 该函数可以创建uRNAList类的新对象，即类似limma的RGList类。.../p/cdfac0bfb733 [ps]：作者已经进行添加了ddaux$G列，可能是想进行log2处理，但导入写函数时并未使用到G列。...（识别阵列中每个特征的复制的非控制探针，并计算每个microRNA探针集的CV。然后，每个探针组CV的中位数作为阵列重现性报告。）...ddauxmeanS中的任何东西，因此，我们需要先创建ddaux对象，然后在ddauxmeanS中存储想使用的矩阵。
（仅）GFMT 可包括： %中每行属于的差异 %> 该组中每行属于的差异 %= 该组中同时在和出现的每一行...作为命令行的比较工具，我们仍然希望能拥有简单明了的界面，可以使我们能够对比较结果一目了然；我们还希望能够在比较出来的多处差异之间快速定位，希望能够很容易的进行文件合并； 由于，vimdiff 命令依赖于...列出交换文件并退出 -r (跟文件名) 恢复崩溃的会话 -L 同 -r -A 以...实际案例： # 示例1.输出的第一列只包含在aaa.txt中出现的行，第二列包含在bbb.txt中出现的行，第三列包含在aaa.txt和bbb.txt中相同的行。...各列是以制表符（\t）作为定界符。
Alt+S 跟SVN的文件比较 Alt+B 上一个差异地方 Ctrl+Page UP 下一个差异地方 Ctrl+Page Down 第一个差异地方 Ctrl+Shift+Page Up 最后一个差异地方...当前也可以通过上面介绍的插件管理器，直接通过软件帮你自动下载并安装。 然后重启notepad++，就可以在Plugins中看到对应的Hex-Editor插件了。...列操作模式中的在整个列中，整个都插入一些内容的话，可以这样操作： Edit -> Column Editor (Alt C) 然后在Text to insert或Number to insert对应的的框中写入要插入的内容...17.资源管理器中，右键点击文件，可以直接用notepad++打开该文件 这个功能类似于UltraEdit，在资源管理器中添加了右键支持，右键点击某文件后，会出现“Edit With Notepad++...而且对于列边界显示模式，还支持两种： 一种是从上到下的竖边线： 另一种是把超过列边界的内容加上一定的底色： 20.可以给代码批量添加或取消注释 选中一段代码，然后：编辑 -> 注释/取消注释 -> 添加
（3）数字分析法 设关键字是d位的以r为基的数，且共有n个关键字，则关键字的每个位可能有r个不同字符出现，但这r个字符出现的频率不固定，可能在某些位上是俊宇的，即每个字符出现的次数接近于r/n，而在另外的一些位上分布不均匀...因此可以选取其中分布比较均匀的那些位，重新组合为新的数，用其作为散列地址。 这种方法比较简洁，但是需要预知每个关键字的情况，这样就限制了使用。 ...（4）折叠法 将关键字分成位数为t的几个部分（最后一部分的位数可能小于t），然后把各部分按位对其进行相加，将所得的和舍弃进位，留下t位作为散列地址。...当关键字位数很多，而且关键字中每位上数字分布比较均匀时，采用折叠法比较合适。 ...2.链地址法（拉链法） 若散列表空间为[0，m-1]，则设置一个由m个指针组成的一维数组CH[m]，然后在寻找关键字散列地址的过程中，所有散列地址为i的数据元素都插入到头指针为CH[i]的链表中。
单页面布局提供的高度直观、高效实用的导航将有助于确保为用户提供最佳体验，特别是在应用在屏幕可自由切换的折叠屏手机上时 在上篇《折叠屏 ① | 华为资深专家解读折叠屏应用基础体验要求》中，为开发者详细讲解了应用基础体验要求...在展开态下，由于屏幕的特殊形态，因此产生了如下主要的场景差异： 单页面（布局重排）：屏幕宽度变宽产生了版面布局优化的机会，可以在适当的条件下进行页面版式调整（页面内的元素的位置、大小，同类型数量等发生变化...组合页面（信息架构重构）：将原先两个或多个页面的内容，合并到一个新页面中以分栏或其他形式呈现出来，形成跨页面的交互，从而在适合的场景下构建出新的页面组合样式和新的用户体验。...Gutters是用来控制元素和元素之间的距离关系，可以根据设备的不同尺寸，定义不同的Gutters值作为断点系统中的统一规范。...规则：应用定义单个组件所占用的栅格数，随着设备尺寸和栅格数量的变化，自动计算新的栅格数量，得出可以重复的元素的个数。 场景：内容运营类信息展示元素。
此方法从子查询Filter中删除相关谓词，并将这些谓词的引用添加到所有中间Project和Aggregate子句（如果缺少的话），以便能够在顶层评估谓词。...冗余别名是不会更改列的名称或元数据，也不会消除重复数据的别名。...这个类是这些算法的入口，并选择要使用的算法。由于AQP中的连接成本可能在多次运行之间发生变化，因此我们没有理由强制这个规则批上面的幂等性。...如果有SELECT * from R, S where R.r = S.s，则R和S之间的连接不是笛卡尔积，因此应该允许。谓词R.r=S.s在ReorderJoin规则之前不会被识别为join条件。...2.IN/NOT IN将被重写为semi/anti join，Filter中未解析的条件将作为join条件被拉出，value=selected列也将用作join条件。
粘贴并格式化 Ctrl+D：选择单词，重复可增加选择下一个相同的单词 Ctrl+L：选择行，重复可依次增加选择下一行 Ctrl+Shift+L：选择多行 Ctrl+Shift+Enter：在当前行前插入新行...Ctrl+R：前往 method Ctrl+N：新建窗口 Ctrl+K+B：开关侧栏 Ctrl+Shift+M：选中当前括号内容，重复可选着括号本身 Ctrl+F2：设置/删除标记 Ctrl+/：注释当前行...Ctrl+shift+F 在文件夹内查找，与普通编辑器不同的地方是sublime允许添加多个文件夹进行查找，略高端，未研究。 Ctrl+P 打开搜索框。...举个栗子：在页面代码比较长的文件中快速定位。 Ctrl+R 打开搜索框，自动带@，输入关键字，查找文件中的函数名。举个栗子：在函数较多的页面快速查找某个函数。...Alt+Shift+1 窗口分屏，恢复默认1屏（非小键盘的数字） Alt+Shift+2 左右分屏-2列 Alt+Shift+3 左右分屏-3列 Alt+Shift+4 左右分屏-4列 Alt+Shift
现在让我们看看结果中存储了哪些信息： res_tableOE %>% data.frame() %>% View() res_tableOE 我们可以使用 mcols() 函数来提取有关存储在每列中的值代表什么的信息...在进行差异表达分析之前，忽略那些很少或根本没有机会被检测为差异表达的基因是有益的。这将增加检测差异表达基因的能力。 DESeq2不会从原始计数矩阵中删除任何基因，因此所有基因都将出现在您的结果表中。...Fold change 结果中的另一个重要列是 log2FoldChange。对于大量的基因列表，很难提取有意义的生物学相关性。为了帮助提高严格性，还可以添加倍数变化阈值。...此外，对于需要折叠变化值作为输入的 GSEA 等功能分析工具，您可能希望提供收缩值。...如上所述，可以通过在 lfcShrink() 函数中添加参数类型来更改默认值。对于大多数最新版本的 DESeq2，type="normal" 是默认值，并且是早期版本中的唯一方法。
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