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图神经网络加速综述: 算法、系统和硬件

通过将相同局部结构中的节点合并为“超级节点”,并将连接超级节点的边合并为“超级边”,可以得到粗图。图粗化的核心步骤是图聚类,通常与图谱相关。一些算法如受限谱近似和逆拉普拉斯,被用于保留一些图属性。...图压缩,通过匹配两个GNN的训练梯度来生成一个压缩图,从而减少GNN的计算量和内存占用。GCond是一种用于生成压缩图的方法,可以在保留原始图训练动态的同时显著减小图的大小。...通过在原始图和压缩图上训练两个具有相同架构的GNN,GCond可以生成压缩图,同时保持原始GNN的性能。...图4 三种可扩展 GNN 训练系统的概述。(a)中的虚线表示来自不同worker的节点之间的依赖关系,而(b)中的灰色节点仅作为子图计算的输入节点。...6.1 异构图上的 GNN 加速 异构图是一种新的数据结构,用于表示现实世界中的复杂图,其中节点和边具有不同类型,彼此具有显着不同的含义。

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数据库关系代数基本运算_不是关系型的数据库

1.1 域 域是一组具有相同数据类型值的集合。 1.2 笛卡儿积 笛卡儿积是域上的一种集合运算。...⑶ 基本关系具备的性质 ① 列是同质的,每一列中的分量是同一类型的数据,来自同一个域; ② 不同的列可出自同一个域,称其中的每一个列为一个属性,不同的属性要给予不同的属性名; ③ 列的次序可以任意交换;...④ 任意两个元组的候选码不能取相同的值; ⑤ 行的次序可以任意交换; ⑥ 分量必须取原子值,每一个分量都必须是不可再分的数据项。...和S(Y,Z),其中X、Y、Z为属性组,R中的Y与S中的Y可以有不同的属性名,但必须出自相同的域集; ② 元组在X上的分量值x的象集K要包含S在Y上投影的集合,满足前面条件的元组在X属性上的投影就是R除以...所以,该关系是一个3NF,但其中仍存在插入和删除操作异常问题。例如,一个新课程和指导老师的数据要插入到数据库中,必须至少有一个学生选修该课程且该指导老师已被分配给他时才能进行。

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    图机器学习无处不在! 用 Transformer 可缓解 GNN 限制

    一个有类型节点或类型边的图被称为异质图,举个例子,在引文网络的项目可以是论文或作者,有类型节点,而 XML 图中的关系有类型边;它不能仅仅通过其拓扑结构来表示,还需要额外的信息 图也可以是有向的(例如追随者网络...表示图处理和操作的常见方法有两种,一种是作为其所有边的集合(可能由其所有节点的集合补充),或是作为其所有节点之间的邻接矩阵。...与其他模式一样,可以通过限制对象的数学表示,以便在数学上与相似对象接近。但在此之中,相似性在图 ML 中很难严格定义:例如,当两个节点具有相同的标签或相同的邻居时,它们是否更相似?...图注:2 到 5 节点小图 边级特征用关于节点连通性的更详细信息补充表示,其中就包括了两个节点之间的最短距离、它们的共同相邻点以及 Katz 指数(指两个节点之间可能走过的一定长度的路径的数量——其可以直接从邻接矩阵中计算出来...图级特征包含关于图相似性和特殊性的高级信息,其中,小图计数,尽管计算成本很高,但提供了关于子图形状的信息。核心方法通过不同的 "节点袋 "方法(类似于词袋)来衡量图之间的相似性。

    1.2K20

    linux软链接和硬链接

    硬链接文件 硬链接文件有两个限制: 1、不允许给目录创建硬链接; 2、只有在同一文件系统中的文件之间才能创建链接。 对硬链接文件进行读写和删除操作时候,结果和软链接相同。...但如果我们删除硬链接文件的源文件,硬链接文件仍然存在,而且保留了原有的内容。这时,系统就“忘记”了它曾经是硬链接文件。而把他当成一个普通文件。修改其中一个,与其连接的文件同时被修 改....对硬链接文件进行读写和删除操作时候,结果和软链接相同。但如果我们删除硬链接文件的源文件,硬链接文件仍然存在,而且保留了愿有的内容。     这时,系统就“忘记”了它曾经是硬链接文件。...而把他当成一个普通文件。 二  两者之间的区别 硬连接指通过索引节点来进行的连接。...在Linux的文件系统中,保存在磁盘分区中的文件不管是什么类型都给它分配一个编号,称为索引节点号(Inode Index)。     在Linux中,多个文件名指向同一索引节点是存在的。

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    解密大型语言模型:从相关性中发现因果关系?

    如果认为LLM的成功在于捕捉术语之间的大量统计相关性,那么关键但缺失的一步是如何处理这些相关性并推断因果关系,其中一个基本的构建块是CORR2CAUSE推断技能。...,XN},可以使用有向图G=(X,E)对它们之间的因果关系进行编码,其中E是有向边的集合。每条边ei,j∈E代表一个因果联系Xi→Xj,意味着Xi是Xj的直接原因。...,XN},一个关于变量之间所有相关性的声明s,以及一个描述变量Xi和Xj对之间的因果关系r的假设h。...为了删除图中的循环,将节点按拓扑顺序排列,这只允许边Xi→ Xj,其中i<j。通过将图的邻接矩阵限制为仅在对角线上具有非零值来实现这一点,从而产生DAG的N(N−1)/2个可能的有向边。...对于因果关系r,重点关注两个节点之间的六种常见因果关系:是父节点、是子节点、是祖先节点(不包括父节点)、是后裔节点(不包含子节点)、混淆节点和碰撞节点。

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    图机器学习无处不在,用 Transformer 可缓解 GNN 限制

    一个有类型节点或类型边的图被称为异质图,举个例子,在引文网络的项目可以是论文或作者,有类型节点,而 XML 图中的关系有类型边;它不能仅仅通过其拓扑结构来表示,还需要额外的信息 图也可以是有向的(例如追随者网络...表示图处理和操作的常见方法有两种,一种是作为其所有边的集合(可能由其所有节点的集合补充),或是作为其所有节点之间的邻接矩阵。...与其他模式一样,可以通过限制对象的数学表示,以便在数学上与相似对象接近。但在此之中,相似性在图 ML 中很难严格定义:例如,当两个节点具有相同的标签或相同的邻居时,它们是否更相似?...图注:2 到 5 节点小图 边级特征用关于节点连通性的更详细信息补充表示,其中就包括了两个节点之间的最短距离、它们的共同相邻点以及 Katz 指数(指两个节点之间可能走过的一定长度的路径的数量——其可以直接从邻接矩阵中计算出来...图级特征包含关于图相似性和特殊性的高级信息,其中,小图计数,尽管计算成本很高,但提供了关于子图形状的信息。核心方法通过不同的 "节点袋 "方法(类似于词袋)来衡量图之间的相似性。

    61020

    hhdb数据库介绍(10-29)

    (双主备库),备份时将检测存储节点状态:如果对应的待备份存储节点被标记为不可用(不论是否动态记载,以当前配置状态为准),备份失败,给出提示如果当前主库与待备份从存储节点(或灾备机房主库)之间复制关系异常...(从库到主库的复制关系异常不影响),备份失败,给出提示如果当前主库与待备份存储节点(或灾备机房主库)之间复制延迟超过10秒,备份失败,给出提示如果当前主库存在GTID断点或待备份的目标从库(或灾备机房主库...若配置库备份复制异常导致配置库备份失败,备份任务仍备份成功,仅在备份列表给出警告提示。备份记录删除备份记录支持快捷删除和批量删除两种删除方式。...)(2)、文件保留周期只是备份文件的保留时间,删除时备份列表记录不会自动删(3)、该定时任务每天零点执行,备份删除时会保留一个全备,即不完全符合时间(如:保留周期为24小时,则会找一个大于等于24小时的完整备份...A,删除A之前所有的自动备份文件)是否添加例外: 可在定时备份计划中设置不进行备份的例外情况。

    6310

    React入门学习(四)-- diffing 算法

    在 React 中,render 执行的结果得到的并不是真正的 DOM 节点,而是 JavaScript 对象 虚拟 DOM 只保留了真实 DOM 节点的一些基本属性,和节点之间的层次关系,它相当于建立在...}] } 其中对于一个节点必备的三个属性 tag,props,children tag 指定元素的标签类型,如“li,div” props 指定元素身上的属性,如 class ,style,自定义属性...拥有相同类的两个组件将会生成相似的树形结构,拥有不同类的两个组件将会生成不同的树形结构。 对于同一层级的一组子节点,它们可以通过唯一 id 进行区分。...diff 运算的时间,因此 React 允许用户通过 shouldComponentUpdate() 判断该组件是否需要进行 diff 算法分析 总的来说,如果两个组件结构相似,但被认定为了不同类型的组件...index 作为 key ,如果我们删除了一个节点,那么数组的后一项可能会前移,这个时候移动的节点和删除的节点就是相同的 key ,在react中,如果 key 相同,就会视为相同的组件,但这两个组件是不同的

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    基于CRDT的一种协作冲突算法

    我们把线性数据用双向链表S表示,其中Left(k)和Right(k)代表双向链表的前置节点和后置节点,Origin(k)是创建节点的直接前身。 我们用的前置节点。...O1的前置节点。O1的前置节点或O1和O2是相同操作。...如果插入中又有新的插入操作,此时会产生冲突,需要解决冲突合理分配插入位置。 意图保全:当且仅当Onew插入到Left(i)和Right(i)两个操作之间时,用户的操作意图才会被保留。...为了确保一致性,YATA要求始终在最左边的未删除字符及其直接后继者之间进行新的插入操作。只有这样,垃圾回收器才能移除第一个删除的插入操作右侧的所有操作。...由于YATA保证所有网站最终都会有相同的内容,因此所有网站最终都会引用与Replace Manager内容相同的插入内容。

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    React入门学习(四)-- diffing 算法

    在 React 中,render 执行的结果得到的并不是真正的 DOM 节点,而是 JavaScript 对象 虚拟 DOM 只保留了真实 DOM 节点的一些基本属性,和节点之间的层次关系,它相当于建立在...}] } 其中对于一个节点必备的三个属性 tag,props,children tag 指定元素的标签类型,如“li,div” props 指定元素身上的属性,如 class ,style,自定义属性...拥有相同类的两个组件将会生成相似的树形结构,拥有不同类的两个组件将会生成不同的树形结构。 对于同一层级的一组子节点,它们可以通过唯一 id 进行区分。...diff 运算的时间,因此 React 允许用户通过 shouldComponentUpdate() 判断该组件是否需要进行 diff 算法分析 总的来说,如果两个组件结构相似,但被认定为了不同类型的组件...index 作为 key ,如果我们删除了一个节点,那么数组的后一项可能会前移,这个时候移动的节点和删除的节点就是相同的 key ,在react中,如果 key 相同,就会视为相同的组件,但这两个组件是不同的

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    使用Cluster API管理数百个Kubernetes集群

    这种简化的方式促进了 80 多个生产集群在不同云提供商之间的迁移。 自动化节点池 在新的云提供商上运行生产工作负载几个月后,我们发现了两个主要的运营痛点。...在后台,该运算符会创建一个新的节点池、清空旧节点池,然后在对用户完全不透明的过程中删除它。从用户的角度来看,所有节点池操作都是通过单个 GitOps 更改就地完成的。...在可预见的未来,我们仍致力于为Cluster API 做出贡献。 早期采用者的风险:我们经历了一次持续数小时的 Sev1 事件,其中生产集群上的 60% 节点被清除。...我们将其追溯到 CAPZ 中的一个错误,其中仅使用序列号后缀来标识节点,而不是使用完整spec.providerID。...这导致Cluster API 使用相同 ID 在集群内引用来自不同节点池的节点,进而删除它们。 自动化增强可靠性:尽管不是主要重点,但我们的自动化工作显著提高了系统可靠性。

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    并发性,时间和相对性(2)

    4.4.2 合并同时写入的值 该算法可确保不会发生数据丢弃,但客户端要做额外工作:若多个操作并发,则客户端必须通过合并并发写入的值来继承旧值。 合并本质和多节点复制中的冲突解决类似,即处理写冲突。...设想人们也可以从他们的购物车删除商品,此时把并发值都合并起来可能会导致错误结果:若合并了两个客户端的值,且其中有一个商品被某客户端删掉,则被删除的项目会再次出现在合并的最终值中。...为防止该问题,项目在删除时不能简单从DB删除,系统必须保留一个对应版本号以恰当的标记该项目需要在合并时被删除。这种删除标记被称为墓碑(逻辑删除)。...4.4.3 版本向量 图-13示例只有一个副本。若存在多个副本但无主节点,算法该如何修改? 图-13使用单个版本号来捕获操作之间的依赖关系,当多个副本同时接受写入时,这不够。...因此,需要为每个K、每个副本都定义一个版本号。每个副本在处理写入时,增加自身版本号,并跟踪从其他副本中看到的版本号。通过这些信息指示要覆盖哪些值、保留哪些并发值。 所有副本的版本号集称为版本向量。

    27030

    开源OLAP系统的比较:ClickHouse、Druid和Pinot

    另一方面,ClickHouse,Druid和Pinot不支持要求在节点之间移动大量数据的查询,例如,两个大型表之间的联接。...ClickHouse具有分区表,由特定的节点集组成。没有“中央权限”或元数据服务器。在其中对某个表进行分区的所有节点都具有表元数据的完全相同的副本,包括存储该表分区的所有其他节点的地址。...在一个系统中存在着几个相当大的功能,而在另一个系统中则没有,还有一些区域,其中一个系统比另一个系统的进步要远得多。但是我要提到的所有这些内容都可以通过合理的努力在另一个系统中复制。...Segment Management in Druid Druid(以及Pinot中的两个节点)中的“主”节点不负责集群中数据段的元数据的持久性以及段与加载这些段的查询处理节点之间的当前映射,此信息保留在...它们即使在非常大的规模(超过500个节点)中仍保留“自动驾驶”属性,而ClickHouse需要专业SRE的大量关注。

    2.6K21

    构建下一代万亿级云原生消息架构:Apache Pulsar 在 vivo 的探索与实践

    其中,vivo 分布式消息中间件团队主要为 vivo 所有内外销实时计算业务提供高吞吐、低延时的数据接入、消息队列等服务,覆盖应用商店、短视频、广告等业务。业务集群已达每天十万亿级的数据规模。...Broker 与 Topic 之间没有直接联系,而是在 Broker 之上抽象出 Bundle 概念,通过 Bundle 与 Topic 建立关系;Topic 通过名称计算哈希值,并散列分布到一致性哈希环中...=2048 注意两个问题: Ledger 过大:最小翻转时间是防止 Ledger 元数据过快增长的手段,但实践发现如果 Topic 分区流量较大,Ledger 的实际值可能远超上述设置的上限阈值。...建议集群维护者建立简单统一的规则处理数据保留策略,如可以设置 TTL = Retention 保留周期值。 数据删除 此处介绍数据的物理删除。...以一个具体产品案例来看,其中有 1 个 Topic、30 个分区、180 个 Bundle: 图 12. 1 个 Topic、30 个分区、180 个 Bundle 的每秒入流量 上图节点间流量差异较大

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    DataStructure

    ,设计出相应的算法,并确保经过这些运算以后所得到的新结构仍保持原来的结构类型。...在图结构中,数据结点一般称为顶点,而边是顶点的有序偶对。如果两个顶点之间存在一条边,那么就表示这两个顶点具有相邻关系。 堆(Heap) 堆是一种特殊的树形数据结构,一般讨论的堆都是二叉堆。...堆的特点是根结点的值是所有结点中最小的或者最大的,并且根结点的两个子树也是一个堆结构。...检索就是在数据结构里查找满足一定条件的节点。一般是给定一个某字段的值,找具有该字段值的节点。 (2)插入。往数据结构中增加新的节点。 (3)删除。把指定的结点从数据结构中去掉。 (4)更新。...改变指定节点的一个或多个字段的值。 (5)排序。把节点按某种指定的顺序重新排列。例如递增或递减。 存储结构时数据及其关系在计算机的存储表示。

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    【数据库SQL server】自学终极笔记

    示例: 术语: 关系:表 关系名:表名 元组:行 属性:列 码:唯一标识行,如:学号 域:相同数据类型值的集合,如性别的域是(男,女) 分量:元组中的一个属性值,如姓名中的王小明 关系模式...当n=2时,称该关系为二元关系 相关概念 元组:关系中的每个元素 候选码:若关系中的某一属性组的值能唯一地标识一个元组 全码:所有属性组是候选码 主码:若一个关系有多个候选码,则选定其中一个为主码...差 - R - S 仍为n目关系,由属于R而不属于S的所有元组组成 R -S = { t|t∈R∧t∈S } 3....外连接与左外连接和右外连接 悬浮元组:两个关系R和S在做自然连接时,关系R中某些元组有可能在S中不存在公共属性上值相等的元组,从而造成R中这些元组在操作时被舍弃了 两个关系中相同的属性组联合...除运算 ÷ 给定关系R (X,Y) 和S (Y,Z),其中X,Y,Z为属性组。 R中的Y与S中的Y可以有不同的属性名,但必须出自相同的域集。

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    数据科学特征选择方法入门

    然后根据无效假设(H0:所有治疗的平均值相等)和替代方案(Hα:至少有两种治疗方法不同)测试该试验统计数据。 ? 皮尔逊相关系数是对-1和1之间两个特征相似性的度量。...一个重要的注意事项是,如果交互项很重要,那么两个低阶X项都必须保留在模型中,即使它们不重要。这是为了将X1和X2保留为两个独立变量,而不是一个新变量。 ?...Lasso和Ridge回归是两种最常见的特征选择方法,决策树也使用不同类型的特征选择创建模型。 有时,您可能希望在最终模型中保留所有特征,但您不希望模型过于关注任何一个系数。...所有的beta并用一个必须调优的lambda(λ)项(通常是交叉验证:将相同的模型与lambda的不同值进行比较)对它们进行缩放。lambda是一个介于0和无穷大之间的值,但最好从0和1之间的值开始。...交互项:当两个特征依赖于另一个特征的值时,量化它们之间的关系;减轻多重共线性并能进一步洞察数据多重共线性:当两个或多个独立变量彼此高度相关时发生。

    1.4K30

    基于可解释的异质相互作用图神经网络的蛋白质-配体亲和力预测

    现有3D-GNN模型的设计思路 方法 为了解决以上问题,论文引入了一种基于相互作用的归纳偏好,包括两个核心假设:第一,蛋白质-配体复合物的结构可以通过异质图来更合理地表示,其中明确区分蛋白质与配体的节点及其相应的边...EHIGN使用异质相互作用图神经网络(HIGN)从四种类型的原子间相互作用学习节点表示。...变体1未考虑基于相互作用的归纳偏好中所做的两个假设。 变体2:仅考虑第一个假设,即异质图假设,但模型仍然遵循瓶颈架构。 变体3:仅考虑第二个假设(亲和力分解假设)和偏差纠正,这意味着输入为同质图。...结果表明,配体原子与其周围所有蛋白质原子的总非共价相互作用力与最近蛋白质原子之间的距离存在较强的负相关关系,相关系数为-0.620。...类似地,蛋白质原子与其周围所有配体原子的总非共价相互作用力与最近配体原子之间的距离也存在中等强度的负相关关系,相关系数为-0.506。

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    关系数据库如何工作

    但是有新的问题(再次!)。如果您在数据库中添加或删除一行(因此在关联的 B+Tree 索引中):您必须保持 B+Tree 内节点之间的顺序,否则您将无法在混乱中找到节点。...在本文的其余部分,我将假设:外关系是左数据集内部关系是正确的数据集例如,A JOIN B 是 A 和 B 之间的连接,其中 A 是外部关系,B 是内部关系。...换句话说,桶大小相同。外部关系的元素与桶内所有元素之间的匹配会花费桶内元素的数量。...这是有效的,因为这两个关系都是排序的,因此您不需要在这些关系中“返回”。该算法是一个简化版本,因为它不处理相同数据在两个数组中多次出现(即多次匹配)的情况。...并发控制确保隔离、一致性和原子性的真正问题是对相同数据的写操作(添加、更新和删除):如果所有事务都只是读取数据,它们可以同时工作而无需修改另一个事务的行为。

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