目前生物信息学研究者已经开发了2000多个分子生物学数据库，几乎覆盖了生命科学的各个领域，大致可分为五类：基因组数据库、核酸序列数据库、蛋白质序列数据库、生物大分子（主要是蛋白质）三维结构数据库以及根据生命科学不同研究领域的实际需要...本期推文将介绍三大综合类公共数据库NCBI、EMBL和IMG。...数据库），包含翻译自核酸数据库（GenBank，RefSeq，TPA）注释的编码区的蛋白序列，以及来自SwissProt、PIR、PRF和PDB等数据库的数据信息。...三大核酸数据库（EMBL-Bank/GenBank/DDBJ）中注释的编码序列都被自动翻译并加入该数据库中，同时收录来自PDB数据库以及Ensembl、Refeq和CCDS基因预测的序列。...UniParc（UniProt Archive），是一个综合性的非冗余数据库，包含了所有主要的、公开的数据库的蛋白质序列。
就小编所知，目前NCBI中的GEO数据库就囊括了大量单细胞测序的数据，但是相对于一些专库专用的数据库来说，其存储相对比较零散。...今天小编就“知你所想，予你所求”，为大家介绍几款单细胞测序的数据库。...tabula-murisa网页 以上两个数据库主要基于两篇已发表的文献搭建而成，主要目的是通过网页版的形式展示文章中的结果，并非以收集并存储多种来源的公共单细胞测序数据为目的。...篇非免疫的单细胞文献，且数据库仍在持续更新中。...CancerSEA下载界面 当然如此火热的单细胞领域不仅仅只有上面几款数据库，偷偷告诉你：其实小编还收藏了其他几款实用的数据库，想get吗？下期敬请期待!
但在该领域中，仍然缺乏存储单细胞公共数据的平台，因此这些数据集的可访问性成为其有效使用的障碍。此外，通过外部单细胞数据进行自身数据的验证也是今后单细胞数据分析的一个重要趋势。...前面一期我们介绍了单细胞测序公共数据库（上），今天，小编就基于上篇的基础，继续为大家介绍几款单细胞测序公共数据库。...但可惜的是，该数据库只更新到2017年，现已停止更新。scRNASeqDB主要目的是促进基于公共数据的各种人类单细胞基因表达谱的分析和可视化。...相比于前三个数据库（多为低通量测序数据，细胞数较少）来说，Single cell portal收录了169个研究的4152655个单细胞的测序数据，并且仍在持续更新当中。...Single cell portal数据下载界面 结合上下篇，小编总共为大家介绍了七款单细胞公共数据库，如果你想利用公共数据对自己的数据进行验证，或者想要深挖公共数据，不妨试一试吧!
三种CloudKit数据库 介绍一下CloudKit中的三种数据库： 公共数据库 公共数据库存放的是开发者希望任何人都能够访问的数据。...公共数据库的内容在CloudKit仪表台是可见的。 公共数据库的数据容量计入应用程序的CloudKit存储配额。...后面讨论的鉴权，尽管操作对象为托管对象或本地持久化存储，但检查的却是网络端的记录或数据库。 公共数据库 vs 私有数据库 我们从几个维度来比较一下公共数据库和私有数据库。...由于公共数据库的一些技术限制，上述的机制无法适用于公共数据库的同步。...公共数据库的适用场合 通过CloudKit调用公共数据库和通过Core Data with CloudKit同步公共数据库两者的技术特点不同，考虑的侧重点也不一样。
提到蛋白质数据库，大家都很熟悉了，基本上每个数据库都会配备一个网页工具让大家查询或者做一些简单的蛋白质数据分析，以下是一些知名的蛋白质组数据库： TrEMBL: 由欧洲生物信息学研究所（EMBL-EBI...）维护的蛋白质数据库，提供基于UniProt程序的自动注释信息。...但是蛋白质组数据库并不是蛋白质数据库，主要是ProteomeXchange联盟，它是一个开放的、公共的数据存储平台，专门用于存储和共享质谱（MS）数据。...PRIDE: PRIDE（蛋白质组学鉴定数据库）是EMBL-EBI（欧洲生物信息学研究所）维护的一个数据库，它是ProteomeXchange联盟的一部分。...sortDirection=DESC&page=2&pageSize=20 查看数据库目前有的数据集数量：List of Datasets (27273) 比如最近的一个公共数据集就是：Neutrophil-derived
元组 t1 = ('a', 'b', 'c', 'd') print('aa' in t1) # False print('aa' not in t1) # True 二、公共方法 函数 描述 len...集合不支持下标 四、总结 运算符 in / not in 公共方法 len() del() range() enumerate() 数据类型转换 tuple() list() set()
目前很多对于公共测序数据的分析，很多都是集中在肿瘤数据当中，主要原因还是在于，肿瘤有一个TCGA的数据库。倒不是说TCGA数据库有多大的样本，而是在于TCGA数据库可以获得每个患者的临床数据。...为了保证选择的数据量多，作者利用GEO和AarryExpress两个数据库检索符合要求的数据。在进行一系列的筛选，最后获得了12个和败血症相关的数据集。 ?
影响因子：2.656 导读 这是一篇完全基于公共数据挖掘，没有做任何实验的文章，充分利用了多种数据库、网络软件和工具，除了WGCNA的分析过程，其他部分不需要编程基础。...目前包括9736个肿瘤样本和8587个正常样本，数据分别来自TCGA数据库和GTEx。 ? 1....应用范围： 这篇文章中是利用该数据库对hub genes在蛋白质水平上验证。做肿瘤数据挖掘的可以利用该数据库对感兴趣的基因进行蛋白质验证，不用做实验，故事还可以说的更饱满些。...（数据库内容很多，之后详细介绍。）...虽然这篇文章属于套路文章，利用的也都是公共数据资源和工具，但是也有值得借鉴的地方，利用WGCNA找到hub genes后，从转录本水平、翻译水平、临床结果和基因组变异多个角度验证；还有文中提到的3个公共数据库资源值得挖掘和利用
在Django项目中，对于 js、css、images 等静态文件资源，需要一个公共的存放路径，不然每个应用都新建一个 static 文件夹的话，其实很不方便。 那么该怎么配置呢？...= [ os.path.join(BASE_DIR, 'static'), ] 在项目根路径下新建 static 文件夹，并添加以下子文件夹和文件 文件结构如下： 好了，这样就配置好了项目下的公共静态文件了...下面来继续配置公共模板路径。
单细胞亚群的生物学命名的4个规则，如下所示 ： 第一个规则：已知的生物学亚群 第二个规则：顺序编号加上特异性高表达量基因 第三个规则：生物学功能注释 第四个规则：转录因子等基因集特异性亚群（更多的生物学功能数据库...CD138−),主要的基因是S1PI2, LRMP, SUGCT, MME, MKI67, and AICDA 虽然作者并没有给出 他们自己的测序数据，但是他使用了一个广为人知的胰腺癌的单细胞转录组公共数据集...（2019-PRJCA001063-PDAC），如下所示的第一层次降维聚类分群后提取里面的b细胞亚群进行细分： 提取里面的b细胞亚群进行细分 所以我们只需要重复一下这个广为人知的胰腺癌的单细胞转录组公共数据集...但是“人算不如天算”，虽然我们确实是没办法直接使用作者的测序矩阵去复现， 但是他使用了一个广为人知的胰腺癌的单细胞转录组公共数据集（2019-PRJCA001063-PDAC），而且强调了作者自己的测序数据分析的结果可以在
前言 在开发过程中，避免不了会使用公共变量，记录共享对象状态、数据最简单的方式就是创建创建公共变量； 当业务逻辑变多，还采用这种思想就会变得危险，代码逻辑变得不清晰，慢慢就有一种代码坏味道。...具体总结如下： 1、过多逻辑分支，不够清晰，公共变量不利于系统维护和项目拓展； 2、安全性收到威胁，过多地方共享变量，变量的写入和读取在多线程下是危险的； 3、业务逻辑交叉过多时，很难保证数据-逻辑的一致性
来源: lintcode-最常公共前缀 描述 给k个字符串，求出他们的最长公共前缀(LCP) 样例 在 "ABCD" "ABEF" 和 "ACEF" 中, LCP 为 "A" 在 "ABCDEFG"...两两比较,即第一个和第二个拿到公共前缀,在用公共前缀去和第三个取公共前缀…. 拿第一个的每个字符去和其余的所有字符串在该位置的字符比较,相同则继续下一个字符,有一个字符串不相同则结束.
在开发过程中，避免不了会使用公共变量，记录共享对象状态、数据最简单的方式就是创建创建公共变量。 当业务逻辑变多，还采用这种思想就会变得危险，代码逻辑变得不清晰，慢慢就有一种代码坏味道。...具体总结为一下几点： 过多逻辑分支，不够清晰，公共变量不利于系统维护和项目拓展； 安全性收到威胁，过多地方共享变量，变量的写入和读取在多线程下是危险的； 业务逻辑交叉过多时，很难保证数据-逻辑的一致性；
最长公共子串（注意子串是连续的） 1、先建立一个二维数组array[str1.size()][str2.size()]（全部初始化为0），初始化第一行和第一列（元素相同处置1），然后进入状态方程 2、状态转移方程...3、最后寻找整个array中的最大值即可（因为可能有多个子串） 示意（图中有两个公共子串，分别为"ab"和"de"，长度都为2） ?...程序： 1 /* 2 本程序说明： 3 4 最长公共子串（注意空格，不要用cin，要用getline） 5 6 */ 7 #include 8 #include...){ 46 cout<<largestCommentSubString(str1,str2)<<endl; 47 } 48 return 0; 49 } 最长公共子序列...1 /* 2 本程序说明： 3 4 最长公共子序列 5 6 */ 7 #include 8 #include 9 #include <string
重点是作者对自己的生物学领域背景知识的把控能力，比如首先应该是知道哪些数据集是可以拿来使用的。
今天小编含泪给大家总结了常用医学公共数据库，含临床数据库、生信数据库。...作为一个提供免费高通量测序数据的数据库，在科研圈中无人不知，无人不晓。每年利用这些公共数据发的文章不计其数。...以及TCGA等公共数据库的基因芯片和RNA-seq数据构建而成，评估了54, 675个基因在21种癌症中对于生存率的影响，包括乳腺癌(6234例)、卵巢癌(2190例)、肺癌(3452例)和胃癌(1440...这些数据库收集基因组序列，注释并分析他们，以提供公共访问。...主要包括： 2.1ArrayExpress ArrayExpress是高通量功能基因组数据的一个公共数据库。
在Django项目中，对于 js、css、images 等静态文件资源，需要一个公共的存放路径，不然每个应用都新建一个 static 文件夹的话，其实很不方便。那么该怎么配置呢？...[ os.path.join(BASE_DIR, 'static'), ] 在项目根路径下新建 static 文件夹，并添加以下子文件夹和文件 文件结构如下： 好了，这样就配置好了项目下的公共静态文件了...下面来继续配置公共模板路径。
最长公共子序列 举个例子：s1="abcfde"，s2="bcde"。那么s1与s2的最长公共子序列就是"bcde"，注意不要求连续。该问题是典型的动态规划问题。...(i, j)从0开始，那么递推关系很容易找到：(maxLen(i,j)表示s1字符串左边i个字符构成的子串与s2左边j个字符构成的子串的最长公共子序列长度，下同) if(s1[i-1] == s2[j-...最长公共子串与上述最长公共子序列不一样，最长公共子串要求连续。...例如s1="asdfddsx"，s2="asssdfed"，那么s1与s2的最长公共子串是："sdf"。...最长公共子串的输出比上面最长公共子序列简单，因为后者一定是连续的，我们只要保存最后一个两个字符串字符相等的位置index，以及最长公共子串的长度length，然后从index位置往回倒推index个字符即可
数据同样保证最小公共区域一定存在。
---- 相关视频——【极客学院】计算机等级考试二级c语言：公共基础知识部分（下）_哔哩哔哩 (゜-゜)つロ 干杯~-bilibili ---- 计算机二级考试公共基础知识部分——-数据库 数据库系统的基本概念...数据库系统(DBS):由数据库(数据)、数据库管理软件(软件)、数据库管理员(r人员)、硬件平台(硬件)、软件平台(软件)五个部分构成的运行实体。...数据库系统的内部结构体系 数据库系统的三级模式： 概念模式：数据库系统中全局数据逻辑结构的描述，全体用户公共数据视图； 外模式:也称子模式与用户模式。...示意图： 数据库的设计与管理 数据库设计概述 数据库设计是数据应用的核心。...数据库管理 数据库的建立； 数据库的调整； 数据库的重组； 数据库安全性与完整性控制； 数据库的故障恢复； 数据库监控。
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