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    妈妈再也不用担心我忘记pandas操作了

    () pd.DataFrame(dict) # 从字典对象导入数据，Key是列名，Value是数据 导出数据： df.to_csv(filename) # 导出数据到CSV文件 df.to_excel(...filename) # 导出数据到Excel文件 df.to_sql(table_name, connection_object) # 导出数据到SQL表 df.to_json(filename) #...升序排列，后按col2降序排列数据 df.groupby(col) # 返回一个按列col进行分组的Groupby对象 df.groupby([col1,col2]) # 返回一个按多列进行分组的Groupby...=max) # 创建一个按列col1进行分组，并计算col2和col3的最大值的数据透视表 df.groupby(col1).agg(np.mean) # 返回按列col1分组的所有列的均值 data.apply...if (rec[3] < 0): return '跌' else: return '平' 总结 pandas的操作上千种，但对于数据分析的使用掌握常用的操作就可以应付了

    2.6K31

    Python-matplotlib 散点图配色设计

    引言 这篇推文还是python-matplotlib 散点图的绘制过程，涉及到的内容主要包括matplotlib ax.scatter()、hlines()、vlines()、text()、添加小图片和定制化散点图图例样式等...该操作在多数数据处理操作中经常遇到，如果觉得pandasz这样处理太过麻烦，也可以使用 R的 dplyr 包的mutate()方法结合if_else操作完成。...接下来的步骤也就是根据具体的需求进行特征构建，所涉及的操作步骤也就不叫简单(列表生成式结合if-else操作)：代码如下： group01 = [y+.1 if type == 'start_x' else...总结 本片绘制推文还是灵活的使用python-matplotlib进行散点图的绘制，主要涉及的绘图技巧为：ax.scatter()、 hlines()、 vlines() 以及散点图例的定制绘制，其目的就是为了熟悉绘图技巧...，同时也希望为大家提供绘图灵感和帮助。

    1.3K10

    Python-matplotlib 散点图绘制02

    引言 这篇推文还是python-matplotlib 散点图的绘制过程，涉及到的内容主要包括matplotlib ax.scatter()、hlines()、vlines()、text()、添加小图片和定制化散点图图例样式等...该操作在多数数据处理操作中经常遇到，如果觉得pandasz这样处理太过麻烦，也可以使用 R的 dplyr 包的mutate()方法结合if_else操作完成。...接下来的步骤也就是根据具体的需求进行特征构建，所涉及的操作步骤也就不叫简单(列表生成式结合if-else操作)：代码如下： group01 = [y+.1 if type == 'start_x' else...总结 本片绘制推文还是灵活的使用python-matplotlib进行散点图的绘制，主要涉及的绘图技巧为：ax.scatter()、 hlines()、 vlines() 以及散点图例的定制绘制，其目的就是为了熟悉绘图技巧...，同时也希望为大家提供绘图灵感和帮助。

    1.2K10

    Python常用小技巧总结

    数据透视表分析--melt函数 将分类中出现次数较少的值归为others Python合并多个EXCEL工作表 pandas中Series和Dataframe数据类型互转 相同字段合并 Python小技巧...简单的表达式 列表推导式 交换变量 检查对象使用内存情况 合并字典 字符串分割成列表 字符串列表创建字符串 Python查看图片 itertools模块combinations itertools中reduce...]) # 先按列col1升序排列，后按col2降序排列数据 df.groupby(col) # 返回⼀个按列col进⾏分组的Groupby对象 df.groupby([col1,col2]) # 返回...var_name和value_name是自定义设置对应的列名。 col_level :如果列是MultiIndex，则使用此级别。...(sys.getsizeof(mylist)) 48 合并字典 从Python3.5开始，合并字典的操作更加简单 如果key重复，那么第一个字典的key会被覆盖 d1 ={"a":1,"b":2} d2

    10.3K20

    Python语言的精华:Itertools库

    前言 你知道Python的Itertools库被认为是Python的瑰宝吗?一些用户甚至认为它是最酷和最令人惊叹的Python库之一。...这就是为什么在内存高效和快速的应用程序中使用迭代器的原因。 我们可以打开无限的数据流(比如读取文件)并获取下一项(比如文件中的下一行)。然后我们可以对项目执行一个操作，并继续进行下一个项目。...Itertools是Python模块，是Python 3标准库的一部分。它允许我们在迭代器上执行高效的内存和计算任务。它的灵感来自APL、Haskell和SML的构造。...从本质上讲，该模块包含许多快速且内存效率高的方法，这些方法可以帮助我们用纯Python简洁而高效地构建应用程序。 无限迭代器 如果我们想构造一个返回无限均匀间隔值的迭代器呢?...或者，如果我们必须从迭代器生成一个元素循环呢?或者，也许我们想要重复迭代器的元素? itertools库提供了一组函数，我们可以使用这些函数来执行所需的所有功能。

    1.1K20

    Pandas速查手册中文版

    它不仅提供了很多方法，使得数据处理非常简单，同时在数据处理速度上也做了很多优化，使得和Python内置方法相比时有了很大的优势。 如果你想学习Pandas，建议先看两个网站。...（1）官网： Python Data Analysis Library （2）十分钟入门Pandas： 10 Minutes to pandas 在第一次学习Pandas的过程中，你会发现你需要记忆很多的函数和方法...pandas-cheat-sheet.pdf 关键缩写和包导入 在这个速查手册中，我们使用如下缩写： df：任意的Pandas DataFrame对象 同时我们需要做如下的引入： import pandas...(dict)：从字典对象导入数据，Key是列名，Value是数据 导出数据 df.to_csv(filename)：导出数据到CSV文件 df.to_excel(filename)：导出数据到Excel...=False)：按照列col1降序排列数据 df.sort_values([col1,col2], ascending=[True,False])：先按列col1升序排列，后按col2降序排列数据 df.groupby

    13.2K92

    python版本单细胞数据基因集打分并可视化

    从我们的新课《掌握Python，解锁单细胞数据的无限可能》学习了python版本的对单细胞数据用某个基因集打分，现在就来实践一下~ 单细胞数据的不同基因集打分有非常广泛的应用，比如文献《Single-cell...underlying mesenchymal stem cell therapy in ischemic acute kidney injury》展示了6个基因集在不同细胞亚群中的打分小提琴图： 基因集变异分析...（GSVA）进一步揭示，促纤维化TEC（肾小管上皮细胞）和受损TEC在炎症和纤维化相关通路中表现出富集，包括TNF-α信号通路、缺氧、TGF-β信号通路、IL-6-JAK-STAT3通路和纤维化，这与其促纤维化和促炎症特性一致...本次就用 msigdb 数据库的，对应的python代码如下： ## 基因集：使用来自 Msigdb 数据库的 # gp为前面加载的gseapy模块的缩写 import gseapy as gp msig...'leiden', cmap='RdBu_r', dendrogram=True) 本次分享到这~

    45610

    用python版InferCNVpy加速运算

    本质上，inferCNVpy这个包是InferCNV的python版重现。主要还是遵循R包版本的计算步骤，进行了少量修改。...inferCNVpy通过使用numpy、scipy和稀疏矩阵，使其计算效率大大提高。inferCNVpy可以在Linux，Mac环境下运行。...Windows下可参考： Windows下安装anconda，可参考 搭建 Python 高效开发环境：Pycharm + Anaconda 通过R里面的reticulate包桥接使用Windows的conda...如果不提供任何参考，则使用所有细胞的平均值，这可能适用于包含足够肿瘤和正常细胞的数据集。 Step3.可视化 绘制热图 现在，可以按细胞类型和染色体绘制平滑的基因表达。...cnv.pl.chromosome_heatmap(adata, groupby="cell_type") CNV聚类和肿瘤细胞鉴定 为了对细胞进行聚类和注释，inferCNVpy镜像了scanpy

    2.9K21

    一句Python，一句R︱数据的合并、分组、排序、翻转、集合

    https://blog.csdn.net/sinat_26917383/article/details/52293091 先学了R，最近刚刚上手python,所以想着将python和R...最好就是一句python，对应写一句R。 python中的numpy模块相当于R中的matirx矩阵格式，化为矩阵，很多内容就有矩阵的属性，可以方便计算。...一、分组.groupby df.groupby(df.year // 10 *10).max() #=R= max（cut(df$year,10)） —————————————————————————...假设b是一个array b.argsort():显示=b的秩+按照从小到大排序 b.argsort()[::-1]:b的秩+按照从大到小排序 b[b.argsort()[::-1]]:从大到小排序后的b...3、笛卡尔积 来源：几个有用的python函数 (笛卡尔积, 排列, 组合) permutations 排列 combinations 组合,没有重复 combinations_with_replacement

    1.4K20

    数据分析该分析什么？

    不管是用Python还是R，其实和用Excel一样，只不过现在之所以用Python、R是因为大数据时代么，数据太多，Excel的处理能力跟不上，但是这些都只是一个工具而已，核心还是围绕统计学不变的。...今天就来聊聊我们该从哪些方向去分析（描述）数据。 01|总规模度量： 总量指标又称统计绝对数，是反映某一数据的整体规模大小，总量多少的指标。...---- 04|离散程度的度量： 变异指标是用来表示总体分布的变异情况和离散程度的指标，通过变异程度也可以看出平均值指标的代表性程度，如果离散程度小，说明大部分数据都是挨着的，则平均值可以很好的反映整体情况的一般水平...全距（又称极差）、方差、标准差等几个指标是用来衡量数值的分散性和变异性。...四分位数将一些数值从小到大排列，然后一分为四，最小的四分位数为下四分位数，最大的四分位数为上四分位数,中间的四分位数为中位数。 3、对于问题2我们引入了方差和标准差两个概念来度量数据的分散性。

    1.2K80

    利用基因突变和K均值预测地区种群

    对基因组序列变异的理解给人类带来许多优势，从帮助识别倾向患常见疾病的人群，到治疗罕见疾病，以及使临床医生能够开针对个体的处方和药物。 在接下来的三部分的内容，我们将介绍基因组测序的基础和发展潜力。...)文件 为了从VCF创建ADAM镶嵌文件，我们将首先使用ADAM的SparkContext loadGenotypes方法加载VCF文件。...清洗和过滤数据 - 数据缺失或者变异是多元的。 为k-means聚类对数据处理 - 为每个样本（在排列上完全相同）创建一个ML向量，然后取得特征向量来运行该模型。...[confusion-matrix-1024x459.png] 下面举一简单的例子，介绍如何使用R语言计算混淆矩阵.这份笔记的代码主要用Scala编写，我们将用％r示使用R语言进行查询操作。...通过Lightning-Viz使用力图对数据进行可视化。笔记中包含用于创建Lightning-Viz可视化的Python代码。

    2.2K100

    遗传算法可视化项目（4）：遗传算法

    再来说针对TSP问题使用遗传算法的步骤。 　　（1）编码问题：由于这是一个离散型的问题，我们采用整数编码的方式，用1~n来表示n个城市，1~n的任意一个排列就构成了问题的一个解。...r1=2，r2=4，将第一个个体r1到r2之间的基因（即城市序号）与第二个个体r1到r2之间的基因交换，交换之后变为： 1 9 7 6 6 3 9 10 8 7 3 2 4 5 8 10 5 1...具体的方法是，随机产生[1,10]（这里仍然以10个城市为例）之间的两个随机数r1和r2（其实也是允许相同的，只是r1，r2相同之后，逆转自然无效,设置交叉变异都是无效的，但是这不会经常发生）,然后将r1...和r2之间的基因进行反向排序。...比如对于染色体： 1 3 4 2 10 9 8 7 6 5 r1=3，r2=5，它们之间的基因反向排列之后得到的染色体如下： 1 3 10 2 4 9 8 7 6 5 说了这么多，接下来就是代码实现了，

    1.7K40

    python 迭代器、生成器、yield、iter

    标准库 3.1 过滤 3.2 映射 3.3 合并 3.4 排列组合 3.5 重新排列 4. yield from 5. 可迭代的归约函数 6. iter 还可以传入2个参数 7....生成器当成协程 learn from 《流畅的python》 1....getitem__并创建迭代器 标准的迭代器接口有两个方法 __next__ 返回下一个可用的元素，如果没有元素了，抛出 StopIteration 异常 __iter__ 返回 self，以便在应该使用可迭代对象的地方使用迭代器...生成器 只要 Python 函数的定义体中有 yield 关键字，该函数就是生成器函数 调用生成器函数时，会返回一个生成器对象 惰性获取匹配项 re.finditer ，可以节省内存和无效工作 生成器表达式可以理解为列表推导的惰性版本...sample = [9, 5, 4, 6, 8, 9] print(list(itertools.accumulate(sample))) # [9, 14, 18, 24, 32, 41] 累加求和，前缀和

    1.2K20

    一文入门Python的Datatable操作

    通过本文的介绍，你将学习到如何在大型数据集中使用 datatable 包进行数据处理，特别在数据量特别大的时候你可以发现它可能比 Pandas 更加强大。...前言 data.table 是 R 中一个非常通用和高性能的包，使用简单、方便而且速度快，在 R 语言社区非常受欢迎，每个月的下载量超过 40 万，有近 650 个 CRAN 和 Bioconductor...如果你是 R 的使用者，可能已经使用过 data.table 包。...datatable as dt 首先将数据加载到 Frame 对象中，datatable 的基本分析单位是 Frame，这与Pandas DataFrame 或 SQL table 的概念是相同的：即数据以行和列的二维数组排列展示...诸如矩阵索引，C/C++，R，Pandas，Numpy 中都使用相同的 DT[i，j] 的数学表示法。下面来看看如何使用 datatable 来进行一些常见的数据处理工作。 ?

    8.9K50

    Pandas

    Pandas 数据结构 DataFrame 是 Pandas 最常用也是非常重要的一个对象，它是一个二维的数据结构，数据以行和列的表格方式排列。...python 中可以作为分组键的类型： 列名 和分组数据等长的数组或者列表 一个指明分组名称和分组值关系的字典或者 series A function to be invoked on the axis...如果想给缺失值赋予自己想要的值，则需要利用方法，以 add 为例 df1.add(df2,fill_value=0) r 表示翻转参数 Df 和 Ser 之间的算术运算 与数组的不同维度的数组进行算术运算的方法相似...（permutation）和随机抽样 随机排列 随机排列可以借助 np.random.permutation(n)实现对 n 维数组的行索引进行一个随机排序，返回值为一个一维数组。...，这里引入 python 的一些函数 使用 agg 方法聚合数据 agg，aggregate 方法都支持对每个分组应用某函数，包括 Python 内置函数或自定义函数。

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