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3D人体模型生成案例分享

该软件在Windows,Linux和MAC中兼容,使其易于实施。下载地址:https://www.cti.gov.br/pt-br/invesalius#download。...可以看到原始数据会以中轴切面,矢状切面,冠状切面来进行显示,而立体就是最后输出结果示意图。 ? 2、选取感兴趣区域 接下来就是要提取图像中感兴趣的区域了,比如要提取人体肋骨。...该工具提供了一些方法来提取一些组织,如图所示。 ? 所以选择骨骼选项,可以看到如下效果图。...通过切换观察三视图遮罩效果图,可以看到遮罩不仅覆盖了肋骨,还覆盖了气管,脏器组织等,这些都是不需要的,所以需要对此进行修改。 ?...4、输出结果 直接输出立体图像和相应的3D表面轮廓结果。 ?

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3dslicer使用教程_c4d视图设置

置中 将3D视图放于场景的中央位置,同时使图像被包含入3Dcube中 放大 缩小 切换投影方式 将会在直角投影和透视投影两种投影方式之间进行切换,并进行相应的绘制,呈现不同的3D视图 视图旋转 3D视图会以一定速率绕上下轴进行旋转...共有三种标识方式,分别是立方体标识方式、人体标识方式和坐标轴标识方式。并可设置它们的大小。...切面方向 控制选择该视图中显示的切面方向。...(矢状面(Sagital)、冠状面(Coronal)、横断面(Axial)或者重定义倾斜方向) 分块显示(Lightbox View) 在该视图中分块显示切面,各分块显示的切面是连续的,从上打下,从左到右依次连续排列...图像混合 切面间距和视场设置 可以自动设置或者手动设置该视图中切面的间距和视场范围(FOV) 图像旋转 显示方向标识 可以选择在slice viewers视图中显示方向标识,与三维的方向标识类似,可以设置不同类型的方向标识和大小

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    10-20国际标准导联系统

    10-20系统电极位置描述如下: 前后矢状线:从鼻根至枕外粗隆取一连线,在此线上,由前至后标出5个点,依次命名为:额极中点(Fpz)、额中点(Fz)、中央点(Cz)、顶点(Pz)、枕点(Oz)。...横位:从左耳前点(耳屏前颧弓根凹陷处)通过中央点至右耳前点取一连线,在此连线的左右两侧对称标出左颞中(T3)、右颞中(T4)、左中央(C3)、右中央(C4)。...侧位:从Fpz点向后通过T3、T4点至枕点分别取左右侧连线,在左右侧连线上由前至后对称地标出左额极(Fp1 )、右额极(Fp2 )、左前颞(F7)、右前颞(F8)、左后颞(T5)、右后颞(T6)、左枕(...,将双耳前凹之间的左右连线称为冠状线。...矢状线由前到后依次为Fpz、Fz、Cz、Pz和Oz,除Fpz与鼻根,Oz与枕外粗隆的距离为矢状线长度的10%外,其余点间距为矢状线长度的 20%;沿着冠状线,从左耳前凹10%处,依次为T3、C3、Cz、

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    FeTA2024——胎儿组织分割和生物测量

    有五种不同的生物测量,按照此处提供的注释协议进行:轴向平面上的大脑双顶径 (bBIP),轴向平面上的颅骨双顶径 (sBIP),矢状面中的蚓部高度 (HV),矢状面中的胼胝体长度 (LCC),冠状面中的最大小脑横向直径...成像平面相对于胎儿大脑定向,并获取轴向、冠状和矢状图 后处理:对于每个受试者,我们手动检查获取的胎儿大脑图像的质量,以汇编一组图像。...对于每个案例,使用 1.5 特斯拉飞利浦 Intera MR 扫描仪在3个正交(轴向、冠状面、矢状面)平面中采集至少3个T2加权单次快速自旋回波 (ssFSE) 序列(TE=80-140ms),参考胎儿脑干轴和...采集至少 3 个 T2 加权 ssFSE 序列,每个方向(矢状面、轴向、冠状面)扫描一次,参数如下:240 mm FOV,512x512 矩阵,平面分辨率为 ~0.5x0.5 mm,切片厚度为 3 mm...所有采集均在孕妇仰卧位使用轮廓 L 线圈和集成脊柱线圈进行 后处理:对于 KCL 数据,所有可用堆栈均经过手动质量审查。

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    吴恩达团队最新成果:利用MRNet进行膝关节磁共振成像异常诊断

    深度学习算法能,它够识别ACL撕裂(在矢状序列上看的最清楚)并使用热图来定位异常(底行),异常存在证据越多的地方热图颜色强度就会越大。...首先,每个二维MRI图像切片会通过一个特征提取器,得到包含每个切片特征的s×256×7×7张量。然后利用池化将这些特征减少到s×256。...因为MRNet会为矢状位T2、冠状位T1和轴向PD序列都生成预测,所以我们训练Logistic回归来对3组预测进行加权,并为每次检测都生成一个输出。...我们从从克罗地亚里耶卡临床医院中心获得了917例检查的公共数据集,它们都带有矢状位T1加权序列和ACL损伤标签。...在183例检查的外部验证集上,在斯坦福矢状位T2加权序列上训练的MRNet在没有额外训练的情况下,在ACL损伤检测中实现了0.824(95%CI 0.757,0.892)的AUC;在外部数据集其余部分上训练的

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    MRI物理基础知识及检查技术

    每一个氢质子可被视为一个小磁体,正常情况下,这些小磁体自旋轴的分布和排列是杂乱无章的,若人体置于一个强大的外磁场内时,这些小磁体的自旋轴将按磁场的方向重新有规律地排列,此时施加一个能够影响磁场方向的射频脉冲...三、纵向弛豫与横向弛豫 纵向弛豫又称自旋-晶格弛豫,简称T1,是指90度射频脉冲停止后,纵向磁化矢量从最小值恢复至平衡态的63%所经历的弛豫时间。...四、MRI图像的特点 图像反映组织间弛豫时间的差别;可多方位成像;可以直接轴位成像,或冠状位、矢状位成像。可多参数成像;可同时得到T1加权像、T2加权像、质子密度加权像。...有流空效应;可在不使用造影剂的情况下,使血管显示。...(2)多参数成像和任意层面成像,根据解剖部位,可以得到轴位、冠状位、矢状位和任意层面的斜位图像。

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    【C++医学影像PACS】CT检查中的三维重建技术

    三维重建是多层螺旋CT的一个最大的优点,也是影像工作多年来,从横断解剖到多平面,乃至立体的一次飞跃,让抽象变的形象,大大地提高了准确性,为临床工作的开展,注入了无限生机,从而解决许多临床上,无法开展的一些难题...它补偿了CT只能提供横断面的缺憾,适用于需要多角度,多方位观察病灶和器官的时候。 第六,曲面重建。它补偿了多平面重建,只提供单纯断面图像的缺憾,使用于显示形状多变的器官以及组织结构。...二、CT平扫和三维重建的区别 主要有以下几点: 【CT平扫】 获取的是原始数据,可以是横切的水平位,也可以是矢状位和冠状位,多数时候可以很好地建立疾病损伤及对比关系。...下面就是我们平时大家所做的CT平扫图像: 图片 【三维重建】 是基于平扫和各种冠状位、矢状位及水平位的数据,用后期电脑重新合成的数据。...将获取的冠状位、矢状位和水平位的数据整合后还原出器官三维立体的形象,可以直观地看到何处有病变,而且根据血流的多少添加色彩,看起来就更加直观。

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    FeTA2022——胎儿脑区分割挑战赛

    根据胎龄和胎儿大小调整以下参数:FOV:200-240mm;图像矩阵:1.5T:256x224;3T:320x224。成像平面相对于胎儿大脑定向,并采集轴向、冠状和矢状图像。...对于每种情况,在 3 个正交(轴向、冠状、矢状)平面中至少有 3 个 T2 加权单次快速自旋回波 (ssFSE) 序列 (TE=80-140ms),参考胎儿脑干轴和/或 使用 1.5 Tesla Philips...Intera MR 扫描仪获取胼胝体轴。...每个方向(矢状、轴向、冠状)一次扫描至少获得 3 个 T2 加权 ssFSE 序列,参数如下:240 mm FOV,512x512 矩阵,平面分辨率为 ~0.5x0.5 mm,切片厚度为 3 mm。...四、技术路线 1、根据固定阈值和形态学最大连通域分析得到大脑ROI区域,然后提取原始图像和标注图像的ROI。

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    基于表面形态的海马亚区分割

    这在海马头部的冠状切片或海马的矢状切片上最容易理解,如图1A所示。 图1 传统和多平面组织切片中海马亚区拓扑图解。 图A 传统海马脑片; 图B 顶部为全脑图像矢状切片。...左侧为传统海马冠状切片的大致位置。右侧3D模型中的黑线显示了海马头部和尾部的褶皱,包括海马趾和内侧弯曲; 图C 海马亚区多平面组织切片,沿海马曲率轴对切片进行重采样。...四、基于表面的海马亚区分割方法与手工分割和基于配准的分割方法的比较 一般来说,手工分割海马亚区的方法是通过探索能够同时将二维冠状MRI切面与冠状组织切片相匹配的标志(landmarks)来实现的。...例如,Steve等人在海马冠状切面中测量了组织学定义的亚区边界,即沿海马向内卷曲的百分比距离,并发现不同切片间和不同样本间的高度一致性。...2、海马亚区的手动分割方法通常使用各向异性图像采集,但这可能会模糊海马头部和尾部的内侧曲率以及海马体的指状结构。

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    MELA2022——纵隔病变分析挑战赛

    建立了一个大规模的基准数据集,从1100次CT扫描中自动检测纵隔病变,其中包括770次训练CT、110次验证CT和220次测试CT。...训练和验证案例包含带有 3D 边界框的注释,由经验丰富的放射科医师从轴向、冠状和矢状方向尽可能接近地围绕纵隔病变进行绘制。检测性能的评估基于FROC,这是一种平衡灵敏度和误报的评估指标。...经验丰富的放射科医师在每次 CT 扫描中通过从轴向、冠状和矢状方向尽可能靠近病灶绘制包围病灶的边界框来注释每个纵隔病灶。每个纵隔病变对应一个注释,该注释由三维真实边界框的坐标和长度组成。...2、由于纵隔位于胸腔内正中部位,所以要先把肺组织提取出来,去除多余的背景区域。...,最后再采用最大连通体+形态学闭操作(核大小是3)+填洞操作后得到肺组织区域,根据肺组织区域获取boundingbox,从原图图像和Mask中提取roi区域。

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    Psychological Science:支持性教养可改善青少年期贫困对成年期静息态功能连接带来的影响

    在被试25岁时,使用fMRI研究中央执行网络【central-executive network,CEN】和情绪调节网络【emotion-regulation network , ERN 】的静息态功能连接...支持性教养: 采用广泛使用的2个量表对被试在11-13岁和16-17岁间接受的支持性教养进行评估。...从涉及到支持性教养的分数中减去无效争论量表分数来描述教养方式。 MRI采集: 扫描仪器型号:GE Signa HDxt 3-Tesla scanner。...表1给出了ROI的坐标,图1 给出了CEN和ERN网络中ROIs的轴状位和矢状位视图。 表1 中央执行网络和情绪调节网络的感兴趣区 ? ?...图1 感兴趣区轴状位和矢状位视图 如果您对静息态脑功能及脑网络数据处理感兴趣,请点击: 第二十六届磁共振脑影像基础班(重庆) 第十二届磁共振脑网络数据处理班(南京) 结果 作者验证了:支持性教养可以改善青春期生活于贫困家庭的青少年的

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    北京协和医院陆菁菁:盆腔器官分割和建模的尝试与挑战 | ISICDM 2018

    通常,我们在临床上采集的经典图像方位是横轴位,矢状位和冠状位。最常用的是横轴位图像。 在磁共振领域,还需要了解的一个概念是T1加权像和T2加权像。...中间的这个图像是矢状位,和之前看的解剖图一样,能看见子宫内膜、结合带、肌层和浆膜、宫颈,这张图是女性盆腔里大家最愿意看到的一张图。它最直观,如果患者长了肌瘤和畸形,都可以看得特别清楚。...后面这个是冠状位,主要作为参考,这个图像上能看到卵巢相对位置等等一般观察女性盆腔,主要使用的是横轴位图像和矢状位图像。...总的来说,从分割算法的角度,根据不同的挑战,采取不同的策略来进行算法的修正,才能达到很好的效果。 这个是学生做的自动分割和手动分割的图像,当然还是很初步的工作。...2011年在MRI杂志上发表的这个研究,做了横截面的图像,尝试分割了不同的大腿肌肉,也没有使用深度学习的算法,而使用的是特征提取的算法。

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    带CT三维重建技术的医院影像PACS系统

    表面阴影遮盖(SSD)容积漫游技术(VRT)虚拟内镜技术(VE)下面对常用的几个方法进行简要介绍图片1、MPR  MPR(Multi-Planar Reformatting),多平面重建,是将扫描范围内所有的轴位图像叠加起来再对某些标线标定的重组线所指定的组织进行冠状...、矢状位、任意角度斜位图像重组。...主要的任务就是把日常产生的各种医学影像(包括核磁,CT,超声,各种X光机,各种红外仪、显微仪等设备产生的图像)通过各种接口(模拟,DICOM,网络)以数字化的方式海量保存起来,当需要的时候在一定的授权下能够很快的调回使用...它在各种影像设备间传输数据和组织存储数据具有重要作用。图片PACS系统源码特点:• 覆盖院内大多数影像科室。...• 高效的检查信息查询:可通过影像号、患者姓名、年龄、性别、检查时间、检查设备等多种查询条件迅速的获取查询患者;• 具有预约、登记、排队、收费、诊断报告、查询、统计、管理等功能;• 实用、便捷的“时间轴”

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    细胞图谱 | Nature | 人类胚胎骨骼发育的多组学图谱

    e, 9孕周时颅骨的苏木精和伊红染色切片的矢状视图(左侧),以及使用10X CytAssist Visium数据剖析的相邻切片的一个区域(右侧)。图像是一个供体的代表。...在缝合形成之后,定向分化的渐进波从颅缝向正在发展的骨前沿扩散(参考文献31)。 我们应用OrganAxis(见方法)定义了一个连续的成熟轴,该轴跨越冠状缝至成熟额骨区域。...冠状缝(CSs)和矢状缝(SSs)根据标签图例着色。图像是两名捐赠者的代表性图像。比例尺,2,000 微米。MAN,下颌骨;MAX,上颌骨;OCC,枕骨;TEM,颞骨。...d, 使用 OrganAxis 对 10X Visium CytAssist 图像的额骨(矢状切面)进行空间分箱。轴线跨越冠状缝至额骨(后-前)。...g, 蝶骨的矢状切面和来自 Cell2location 的细胞状态富集。图像是一个捐赠者的代表性图像。

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    nature neuroscience:整合脑干和皮层功能结构

    图1. a, 脑干导航图谱(https://www.nitrc.org/projects/brainstemnavig/)中所有 58 个脑干核的阈值(35%)概率模板的冠状(后视图)、矢状和轴向视图。...b, 皮质(灰点, n = 400)和脑干(绿点,n = 58)地块坐标质心的冠状(后视图)、矢状和轴向视图。c, 左,FC 矩阵(458 个区域 × 458 个区域)。...图中显示了脑干核的冠状面(后视图)、矢状面和轴向视图。节点大小和颜色反映加权程度,并绘制了脑干内 5% 最强功能连接的边缘(2.5% 和10%)。关键脑干核已标记。...显示了脑干核的冠状(后视图)、矢状面和轴向视图。节点大小与图2a中所示的加权程度成正比。有关按社区隶属关系组织的所有脑干核的列表,请参见表1。...显示了脑干核的冠状(后视图)、矢状和轴向视图。节点大小与图2a中所示的加权程度成正比。我们使用扩散图嵌入来估计皮质区域与脑干连接相似性的第一个梯度。

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    Feinstein Institute研究人员解码脑沟和白质区域的神经活动,预测手指运动和手部触觉刺激

    通过识别和提取重复的神经信号,研究人员能够可靠而准确地预测手指的运动和不同手指的触摸刺激。...如图4所示,在参与者 P3 的运动和感觉任务中,不仅在提示开始后,而且在提示偏移后观察到从 SEEG电极记录的复合时间响应。在感官任务中,机械触觉刺激(快速敲击)在整个提示期间出现在指尖。...图5 如下图所示,在参与者P3中使用SEEG或HD ECoG类型电极记录时,使用基于时间相关的特征选择显著提高了SVM和LSTM类型算法的解码精度。在其他参与者中也观察到这种趋势。...图 6 研究人员将电极位置(右半球)根据Yeo 7图谱绘制到参与者P1_01(红色)、P2_02(绿色)和P3_01(蓝色)的标准大脑。(A)侧位矢状面。(B)前视图的冠状面。...(C)从下方透视的横向视图。

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    NVIDIA开发强大的深度学习技术,可自动分割肿瘤

    为了帮助医生更有效地分析,治疗和监测肿瘤,NVIDIA研究人员开发了一种强大的基于深度学习的技术,该技术使用3D磁共振图像自动分割肿瘤。分割提供受影响区域的肿瘤边界定义。...一个典型的分割例子,真实和预测标签覆盖在T1c MRI轴向、矢状和冠状切片上。...Myronenko利用来自19家机构的数据和几台核磁共振扫描仪,训练了一个编码解码卷积神经网络,提取大脑核磁共振成像的特征。 ? 网络架构的原理图可视化。...编码器提取图像的特征,解码器重建图像的密集分割掩模。 该网络在NVIDIA的Tesla GPU的V100,以及使用cudnn加速TensorFlow深度学习框架的DGX-1服务器上进行了训练。...Myronenko表示,“在训练期间,我们使用了尺寸为160x192x128的随机输出,确保大部分图像内容保留在分割区域内。”

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    医学图像了解

    比如说,一个8比特的光栅可以有256个从0到255数值不等的图像深度 光度表示解释了像素数据如何以正确的图像格式(单色或彩色图片)显示。...并且可以根据需要,灵活选择轴、冠、矢及斜位扫描,充分显示病变 MRI被应用于心脏检查的多个方面,包括:形态学检查,提供心脏解剖的高分辨率成像;心脏功能学检查,评价射血分数EF,每搏输出量SV,收缩末期和舒张末期容积...,心输出量,以及瓣膜性能;心肌灌注和心肌活性;冠脉解剖和血流;心肌代谢;高分辨率血管壁斑块成像 脊椎检查中通常使用T1、T2扫描序列,并且会在矢状位、轴位、冠状位和任意角度生成多个扫描序列 MRI是前列腺增生和前列腺癌诊断的常用检查手段之一...,通常使用T1和T2扫描,使用最多的扫描方向为横轴位。...后缀为 .dcm,可以使用 python的dicom包读取,一般使用其pixl_array数据 Dicom格式数据处理过程 医学扫描图像(scan)其实是三维图像,使用代码读取之后开源查看不同的切面的切片

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    Neuron:发音运动轨迹在大脑语音感觉运动皮层上的编码

    中正矢状面运动以笛卡尔x和y坐标来表示。 (B)从声学和语音特征(彩色)推断出发音器中正矢状运动。每个参考传感器的轨迹以黑色显示。...(E)映射到声道中正矢状视点的示例电极编码滤波器权重表现出与语音相关的运动轨迹运动轨迹(AKT)。轨迹的时间过程由细到粗的线表示。喉音(通过发声进行音高调制)沿y轴为一维,x轴为时程。...除声音控制外,四种截然不同的声道结构还包括冠状,唇侧和背侧收缩。 使用层次聚类法根据电极的发音运动描述来组织电极(图3A)。为了从语音学角度解释这些聚类,研究者为每个电极建立了一个音位编码模型。...其中三组描述了声道的收缩:冠状、唇状和舌背,广泛覆盖英语中所有辅音。另一组描述了一个元音(元音)AKT,涉及喉部活动和下颌张开运动。...冠状位和唇位AKTs的解剖聚类有显著性差异(p和元音AKTs的解剖聚类无显著性差异。

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    eLife:脑卒中大鼠的功能超声成像

    此外,所选的冠状横断面包括丘脑后核(Po)、丘脑网状核和以传递与须相关信息而闻名的纹状带腹侧部分,并将S1BF的传出投射直接传递到其他皮层和皮层下区域。...数据采集后,在定制开发的数字大鼠图谱上记录和分割冠状截面,以提供由中风或诱发活动引起的灌注变化的动态视图。...然后,使用骨螺钉和牙水泥将定制设计的不锈钢头柱固定在动物头骨上(图1B,左)。 颅窗成像:在恢复和适应头固定后,在距矢状缝2 -4 mm和6 mm之间进行第二次颅窗。...为了找到感兴趣的平面,我们使用了大脑地标(例如大脑表面、海马、上矢状窦、大血管)。...使用蠕动泵,经心脏灌注磷酸盐缓冲盐水和4%多聚甲醛。收集脑并进行过夜后固定。在振动机上切片50 μ m厚的横跨MCA区域的冠状脑切片,并使用甲基紫染色程序进行分析。

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