为了方便十几个新手使用云服务器，我取巧的root权限安装了一堆生物信息学软件，代码如下： sudo apt install -y fastqc sudo apt install -y samtools...sudo apt install -y bcftools sudo apt install -y bwa sudo apt install -y ncbi-blast+ sudo apt install...-y sra-toolkit sudo apt-get install r-base-core # 最新版 没想到第一个软件就翻车了，尴尬至极！...高手在biostar上面给出解释： This seems to be a bug when installing fastqc using apt-get install fastqc on some...http://www.bioinformatics.bbsrc.ac.uk/projects/fastqc/fastqc_v0.11.5.zip unzip fastqc_v0.11.5.zip 这样就可以使用全路径调用啦
在 https://www.anaconda.com/download 下载相应版本的安装包。...在linux 上安装可以参考 https://docs.anaconda.com/anaconda/install/linux 创建虚拟环境 其次，运行如下命令创建虚拟环境： conda create...python=python_edition 其中，yourenvname可以任意命令，python_edition是python版本，可以是 3.5, 3.6, 2.7, … 如果没有网络连接，可以使用如下命令...，克隆一个本地的环境 conda create -n yourenvname --clone root 激活虚拟环境 使用如下命令 conda activate your_env_name 这时，命令行会变成以...:/home$ 以后你运行的所有命令都是在虚拟环境中。
.pub 7、Update the Apt repository cache $ sudo apt-get update 8、Install CUDA $ sudo apt-get install cuda-libraries...-9-0 9、安装 cuda 驱动 安装驱动可能需要的依赖包 sudo apt-get update sudo apt-get install dkms build-essential linux-headers-generic...到最新版 sudo chown -R ai:ai /home/ai/anaconda3 conda update -n base conda 升级安装包到最新版 conda update...、激活 conda 环境 source activate tensorflow 17、安装 TensorFlow pip install --ignore-installed --upgrade...=8888 #可自行指定一个端口, 访问时使用该端口
在没有外网的情况下，安装Python环境只能采用离线方式。...有网络的情况下，可以直接使用命令行安装： sudo apt-get install python3.8 sudo apt install python3-pip 没有网络的话，需要先下载离线包。...Python-3.8.5.tgz -C ~ cd Python-3.8.5 安装编译环境： sudo apt-get install zlib1g-dev libbz2-dev libssl-dev libncurses5...sudo apt-get即可。...--version 输出版本号conda 4.9.2即安装成功。
linux中运行ifconfig出现错误 ? 正常情况下，只需要在控制面板上输入 sudo apt install net-tools 就可以正常 ifconfig 了。 ?...不能sudo apt install net-tools ? 出现这种问题时，解决方法是，首先输入 sudo apt-get update ? 然后输入： sudo apt upgrade ?...在控制面板上输入 sudo apt install net-tools 就可以正常 ifconfig 了。...不能sudo apt install net-tools（Linux不能联网） 原因：虚拟机的网络设置错误，点击vMware下的虚拟机->设置，选择网络设置。...主机模式：主机之和Linux连接在一起，使用与主机无法上网的情况。 一定要根据自己的需要设置好对应的模式。设置好后重启。
在上一期的内容中，我带大家完成了Linux子系统的安装，今天我们就要开始在Linux子系统上安装LDSC了，这也是一个很大的坑！！！...下面的Linux代码是帮助升级相关软件的 sudo apt-get update sudo apt-get install --reinstallbuild-essential 然后下载Anaconda...bioconda下载相关依赖包，如果无法使用代理的话，可以使用国内的镜像 conda config --add channels bioconda conda config --add channels...http://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/ 接下来一步一步安装所需的软件和安装包： conda install python=2.7 #安装...python 2.7 conda install pybedtools=0.7 #安装pybedtools 0.7 conda install nose=1.3 #安装nose 1.3 conda install
您可以使用以下命令安装JDK： $ sudo apt-get install default-jdk 您现在已安装Java Runtime Environment或Java Development Kit...您可以使用以下命令安装它： $ sudo apt-get install oracle-java8-installer 同样，系统会提示您输入y以确认安装。您还需要接受Oracle二进制代码许可条款。...要安装JDK 9，请使用以下命令： $ sudo apt-get install oracle-java9-installer 虽然Oracle JDK 9可能值得研究，但仍可能存在安全问题和错误，因此您应该选择...您可以通过执行与上一节中相同的命令来执行此操作： $ sudo update-alternatives --config java 从首选安装中复制路径，然后使用nano或您喜欢的文本编辑器打开/ etc...---- 参考文献：《How To Install Java with Apt-Get on Debian 8》
： sudo apt-get update 安装yum： sudo apt install yum 安装git 安装git： sudo apt install git 安装vim 安装vim： sudo...apt-get purge vim-common sudo apt-get update sudo apt-get upgrade sudo apt-get install vim 谷歌浏览器信息迁移...purge ibus 下载deb安装包并安装 下载地址：https://shurufa.sogou.com/linux sudo dpkg -i 安装包名 安装输入法依赖 sudo apt install...安装： sudo apt install flameshot 安装完之后在系统中设置快捷键，这样使用习惯就完全和windows一样。...https 或者 wss 协议连接 #rpc-secure=true # 在 RPC 服务中启用 SSL/TLS 加密时的证书文件, # 使用 PEM 格式时，您必须通过 --rpc-private-key
希望通过我的分享，帮助大家更好地了解和使用各类技术产品。 引言 在使用conda进行包管理时，我们有时会遇到一些棘手的错误。其中一个常见的问题就是libarchive.so.19相关的错误。...可以通过以下命令进行安装： sudo apt-get update sudo apt-get install libarchive-dev 如果使用的是其他包管理器，如yum或brew，相应的命令如下：...# CentOS/RHEL sudo yum install libarchive # macOS brew install libarchive 方法二：更新环境变量 确保环境变量中包含了正确的库路径...，可以尝试使用conda-forge渠道来安装包： conda install -c conda-forge conda-libmamba-solver 代码案例演示 以下是一个完整的演示，通过重新安装依赖库和更新环境变量来解决问题...： # Step 1: 安装缺失的libarchive库 sudo apt-get update sudo apt-get install libarchive-dev # Step 2: 更新环境变量
本教程安装环境为 1、Ubuntu18.04 Server系统 2、JDK1.8 这里提一下，在Ubuntu中是可以sudo apt-get install jetty9安装的，这个安装包是和openjdk10...挂在一起，如果没有特定要求，可以直接快速安装使用。
这篇文章给大家介绍了“linux 中命令APT的详尽使用方法”的相关知识，讲解详细，步骤过程清晰，有一定的借鉴学习价值，因此分享给大家做个参考，感兴趣的朋友接下来一起跟随小编看看吧。 ...apt-cache search package 搜索包 apt-cache show package 获取包的相关信息，如说明、大小、版本等 sudo apt-get install package...安装包 sudo apt-get install package - - reinstall 重新安装包 sudo apt-get -f install 修复安装"-f = ――fix-missing...使用 dselect 升级 apt-cache depends package 了解使用依赖 apt-cache rdepends package 是查看该包被哪些包依赖 sudo apt-get...清理无用的包 sudo apt-get check 检查是否有损坏的依赖 这篇关于“linux 中命令APT的详尽使用方法”的文章就介绍到这了！
/miniconda # 使用原厂源进行安装(国内不推荐) export DL_SITE=https://repo.anaconda.com/miniconda # 上方命令二选一即可 # 下载安装包...可以使用下方指令创建新的虚拟环境，也可使用默认环境继续进行: # 创建 conda 环境 名字叫做 'studyNemo' 指定python版本为3.8 conda create -n studyNemo...python==3.8 # 激活 conda 中名为 studyNemo 的环境 conda activate studyNemo # 退出环境 如果从base中退出则回到基本命令行 conda deacitvate...注意: base 与 studyNemo 的环境相互独立，并不互通，在不同环境中install的包不能相互使用 安装Jupyter Lab pip install jupyter jupyterlab...apt-get upgrade 开始安装Nemo(注意当前conda环境)： # 需要安装依赖 sudo apt-get install -y libsndfile1 ffmpeg # 在对应的conda
这样带来的好处是开发者不需要一开始明确所构建网络的结构，可以慢慢学习找到更合适的结构，就好比在建筑工地的实地考察的工程师，工人们每搭一堵墙都会过来询问下一步要做什么，而TensorFlow就好比在办公室画图纸的建筑师，在施工之前就设计好整栋大楼的结构...apt-get install dkms build-essential linux-headers-generic #安装依赖 添加下面文件sudo vim /etc/modprobe.d/blacklist-nouveau.conf...sudo service lightdm start #启动图形界面 cat /proc/driver/nvidia/version #测试驱动 安装CUDA 到NVIDIA官网下载相应系统的CUDA安装包...add /var/cuda-repo-9-0-local/7fa2af80.pub #apt添加安装CUDA所需要的公钥 sudo apt-get update sudo apt-get install...install pytorchpython import torchprint(torch.cuda.is_available()) conda install torchvision 测试Pytorch
/miniconda # 使用原厂源进行安装(国内不推荐) export DL_SITE=https://repo.anaconda.com/miniconda # 上方命令二选一即可 # 下载安装包...可以使用下方指令创建新的虚拟环境，也可使用默认环境继续进行: # 创建 conda 环境 名字叫做 'studyNemo' 指定python版本为3.8 conda create -n studyNemo...python==3.8 # 激活 conda 中名为 studyNemo 的环境 conda activate studyNemo # 退出环境 如果从base中退出则回到基本命令行 conda deacitvate...注意: base 与 studyNemo 的环境相互独立，并不互通，在不同环境中install的包不能相互使用 1.安装Jupyter Lab pip install jupyter jupyterlab...apt-get upgrade 开始安装Nemo(注意当前conda环境)： # 需要安装依赖 sudo apt-get install -y libsndfile1 ffmpeg # 在对应的conda
（也可以独立安装和使用，无需依赖 Anaconda） pip install jupyter notebook conda install jupyter 2....详解（启动、设置密码、测试等） 三、PyCharm使用Jupyter Notebook 本文将介绍了PyCharm使用conda虚拟环境中的Jupyter 0....the number of packages updated during conda update use conda install conda=23.9.0 当前使用的Conda...install conda=23.9.0 中途停止的下场 conda错乱了…… 2....==3.10 conda activate csdn1 conda install jupyter 重运行.ipynb文件 successful
您可以使用以下命令安装JDK： sudo apt-get install default-jdk 安装Oracle JDK 如果要安装Oracle JDK（Oracle分发的正式版），则需要执行几个步骤...您可以使用以下命令执行此操作： sudo apt-get install oracle-java8-installer Oracle JDK 9 这是一个开发人员预览版，一般版本计划于2017年3月发布...要安装JDK 9，请使用以下命令： sudo apt-get install oracle-java9-installer 管理Java 一台服务器上可以安装多个Java。...您可以在命令行使用update-alternatives配置默认使用的版本，管理哪些符号链接用于不同的命令。...您可以通过执行与上一节中相同的命令来执行此操作： sudo update-alternatives --config java 从首选安装中复制路径，然后使用nano或您喜欢的文本编辑器打开/etc/environment
之前看到说有vina1.2需要编译安装，我嫌麻烦找到了别的方法，使用apt安装，但运行到两个ligand时发现无论如何也无法执行，查看版本才发现我安装的是旧旧版本，故在此记录下安装新版本的过程。...0，旧版本的安装与卸载 apt install autodock-vina #安装的是旧版本,vina --version： v1.1.2 2011年的产品 apt remove autodock-vina...#卸载 安装新版本 备注：第4步参照vina的document文件，可以在conda环境下用pip安装（好像很简单） 1，首先需要编译boost库 参考https://www.jianshu.com...3，安装其它软件 在vina的tutorial里，你需要安装ADFR套装，在linux下它有.app安装包，很容易，以后要用到里边的prepare_ligand.py和prepare_receptor.py...--env --add channels conda-forge $ conda install numpy $ pip install vina $ pip install -U numpy vina
ps：许多软件conda 和pip 也有对应的支持，不一定需要用sudo 权限才能下载。比如cowsay，可以自行搜索一下。 1. 文字秀 一共三个命令。...sudo apt-get install sysvbanner sudo apt-get install toilet sudo apt-get install figlet image.png 2...$ sudo apt-get update $ sudo apt-get install cmatrix 将首选项中的命令行背景设置为黑底绿字。...烤火炉 安装包 libaa-bin 。...动物说 安装包 cowsay 。
Miniconda 使用Anaconda会安装一百多个依赖包，如果想灵活控制安装的依赖包或带宽有限，使用Miniconda是个不错的选择。...Conda是个包管理器，Anaconda就是建立在它的基础上。Conda不只跨平台还与语言无关，与pip和virtualenv相结合的作用相似。...Miniconda允许先创建包含Python的安装包，然后用conda安装其他的依赖包。 3. Pypi pandas可以通过pip安装，但要安装相关的依赖包。...pip install pandas 4....包管理器 可以用linux的包管理器进行安装，如 sudo apt-get install python-pandas zypper in python-pandas 5.
安装前，请安装所有必备工具: # 在 Linux 上: $ sudo apt-get install python-pip python-dev python-virtualenv # 在 Mac 上...使用Anaconda安装TensorFlow主要有以下几个步骤： 安装 Anaconda 建立一个 conda 计算环境 激活环境,使用 conda 安装 TensorFlow 安装成功后,每次使用 TensorFlow.../PATH_TO_INSTALL.SH --user 注意把 PATH_TO_INSTALL.SH 替换为你下载的安装包的文件路径，将执行路径 output/bazel 添加到 $PATH 环境变量中。...$ sudo apt-get install python3-numpy swig python3-dev python3-wheel 安装 CUDA (在 Linux 上开启 GPU 支持) 为了编译并运行能够使用...编译目标程序, 开启 GPU 支持 TensorFlow安装问题 在安装TensorFlow环境的过程中，可能会遇到很多的问题，现在将开发中遇到的一些常见问题写在这里以供大家参考。
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