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【生信文献200篇】88 弥漫B细胞性淋巴瘤的基因和功能驱动

文章信息 英文标题:Genetic and Functional Drivers of Diffuse Large B Cell Lymphoma 中文标题:产生弥漫B细胞性淋巴瘤的内在基因和功能驱动...期刊:《Cell》 影响因子: 41.582 发表时间: 2017 Oct 5 研究领域:弥漫B细胞性淋巴瘤 文献概述 问题:弥漫性B细胞淋巴瘤(DLBCL)是最常见的血液系统恶性肿瘤...实验结果 DLBCL中的遗传驱动因素 从发现阶段开始,通过对1001个DLBCL和400个成对种系DNA进行全外显子组测序来鉴定DLBCL中突变的基因。...下面添加了一些其他信息:国际预后指数评分,对治疗的初始反应(是否完全反应),以及DLBCL的起源细胞亚群,活化的B细胞样(ABC)和生发中心B细胞样(GCB)DLBCL。...因此,必需的驱动基因敲除导致的适应性降低反映了这些基因在DLBCL背景下的功能重要性。 总共有35个驱动基因,其敲除导致DLBCL细胞的活力下降,将它们鉴定为功能性癌基因。

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如何评估某活动带来的大盘增量 | 得物技术

1引言 双11期间上线某功能/活动,用户开通后参与能给大盘带来交易增量吗? 业务第一反应大概率是说“会!”。那么,某活动/功能上线与大盘交易提升之间确实存在因果关系吗?如果真实存在,具体增量是多少?...假设期间采用了ab实验,活动上线时将大盘所有用户随机分成的两组,一组能够参加活动(干预组),另一组不能参加活动(对照组),然后通过观察两组用户在期间的交易表现,对比得出最后的结论。...双重差分法,适用于没有做实际随机对照的场景,例如期间全量上线了该活动。第三部分会重点介绍该方法的使用。 3双重差分法 3.1 基本思想 在没有随机实验的情况下去模拟一种随机分配实验。...实验组:受到营销活动的干预影响,根据影响程度又可以分为「平销已开通」影响复购动支,「平销未开通->新开通」 影响开通和动支。 对照组:没有受到同一活动的干预影响,表现为用户「始终未开通」。...如平销期与期之间新增用户、中途开通的用户表现。

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    如何评估某活动带来的大盘增量 | 得物技术

    1引言 双11期间上线某功能/活动,用户开通后参与能给大盘带来交易增量吗? 业务第一反应大概率是说“会!”。那么,某活动/功能上线与大盘交易提升之间确实存在因果关系吗?如果真实存在,具体增量是多少?...假设期间采用了ab实验,活动上线时将大盘所有用户随机分成的两组,一组能够参加活动(干预组),另一组不能参加活动(对照组),然后通过观察两组用户在期间的交易表现,对比得出最后的结论。...双重差分法,适用于没有做实际随机对照的场景,例如期间全量上线了该活动。第三部分会重点介绍该方法的使用。 3双重差分法 3.1 基本思想 在没有随机实验的情况下去模拟一种随机分配实验。...实验组:受到营销活动的干预影响,根据影响程度又可以分为「平销已开通」影响复购动支,「平销未开通->新开通」 影响开通和动支。 对照组:没有受到同一活动的干预影响,表现为用户「始终未开通」。...如平销期与期之间新增用户、中途开通的用户表现。

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    电商GMV和支付规模预测

    在电商时,为了能够合理地制定KPI、高效地商品备货和营销资源的安排,都通常都需要对这次大的GMV和订单规模做预测,避免出现诸如产品断货或者过剩、人员效率不高等问题,导致客户流失未能成交。...这里很明确的,我们就是要预测某个大时间段的GMV,做本次预测的核心目标是,让业务方做好对促销资源投入的评估,最终实现投入资源的合理分配。...在传统的预测中,通常是基于历史GMV趋势做预测的,衡量的是历史期相对平销期流失爆发度,计算公式是本次大GMV=前平销期GMV*爆发系数,其中,前平销期GMV可以通过时间序列模拟获得,而期间的爆发系数通常是基于业务经验做推断获得的...这样,预测的输出结果就明确了,首先是用户id,用于用户的分类,例如基于此,可以将用户分为A组、B组等;其次是不同分类用户的购买概率,例如A类、B类客户购买概率分布是多少;最后是的购买金额。...针对模型选择方面,这里可以使用的模型还是很多,需要尽可能的实验尝试,比较经常用到的是GDBT模型和LR模型,但是需要明确不同的适用场景。

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    人体皮肤的单细胞转录组显示与年龄相关的成纤维细胞启动的损失

    结论:结果定义了四个主要亚群,这些亚群可以在空间上定位并显示不同的分泌,间充质和功能。重要的是,这种成纤维细胞"启动"随着年龄的增长而减少。...第三个亚群,预计具有更多的 网状成纤维细胞特性,显示出更大的间充质潜力(簇#9,"间充质成纤维细胞")。第四个亚群具有大部分网状成纤维细胞特性,其特征在于功能(簇#2,"炎成纤维细胞")。...(CCL19)和(APOE)用来检测炎成纤维细胞,(ASPN)为间充质亚群的标志物。(PDGFRA)被纳入成纤维细胞对照组。RNA FISH 实验分别证实了网状真皮层内每个分泌亚群的位置。...由于年老可用组织切片中存在的毛囊量较低,因此无法通过实验证明这一观察结果。与老化细胞增殖能力降低一致,来自老年成纤维细胞的表达谱表明炎和分泌亚群中细胞周期的 G1 / S 过渡显著延迟。...对来自老年亚群最具代表性的基因的GO分析表明,每个簇的功能注释都存在相当的年龄依赖性损失。与年轻的成纤维细胞亚群相比,老年显示出较少的功能相关term。

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    JDV背后的技术-助力618

    图2.心跳上报流程 方案:基于以上屏使用场景,对屏渲染实例的实时监控将是非常非常重要功能,为了方便基于屏实时监控进行异常预案决策,在本次618前我们已增加了屏实时监控能力,该功能也被团队内部认为是监控能力细化的升级版...基于这个特性,实现了代理数据源功能,对不同人开屏请求进行合并,在后台生成一个查询任务定时获取数据,将数据写入缓存,屏直接查询缓存中的数据,从而避免多个相同请求对DB或底层数据服务造成查询压力。...在前能提前规划和识别出根本问题,遇到难点能够通过采用创新方案,精准识别出技改功能点,在系统保障机制等方面起到了非常关键的作用。...具体细节如下: 识别技改:主要在前期研发已经识别出历来过程中的痛点,通过对屏组件升级、QPS请求管控、代理数据源任务实时管控等功能上的优化调整,全面提升屏搭建效率和降低对底层的访问压力,...录屏任务服务:当系统需要跨0点停数、倒计时功能验证时,为确保在跨0点场景做到真实验证而又无需人员每次等到指定时间点,通过指定时间段自动录屏后续进行回放验证等方式,避免期间人员经常凌晨验证释放人员精力提升工作效率

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    运营大型促销设计小结

    运营就是根据不同产品策略目标,对多个产品设计不同的创意玩法及套餐方案,集成整合进行大规模的限时售卖活动(如:新春、618年中、双11等活动),为业务及品牌提供明确、连续、一致的销售增长,...运营设计难点 运营一般每年都会进行三场活动推广:新春、618、双11,而每期都需要不同的策略玩法去实现运营目标,给我最大的感触有以下两点: a)设计周期短 设计包含:1 个主会场 + 4...正常周期环节: 利用倒推法拓展后: B....B. 场景设计 即主会场头部 Banner,好比整个大的门面担当,主导整个会场的视觉方向。需要注意整个画面的主体、陪体、背景及空白各个成分的相互关系,结合内容与表现形式形成完整的画面。 3....头部 Banner 基因提取 为保证头部的视觉统一,清晰传达分会场的主要特性,并高效提升设计师的周期成本保证高质量的输出,可提取具有代表性的 共鸣符号 进行设计延展,大力减少用户的思考时间。

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    鞋履电商RDC的规划与设计

    1.明确设计目标 (1)项目定位:电商区域配送中心,负责区域内电商业务的收货、存储、发货等任务; (2)规划主体:仓库内部的仓内物流; (3)业务范畴:公司B2C业务,具体分日常、小三种模式,其中小是日常的三至五倍...,是日常的数十倍甚至几十倍; (4)业务特征:品牌多、存储总量大、SKU量大、订单多且量少、拆零拣选作业多; (5)自动化程度:适度自动化,柔性强; (6)确定的仓库主要设计目标,见表1。...根据鞋履货物规格及阁楼货架结构特性确定了表3中的存储设计参数。 (3)输送分拣流量设计参数的确认 按照规定的作业时间及设计基础数据计算每个功能区的需求流量。...如图2所示,共设计了四层阁楼货架,每一层均设计了较大的柔性平台操作区,平时可作为集中收货暂存区,时可用作临时打包区,应对订单高峰。...本文规划的方案中物流动线简洁、固定设备投资合理,可存储450万件鞋履商品,收货能力达1万箱/天,拣货能力达7千箱/天,发货能力达5万单/天,方案留有较多的柔性作业空间以应对时订单的波动及不稳定。

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    618数据洪峰来了 一键下单背后都有哪些技术支撑?

    618来临,在零点的时候,你打开购物车、点点点、清空,整个过程一气呵成。但背后,成千上万的数据在马不停蹄、加速流转,以保障消费体验流畅有序。 腾讯云和数据库服务是背后默默守护的“无名英雄”。...一旦数据库成为瓶颈、或任何细微的疏忽,整个618将会变成一个大型“灾难现场”。 一场电商,涉及到的数据量有多大?...一到节点,数据量级就会几何级增长。 据不完全统计,今年腾讯云数据库为电商客户承载了十亿级别的QPS(每秒查询数)、PB级别的数据存储量,整个大期间数据库平稳有序运行。...二、自动化运维已成为电商常态 历经数十年发展,数据库运维已经度过石器时代、工具时代、专家时代,随着工具的日趋成熟,低价值的工作量得以解放,DBA价值不断提升,数据库运维进入了智能时代。...,利用AI技术为用户提供在线自动优化数据库性能的服务,针对业务访问特性定制化生成最优配置,大幅提高数据库运维效率。

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    JMC | 通过基于深度学习的设计、合成和生物学评价发现吡唑并哒嗪酮衍生物作为选择性DDR1抑制物

    作者通过整合深度生成模型、激酶选择性筛选和分子对接,建立了基于骨架的分子设计流程,产生了一种新型的DDR1抑制剂化合物2,该化合物显示出有效的 DDR1 抑制特性(IC50 = 10.6±1.9 nM)...激酶的选择性是设计先导化合物的一个重要特性,在这项研究中,作者关注的是生成的分子与各种激酶的交叉反应性,包括FGFR和那些与DDR1抑制剂有交叉反应性的激酶。...(B)剩余生成分子的TMAPs和前10个分子的放大版。 作者选择前2个化合物进行进一步的合成和生物活性实验。化合物合成如方案1所示,作者开发了一种有效的途径来获得衍生物1和2。 方案1....用KinMap绘制的化合物2的激酶选择性图 化合物2抑制细胞中炎症细胞因子的表达和DDR1的自磷化 鉴于DDR1在炎症反应中的关键功能,作者通过测量其抑制LPS诱导的炎症细胞因子(包括IL-6、IL...在多种实验中化合物2都表现出了优越的性能,表明化合物2是迄今为止最具选择性的DDR1抑制剂之一。

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    鞘脂代谢调控星形胶质细胞 | MedChemExpress

    研究团队发现,星形胶质细胞中的 cPLA2 的 C2 结构域与 MAVS 中的 CARD 结构域相互作用,在实验性自身免疫性脑脊髓炎 (EAE) 以及潜在的多发性硬化症 (MS) 中上调 NF-κB...LacCer 诱导的 cPLA2-MAVS 信号传导驱动 NF-κB 依赖性炎程序 已知 LacCer 与 cPLA2 相互作用,通过小鼠和星形胶质细胞敲除 PLA2G4A (编码 cPLA2 的基因...) 实验,发现了 LacCer 通过激活 cPLA2 上调星形胶质细胞中 NF-κB 依赖性炎症转录程序。...敲除 Mavs 抑制了 NOD EAE 进展并减少 CNS 中炎单核细胞的积累,以及星形细胞的致病活动相关 NF-κB 驱动的炎症基因的表达。...Miglustat 抑制了小鼠和人类星形胶质细胞中 Pla2g4 和炎基因的表达,降低星形胶质细胞的神经毒性,以及它们在趋化实验中招募单核细胞和激活小胶质细胞的能力。

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    智慧供应链的学习笔记(库存管理、配补货、仓间调拨、控制塔等)

    ;在的时候,菜鸟会通过多方资源协调,保证他在时候能够正常出货。...刚才讲了我根据日常中小计划,就可以出全年商品协同计划。...第二类是补货 补货是一个非常特殊的场景,因为它的量在某一个时间点爆发得非常。在这种情况下,我们会基于预测、业务进销存计划、物流产能和供应商产能,在长周期下把入库节奏和数量做一个拆解。...这里的难点有以下几个: 第一个是销售预估,我们预测团队针对期间的销售做了很多的模型优化,从去年到今年618上线,新的预测上线后,整个计划的达成度就有了大幅提升。...,品会有期间的加量情况; 易缺货性,在考虑到模型上的调整后,通常会对这部分做一些条件上的限制; MOQ(最小起订量),最小起订量会根据箱规等规则做调整; 通过预处理、调整层的处理,有效的应对爆品

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    唠嗑 | Q4 & 年度总结

    3月 321 背景: 常规,电商行业一般都有321、618、916、双11双12等,以及一些节日里的小。...过程&结果: 在同事协助下,负责跟进321客户端商城侧的整体流程,从UI可行性评估、App目标版本确认、商城模板兼容性开发、预演、到最终验收,保障商城业务顺利进行。...关于商城可参考「动态页面之路 - 需求背景」系列文章。 收获: 初次跟进整场的各个环节,对有了更深的理解。...时光机优化 需要预演,需要提前穿越到当天来测试,这里主要是对工具的优化,进行提效(支持测试和运营的批量操作)。 通用图墙一期 背景: 图墙从单纯的电商侧业务,吸纳了内容和直播侧的业务。...对产品提过来的需求,不要一味去实现,可以结合目前App能力来给产品提自己的方案,这样能让业务更快落地、更快实验,即不要停留在产品功能表面,而是搞懂背后的业务诉求(如果产品认可我们的方案,那岂不是又砍了一个需求

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    转化率精准预估优化论文随笔记

    CVR修复策略 上述训练范式的有效性依赖于A(x,y)和B(x,y)之间的i.i.d.假设。...在我们的智能数据复用方案中,我们首先寻找与即将到来的B(x,y)的分布相似的【历史数据】,并使用【历史数据】微调生产模型,过程如下式: 所以这里的Fineture(B) 是一个纠偏值。...x,y)代表历史数据对应当天前10小时的CVR均值,可以从历史数据中统计获得;而B‘(x,y)代表当天前10小时的真实CVR均值 3 期间 分布相似数据的搜寻 找到当下,相似的历史“促销”数据...,包括双11,618,双12等等时间点 寻找的方式就是构建时序向量,然后求相似。...我们检索到的Top2结果是2022年7月12日的狂暑季,以及7月31日的七夕节(没有检索到99是因为88发生在99之前)。同时,我们还随机展示了一个低相似度的非日期。

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    产品经理需要会 SQL 吗?会 SQL 对产品有多大帮助?

    当时我每天就在琢磨,什么行为导致用户留存高,如何设计产品提高新用户完成这些行为,以及设计的促进这些行为的功能,是否真的能留存呢? 当时想出各种实验,我先说一些 A&B 的例子方便大家理解。...那么我们可以根据这个数据,设计一个「新手任务」的功能,促进新用户发帖。让新注册用户,注册后去完成新手任务,首次发帖。...那么这种「新手任务」发帖的用户与用户主动发帖、用户没有发帖三类用户比较,七日留存数据是怎样的?留存是否至少高于没有发帖的用户呢?...即便是这种简单的产品设计实验,一般的数据分析工具也很难灵活的统计,更何况实际的实验要比这复杂的多。我们自己写 SQL,会灵活自如更多。更快得到我们想要的实验结果,更好的证明自己工作的价值。 三....本文作者:蒋川,卡拉云联合创始人,B 端产品经理,专注研究企业内部效率工具实施搭建。 如果我的回答对你有帮助,还想深入了解更多信息,请访问我们的网站「卡拉云」

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    历时三年,苏宁如何建设多数据中心多活的实践项目?

    作者 | 陈跃泉、涂成义、马忠成 策划 | 蔡芳芳 随着苏宁线下线上业务以及全产业、全业态规模式快速增长,特别是每年苏宁 818 、双 11 等节点,销售订单基本都呈现倍数级增长态势,需要进行大量资源扩容...混合云降低持有成本:由于电商业务的特殊性,流量与平时流量相差上百倍,期间将流量划拨到公有云,在多活能力的基础上,实现私有云与公有云混部,降低私有云长期持有成本。...2、混合云部署 苏宁业务系统流量是平时业务流量的十倍甚至上百倍,日常资源都是按照的峰值进行准备,资源持有和运维成本较高,资源采购,上线周期较长。...因此期间,通过将部分流量弹到公有云,利用公有云的弹性能力,为私有云进行削峰,大大降低苏宁私有云长期持有成本,以及运维成本。...混合云项目经历一年左右的建设,也已初具规模,将为苏宁后续的业务高速发展保驾护航,降低公司扩容成本。

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    肿瘤前基质细胞驱动BRCA1介导的乳腺肿瘤形成

    同时,该研究发现一群与癌前期相关的成纤维细胞,其可产生大量的肿瘤因子包括MMP3,且在体内可促进BRCA1驱动的肿瘤形成。...Extend figure 1b-c:注释后每个个体的展示及总图展示,可以看出批次效应得到了很好的校正 Extend figure 1d:质控后的基因和UMI的个体小提琴图展示,文章后面说质控标准为基因...d - i:作者进一步流式验证了只有basal细胞表达NGFR,为了在功能上进一步验证,作者进行了体外实验,NGFR+的basal细胞加入外源性的NGF观察乳腺球形成情况,实验表明,加入NGF后显著增加了...Fig 2:a - b:作者通过成纤维细胞密度分析表明BRCA1组具有独特的转录组空间改变,差异表达分析同样显示出显著的差异。...接下来为了从功能上确定成纤维细胞来源的MMP3对人乳腺上皮的影响。作者使用原代人乳腺成纤维细胞和乳腺上皮细胞进行3D基质-上皮共培养实验。①对照组成纤维细胞慢病毒过表达MMP3后,生长显著增加。

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    肿瘤免疫逃逸

    2.共抑制信号及凋亡分子 (1)B7-Hs共抑制分子:T细胞活化除需要 TCR转导的第一信号外,还需要协同刺激分子转导的第二信号。...等代谢途径,诱导T细胞凋亡;④影响B细胞的功能。...下面从来源和功能的角度,介绍肿瘤相关炎症反应对肿瘤发生发展的影响。 1.炎症与肿瘤的发生 在某些肿瘤类型中,炎症反应在早期细胞癌变阶段就已出现,并参与促进了肿瘤的发生。...2.组织局部的炎反应 人的实体瘤是癌细胞与浸润免疫细胞长期“共进化”的结果,通常可按解剖结构分为癌旁、癌旁间质、侵袭边缘和癌巢等多个区域,各自具有独特的组成、功能特性与区域微环境。...侵袭前沿区域富含大量的炎症细胞,以往曾被认为是机体防御和抵抗肿瘤的重要场所;然而这些区域的炎症反应/细胞非但不能清除肿瘤,其血管生成和组织重塑功能反而可被肿瘤利用来帮助其进展。

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    压力超载心衰小鼠心脏免疫浸润的单细胞测序揭示了免疫激活程度

    各组均有相关特异性基因表达,Cluster 3和5为阴性,3主要与修复有关,其他的与炎有关,在整个病变过程中均有变化。...9b73442c483d379d1a7d4f238c30bc9.png 3.心脏中原本有大量B细胞,细胞簇0、2、11、17为四组B细胞,各簇随病变都有变化,为验证其变化,还做了免疫组化、流式细胞、免疫荧光的验证...,第一周和第四周 ll1b炎因子基因显著富集在疾病组,在第四周则出现了Ccr2和Cd68等新的炎因子基因。...30009ff2d7f5a8ae1f99fee73150701.png 总结 单细胞注释分组是单细胞分析的核心,假以湿实验辅助,有很强的说服力,对每个细胞簇可以继续分类,可以对分类功能、marker...gene对探究分析, Reactome gene ontology analysis 、GSVA 等对功能预测也有一定启示意义。

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    科研助攻 | 全面解读 (下):白介素家族大盘点 ! | MedChemExpress (MCE)

    因子炎症相关IL-10抗炎IL-19抗炎IL-20主抗炎,某些疾病如肿瘤中炎IL-22抗炎/炎双重作用IL-24抗炎/炎双重作用IL-26炎IL-28A (IFN-λ2)炎IL-28B (IFN-λ3...尽管这些细胞因子都通过 JAK-STAT 信号通路发挥功能,但它们在生物学活性上却大相径庭。IL-12 与 IL-23 主要作为炎/刺激细胞因子,强化炎症信号,对免疫平衡及炎症反应至关重要。...而 IL-27 兼具炎和抗炎双重特性,促进 Th1 分化同时抑制 Th17 细胞发育,由于 IL-27 通过结合 gp130 受体发挥作用,也时常被归类为 IL-6 家族。...03抗感染/炎"先锋队" IL-17 家族▐ 细胞因子成员:IL-17A、IL-17B、IL-17C、IL-17D、IL-17E(IL-25)、IL-17F▐ 特征:均包含四个高度保守的半胱氨酸残基。...所有成员以同二聚体或异二聚体(IL-17A/F)形式存在,通过结合具有同源序列的五种受体(IL-17RA/RB/RC/RD/RE)二聚体发挥功能

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