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UseGalaxy.cn生信云|零代码使用Tiverse优雅地处理数据集

Dplyr Mutate create, modify, and delete columns mutate 函数用于添加新变量或修改现有变量,能够基于已有数据创建新的变量列,支持对数据框进行实时的变量操作和修改...Dplyr Rename columns rename 函数用于重命名数据框中的变量名,能够快速修改变量的名称,使得数据的列名更符合用户的需求和习惯。...Dplyr Select keep or drop columns select 函数用于选择数据框中的特定列,可以保留感兴趣的变量,并且能够根据列名、位置或条件表达式进行灵活的变量选择操作。...Dplyr Slice select rows by position slice 函数用于按行数进行切片,能够从数据框中提取特定的行,支持根据行数或行号选择需要的行,也支持使用负数表示从末尾开始计算的行数...Tidyr Pivot Wider from long pivot_wider 函数用于将长格式数据转换为宽格式数据,能够将数据框中的一列分成多个列,根据指定的列名进行展开,使得数据以更直观的宽格式形式呈现

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    R 数据整理(六:根据分类新增列的种种方法 1.0)

    也就回到了开始创建的数据框test。 separate&&unite 将同一列中的内容分为两列内容。或将两列内容合并为同一列内容。 首先还是可以创建一个数据框。...对于待分离的对象(col),不必加上引号;但对于即将创建的新列(into),需要使用引号,由于是两列,这里使用向量创建。sep参数设定读取表格信息时以何符号作为分隔符。...对于即将合并的新列,需要使用引号;但对于想要合并的多个列名,可以不用使用引号。sep 参数设定多列合并后不同数据分隔使用的分割符。...library(dplyr) test <- iris[c(1:2,51:52,101:102),] rownames(test) =NULL 必备dplyr技巧 mutate 新增一列。...按列号 select(test,1) select(test,c(1,5)) 按列名 如果想要用向量来存放希望筛选的列名,需要使用函数 one_of 来存放该向量。

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    两个神奇的R包介绍,外加实用小抄

    如需一列中需要填入三个无规律的数字,可以用向量c(1,3,4),同样如果填是字符串也需要加双引号。 认识Tidy Data TidyData?泰迪数据是神马数据?我想到了如下两坨: ?...这是一种组织表格数据的方式,提供了一种能够跨包使用的统一的数据格式。 有多统一? 每个变量(variable)占一列,每个情况(case,姑且这么翻译)和观测值(observation)占一行。...expand(列出每列值所有可能的组合,天哪我是写到这里的时候刚看懂的!) 来看示例 ? ? 我是看到了结果才知道我干了啥的喂。就是选中的列中的值各种组合,成为一个新表。...Sampleid select(frame3,contains("n")) #列名包含n的列 select(frame3,starts_with("a")) #以a开头的列 5.mutate 根据原有的列生成新的列...这是根据相同的列名进行合并,当在两个表格中列名不一样时,需要在括号内加 by=c("col1"="col2") 其中col1和2分别是在两个表格中的需合并的列名 semi_join,anti_join

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    R 数据整理(七:使用tidyr和dplyr处理数据框 2.0)

    2.8 mutate 可以为数据框计算新变量,返回含有新变量以及原变量的新数据框: mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width) > head(test,...也可以用来添加新列,结合我先前说过的新增列的种种方法,并且支持多个语句组成的复合语句: > d.class %>% mutate(sexc = { + x 列号 select(test,1) select(test,c(1,5)) 按列名 如果想要用向量来存放希望筛选的列名,需要使用函数 one_of 来存放该向量。...对于待分离的对象(col),不必加上引号;但对于即将创建的新列(into),需要使用引号,由于是两列,这里使用向量创建。sep参数设定读取表格信息时以何符号作为分隔符。...对于即将合并的新列,需要使用引号;但对于想要合并的多个列名,可以不用使用引号。sep 参数设定多列合并后不同数据分隔使用的分割符。

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    tidyverse:R语言中相当于python中pandas+matplotlib的存在

    ,是弱类型的,同时与data.frame有相同的语法,使用起来更方便。...:数据整理 dplyr包的下述五个函数用法 4.1 筛选: filter 4.2 排列: arrange 4.3 选择: select 4.4 变形: mutate 4.5 汇总: summarise...#key:将原数据框中的所有列赋给一个新变量key #value:将原数据框中的所有值赋给一个新变量value #…:可以指定哪些列聚到同一列中 #na.rm:是否删除缺失值 widedata <-...:unit() #unite(data, col, …, sep = “_”, remove = TRUE) #data:为数据框 #col:被组合的新列名称 #…:指定哪些列需要被组合 #sep:组合列之间的连接符..., #convert = FALSE, extra = “warn”, fill = “warn”, …) #data:为数据框 #col:需要被拆分的列 #into:新建的列名,为字符串向量 #sep

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    生信技能树- R语言-day7

    (dplyr)arrange(test, Sepal.Length) #默认根据这一列从小到大给整个数据框排序arrange(test, desc(Sepal.Length)) #从大到小distinct...duplicated(mm)] 提取没有重复的第一次出现的mutate,数据框新增一列mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width) new是新产生的列名新加之后...,根据逻辑值向量生成有两个取值的字符型向量ifelse() + str_detect()samples = c("tumor1","tumor2","tumor3","normal1","normal2...else2, ifelse(,,ifelse)在ifelse里加一个ifelse补充 case_when练习题1.加载deg.Rdata,根据a、b两列的值,按照以下条件生成向量x:load("deg.Rdata...% # 矩阵变成数据框rownames_to_column() %>% #把行名变成一列mutate(group = rep(c("control","treat"),each = 3)) #新增一列group

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    r语言学习day6

    ")library(dplyr)示例数据直接使用内置数据集iris的简化版:test dplyr五个基础函数library(dplyr)创建一个示例数据框...data 使用mutate()函数创建新的变量data mutate(data, z = x + y)输出结果print(data..., by = "x")inner_join()函数和merge()函数都用于将两个数据框按照某些共同的列进行合并,但它们有一些区别:语法差异:inner_join()函数来自于dplyr包,其语法更加简洁明了...包依赖:inner_join()函数属于dplyr包,因此需要先加载dplyr包才能使用。merge()函数是基础R的一部分,无需额外加载包即可使用。...例如,当两个数据框中存在重复的列名时,inner_join()会自动为其中一个数据框的重复列名添加后缀以区分,而merge()函数则不会自动处理,需要手动指定后缀。

    15010

    数据处理第2节:将列转换为正确的形状

    转换列:基础部分 您可以使用mutate()函数创建新列。 mutate中的选项几乎是无穷无尽的:你可以对普通向量做任何事情,可以在mutate()函数内完成。...mutate中的任何内容都可以是新列(通过赋予mutate新的列名),或者可以替换当前列(通过保持相同的列名)。 最简单的选项之一是基于其他列中的值的计算。...为此,首先指定要拆分的列,然后指定新的列名,以及用于拆分的分隔符。示例代码显示基于'='作为分隔符分隔成两列。...您指定新列名称,然后指定要合并的列,最后指定要使用的分隔符。...在前面的示例中,新列“sleep_measure”是一个字符向量。 如果您要进行总结或后续的绘制,则该列将按字母顺序排序。

    8.1K30

    从零开始的异世界生信学习 R语言部分 06 R应用专题

    数据新增列 # mutate,数据框新增一列,新增一列是两列数值的乘积 mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width) 图片 图片 select和filter...list,使用下标循环,可以将每次循环的结果都保存到列表中 ## cbind 按列拼接 a = rnorm(10) b = 1:10 cbind(a,b) ##do.call() 函数是对列表 list...mutate(group = rep(c("control","treat"),each = 3)) ##给数据添加一列分组列 ##最终生成作图过程中间的转换的数据框dat 图片 pdat = dat...%>% pivot_longer(cols = starts_with("gene"), ##选择那几列的列名合成在一起组成新的一列 names_to = "gene...", ##新的列的名字 values_to = "count") ## 把原来列中的数值一一对应形成一个新的数值列'count' 图片 library(ggplot2

    2.5K30

    生信学习-Day6-学习R包

    综上所述,这行代码的作用是创建一个新的数据框 test,它包含了 iris 数据集中的第1、2、51、52、101、102行. 4 五个基础函数 1.新增列:mutate() 2.选择列(按列筛选) 列号...vars 的新变量,它是一个字符向量。...这样做的目的通常是为了在后续的函数调用中简化代码,特别是在你想要操作数据框中特定的列时。 这会从 your_data_frame 数据框中选择列名与 vars 向量中的字符串相匹配的列。...y = test2:表示要与test2数据框进行semi-join操作,即保留test1中与test2匹配的行。 by = 'x':指定要根据哪个列进行匹配。在这里,使用列x来进行匹配。...y = test1:表示要与test1数据框进行anti-join操作,即从test2中删除与test1匹配的行。 by = 'x':指定要根据哪个列进行匹配。在这里,使用列x来进行匹配。

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    数据清洗与管理之dplyr、tidyr

    本期回顾 R语言 | 第一部分:数据预处理 R语言|第2讲:生成数据 R语言常用的数据输入与输出方法 | 第三讲 本期目录 0 二维数组行列引用 1 创建新变量 2 变量重新编码 3 变量重新命名 4...缺失值 5 dplyr包的下述五个函数用法 5.1 筛选: filter 5.2 排列: arrange 5.3 选择: select 5.4 变形: mutate 5.5 汇总: summarise...包的下述五个函数用法【高级数据管理包】 # install.packages("dplyr") library(dplyr) #使用datasets包中的mtcars数据集做演示,首先将过长的数据整理成友好的...:unit() #unite(data, col, …, sep = “_”, remove = TRUE) #data:为数据框 #col:被组合的新列名称 #…:指定哪些列需要被组合 #sep:组合列之间的连接符..., #convert = FALSE, extra = “warn”, fill = “warn”, …) #data:为数据框 #col:需要被拆分的列 #into:新建的列名,为字符串向量 #sep

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