在数据可视化的研究热潮中，如何让数据生动呈现，成了一个具有挑战性的任务，随之也出现了大量的可视化软件。相对于其他商业可视化软件，Python是开源且免费的，而且具有易上手、效果好的优点。...它可以根据热力图或树状图的完成度或点的相关度对数据进行过滤和排序。...2 HoloViews HoloViews是一个开源的Python库，旨在使数据分析和可视化更加简便，可以用非常少的代码行完成数据分析和可视化。...声明意味着用户只需要提供数据列与编码通道之间的链接，例如，x轴、y轴、颜色等，其余的绘图细节它会自动处理。...在创建绘图后，用户可以在它的上面添加字段，以便对数据进行筛选和排序。
image.png 对照论文然后看数据和代码，能够更好的理解论文的设计和分析思路，非常好的学习素材。论文的主要研究内容还没有看太懂，好像是研究了越南和坦桑尼亚的一些厕所的微生物多样性。...数据集的部分截图，总共是81行，52列，行是物种，列是地点，数值代表物种丰度 ?...row.names=1指定第一列作为数据集的行名 check.names 参数我平时很少用，，查了一下帮助文档，作用是检查每列的名字是否符合规范 ?...(Samples),transform,rescale=sqrt(Value)) ggplot2画图 library(ggplot2) p <- ggplot(df, aes(Species, Samples...image.png 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本
对于一些简单的绘图，特别是与IPython结合使用时，pyplot模块提供了一个matlab接口。你可以通过面向对象的接口或通过一些MATLAB的函数来更改控制行样式、字体属性、轴属性等。...热图、等高线图和形状文件。...、空间图、泰森多边形图、形状文件和许多更常见的空间可视化的实现。...除了为常用的地理数据可视化提供内置的可视化功能外，geoplotlib还允许通过定义定制层来定义复杂的数据可视化（绘制OpenGL，如分数、行和具有高性能的多边形），创建动画。...你可以根据数据的完整度对数据进行排序或过滤，或者根据热度图或树状图来考虑对数据进行修正。
处理缺失的数据是一件让人痛苦的事，Missingno通过使用视觉摘要来快速评估数据集的完整性，而不是通过大篇幅的表格。它可以根据热力图或树状图的完成度或点的相关度对数据进行过滤和排序。...HoloViews是一个开源的Python库，旨在使数据分析和可视化更加简便，可以用非常少的代码行完成数据分析和可视化。 除了默认的Matplotlib后端，它还添加了一个Bokeh后端。...因为是基于Vega-Lite（交互式图形语法）的声明性统计可视化库，Altair API具有简单、友好、一致等特点。...声明意味着用户只需要提供数据列与编码通道之间的链接，例如，x轴、y轴、颜色等，其余的绘图细节它会自动处理。...在创建绘图后，用户可以在它的上面添加字段，以便对数据进行筛选和排序。
，再到验证效果，每一步都配有具体操作和注意事项，具有很强的实操性。...本文将探讨如何使用Holoviews创建复杂的可视化布局，并展示具体的代码实现。1. 安装Holoviews在开始之前，确保已经安装了Holoviews和相关依赖库。...结合小提琴图和热力图在一些复杂的可视化场景中，可能需要将分布图和热力图等进行组合。...= (heatmap | violin)complex_layout这段代码结合了热力图和小提琴图，展示了如何通过不同的可视化方式来分析同一组数据。...combined_layout = pn.Tabs( ('Tab 1', layout1), ('Tab 2', layout2),)combined_layout.servable()在这个示例中，我们创建了两个不同的布局
什么是弦图 下面这张图就是弦图，主要用于展示多个对象之间的关系，连接在圆上任意两点之间的线段叫做弦。...->对象的方向 一般来说，弦图可以用于以下几种场景： 人口迁徙（不同城市之间迁入迁出） 电竞战队或球队之间选手交易 具有重叠成分的不同成品与各成分关系 类似以上几类场景的情况等等 今天，我们绘制弦图要用到的可视化库是...弦图绘制 HoloViews是一个开源的Python库，可以用非常少的代码行中完成数据分析和可视化，除了默认的matplotlib后端外，还添加了一个Bokeh后端。...官网：http://holoviews.org/ 首先，我们需要安装第三方库holoviews pip install holoviews 我们先看看官方案例 import holoviews as...，相信大家也可以做出酷炫的弦图了！
Matplotlib Matplotlib 是 Python 的一个绘图库，可以绘制出高质量的折线图、散点图、柱状图、条形图等等。它也是许多其他可视化库的基础。...Python 数据可视化库，专门用于绘制统计图形，如热图、小提琴图、带误差线的折线图等等。...它可以绘制出高质量的折线图、散点图、柱状图、条形图等等。...Holoviews 是一个 Python 可视化库，可以创建交互式的数据可视化，支持多种类型的可视化图形，如折线图、散点图、柱状图、热力图等等。...它支持创建多种类型的网络结构，如有向图、无向图、加权图等等。
在数据科学和数据可视化领域，Holoviews 是一个非常强大的 Python 库，它可以帮助我们轻松地创建各种复杂的可视化布局。...Holoviews 提供了一个高层次的接口，使得创建交互式和静态可视化变得简单而直观。本文将介绍如何使用 Holoviews 来创建复杂的可视化布局，让你的数据以最直观的方式展现出来。...你可以使用 pip 进行安装：pip install holoviews示例：创建一个复杂的可视化布局让我们通过一个示例来演示如何使用 Holoviews 创建一个复杂的可视化布局。...height=300), opts.Scatter(width=600, height=300), opts.Layout(shared_axes=False))在这个例子中，我们创建了两个曲线图和两个散点图...然后，我们将它们组合在一起，形成一个复杂的布局。通过使用 opts 方法，我们可以设置图形的大小和样式，以及是否共享坐标轴等参数。
很多其它的python绘图库是基于matplotlib开发的，比如seaborn、ggplot、plotnine、holoviews、basemap等。...柱状图、点线图、直方图、饼图、堆积柱状图、填充直方图、直方散点图、面积图、趋势图、箱型图、小提琴图、数据地图、雷达图、漏斗图、嵌套饼图、各类三维图等等，不胜枚举。..., 4],[1, 2, 3, 4],label='my first line') #绘图函数plot plt.legend() # 图例函数，用于调整图例位置等 plt.xlabel('X') # x轴标签...plt.ylabel('Y') # y轴标签 plt.show() # 显示图表 4、结果 这里的pyplot模块方法函数都是做什么的呢？...plot() : 根据给的x和y值绘制直线或标记图 figure() : 创建一个新的图表 legend() : 在图表上放置图例 xlabel() : 设置x轴标签 ylabel() : 设置y轴标签
尽管如此，x 轴和 y 轴热图是在图像坐标中定义的，它不能表示图像边界外的身体部位。此外，物体或人体本身的遮挡可能会导致深度轴预测的歧义。...方法 VisDB方法结构图，其中紫色为可见点，橙色为不可见点 先导：基于热图的表示 给定输入图像，基于热图的先验方法为每个人体关节和网格顶点估计三个一维热图 H=\left\{H^x, H^y, H...x 和 y 轴热图 H^x, H^y 在图像空间中定义，z 轴热图 H^z 在深度空间中相对于根关节定义。...为了处理只有部分身体可见的更实际的场景，作者对基于热图的表示进行了以下调整：1）为了增强 x 轴和 y 轴热图，我们预测二进制截断标签 S^x, S^y ，指示关节是否或顶点在图像帧内，2) 对于...z 轴热图，我们预测一个二进制遮挡标签 S^z ，它指定深度方向的可见性。
，hvPlot 是一个非常棒的空间可视化工具库，它利用了其他 Holoviz 库——Holoviews、Geoviews、Datashader 和 Colorcet，所以可以极大简化创建大型数据集的交互式地图所需步骤...如下图所示：pn.Row(plot_cause_count(2006) , plot_cause_burn(2006), width=1000)图片这里需要注意的是 Panel 和 hvPlot 如何识别这两个子图共享相同的...y 轴。...分析结果组装现在我们已经从不同维度进行了分析，我们使用小部件把它们进行组合，使我们可以沿着时间轴动态选择和做一些数据探索，构建组合仪表板的代码如下：plots_box = pn.WidgetBox(pn.Column...gif动图，大家快快实际操作一下吧！
2.1 散点图 散点图，常用于分析离散数据的分布。比如我们有一个数据集，里面的图片有不同的大小，我们可以利用x，y轴分别对应图片的宽高，从而画出图片尺度的空间分布情况。...越密集的地方，说明该尺度类型的图越多，如下图所示。 ?...2.3 直方图，饼状图 这两种图，都常用于统计数据的分布比例以及响应幅度，比如一幅图片的亮度分布情况，不同网络层的参数量，计算时间代价。 ? ?...如果在低维空间中具有可分性，则数据是可分的，如果不具有可分性，可能是数据不可分，也可能仅仅是因为不能投影到低维空间。 下图是t-SNE可视化结果图，可以看出，数字都有很明显的聚类效果。 ?...4. holoviews：很酷炫的工具，与season差不多，1000+star。 https://github.com/ioam/holoviews ?
带有成千上万数据点的图形会降低浏览器处理速度。 ◆ ◆ ◆pygal ? 基本点图 Pygal是制作漂亮的即用图表的优选绘图库，它只需要编写很少的代码。...每种表格都被打包成一个类函数（如：pygal.Histogram()制作柱状图， pygal.Box() 制作箱型图），并且它有各种色彩默认风格。...交叉过滤器示例 Bokeh受到《The Grammar of Graphics》中概述的概念启发。 你可以把各个组件逐个叠加在一起来创建最终的图表——例如，你可以以坐标轴为起点，添加点、线、标签等。...HoloViews融合了Seaborn和pandas，扩大了pandas数据帧和Seaborn的统计图表的功能。 ◆ ◆ ◆plotly ?...范围滑块示例 从简单的条形图表到复杂的3D网格图形，Plotly拥有广泛的具有出版物品质的图表类型。
2 HoloViews HoloViews是一个开源的Python库，结合Bokeh提供的交互式小部件，可以使用HTML5和WebGL快速生成交互式视图，以及进行高维数据的可视化探索。...可以在线绘制条形图、散点图、饼图、直方图等多种图形，可以画出很多媲美Tableau的高质量图。Plotly支持在线编辑图形，支持Python、JavaScript、MATLAB和R等多种语言的API。...plotnine的优点为代码简洁，易学；绘制出的图流畅大方；不需要很多的代码就可以绘制出很不错的图。在使用plotnine绘图之前，首先需要理解绘图的基本概念。...因为是基于Vega-Lite（交互式图形语法）的声明性统计可视化库，Altair API具有简单、友好、一致等特点。...它可以根据热力图或树状图的完成度或点的相关度对数据进行过滤和排序。
sqlite3 # 数据处理 import numpy as np import pandas as pd # 数据大屏 import holoviews as hv import colorcet...as cc import panel as pn from holoviews.element.tiles import EsriImagery from datashader.utils import...要是我们要是想要给图表添加一个时间轴，通过拖拽时间轴来不断调整图表当中数据的变化，就可以这么来做，代码如下 # 绘制时间轴 year = pn.widgets.IntSlider(name='Year...接下来我们来绘制几张简单的柱状图，首先是对不同的火灾等级进行分组统计并且绘制成柱状图，代码如下 def plot_class(year): year_df = df[df['FIRE_YEAR'...，根据不同级别来区分".format(year)) plot_class(2006) output 当然我们也可以绘制将柱状图绘制成是水平方向的，例如我们想要探究一下不同原因造成的火灾的持续的时间有多长
Seaborn是在matplotlib的基础上进行了更高级的API封装，从而使得作图更加容易，在大多数情况下使用seaborn能做出很具有吸引力的图，而使用matplotlib就能制作具有更多特色的图。...横向比较的话，plotnine的效果更好。这两个绘图包的底层依旧是matplotlib，因此，在引用时别忘了使用%matplotlib inline语句。...值得一说的是plotnine也移植了ggplot2中良好的配置语法和逻辑。 holoviews HoloViews是一个开源Python库，旨在使数据分析和可视化变得简单无缝。...使用HoloViews，您通常可以在极少数代码中表达您想要做的事情，让您专注于您想要探索和传达的内容，而不是绘图过程。...受 Seaborn 和 ggplot2 的启发，它专门设计为具有简洁，一致且易于学习的 API 。
，并且，它提供的Bar Chart Race（动态条形图）有一套完整的参数让我们可以绘制出自己想要的动态条形图。...plotly Python绘图库可以制作交互式的线图、散点图、面积图、条形图、箱型图、分布图、热力图、子图、极坐标图、气泡图等多种发行级别的图形。 ? ?...GitHub链接：https://github.com/ResidentMario/missingno GitHub Star：2.2k 2.7 HoloViews HoloViews是一个开源的Python...官方文档链接：https://holoviews.org/ GitHub链接：https://github.com/pyviz/holoviews GitHub Star：1.6k 2.8 Mayavi...官方文档链接：https://www.echartsjs.com/zh/tutorial.html 3.2 AntV G2 G2 是一套基于可视化编码的图形语法，以数据驱动，具有高度的易用性和扩展性，用户无需关注各种繁琐的实现细节
前面我们在人工智能大模型不会告诉你的热图绘制技巧 演示了如何使用ggplot2热图扩展包（ggalign），可以快速替代之前的 pheatmap： 比如我们可以先去geo数据库里面下载 GSE104171...它使你能够使用熟悉的 ggplot2 语法创建复杂热图。...使用以下自定义布局： align_group()：将布局轴分组到具有组变量的面板中。 align_kmeans()：通过 kmeans 将布局轴分组到面板中。...热图注释轴和图例自动生成。 树状图可以轻松自定义和着色。 对图表大小和间距有灵活的控制。 可以通过面板区域轻松与其他 ggplot2 图表对齐。 可以轻松扩展用于其他聚类算法或注释图表。...更复杂的示例 以下是使用 ggalign 进行的一些更高级的可视化示例： 热图-布局控制 heatmap_layout()/ggheatmap函数用来初始化热图布局 输入数据 数据输入可以是数值或字符向量
二，Seaborn Seaborn 基于 matplotlib，具有多种特性，比如内置主题、调色板、可以可视化单变量数据、双变量数据，线性回归数据和数据矩阵以及统计型时序数据等，能让我们创建复杂的可视化图形...因此，这些图在美化方面是相似的，自定义图时用的语法也都非常相似。Seaborn主要基于Matplotlib进行抽象层封装，提供了更加直观的语法和开箱即用的特性。...六，Plotly Plotly则是一个功能强大且多功能的Python库，提供了广泛的工具来创建交互式且具有视觉吸引力的绘图(借助浏览器渲染图片)。...十，holoviews (html渲染) HoloViews是一个开源Python库，旨在使数据分析和可视化变得简单无缝。...使用HoloViews， 您通常可以在极少数代码中表达您想要做的事情，让您专注于您想要探索和传达的内容，而不是绘图过程。
图2 主页面左边是能做的图形种类，右边是图形示例，包括韦恩图、热图、circos图、火山图、GO富集弦图，另外还有箱体图、柱状图、线图、散点图、漏斗图等，基本上囊括了我们文章发表的常见图形，界面相当友好...图3 出现如下界面，左上角有提示，可以粘贴6个列表，右边显示如何引用。 ? 图4 粘贴自己的数据，演示如下，将两列基因名分别粘贴到右侧两个框内，并修改相应的名字，其他参数默认，然后自动出图 ?...图9 接下来，小编也演示下，密钥一栏输入test（其他作图种类都一样），按右侧要求整理log2FC、p-value两列数据并粘贴，在上下调颜色处输入up 、down，以及x轴、y轴名字，（这里吐槽一下，...图12 ? 图13 ? 图14 这个热图效果还是挺不错的。...图15 ? 图16 此处，我们选择按照logFC排序，看下结果，炫目多彩 ?
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