1背景 jenkins发布时,使用ansible执行远程主机上的启动tomcat脚本发现不生效,启动tomcat的脚本中有环境变量。...ansible主机为:172.16.35.8 tomcat服务器为:172.16.35.56 2tomcat启动脚本 1[app@cecntos jenkins]$ cat tomcat_start.sh...20fi 3现象 在tomcat服务器执行脚本无问题,可以正常启动。...jenkins]$ ps -ef|grep tomcat 3app 15110 28067 0 13:56 pts/4 00:00:00 grep tomcat 在ansible主机执行tomcat启动脚本...tomcat 2app 2390 10257 0 11:28 pts/4 00:00:00 grep tomcat 3[app@cecntos jenkins]$ 4解决方法 在ansible执行启动脚本时
作为一名C语言助教,最恶心的事情莫过于改作业了,尤其是我们学校这种对输入输出都没有严格要求的题目,不能通过类似OJ的判题系统批量批改的,原则上是只能手动批改的。...但是一直做着相同的简单的劳动真的很让人发疯,而作为一名程序员,对待这样的任务很自然就想到了编程。考虑了我现在略懂的语言,对于这种直接和文件达交道的事,我很自然的选择了使用shell脚本。...虽然我对shell脚本其实是一窍不通的,然而正巧身边有一本关于这个的书,就花了一个晚上的时间倒腾了一下,有问题了就翻一下资料,差不多把这个小程序弄了个框架。...其实想想,实现的东西也很简单,但是还是花了我不少的功夫。毕竟,这是我写的第一个实用的shell脚本呢。...实现的功能很简单,就是在文件夹下处理一堆的源文件,把编译之后的输出结果与标准答案(146)比较,如果包含标准答案,就判A,当然如果没有加注释,就只能判为B,如果编译通过了,就判C/D,否则判E。
文章的数据分析量可以用“庞大”来形容,所以作者提供了Shell脚本命令,用于通过qsub命令将一个名为wrap_manifest.sh的脚本提交到集群作业调度系统中运行。...【遗憾的是俺还不太会sh脚本,所以没办法批量化处理太多数据……】 还是来看看MR的部分作者是咋做的—— 孟德尔随机化(MR)用于为共定位 e/sQTL 与 POAG 和/或 IOP 基因座之间的因果关系提供额外的遗传学支持...鉴于 IVW 方法假定不存在横向多向性,因此在进行敏感性分析时,采用了对违反排除-限制假定具有稳健性的方法(The simple-median, weighted-median, MR-Egger, 还有...本杰明-霍奇伯格(BH)FDR的主要IVW/Wald比值检验的MR关联被认为具有统计学意义。.../Path/GWAS.txt MR/data/GTEx_v8_eQTL/ .v8.signif_variant_gene_pairs.txt.gz qsub MR/src/wrap_manifest.sh
shell 脚本中关于用户输入参数的处理 bash shell 脚本提供了3种从 用户处 获取数据的方法: 命令行参数(添加在命令后的数据) 命令行选项 直接从键盘读取输入 1 命令行参数 像 shell...脚本传递数据的最基本方法是使用 命令行参数..../temp.sh numbe bash shell 还提供了几个特殊的变量: $# 脚本运行时携带的 命令行参数的个数; $* 将命令行上提供的 所有参数 当做 一个单词 保存; $@ 将命令行上提供的...这里从略, 等有需要用到再回来补上. 3 获取用户输入 尽管 命令行选项 和 参数 是从 用户处 获取输入的一种重要方式, 但有时脚本的交互性还需更强一些....比如在脚本运行时问一个问题, 等待运行脚本的人来回答, bash shell 为此提供了 read 命令. 3.1 read 命令 read variable_name 从标准输入(键盘) 或 另一个文件描述符中
蓝鲸作业平台能干嘛? 蓝鲸作业平台的功能非常的强大。 基本上可以理解为只要是命令行或者脚本能搞定的事情,蓝鲸作业平台都能干。...蓝鲸作业平台支持针对Windows平台批量执行上述脚本和命令。 Linux平台上单个的bash命令、shell脚本的执行? 完全没问题。 蓝鲸作业平台支持针对Linux平台批量执行上述脚本和命令。...依然完全没问题,蓝鲸作业平台支持这两种类型的脚本。 那如果需要在部署在linux上的DB服务器执行SQL脚本呢? 依然没有问题。蓝鲸蓝鲸作业平台支持SQL批量执行。 ?...蓝鲸作业平台支持多种脚本的批量执行,可通过手动编写、从已有的脚本克隆、从本地上传,三种方式导入脚本并批量执行。 ?...此后,蓝鲸平台用户执行任务的时候,只能执行分配的帐号具有的权限的相应任务。此功能目前只有企业版支持。 添加服务器本地帐号,并把它授权给蓝鲸平台帐号。 ? ?
有幸在工作中体验了几个计算集群的使用,几乎每个计算集群都有专门的集群调度系统,而当需要在短时间对多个系统做测试是第一道障碍就是熟悉各个调度系统的操作指令,以下列举近期使用到的几个分布式作业调度系统的常用操作指令和几个超算中心使用体验...以下为常用指令 qload -w: 显示可用队列资源使用情况 bsub: 提交作业 常用参数 bsub -q q_x86_share -N 1 -o job.out /path/job.sh, 注意投递任务脚本路径必须填写绝对路径...: 查看计算节点使用情况 qsub job.pbs: 提交作业 job.pbs中填写提交参数与执行程序,参数格式为 #PBS -q queue qstat: 查看已提交作业 可通过-u 参数指定用户名进行只查看自己的任务...SGE, 以下为常用指令 qconf -sql: 显示队列 qconf -sq QUEUE: 显示指定队列信息 qhost: 查看计算节点使用情况 qsub: 提交作业 qstat:查看已提交作业 qdel...欢迎您继续补充完善 那我就补充一下,早在 2015年9月29日 我就介绍过关于qsub和condor两种在集群上面提交任务的方式比对 condor_q 可以用来查看任务提交情况 condor_rm 可以用来杀掉提交的任务
用户使用PBS命令,将上述编写好的脚本提交到PBS系统。 PBS系统根据脚本中作业的资源需求和集群的可用资源情况,将作业放入作业队列中等待执行。...在这里,/bin/bash表示该脚本将由Bash解释器执行。 接下来,从第2行开始的这些#开头的语句,不是注释,而是PBS作业调度系统的作业指令。...在Vim中编辑完毕自己的脚本文件后,即可保存并退出Vim。首先,我们需要按下Esc键,退出编辑模式;随后,依次输入:wq这3个按键,即可保存并退出VIm。 ...qsub py_task.pbs 上述代码会将我们前述编辑好的PBS脚本文件py_task.pbs提交到PBS作业调度系统中,并开始等待系统分配资源,从而执行作业。...当然,有的时候执行上述代码,会出现如下图所示的错误,即qsub: submit error (Unauthorized Request...)字样的报错。
在 PBS 任务递交系统的 HPC 集群上,我们需要在登录节点上用 qsub 命令递交任务,把计算任务投递到计算节点中运算。...投递交互式任务 使用 qsub 的 -I 可以创建交互式作业,这样你就能在终端上直接交互式使用计算节点。...比如,递交的队列名字为 queueName,可以: qsub -I -q queueName 成功的话,终端会显示连接上的节点名字: shiyanhe@shiyanheNode23:~ 这时候,你在终端上执行的各种命令...如要退出交互作业,可在终端输入 exit 命令,或使用按键 Ctrl+D。...核 64 Gb 内存的资源: qsub -I -q queueName -l ncpus=8,mem=64gb -N jupyter 查询所有队列,可以使用 qstat -q。
这样一来,表面上我们仍然可以使用 PBS 中常用的脚本文件和相关命令,而实际上管理和执行任务的作业管理系统则是 Slurm。...PBS 常用命令 作业控制 qsub:提交作业 qdel:取消作业 qsig:给作业发送信号 qhold:挂起作业 qrls:释放挂起的作业 qrerun:重新运行作业 qmove:将作业移动到另一个队列...作业属性: 通过命令行参数传递给 qsub 命令; 在 PBS 脚本中以 #PBS 方式指定。...ncpus 正整数 设定作业所需的 CPU 数目 PBS 脚本 PBS 脚本本质上是一个 Linux shell 脚本,在 PBS 脚本中可以用一种特殊形式的注释(#PBS)作为 PBS 指令以设定作业属性...节点:Node 即指计算节点 包含处理器、内存、磁盘空间等资源 具有空闲、分配、故障等状态 使用节点名字标识 分区:Partition 节点的逻辑分组 提供一种管理机制,可设置资源限制
一、背景 最近在使用记事本编写带有包名并且有继承关系的java代码并运行时发现出现了很多错误,经过努力一一被解决,今天我们来看一下会遇见哪些问题,并给出解决办法。...解决办法为:我们需要使用javac *.java命令来进行运行,因为此时存在继承关系,编译子类的同时也需要先编译父类 2)运行java Zi命令,出现以下错误 ? 这是什么原因呢?...代表在当前目录下创建包路径)命令来进行编译,这样javac命令会自动帮我们创建包名所指定的文件夹,并在该文件夹下创建Zi.class文件。 ?...由此我们得出了在CMD窗口中使用javac和java命令进行编译和执行带有包名的具有继承关系的类的方式: 1.使用javac -d . *.java进行编译 2.使用java com.hafiz.Zi(...带包名的类全名)命令进行运行!
(2) code -这包含rpcr和rLucas(分析中广泛使用的两个包)、一些具有必要功能的单独r脚本,以及与模型创建有关的4个文件夹。...MODEL_CODE具有训练每个队列上的模型以及执行来自第一个队列的模型的外部验证所需的代码。Models_c1、Models_c2和Models_c3包含训练好的模型。...首先,precess.sh脚本调用以下脚本,这些脚本执行以下操作: fastp.sh --将FASTQ使用fastp质控。 align.sh --bowtie2和samtools生成bam文件。...https://github.com/cancer-genomics/PlasmaToolsHiseq.hg19 以precess.sh和fastp.sh为例来欣赏下代码,很规范和整洁,qsub任务提交...fastp.sh qsub -hold_jid_ad fastp.sh align.sh qsub -hold_jid_ad align.sh post_alignment.sh qsub -hold_jid_ad
SQL-MAP是PDF.NET(PWMIS数据开发框架)具有特色的开发技术,它可以将SQL语句映射成DAL代码,而且能够做到无需IDAL和DalFactory自动切换数据库到另外一个数据库系统,...,它表示定义一个自定义的简单类型,在XSD文件的节点中使用 type 属性来引用它即可。...在节点属性中,use="required" 表示必须的属性,use="optional" 表示可选的属性。 整个XSD文件的编写要注意的也就这么多,编写起来还是比较简单的。...有了这个XSD文件,在建立的Sql-Map配置文件的 标签中,加入这个XSD的使用声明,就能够看到智能提示的效果了。...-- 在下面敲入尖括号,就能够出现当前节点区域内的应该编写的内容,来试试吧 --> 有了这个SqlMap.config文件,就能够使用代码生成器自动生成DAL代码了。
否则CPU时间片会轮流分配给各个人的任务,从而影响所有人的正常作业。...、pbs_sched、pbs_mom、trqauthd添加到系统初始化简脚本/etc/init.d/中,并设置为开机启动。...帐号 $adduser user1 #切换都master,使用非root用户user1测试提交作业 $ssh master $su user1 $echo sleep 7 | qsub #查看作业分配和状态...,开启其服务,创建提交用户和master、salve1一致 测试 $ssh master $su user1 $echo sleep 7 | qsub $qstat -an #追踪某个作业 $tracejob...过了一两天看到有人在提到,需要在计算节点添加一致的非root用户,使其有一样的uid和gid,结合日志的错误信息Bad UID,然后分别在不同的计算节点添加一致的user后,执行提交作业,作业可以顺利提交到不同的节点上执行了
我们经常会看见输出变量的时候会带有引号,如双引号、单引号,这与正常的变量有何差异呢? ? 除此之外,还有种倒单引号,它的内容只能是命令。...例3:判断文件是否存在,若存在,则输入“ok”;若不存在,则输入“file not exist”。...3.个例展示 前面展示的可能是我们平时编写脚本经常碰到的问题,但是我们设计到数据处理时,往往交互式命令不能满足需求,我们得通过脚本批量执行来达到我们的要求。...例7:问题描述:我们运行模式时,如运行CESM模式,我们一般会经历几个操作步骤,如进行环境的配置;新建个例;进行setup和build;提交作业等。.../cesm2.job cat cesm2.job 上诉程序的主要步骤: 设置并修改环境变量,设置路径 创建新的case个例 修改运行的相应参数 setup和buliding 修改并替换初始场 提交作业
分析Histgram与NTuple的存储特点 4. 给出后续*.root文件读取的代码示范 5....服务器后台qsub提交作业 1. exampleB5与exampleB4a中与root数据存储有关的代码 exampleB5 B5Analysis.hh #ifndef B5Analysis_h #define...服务器后台qsub提交作业 1.提交单次作业:qsub oneJob.sh ----oneJob.sh #PBS -N lxzjob #PBS -l nodes=1:ppn=1 exampleB1 /data.../simulation/home/liangxz/geant4_workdir/B1/run2.mac > log 2.提交多个作业:..../bin/bash # i 代表要申请多少核心 i=1 while(( \${i}<=5 )) do qsub -v NAME="run${i}.mac" oneJob.sh
输入:tree & final.mdl & text & L.fst & feats 输出:ali.JOB.gz (根据重新构建的图产生) & final.mdl (cp from 训练过程的最终结果)...diagnostic/analyze_alignments.sh --cmd "$cmd" $lang $dir 备注: compile-train-graphs & gmm-align-compiled 输入
2023-07-11:给定正整数 n, 返回在 [1, n] 范围内具有 至少 1 位 重复数字的正整数的个数。 输入:n = 100。 输出:10。...该代码在给定正整数n的范围内采用了一种比较高效的算法,通过一系列的位运算和迭代计算,找出了每个位数下非重复数字的个数,然后根据n的位数和偏移量来计算在该位数下包含至少1位重复数字的正整数的个数,并将它们相加得出最终结果...该代码的时间复杂度为O(log10(n) * 2 ^ 10),其中n是输入的正整数。...主要消耗时间的是计算每个位数下非重复数字的个数,该计算的时间复杂度为O(log10(n)),而计算每个长度为len的非重复数字的个数的时间复杂度为O(2 ^ len)。...该代码的空间复杂度为O(1),因为它只使用了常量级的额外空间来保存一些临时变量,不随输入规模的增长而增加。
少部分节点的算力不如计算节强大,但是允许用户登录。它们称作服务节点(或登录节点或头节点),只运行用户脚本、编译文件、任务管理软件。用户通常登录这些节点,以访问机群。...下图是NASA的2004 Columbia超级计算机,它有10240个处理器,具有一定代表性: ? 如何在HPC群上运行代码呢?通常是在服务节点登录,使用任务规划器(job scheduler)。...首先,先来看一些定义: 任务:这是应用的元数据,例如它的可执行文件、输入和输出、它的硬件和软件需求,它的执行环境,等等; 机器:这是最小的任务执行硬件。...这些指令的Windows批处理脚本形式是#PBS 或 REM PBS (例如,#PBS -q serial or REM PBS –q serial)。...我们可以如下提交文件: $ qsub simple.sh 因为没必要为这样的一个简单任务写Shell文件,qsub用行内参数就可以了: $ qsub -- /usr/local/bin/python3.5
Lab到本地机器 在本地打开转发的远程机器Jupyter Lab 安装 又是俗套的流程了,安装也很俗套的简单 python -m pip install jupyter-forward #conda...jupyter -forward依赖于远程主机的SSH身份验证机制。...在计算节点运行要稍微麻烦一点,需要指定 --launch-command 选项,示例如下: jupyter-forward username@supersystem.univ.edu \ --launch-command "qsub...-q regular -l select=1:ncpus=36,walltime=00:05:00 -A AABD1115" 其实是利用了PBS作业管理系统在计算节点执行了JupyterLab。...JupyterLab也有团队协作的插件,感兴趣的都可以去尝试一下。
tags可让您使用指定了标签的跑步者来运行作业,此runner具有ruby和postgres标签。...job: tags: - ruby - postgres 给定带有osx标签的OS X Runner和带有windows标签的Windows Runner,以下作业将在各自的平台上运行...为了更好地控制retry哪些失败,可以是具有以下键的哈希值: max :最大重试次数. when :重试失败的案例. 根据错误原因设置重试的次数。...script_failure :脚本失败时重试。 api_failure :API失败重试。 stuck_or_timeout_failure :作业卡住或超时时。...stale_schedule :无法执行延迟的作业。 job_execution_timeout :脚本超出了为作业设置的最大执行时间。 archived_failure :作业已存档且无法运行。
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