在使用XPath解析式时，你需要理解四个最为重要的特殊符号：“/”,“//”,“*”，“.”，“|”。...以上两种写法是等价的，这里我们主要关注XPath文本谓语的使用，其实非常简单，每一篇博客中结构都是如下这样，category是一个闭合节点，我们仅需定位到所有tern属性值为“ggplot2”的category..." scheme="http://www.raindu.com/tags/ggplot2/"/> 所有属性的文本谓语定位时，是紧跟着其节点，使用方括号包围，“@”号引用节点属性名，可以为节点赋值也可以不赋值...路径表达式中如果包含匹配函数，其中的匹配模式需要使用单引号/双引号，这里往往与外部的XPath表达式的单引号/双引号冲突导致代码无法运行，所以出现这种情况时你一定要决定好内层和外层分别使用单引号/双引号...我们主要关注XPath文本谓语的使用，其实非常简单，每一篇博客中结构都是如下这样，category是一个闭合节点，我们仅需定位到所有tern属性值为“ggplot2”的category节点并将其对应scheme
没加载R包在运行一个R对话时，除了一些基础函数包会自动加载，其他的函数包都需要手动加载才能使用其中的函数，一般用library()函数，未加载R包会出现找不到函数的报错信息：ggplot(data =...输入错误一般是字符或者符号错误，如中文字符：library(tidyverse)ggplot(data = mpg) + geom_point(mapping = aes(x = displ, y =...句式不完整如输入一个函数时的括号不完整；或者在一句完整的代码后多加了逗号，运行时会在控制台的下一行最左侧出现'+'，提示代码输入不完整，可以写完整或者按Esc取消运行。...ggplot(data = mpg,> ggplot(data = mpg,+另外一种情况是使用ggplot2函数作图时，多个函数的连接是在函数的末尾，而不是开头：library(ggplot2)ggplot...其他遇到一个新的函数时，可以使用?function_name来快速查看函数的帮助文档，如?
scales: 这个参数通常由 ggplot2 内部处理，在这里并没有具体使用。 r: 圆的半径，默认为 3。这是文本标签围绕的圆的大小。 x0: 圆心的 x 坐标，默认为 0。...2.计算 x 和 y 坐标：使用极坐标公式将角度转换为笛卡尔坐标： • x = x0 + r * cos(theta)：根据角度和半径计算每个标签的 x 坐标。...::after_stat(x), y = ggplot2::after_stat(y) ) ) ❝使用 ggproto 定义了一个新的 ggplot2 统计对象 StatTextcircle...这个对象继承自 ggplot2 的 Stat 类，并定义了一些自定义的行为和属性，用于在 ggplot2 中实现圆形文本布局。...它使用一个自定义的统计对象 (StatTextcircle) 来创建一个新的 ggplot2 图层，这个对象计算文本标签的位置和角度，使它们形成一个圆形。
欢迎大家关注全网生信学习者系列：WX公zhong号：生信学习者Xiao hong书：生信学习者知hu：生信学习者CDSN：生信学习者2介绍使用 ggplot2 包画箱线图通常使用 geom_boxplot...在ggplot2 中，可以通过使用 geom_point() 来在箱线图上增加点，这些点可以代表分组中特定指标的出现率。...的画图，下面是代码的逐行解析：ggplot(data = plotdata, aes(x = Group, y = Index, color = Group))：初始化一个 ggplot 对象，使用 plotdata...数据框的基础上添加文本标签，映射 Group 到 x 轴，position 到 y 轴，occ_lab 作为标签文本，不显示图例。...pl结果：带有显示Index在不同分组出现率的箱线图画图: prism主题结果：带有显示Index在不同分组出现率的prism风格的箱线图
这时我们遇到了flatMap函数的方法糖for-comprehension，它可用让我们在一个for-loop里进行我们熟悉的行令式编程，就像下面这样： for { x <- getRecNo r...它们都是把普通的函数或者运算包嵌在一个结构里然后在实现这个类型的flatMap函数时体现这些运算的具体意义。这些道理在scalaz的源代码里都可以得到证实。...那么会不会出现在一个for-loop里出现几百行指令的情况呢？我认为不会，因为我们可以用函数组合方式把一个大程序分解成各种功能单一的简单函数，然后逐层进行组合，最终的程序最多也就是十几二十行。...) 再有一个问题就是FP的运算方式了：我们可以看到运算一连串的flatMap是一种递归算法，除非使用尾递归算法，compiler是无法对算法进行优化的，那么运算flatMap就很容易会发生堆栈溢出错误（...stackoverflow error），无法保障程序运行安全。
在更为复杂的图表中，我们可以叠加运行若干子元素语句来完成任务。在Figure 4基础上，我们可以使用text() 在特定的坐标增加文本。...data=mpg表示使用的数据集为mpg，mapping中是定义了映射到图表X轴、Y轴的数据属性，以及每个数据点的颜色（映射在X轴上的数据属性是displ，Y轴是hwy，颜色则按照数据集中class的种类标注...现在，我们没有生成任何图表——运行此行语句只会生成一个空白画布。 在绘完数据点后，参考plot()，在ggplot2中我们也通过使用第三个元素，geom_point()来改变几何对象类型。...很多功能包的使用，比如ggplot(), gganimate(), 其中的元素便是根据R绘图原理，将一个宏观的图表进行元素拆分，并进行分别叠加声明。另外，在绘图时，千万不要急于对图表进行美观。...至于绘图时的语法，我们只要熟悉了R绘图原理，明白了绘图时需要定义的元素有哪些，不论哪个工具包，就都可以手到擒来了。 卞褚奇 UCLA数学、统计本科毕业生 校对：林亦霖
（不要问为啥没有xlsx,excel文件属于富文本数据文件格式，导入太麻烦，需要很多转换和专用包的支持，劳神费力） TXT文件导入： 文件路径在桌面，名为myfile.txt 文件需为很规则的一维表，最好第一行有名称...（注意下R认可的路径与PC上文件路径使用的斜杠格式及方向） 导入后，数据文件存放在右上侧environment项目下的data列表中，可以直接点击查看，也可以通过head(data)预览数据前6行记录...= T, sep = '\t')#直接复制 然后回车或者“Ctrl+L”运行即可导入。...比较推荐前两种，比较保险，不容易出现错误，可以直接将以上语法做笔记保存，需要时直接复制，替换路径和名称直接运行。...")#安装下载工具包 library(ggplot2)#加载下载工具包 detach("ggplot2")#分离包（从内存空间中移除） remove.packages("ggplot2")#删除（相当于卸载
lst_y,bins=20) plt.show() # 首先，纯粹的Python代码 t1=time.time() First, plain vanilla for-loop t1=time.time...plain vanilla for-loop\n----------------------------------------------\n{} us".format(1000000*(t2-t1...这样我就可以有效运行超过1000个相同表达式的循环，来计算平均执行时间以避免任何随机效应。...因此，如果您在Jupyter Notebook中运行整个脚本，则可能会出现与第一种情况（即普通循环执行）略有不同的结果，但接下来的三种应该会给出非常一致的趋势（基于您的计算机硬件）。...这貌似不是一个显著改进，但节省的每一点时间都可以加入数据科学工作流程中，从长远来看是值得的！如果数据科学工作要求这种转换发生一百万次，那么可能会导致短则八小时，长则两天的差异。
在R升级到4.0+后，clusterProfiler的cnetplot会报如下的rescale错误，这个现象以及解决方法在以前的推文：R tips：debug并修复一个ggplot2绘图错误的例子中曾经说过...这部分主要解决两个问题： （1）上一篇的推文提到过，错误出现的原因是cnetplot生成的ggplot2对象中的data对象在渲染过程中某些数据被转换为了AsIs对象，最终导致报错。...:::ggplot_build.ggplot) dat %>% clusterProfiler::cnetplot() 在Rstudio界面中一直next，直到下面这一条命令时停止，因为这条命令之后就会出现...()) # { # 熟悉的字符rescale开始出现了... # x x, range = limits), limits) # uniq...然后将ggplot_build.ggplot函数退出debug模式（记得再运行一下刚才的rescale.AsIs函数的定义）。
在这个练习中，我们将使用for-loop来构建和打印各种列表。当你做这个练习时，你会开始明白它们是什么。我现在不会告诉你。你必须自己弄清楚。...如果在任何时候你这样做时出现问题（很可能会），只需按住CTRL并按下c（CTRL-c），程序就会中止。 常见学生问题 for-循环和**while-循环有什么区别？...如果else部分永远不应该运行，因为这没有意义，那么你必须在else中使用一个 die 函数，打印出错误消息并终止程序，就像我们在之前的练习中所做的那样。这将找到许多错误。...调试程序的最佳方法是使用print打印出程序中变量的值，以查看它们出错的位置。 确保程序的各个部分在编写时能够正常工作。不要在尝试运行之前编写大量的代码文件。少写一点，运行一点，修复一点。...如果你在阅读代码时发现错误，请尝试修复它们，并将更改发送给作者。 当你不使用纸张时的另一种技巧是在代码中用#注释来记录你的笔记。有时，这些注释可能成为实际的注释，帮助下一个人。
作图的时候常出现一个问题，我把windows系统字体Times New Roman指定为图形里的字体，虽然在RStudio图形窗口会显示指定字体，但是在保存为PDF时出现问题，出现字体类别错误，指定字体无法显示...但是在输出图形时出现错误： ? 显示字体类别错误 ? 那么这个问题怎么解决这个问题了？ 需要用到sysfonts和showtext两个包。...或者也可以： showtext_auto() # 全局自动使用 library(ggplot2) ggplot(Bar,aes(x = group,y = value,fill = Cohort))...建议在原始R控制台中运行代码。 如果想在RStudio中运行代码则手动打开图形设备，如x11()和windows()。...showtext_begin()和showtext_end()可以控制在哪一段代码间使用字体，而showtext_auto()是全局都使用。
上ggthemr的项目说明页： library(devtools) install_github('cttobin/ggthemr') 笔者在遵循上述步骤时不太顺利，遇到了如下错误： ? ...不过不用担心，按照上述的错误提示，我们打开对应目录，找到了对应的压缩包： ?...经过上述步骤我们便完成了ggthemr的安装准备工作； 2.2 傻瓜式用法 在我之前写得某篇文章中使用过Python中matplotlib.pyplot.style，仅仅使用style.use()...),nrow=100)) p x = X1, y = X2)) + stat_density2d(aes(fill = ..density..), geom...text_size：用于控制文本部分字体大小，默认12 type：用于控制背景区域填充的形式，当'inner'时如下： ? 当设置为'outer'时如下： ?
ggplot2包是一个很好的可视化包，ggsignif包是ggplot2包的一个扩展包。 今天来学习怎么在ggplot2包绘制的图形上添加显著性差异注释。 1....安装R包 install.packages("ggplot2") # 安装包 install.packages("ggsignif") # 安装包 library(ggplot2) # 加载包 library...加载数据 使用iris数据集。...data # 绘图数据所在的数据框 position # 位置调整；可以是字符串，也可以是位置调整函数的结果 na.rm # 逻辑词，默认为FALSE，移除缺失值时显示警告信息，为TRUE，则不显示警告信息...family # 设置文本字体 vjust # 相对于括号线，上下调整文本的距离 parse # 逻辑词，为TRUE，则标签将解析为表达式 参考资料 stat_signif()和geom_signif
背景 最近在学习MIT的分布式课程6.824的过程中，使用Go实现Raft协议时遇到了一些问题。...rf.winElectionCh <- true } } }() } 其中，peers切片的长度为3，因此最高下标为2，在非并行编程中代码中的for-loop...可是在调试过程中，一直在报 index out of bounds 错误。调试信息显示i的值为3，当时就一直想不明白循环条件明明是 i < 2，怎么会变成3呢。 01....由于闭包只是绑定到这个 val 变量上，因此极有可能上面的代码的运行结果是所有 goroutine 都输出了切片的最后一个元素。...这是因为很有可能当 for-loop 执行完之后 goroutine 才开始执行，这个时候 val 的值指向切片中最后一个元素。
我们主要使用两个参数控制线条的位置，slope控制斜率，intercept控制截距，下面是一个简单的例子，我们在散点图层上叠加截距为20，斜率为2的直线： library(ggplot2) p 使用geom_vline()来快捷地添加垂直线条，xintercept传入的参数即为线条在x轴上的位置，若传入向量则可同时添加多条线条： library(ggplot2) p <- ggplot...~variable) p 2.5 density()与density2d() 很多时候当我们获取的数据集样本数量足够时，通常我们可以绘制密度估计图来大致描述数据集数据的分布，ggplot2中当然提供了这类方法...<- ggplot(mtcars, aes(wt, mpg, label = rownames(mtcars))) p + geom_text() 对出现标签遮挡的情况进行抹除（不建议使用）： p...+ geom_text(check_overlap = TRUE) 使用别致的标签： p + geom_label() 改变文本标签的大小： p + geom_text(size = 10) 调整文字标签位置
如果您运行此代码并收到错误消息“没有名为'tidyverse'的软件包”，则需要先安装它，然后再次运行library（）。...当行驶相同距离时，具有低燃料效率的汽车比具有高燃料效率的汽车消耗更多燃料。 要了解有关mpg的更多信息，请通过运行？mpg打开其帮助页面。...创建ggplot 要绘制mpg，请运行此代码将displ放在x轴上，将hwy放在y轴上： ggplot(data = mpg) + geom_point(mapping = aes(x = displ...答案： 1.仅仅运行ggplot（data = mpg），将会出现一个只有背景的空图。 2.运行dim(mpg)，发现mpg有234行，14列。 3.使用？...它选择了一个合理的尺度来与美学一起使用，它构建了一个解释水平和价值之间映射的图例。对于x和y美学，ggplot2不会创建图例，但会创建带有刻度线和标签的轴线。
Example", x = "Category", y = "Values") 使用基础R函数boxplot()绘制箱线图 如果你不想使用ggplot2，可以使用R的基础图形函数boxplot()：...在使用ggstatsplot包绘制图形时遇到"Error in select(): ! Names must be unique."的错误，这通常意味着在数据处理过程中，列名或其他标识符出现了重复。...根据搜索结果，这个问题可能与数据处理方式有关，尤其是在使用dplyr包的select()函数时。 解决这个问题的一种方法是确保在进行选择操作时，所选的列名是唯一的。...此外，如果错误发生在使用ggstatsplot的ggwithinstats()函数时，这可能是因为在处理大量数据点时，函数内部的某些操作导致了列名不唯一。...) # 使用ggplot2绘制箱线图 ggplot(df, aes(x = gene, y = expression)) + geom_boxplot() + labs(title = "Boxplot
devtools直接从Github安装它（编程模板-R语言脚本写作：最简单的统计与绘图，包安装、命令行参数解析、文件读取、表格和矢量图输出）。...bbc_style（）：没有参数，通常是将文本大小、字体和颜色，轴线，轴线文本，边距和许多其他标准图表组件转换为BBC样式。...= font, size = 18, ## color = "#222222"), axis.text.x = ggplot2::element_text(margin = ggplot2...使用panel.grid.major.x = element_line添加x轴上的网格线。...（使用panel.grid.major.y = element_blank（）删除y轴上的网格线） 人工更改轴间距： 使用scale_y_continuous或scale_x_continuous更改轴文本标签
要检查图例在最终绘图中出现的确切位置，必须查看保存的文件。...手动更改轴文本 可以使用scale_y_continuous或scale_x_continuous自由更改轴文本标签： bars <- bars + scale_y_continuous(limits=...添加注释 向绘图添加文本注释的最简单方法是使用geom_label： multiple_line + geom_label(aes(x = 1980, y = 45, label = "I'm an annotation...（如果您对为什么将x设置为大陆，将y设置为预期寿命感到困惑，那么当图表似乎正以相反的方式绘制它们时，这是因为我们已经翻转了 使用coord_flip（）进行绘图。...Exporting your plot and x-axis margins 当您制作的绘图超出bbplot中的默认高度450px时，您确实需要考虑x轴边距的大小。
出现bug的代码是在使用clusterProfiler的cnetplot函数绘制一个富集分析图，正常情况下，它应该是出图如下： bug重现 出现问题的R对象是一个clusterProfiler的富集分析对象...UseMethod("print"))(x) 可以看到，ggplot2对象p在绘制图形时发生了错误：第一个调用方法是print泛型方法，然后方法分发到print.ggplot方法上(#2)，再然后是调用...这个时候可以对这个方法进行debug，并查看此代码运行时候的相关代码逻辑和数据情况。...debug(ggplot2:::ggplot_build.ggplot) p # 此时会进入debug界面， 一路单步执行下去，直到要出错的代码时停止 data %>% glimpse() # 查看数据...前文中，我们已经知道ggplot_build是一个S3泛型方法，而此处的x其实是ggplot2对象。
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