如果你在安装和使用Seurat (v5) and SeuratObject (v5) 过程中，出现了一些关于Matrix package的问题，可以看看本文。...我使用的是macOS, x86_641) SueratObject v5.0.0是基于Matrix 1.6-1 package的，所以我在CRAN官网：https://cran.r-project.org...，提示是Matrix版本的问题。...所以我得回到2)的位置，考虑一下compilation的问题Error: compilation failed for package "Matrix"通过搜索，我发现R包有时候是需要编译器的 (这里我不知道描述的是否准确...而Matrix package就需要Fortran compiler，我电脑没有安装，所以我需要安装fortran编译器。5).
//www.chpc.utah.edu/documentation/software/intel-parallelXE.php 2 性能对比 对于气象中的应用，主流数值模式基本都是以Fortran编写的...，为了追求更高的计算速度，我们尽量使用的intel编译器，像超算中心基本都预装了商业版Intel Parallel Studio。...但对于个人或小规模团队，还是使用的gcc+gfortan免费的编译器，毕竟商业许可要花不少钱，还是绑定IP的。...下图列出了Intel Fortran编译器，即ifort的应用性能，可以看出，ifort编译的程序运行速度比gfortran要高一些。...(包含ifort) intel-oneapi-mpi-devel-2021.3.0(包含mpif90等) 重新登陆环境变量生效后即可使用icc,ifort和mpi。
MPI是一个跨语言的通讯协议，用于并发编程。MPI标准定义了一组具有可移植性的编程接口。 安装环境 MPICH 是开源的消息传递接口（MPI）标准的实现。...dest是目的进程在指定的进程域 comm 的进程号。 tag是用户定义的消息的类型。...source 是来源进程在指定的进程域 comm 或 MPI_ANY_SOURCE 的进程号。 tag 可以是 MPI_ANY_TAG。...编译运行程序 封装的编译器： 对于 C 程序：mpicc test.c -o test 对于 C++ 程序：mpicxx test.cpp -o test 对于 Fortran 77 程序：mpif77...test.f -o test 对于 Fortran 90 程序：mpif90 test.f90 -o test 你也可以链接其它库：mpicc test.c -o test -lm 运行： 启动 16
近期加利福尼亚大学的研究者构建了基于Keras-Fortran的桥梁接口（KFB），并利用FKB解决有关全球气候模拟实验方法的鲁棒性的问题，在该方法中，利用深度学习神经网络模拟次网格物理过程。...不过当前大部分海洋学、计算物理、气候模式和航天仍在使用Fotran进行数值计算。由于这些历史“宝藏”代码的复杂性以及体量等问题，导致很难利用现代编程语言重写这些Fortran代码。...然后，这些信息转换为与FKB/F中匹配的Fortran神经网络配置，从而允许用户可以在Fortran中构建相同的网络，很容易在Fortran环境中加载和使用。...如果在Fortran环境中进行了任何的修改，FKB/P将这些更改解析到HDF5文件中，利用Keras重新训练。...也就是说，初始的网络模型可以在Fortran中构建，在初始训练和测试之后，可以迁移到Keras进行评估。这使得可以利用GPU训练Keras模型，然后嵌入到Fortran代码中。
CESM是CCSM的升级版，2010年，国家科学基金会（NSF）和美国能源部（DoE）的重要资金（NSF）和重要资金的全球动力学部门（CGD）在2010年发布了CESM1。...www.centos.org/download/ Kernel 4.14.0-115.el7a.0.1 https://www.centos.org/download/ 3 移植规划数据 本章节给出CESM软件在移植过程中涉及到的相关软件安装规划路径的用途及详细说明...2 /path/to/OPENBLAS OpenBLAS的安装规划路径。 这里的安装规划路径只是一个举例说明，建议部署在共享路径中。...现网需要根据实际情况调整，后续章节凡是遇到安装路径的命令，都以现网实际规划的安装路径为准进行替换，不再单独说明。 3 /path/to/HDF5 HDF5的安装规划路径。...需要查看输出到屏幕中的日志，如图7-1所示红线处，需要手动计算出时间差，数值越少性能越优。 图7-1 测试样例 ?
最开始的时候按照官网给的指南是需要安装 OpenMPI 等一系列依赖库，而笔者在 Mac 平台下习惯使用 Homebrew 来安装软件，一番调查下发现 OpenMPI 还没有发行 big_sur_arm...抱着试一试学一学的态度，我分别使用了这两款软件在 Ubuntu ARM 20.04 上进行了相关的编译安装测试。...小提示 有一点有意思的事是，在 Ubuntu 平台下可能会出现无法寻找对应的依赖库的问题。...解决这一问题比较好的办法是在所使用的 .bashrc 或者 .zshrc 文件里添加完整的 LIBRARY_PATH 和 LD_LIBRARY_PATH 配置。...版权声明：如无特别声明，本文版权归 仲儿的自留地 所有，转载请注明本文链接。
应使用高级一些的LaTeX编译器，如TeX Live等。...编译器/系统环境基本要求： （1）GNU编译器>=5.x版本，笔者机子上装的是5.4.0（读者可运行gcc -v查看版本号）。若读者机子上编译器版本太低，可参考教程《Linux下安装高版本GCC》。...注意若将GCC安装到非默认位置（如/opt/gcc-5.4.0），请勿在自己账户的~/.bashrc里导出关于/usr/lib64的库路径，因为显然/usr/lib64里是旧版的库，故意导出旧版库容易造成后续编译问题...linux下再）解压，改名，进入文件夹 tar -jxvf hdf5-1.12.0.tar.bz2 mv hdf5-1.12.0 hdf5 cd hdf5 依次执行以下三条命令进行编译 ....完成后在~/.bashrc中写上环境变量 export HDF5_ROOT=/home/$USER/software/hdf5-1.12.0 export PATH=$HDF5_ROOT/bin:$PATH
技术博客：使用PHP DOM解析器提取HTML中的链接——解决工作中的实际问题引言在日常的Web开发工作中，我们经常需要处理HTML文档，并从中提取特定信息，比如链接、图片地址等。...通过这个过程，我发现了PHP DOM解析器的强大之处，它不仅能帮助我们轻松处理HTML文档，还能保证数据的准确性和完整性。工作中的实际问题在最近的一个项目中，我负责维护一个内容聚合平台。...加载HTML字符串：使用loadHTML()方法将HTML字符串加载到DOMDocument对象中。注意，这里使用了@来抑制可能的警告，但在实际开发中，我们应该处理这些警告，以避免隐藏潜在的问题。...处理href：在提取到href之后，你可以根据需要进行进一步的处理，比如去重、验证URL的有效性、存储到数据库等。...在实际工作中，当遇到类似的需求时，我强烈推荐使用DOM解析器来处理HTML文档。
这将有助于更好地理解并帮助在将来为任何ML问题建立直觉。 ? 首先构建一个简单的自动编码器来压缩MNIST数据集。使用自动编码器，通过编码器传递输入数据，该编码器对输入进行压缩表示。...通常，编码器和解码器将使用神经网络构建，然后在示例数据上进行训练。 但这些编码器和解码器到底是什么？ ? 自动编码器的一般结构，通过内部表示或代码“h”将输入x映射到输出（称为重建）“r”。...现在对于那些对编码维度（encoding_dim）有点混淆的人，将其视为输入和输出之间的中间维度，可根据需要进行操作，但其大小必须保持在输入和输出维度之间。...由于要比较输入和输出图像中的像素值，因此使用适用于回归任务的损失将是最有益的。回归就是比较数量而不是概率值。...检查结果： 获得一批测试图像 获取样本输出 准备要显示的图像 输出大小调整为一批图像 当它是requires_grad的输出时使用detach 绘制前十个输入图像，然后重建图像 在顶行输入图像，在底部输入重建
JavaScript的原型很多人都知道也很好用，但是很多人在使用原型继承中导致的安全问题却很少人知道，接下来我们就来好好了解一下。...在真实开发中，我们经常会在代码中使用Property accessors 属性访问器，并且使用用户输入的参数去访问某个对象的属性。...这看起来可能是一个很稀疏平常的操作，但是往往在这个过程中我们的代码就已经产生了一个很大的安全漏洞！！！为什么这样写代码会产生安全问题？...如果在客户端上，这可能问题不大，如果这是在服务器上，那就可能会为黑客攻击提供漏洞。...在代码中减少属性访问器的使用尽可能使用.的方式去访问对象的属性或者使用 Map或Set，来代替我们的对象检查对象的原型链，查看新创建对象的原型是否被恶意添加了原本不该有的属性，或者属性被修改检查用户的输入
今天在类中使用 uasort() 函数时发现报了错误:Warning: uasort() expects parameter 2 to be a valid callback ..., 然而直接在纯 php...页面测试的时候发现又没问题....要是改成PHP页面的话,则无问题: 的回调函数'compareByMargin'调用不明确, 编译器不知道是调用的哪里的这个函数....这样明确告诉编译器是指向当前类的compareByMargin函数.
书接上回提出的Git在Xcode中的配置与使用常见问题4个问题 问题1，如何在Xcode中创建代码库，并添加和提交代码到代码库？ 问题2，如何在Xcode中提交推送给远程服务器代码库？...问题3，如何在Xcode中克隆远程服务器代码库到本地？ 问题4，如何使用Xcode获取远程代码库数据，并解决冲突问题？...2、问题2 本地有代码库提交推送给远程服务器代码库，在Xcode中可以通过菜单File→Source Control→Push…进行推送，但是如果是第一次访问，会出现对话框，没有可以推送的远程服务器代码库名...在Xcode中可以通过菜单Window → Organizer，选中Repositories→myrepo→Remotes，点击左下角的“Add Remote”按钮，弹出对话框，在Remote Name...如果这个过程中有冲突发生，会弹出对话框在两个代码窗口中可以看到它们的冲突点， ? 下面的4个按钮，可以把冲突点进行合并，并进行编辑。如果没有冲突，Pull是可以点击，点击Pull按钮就可以了。
首先给一个常规的动态创建控件，并进行验证的代码 [前端aspx代码] <%@ Page Language="C#" AutoEventWireup="true" CodeFile="Test.aspx.cs...= new TableCell(); Cell.Controls.Add(_TxtBox); Cell.Controls.Add(_Require);//将刚才创建的二个控件...runat="server" Text="验证动态控件" Enabled="true" /> 再次运行，发现没办法再对动态生成的控件进行验证了...(也就是说，新创建的验证控件没起作用) ,怎么办呢？...经过一番尝试，发现了一个很有趣的解决办法，具体参看以下代码: <%@ Page Language="C#" AutoEventWireup="true" CodeFile="Test.aspx.cs"
4.修改配置文件 $ sudo vim Makefile.config 根据个人需要进行修改 a.若使用 cudnn,则将#USE_CUDNN := 1 修改成:USE_CUDNN := 1...注意：GPU运算能力（GPU Compute Capability ）3.0以上才支持CUDNN b.若使用的 opencv 版本是 3 的,则将#OPENCV_VERSION := 3 修改为...7.执行编译和测试命令 在~/ caffe/目录下 $ make all -j4 $ make test -j4 $ make runtest -j4 问题： Makefile:532: recipe...配置 pycaffe 接口 在 caffe 根目录的 python 文件夹下,有一个 requirements.txt 的清单文件,上面列出了需要的依赖库,按照这个清单安装就可以了。...在安装 scipy 库的时候,需要先安装 fortran 编译器 (gfortran),如果没有这个编译器就会报错,因此,我们可以先安装一下。
在PHP中使用SPL库中的对象方法进行XML与数组的转换 虽说现在很多的服务提供商都会提供 JSON 接口供我们使用，但是，还是有不少的服务依然必须使用 XML 作为接口格式，这就需要我们来对 XML...而 PHP 中并没有像 json_encode() 、 json_decode() 这样的函数能够让我们方便地进行转换，所以在操作 XML 数据时，大家往往都需要自己写代码来实现。...在 phpToXml() 的代码中，我们还使用了 get_object_vars() 函数。就是当传递进来的数组项内容是对象时，通过这个函数可以获取对象的所有属性。...测试的 $data 内容非常长，大家可以直接通过测试代码的链接去 Github 上查阅。 总结 这篇文章的内容是简单的学习了一个 SPL 扩展库中对于 XML 操作的两个对象的使用。...测试代码： https://github.com/zhangyue0503/dev-blog/blob/master/php/202009/source/在PHP中使用SPL库中的对象方法进行XML与数组的转换
这正是因为链接器（链接器其实 是ld,gcc调用了它）在foo.o中找到了main.o中需要的foo的定义，并且在main.o中找到了main的定义。...这里还牵扯到一个问题，那就是c是很纯朴的语言，c的函数在文本文件中是什么名字，那么编译出来在目标文件（一般是.o文件）中相应的那个函数还是那个名字（不会像c++一样为了重载在函数名前后加一大堆区分符）。...就像c++要用c库，也需要在声明这个库中的函数时使用extern “C”，使c++编译器在编译这个函数时生成的符号名是C风格而不是C++风格。...这也就是为什么时常有人问gcc main.cc会出错的问题了，如果main.cc用到了c++库中的函数，那么当然要使用gcc -lstdc++ main.cc才行了） 如果我们保持main.c不变，...这是编译器（f77）的一个命名规则，没有为什么，它就是把你在fortran中的函数名字全转换成小写，然后在最后加一个下划线。我昨天搜了很多版本，头昏脑胀，怎么调都说找不到，也没有想到要自己看看。
LibCChem不仅有GPU加速的代码，也用Global array（GA）的共享内存机制进行并行代码编写。同时，也采用了HDF5文件存储方式，可以并行I/O以及在内存中写临时文件。...例如，用户需要安装HDF5，Boost（C++的一个大库），eigen（C++线性代数库）。当然GAMESS也需要Fortran编译器、数学库、并行环境等。...以afandiadib/gamess为例进行讲解，如何用镜像进行计算。我们可以进入容器（container），在容器中运行GAMESS。...如果上述功能依赖老版本GAMESS的ddikick并行机制，那么可能没法使用LibCChem进行加速。我测试能量分解遇到这样问题。...另外如果打包镜像的人仔细搭配了编译器或软件库，那么容器中效率也许会比自己编译的效率高。IBM的一个研究文档讨论过Docker效率问题。
概述 HDF5 (Hierarchical Data Format) 是由美国伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校，是一种跨平台传输的文件格式，存储图像和数据 hdf5的优势 通用数据模型，可以通过无限多种数据类型表示非常复杂...在各种计算平台(从笔记本电脑到大规模并行系统)和编程语言(包括C、c++、Fortran 90和Java)上运行的软件库 hdf5结构 hdf5结构分为两个部分，一个是group，一个是dataset...不同的group存放不同的数据，dataset分为原始数据和元数据 groups 每一个hdf5文件有一个根目录，根目录的子级单位有多个group ?...hdf5的文件格式，极其类似unix操作系统 datasets HDF5数据集包含数据和描述文件也就是metadata ?...hdf5是一个非常专业的数据存储格式，同时支持的数据类型广泛，有更高级的使用，但是考虑到时间和需求，我应该不会在这方面深入过多，后续应该会更新r语言的hdf5文件处理，python备用。
它将数值分析、矩阵计算、科学数据可视化以及非线性动态系统的建模和仿真等诸多强大功能集成在一个易于使用的视窗环境中，为科学研究、工程设计以及必须进行有效数值计算的众多科学领域提供了一种全面的解决方案，并在很大程度上摆脱了传统非交互式程序设计语言...在新的版本中也加入了对C，FORTRAN，C++，JAVA的支持。 编程环境 MATLAB由一系列工具组成。这些工具方便用户使用MATLAB的函数和文件，其中许多工具采用的是图形用户界面。...允许用户编写可以和MATLAB进行交互的C或C++语言程序。另外，MATLAB网页服务程序还容许在Web应用中使用自己的MATLAB数学和图形程序。...软件开发 在开发环境中，使用户更方便地控制多个文件和图形窗口；在编程方面支持了函数嵌套，有条件中断等；在图形化方面，有了更强大的图形标注和处理功能，包括对性对起连接注释等；在输入输出方面，可以直接向Excel...和HDF5进行连接。
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